MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014638	AGG	2	6	636313	636318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063918
12502	NC_014638	CGA	2	6	636341	636346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063918
12503	NC_014638	TCC	2	6	636377	636382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063918
12504	NC_014638	CCG	2	6	636394	636399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063918
12505	NC_014638	CGCC	2	8	636424	636431	0 %	0 %	25 %	75 %	311063918
12506	NC_014638	GTC	2	6	636482	636487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063918
12507	NC_014638	GGC	2	6	636491	636496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063918
12508	NC_014638	CGG	2	6	636598	636603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063918
12509	NC_014638	CGC	2	6	636629	636634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063918
12510	NC_014638	GCCG	2	8	636647	636654	0 %	0 %	50 %	50 %	311063918
12511	NC_014638	CCG	2	6	636730	636735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063918
12512	NC_014638	CTCC	2	8	636739	636746	0 %	25 %	0 %	75 %	311063918
12513	NC_014638	CGT	2	6	636823	636828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063918
12514	NC_014638	TCG	2	6	636840	636845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063918
12515	NC_014638	TCG	2	6	636918	636923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063918
12516	NC_014638	AAGC	2	8	636959	636966	50 %	0 %	25 %	25 %	311063918
12517	NC_014638	TCA	2	6	637186	637191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063919
12518	NC_014638	TCACCG	2	12	637210	637221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311063919
12519	NC_014638	GCC	2	6	637227	637232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063919
12520	NC_014638	GC	3	6	637237	637242	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12521	NC_014638	CAG	2	6	637260	637265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12522	NC_014638	TCA	2	6	637274	637279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063919
12523	NC_014638	GCC	2	6	637308	637313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063919
12524	NC_014638	GAG	2	6	637338	637343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063919
12525	NC_014638	GGCCG	2	10	637370	637379	0 %	0 %	60 %	40 %	311063919
12526	NC_014638	TCGG	2	8	637440	637447	0 %	25 %	50 %	25 %	311063919
12527	NC_014638	CCAT	2	8	637455	637462	25 %	25 %	0 %	50 %	311063919
12528	NC_014638	GCG	2	6	637464	637469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063919
12529	NC_014638	CAA	2	6	637499	637504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063919
12530	NC_014638	GTC	2	6	637512	637517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12531	NC_014638	GC	3	6	637540	637545	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12532	NC_014638	CAG	2	6	637631	637636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12533	NC_014638	GTC	2	6	637641	637646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12534	NC_014638	GC	3	6	637679	637684	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12535	NC_014638	ACC	2	6	637720	637725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063919
12536	NC_014638	GTG	2	6	637746	637751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063919
12537	NC_014638	TGA	2	6	637771	637776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063919
12538	NC_014638	TCG	2	6	637834	637839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12539	NC_014638	TGG	2	6	637873	637878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063919
12540	NC_014638	CGG	2	6	637978	637983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063919
12541	NC_014638	GAC	2	6	638028	638033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12542	NC_014638	CCG	2	6	638044	638049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063919
12543	NC_014638	GC	3	6	638058	638063	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12544	NC_014638	CG	3	6	638073	638078	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12545	NC_014638	TCG	2	6	638164	638169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063919
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12547	NC_014638	TCG	2	6	638185	638190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063919
12548	NC_014638	GGA	2	6	638237	638242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063919
12549	NC_014638	GC	3	6	638265	638270	0 %	0 %	50 %	50 %	311063919
12550	NC_014638	GAT	2	6	638280	638285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063919
12551	NC_014638	CGC	2	6	638544	638549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063920
12552	NC_014638	CAT	2	6	638561	638566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063920
12553	NC_014638	GCCGGT	2	12	638573	638584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311063920
12554	NC_014638	CGG	3	9	638585	638593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063920
12555	NC_014638	GCA	2	6	638654	638659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063920
12556	NC_014638	CCG	2	6	638674	638679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063920
12557	NC_014638	GACGCC	2	12	638721	638732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311063920
12558	NC_014638	TCG	2	6	638743	638748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063920
12559	NC_014638	ATC	2	6	638766	638771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063920
12560	NC_014638	GCC	2	6	638892	638897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063920
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12562	NC_014638	TCG	2	6	638992	638997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063920
12563	NC_014638	ACG	2	6	639070	639075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063920
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12565	NC_014638	GC	3	6	639196	639201	0 %	0 %	50 %	50 %	311063920
12566	NC_014638	GAG	2	6	639258	639263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063920
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12568	NC_014638	GCGCAA	2	12	639302	639313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063920
12569	NC_014638	CAT	2	6	639320	639325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063920
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12589	NC_014638	GTC	2	6	640313	640318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063921
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12591	NC_014638	CG	3	6	640375	640380	0 %	0 %	50 %	50 %	311063921
12592	NC_014638	CGG	2	6	640393	640398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063921
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12602	NC_014638	GCT	3	9	641051	641059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063921
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12605	NC_014638	CG	3	6	641130	641135	0 %	0 %	50 %	50 %	311063921
12606	NC_014638	GCT	2	6	641189	641194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063921
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12616	NC_014638	GTG	2	6	641848	641853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063922
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12855	NC_014638	GTCGCC	2	12	653544	653555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311063929
12856	NC_014638	CGG	2	6	653560	653565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063929
12857	NC_014638	CGT	2	6	653585	653590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063929
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12923	NC_014638	GATC	2	8	656537	656544	25 %	25 %	25 %	25 %	311063932
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12948	NC_014638	GAT	3	9	657987	657995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063934
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12955	NC_014638	TGA	2	6	658339	658344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063934
12956	NC_014638	ACGC	2	8	658400	658407	25 %	0 %	25 %	50 %	311063934
12957	NC_014638	GCG	2	6	658459	658464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063934
12958	NC_014638	CCT	2	6	658468	658473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063934
12959	NC_014638	GCA	2	6	658497	658502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063934
12960	NC_014638	CTG	2	6	658540	658545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063934
12961	NC_014638	GGT	2	6	658558	658563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063934
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12963	NC_014638	ATG	2	6	658616	658621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063934
12964	NC_014638	CAT	2	6	658895	658900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063935
12965	NC_014638	CG	3	6	658960	658965	0 %	0 %	50 %	50 %	311063935
12966	NC_014638	GAC	2	6	659013	659018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063935
12967	NC_014638	GAG	2	6	659055	659060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063935
12968	NC_014638	CGC	2	6	659147	659152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063935
12969	NC_014638	GAG	2	6	659157	659162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063935
12970	NC_014638	CGC	2	6	659186	659191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063935
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