MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014616	TTC	2	6	2111411	2111416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288260
44002	NC_014616	TGG	2	6	2111436	2111441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288260
44003	NC_014616	TTC	2	6	2111459	2111464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288260
44004	NC_014616	GTA	2	6	2111482	2111487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288260
44005	NC_014616	CGA	2	6	2111499	2111504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44006	NC_014616	CGG	2	6	2111526	2111531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288260
44007	NC_014616	GAT	2	6	2111536	2111541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288260
44008	NC_014616	CTT	2	6	2111563	2111568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288260
44009	NC_014616	GCG	2	6	2111573	2111578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288260
44010	NC_014616	GTC	2	6	2111596	2111601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44011	NC_014616	GGCGTT	2	12	2111623	2111634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310288260
44012	NC_014616	GAA	2	6	2111674	2111679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310288260
44013	NC_014616	GCA	2	6	2111706	2111711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44014	NC_014616	TGG	2	6	2111775	2111780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288260
44015	NC_014616	GGC	2	6	2111806	2111811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288260
44016	NC_014616	TGG	2	6	2111820	2111825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288260
44017	NC_014616	CTG	2	6	2111962	2111967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44018	NC_014616	TCG	2	6	2111987	2111992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44019	NC_014616	GCC	3	9	2112013	2112021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44020	NC_014616	GC	3	6	2112035	2112040	0 %	0 %	50 %	50 %	310288260
44021	NC_014616	AGC	2	6	2112047	2112052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288260
44022	NC_014616	GC	3	6	2112200	2112205	0 %	0 %	50 %	50 %	310288260
44023	NC_014616	GGA	2	6	2112208	2112213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288260
44024	NC_014616	CCG	2	6	2112228	2112233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44025	NC_014616	GGT	2	6	2112256	2112261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288260
44026	NC_014616	GTT	2	6	2112346	2112351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288260
44027	NC_014616	AGCCGG	2	12	2112375	2112386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310288260
44028	NC_014616	GGA	2	6	2112391	2112396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288260
44029	NC_014616	CGG	2	6	2112420	2112425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288260
44030	NC_014616	GCC	2	6	2112484	2112489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44031	NC_014616	GTG	2	6	2112500	2112505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288260
44032	NC_014616	CGC	2	6	2112516	2112521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44033	NC_014616	CGG	2	6	2112525	2112530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288260
44034	NC_014616	TGCG	2	8	2112615	2112622	0 %	25 %	50 %	25 %	310288260
44035	NC_014616	TTC	2	6	2112671	2112676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288260
44036	NC_014616	GCC	2	6	2112712	2112717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44037	NC_014616	GC	3	6	2112792	2112797	0 %	0 %	50 %	50 %	310288260
44038	NC_014616	CGC	2	6	2112820	2112825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288260
44039	NC_014616	TTG	2	6	2112845	2112850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288260
44040	NC_014616	TGC	2	6	2113303	2113308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44041	NC_014616	GCT	2	6	2113385	2113390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44042	NC_014616	GAG	2	6	2113398	2113403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288261
44043	NC_014616	ACG	2	6	2113456	2113461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44044	NC_014616	CCG	2	6	2113498	2113503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288261
44045	NC_014616	TTC	2	6	2113518	2113523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288261
44046	NC_014616	CGA	2	6	2113580	2113585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44047	NC_014616	ATC	2	6	2113623	2113628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288261
44048	NC_014616	CGA	3	9	2113676	2113684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44049	NC_014616	CGG	2	6	2113753	2113758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288261
44050	NC_014616	CTC	2	6	2113775	2113780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310288261
44051	NC_014616	CCGCGG	2	12	2113790	2113801	0 %	0 %	50 %	50 %	310288261
44052	NC_014616	CG	3	6	2113834	2113839	0 %	0 %	50 %	50 %	310288261
44053	NC_014616	GGT	2	6	2113853	2113858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288261
44054	NC_014616	CG	3	6	2113867	2113872	0 %	0 %	50 %	50 %	310288261
44055	NC_014616	CG	3	6	2113875	2113880	0 %	0 %	50 %	50 %	310288261
44056	NC_014616	GCT	2	6	2113904	2113909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44057	NC_014616	CTG	2	6	2113937	2113942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44058	NC_014616	ATG	2	6	2113953	2113958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288261
44059	NC_014616	CACGC	2	10	2114000	2114009	20 %	0 %	20 %	60 %	310288261
44060	NC_014616	ACT	2	6	2114011	2114016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288261
44061	NC_014616	ATC	2	6	2114019	2114024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288261
44062	NC_014616	CGA	2	6	2114030	2114035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44063	NC_014616	CAC	2	6	2114063	2114068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288261
44064	NC_014616	GCC	2	6	2114103	2114108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288261
44065	NC_014616	TCA	2	6	2114125	2114130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288261
44066	NC_014616	TGC	2	6	2114179	2114184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288261
44067	NC_014616	GCC	2	6	2114402	2114407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288262
44068	NC_014616	TGA	2	6	2114451	2114456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288262
44069	NC_014616	CGG	2	6	2114475	2114480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288262
44070	NC_014616	GT	3	6	2114496	2114501	0 %	50 %	50 %	0 %	310288262
44071	NC_014616	GAG	2	6	2114504	2114509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288262
44072	NC_014616	CGG	2	6	2114541	2114546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288262
44073	NC_014616	CAG	2	6	2114575	2114580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288263
44074	NC_014616	AAT	2	6	2114627	2114632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310288263
44075	NC_014616	GCA	2	6	2114648	2114653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288263
44076	NC_014616	CG	3	6	2114656	2114661	0 %	0 %	50 %	50 %	310288263
44077	NC_014616	GCA	2	6	2114702	2114707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288263
44078	NC_014616	TGCGCG	2	12	2114710	2114721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310288263
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44081	NC_014616	CAT	2	6	2114900	2114905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288263
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44084	NC_014616	TCGC	2	8	2115129	2115136	0 %	25 %	25 %	50 %	310288263
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44086	NC_014616	TGC	2	6	2115172	2115177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288263
44087	NC_014616	ACTC	2	8	2115182	2115189	25 %	25 %	0 %	50 %	310288263
44088	NC_014616	CA	3	6	2115190	2115195	50 %	0 %	0 %	50 %	310288263
44089	NC_014616	TGACA	2	10	2115344	2115353	40 %	20 %	20 %	20 %	310288264
44090	NC_014616	GGAC	2	8	2115362	2115369	25 %	0 %	50 %	25 %	310288264
44091	NC_014616	CGG	2	6	2115377	2115382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288264
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44097	NC_014616	TCG	2	6	2115730	2115735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288264
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44099	NC_014616	CGA	2	6	2116093	2116098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288265
44100	NC_014616	CGC	2	6	2116135	2116140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288265
44101	NC_014616	CCAG	2	8	2116143	2116150	25 %	0 %	25 %	50 %	310288265
44102	NC_014616	AAG	2	6	2116196	2116201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310288265
44103	NC_014616	GGCA	2	8	2116217	2116224	25 %	0 %	50 %	25 %	310288265
44104	NC_014616	GCT	2	6	2116246	2116251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288265
44105	NC_014616	TCG	2	6	2116260	2116265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288265
44106	NC_014616	TC	3	6	2116353	2116358	0 %	50 %	0 %	50 %	310288265
44107	NC_014616	CCG	2	6	2116401	2116406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288265
44108	NC_014616	ATG	2	6	2116452	2116457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288265
44109	NC_014616	TTC	2	6	2116577	2116582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288265
44110	NC_014616	TAC	2	6	2116664	2116669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288265
44111	NC_014616	CTT	2	6	2116959	2116964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288266
44112	NC_014616	CTG	2	6	2116983	2116988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288266
44113	NC_014616	GCTCC	2	10	2117075	2117084	0 %	20 %	20 %	60 %	310288266
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44115	NC_014616	TGC	2	6	2117113	2117118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288266
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44227	NC_014616	TAG	2	6	2134895	2134900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288272
44228	NC_014616	GAC	2	6	2134904	2134909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288272
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44230	NC_014616	TCA	2	6	2135032	2135037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288272
44231	NC_014616	CG	3	6	2135095	2135100	0 %	0 %	50 %	50 %	310288272
44232	NC_014616	GCA	2	6	2135107	2135112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288272
44233	NC_014616	CCAC	2	8	2135119	2135126	25 %	0 %	0 %	75 %	310288272
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44241	NC_014616	CCG	2	6	2135541	2135546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288272
44242	NC_014616	GGC	3	9	2135603	2135611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288272
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44346	NC_014616	GCG	2	6	2140765	2140770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288275
44347	NC_014616	GAT	2	6	2140775	2140780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288275
44348	NC_014616	GCGG	2	8	2140903	2140910	0 %	0 %	75 %	25 %	310288275
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44350	NC_014616	GC	3	6	2141050	2141055	0 %	0 %	50 %	50 %	310288275
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44352	NC_014616	CGA	3	9	2141197	2141205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288275
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44459	NC_014616	CTT	2	6	2146218	2146223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288279
44460	NC_014616	GGC	2	6	2146224	2146229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288279
44461	NC_014616	GAG	2	6	2146303	2146308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288279
44462	NC_014616	CAT	2	6	2146316	2146321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288279
44463	NC_014616	GAT	2	6	2146485	2146490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288279
44464	NC_014616	TGG	2	6	2146496	2146501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288279
44465	NC_014616	GCA	2	6	2146513	2146518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288279
44466	NC_014616	GC	3	6	2146521	2146526	0 %	0 %	50 %	50 %	310288279
44467	NC_014616	CCG	2	6	2146579	2146584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288280
44468	NC_014616	TGA	2	6	2146585	2146590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288280
44469	NC_014616	TGGC	2	8	2146611	2146618	0 %	25 %	50 %	25 %	310288280
44470	NC_014616	GAG	2	6	2146620	2146625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288280
44471	NC_014616	ATC	2	6	2146663	2146668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288280
44472	NC_014616	CGC	2	6	2146703	2146708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288280
44473	NC_014616	CAAT	2	8	2146746	2146753	50 %	25 %	0 %	25 %	310288280
44474	NC_014616	GA	3	6	2146756	2146761	50 %	0 %	50 %	0 %	310288280
44475	NC_014616	CAA	2	6	2146765	2146770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310288280
44476	NC_014616	CTG	3	9	2146816	2146824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288280
44477	NC_014616	CAG	2	6	2146855	2146860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288280
44478	NC_014616	TGA	2	6	2146893	2146898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288280
44479	NC_014616	GTT	2	6	2146932	2146937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288280
44480	NC_014616	TCGG	2	8	2146943	2146950	0 %	25 %	50 %	25 %	310288280
44481	NC_014616	T	6	6	2147023	2147028	0 %	100 %	0 %	0 %	310288280
44482	NC_014616	CGC	2	6	2147103	2147108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288280
44483	NC_014616	CAT	2	6	2147221	2147226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288280
44484	NC_014616	GCCGTC	2	12	2147227	2147238	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310288280
44485	NC_014616	TGT	2	6	2147253	2147258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288280
44486	NC_014616	TC	3	6	2147307	2147312	0 %	50 %	0 %	50 %	310288280
44487	NC_014616	GCA	2	6	2147351	2147356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288280
44488	NC_014616	CGT	2	6	2147403	2147408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288280
44489	NC_014616	TCG	2	6	2147457	2147462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288280
44490	NC_014616	CCA	2	6	2147695	2147700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288281
44491	NC_014616	CAGG	2	8	2147705	2147712	25 %	0 %	50 %	25 %	310288281
44492	NC_014616	GTT	2	6	2147784	2147789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288281
44493	NC_014616	GTG	2	6	2147815	2147820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288281
44494	NC_014616	GTT	2	6	2147829	2147834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288281
44495	NC_014616	TTG	2	6	2147872	2147877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288281
44496	NC_014616	GCCG	2	8	2147880	2147887	0 %	0 %	50 %	50 %	310288281
44497	NC_014616	TTC	2	6	2147920	2147925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288281
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