MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014638	TGC	2	6	418865	418870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063770
8002	NC_014638	ACG	2	6	418880	418885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063770
8003	NC_014638	TGG	2	6	418886	418891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063770
8004	NC_014638	CCG	2	6	418898	418903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063770
8005	NC_014638	GCT	2	6	418911	418916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063770
8006	NC_014638	TCGGC	2	10	418955	418964	0 %	20 %	40 %	40 %	311063770
8007	NC_014638	GGA	2	6	419007	419012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063770
8008	NC_014638	CGG	2	6	419133	419138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063770
8009	NC_014638	CGC	2	6	419142	419147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063770
8010	NC_014638	CCA	2	6	419336	419341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063771
8011	NC_014638	GCATCG	2	12	419387	419398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8012	NC_014638	GCT	2	6	419427	419432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8013	NC_014638	GCG	2	6	419483	419488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063771
8014	NC_014638	GAC	3	9	419527	419535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8015	NC_014638	GC	3	6	419544	419549	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8016	NC_014638	GCC	2	6	419584	419589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063771
8017	NC_014638	ACA	2	6	419591	419596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063771
8018	NC_014638	CG	3	6	419600	419605	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8019	NC_014638	TCG	2	6	419609	419614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8020	NC_014638	GCT	2	6	419619	419624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8021	NC_014638	GGC	2	6	419626	419631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063771
8022	NC_014638	CGC	2	6	419677	419682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063771
8023	NC_014638	GCT	3	9	419697	419705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8024	NC_014638	CGA	2	6	419730	419735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8025	NC_014638	ACCA	2	8	419740	419747	50 %	0 %	0 %	50 %	311063771
8026	NC_014638	CGT	2	6	419754	419759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8027	NC_014638	GCT	3	9	419817	419825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8028	NC_014638	CGA	2	6	419850	419855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8029	NC_014638	ACG	2	6	419882	419887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8030	NC_014638	GGC	2	6	419908	419913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063771
8031	NC_014638	TGC	2	6	419927	419932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8032	NC_014638	CGAC	2	8	419946	419953	25 %	0 %	25 %	50 %	311063771
8033	NC_014638	GA	3	6	419966	419971	50 %	0 %	50 %	0 %	311063771
8034	NC_014638	CG	3	6	419988	419993	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8035	NC_014638	CG	3	6	420014	420019	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8036	NC_014638	GCGCCC	2	12	420020	420031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063771
8037	NC_014638	CCA	2	6	420035	420040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063771
8038	NC_014638	CG	3	6	420063	420068	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8039	NC_014638	GCC	2	6	420087	420092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063771
8040	NC_014638	GTC	2	6	420148	420153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8041	NC_014638	AGC	2	6	420197	420202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8042	NC_014638	CCGA	2	8	420211	420218	25 %	0 %	25 %	50 %	311063771
8043	NC_014638	CGG	3	9	420224	420232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063771
8044	NC_014638	CCT	3	9	420245	420253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063771
8045	NC_014638	CCCT	2	8	420271	420278	0 %	25 %	0 %	75 %	311063771
8046	NC_014638	CG	3	6	420290	420295	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8047	NC_014638	ATCC	2	8	420366	420373	25 %	25 %	0 %	50 %	311063771
8048	NC_014638	AAGGCG	2	12	420391	420402	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	311063771
8049	NC_014638	GGA	2	6	420432	420437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063771
8050	NC_014638	GTCG	2	8	420438	420445	0 %	25 %	50 %	25 %	311063771
8051	NC_014638	CGC	2	6	420446	420451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063771
8052	NC_014638	AGA	2	6	420470	420475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063771
8053	NC_014638	CGA	2	6	420501	420506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8054	NC_014638	TCG	2	6	420545	420550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8055	NC_014638	CGA	2	6	420669	420674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8056	NC_014638	TCG	2	6	420737	420742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8057	NC_014638	CGGCT	2	10	420778	420787	0 %	20 %	40 %	40 %	311063771
8058	NC_014638	TGA	2	6	420803	420808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063771
8059	NC_014638	GCT	3	9	420852	420860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8060	NC_014638	CTG	2	6	420865	420870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8061	NC_014638	TCA	2	6	420887	420892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063771
8062	NC_014638	GGA	2	6	420939	420944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063771
8063	NC_014638	TCG	2	6	420974	420979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8064	NC_014638	CTG	2	6	420997	421002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8065	NC_014638	CAG	2	6	421018	421023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
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8067	NC_014638	CGA	2	6	421068	421073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063771
8068	NC_014638	GCCG	2	8	421140	421147	0 %	0 %	50 %	50 %	311063771
8069	NC_014638	CGG	2	6	421166	421171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063771
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8076	NC_014638	TCA	2	6	421436	421441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063772
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8078	NC_014638	GCGAT	2	10	421558	421567	20 %	20 %	40 %	20 %	311063772
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8080	NC_014638	CGGT	2	8	421615	421622	0 %	25 %	50 %	25 %	311063772
8081	NC_014638	CTC	2	6	421626	421631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063772
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8088	NC_014638	ACG	2	6	422120	422125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063773
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8091	NC_014638	GGC	2	6	422356	422361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063773
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8094	NC_014638	AACG	2	8	422531	422538	50 %	0 %	25 %	25 %	311063774
8095	NC_014638	ACG	2	6	422566	422571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063774
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8098	NC_014638	CGAC	2	8	422620	422627	25 %	0 %	25 %	50 %	311063774
8099	NC_014638	CGCGG	2	10	422651	422660	0 %	0 %	60 %	40 %	311063774
8100	NC_014638	GCCG	2	8	422726	422733	0 %	0 %	50 %	50 %	311063774
8101	NC_014638	TCAG	2	8	422803	422810	25 %	25 %	25 %	25 %	311063774
8102	NC_014638	GAG	2	6	422859	422864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063774
8103	NC_014638	GAG	2	6	422877	422882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063774
8104	NC_014638	CAC	2	6	422885	422890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063774
8105	NC_014638	CAT	2	6	422900	422905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063774
8106	NC_014638	GAG	2	6	422979	422984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063774
8107	NC_014638	GC	3	6	423035	423040	0 %	0 %	50 %	50 %	311063774
8108	NC_014638	GCG	2	6	423065	423070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063774
8109	NC_014638	CAT	2	6	423101	423106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063774
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8111	NC_014638	CAA	2	6	423149	423154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063774
8112	NC_014638	TCG	2	6	423169	423174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063774
8113	NC_014638	GCGTGC	2	12	423206	423217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311063774
8114	NC_014638	AGGCGC	2	12	423229	423240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	311063774
8115	NC_014638	CGA	2	6	423266	423271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063774
8116	NC_014638	ACG	2	6	423279	423284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063774
8117	NC_014638	TGA	2	6	423286	423291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063774
8118	NC_014638	AGC	2	6	423304	423309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063774
8119	NC_014638	ACG	2	6	423325	423330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063774
8120	NC_014638	GCAG	2	8	423332	423339	25 %	0 %	50 %	25 %	311063774
8121	NC_014638	GC	3	6	423365	423370	0 %	0 %	50 %	50 %	311063774
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8482	NC_014638	CAT	2	6	440389	440394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063790
8483	NC_014638	ATG	2	6	440405	440410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063790
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8485	NC_014638	CCG	3	9	440466	440474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063790
8486	NC_014638	CGGACA	2	12	440505	440516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063790
8487	NC_014638	CG	3	6	440580	440585	0 %	0 %	50 %	50 %	311063790
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8491	NC_014638	TGCG	2	8	440682	440689	0 %	25 %	50 %	25 %	311063790
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