MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014616	AGC	2	6	151592	151597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3002	NC_014616	CGG	2	6	151601	151606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286665
3003	NC_014616	TCG	2	6	151607	151612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3004	NC_014616	TC	3	6	151632	151637	0 %	50 %	0 %	50 %	310286665
3005	NC_014616	GCT	2	6	151674	151679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3006	NC_014616	TGGG	2	8	151771	151778	0 %	25 %	75 %	0 %	310286665
3007	NC_014616	ATC	2	6	151783	151788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286665
3008	NC_014616	TCG	2	6	151790	151795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3009	NC_014616	ATG	2	6	151798	151803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286665
3010	NC_014616	GGTGTC	2	12	151806	151817	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310286665
3011	NC_014616	CTCGGC	2	12	151840	151851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286665
3012	NC_014616	CGGA	2	8	151902	151909	25 %	0 %	50 %	25 %	310286665
3013	NC_014616	TGC	2	6	151937	151942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3014	NC_014616	CG	3	6	151971	151976	0 %	0 %	50 %	50 %	310286665
3015	NC_014616	TTC	2	6	152077	152082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286665
3016	NC_014616	GGCT	2	8	152125	152132	0 %	25 %	50 %	25 %	310286665
3017	NC_014616	GC	3	6	152135	152140	0 %	0 %	50 %	50 %	310286665
3018	NC_014616	GCT	2	6	152151	152156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3019	NC_014616	GTG	2	6	152206	152211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286665
3020	NC_014616	CTG	2	6	152212	152217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3021	NC_014616	GCC	2	6	152265	152270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286665
3022	NC_014616	TTC	2	6	152272	152277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286665
3023	NC_014616	GAT	2	6	152280	152285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286665
3024	NC_014616	TGT	2	6	152297	152302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286665
3025	NC_014616	CGATG	2	10	152316	152325	20 %	20 %	40 %	20 %	310286665
3026	NC_014616	GCT	2	6	152403	152408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3027	NC_014616	TGC	2	6	152420	152425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
3028	NC_014616	ATC	2	6	152455	152460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286665
3029	NC_014616	CCA	2	6	152474	152479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286665
3030	NC_014616	CGA	2	6	152660	152665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3031	NC_014616	TGC	2	6	152698	152703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3032	NC_014616	CGG	2	6	152743	152748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286666
3033	NC_014616	ACG	3	9	152749	152757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3034	NC_014616	GCC	2	6	152762	152767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286666
3035	NC_014616	GT	3	6	152796	152801	0 %	50 %	50 %	0 %	310286666
3036	NC_014616	ACG	2	6	152803	152808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3037	NC_014616	GCC	3	9	152841	152849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286666
3038	NC_014616	GTG	2	6	152865	152870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286666
3039	NC_014616	CGC	2	6	152894	152899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286666
3040	NC_014616	CG	3	6	152981	152986	0 %	0 %	50 %	50 %	310286666
3041	NC_014616	TGA	2	6	153017	153022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286666
3042	NC_014616	GGC	2	6	153025	153030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286666
3043	NC_014616	GCG	2	6	153121	153126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286666
3044	NC_014616	GAT	2	6	153191	153196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286666
3045	NC_014616	CTGG	2	8	153221	153228	0 %	25 %	50 %	25 %	310286666
3046	NC_014616	GCC	2	6	153240	153245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286666
3047	NC_014616	GCGA	2	8	153333	153340	25 %	0 %	50 %	25 %	310286666
3048	NC_014616	CAG	2	6	153363	153368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3049	NC_014616	CGA	2	6	153374	153379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3050	NC_014616	CGTGC	2	10	153441	153450	0 %	20 %	40 %	40 %	310286666
3051	NC_014616	TGC	2	6	153487	153492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286666
3052	NC_014616	AGG	2	6	153550	153555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286666
3053	NC_014616	CTT	2	6	153665	153670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286666
3054	NC_014616	GCCG	2	8	153787	153794	0 %	0 %	50 %	50 %	310286667
3055	NC_014616	CAT	2	6	153816	153821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286667
3056	NC_014616	TGC	2	6	153843	153848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3057	NC_014616	TGC	2	6	153864	153869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3058	NC_014616	TGCG	2	8	153953	153960	0 %	25 %	50 %	25 %	310286667
3059	NC_014616	CGGC	2	8	153969	153976	0 %	0 %	50 %	50 %	310286667
3060	NC_014616	GTT	2	6	153979	153984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286667
3061	NC_014616	GGTGC	2	10	154025	154034	0 %	20 %	60 %	20 %	310286667
3062	NC_014616	CGAC	2	8	154036	154043	25 %	0 %	25 %	50 %	310286667
3063	NC_014616	TGC	3	9	154056	154064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3064	NC_014616	CGC	2	6	154066	154071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286667
3065	NC_014616	CTG	2	6	154163	154168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3066	NC_014616	TG	3	6	154183	154188	0 %	50 %	50 %	0 %	310286667
3067	NC_014616	GGCGT	2	10	154229	154238	0 %	20 %	60 %	20 %	310286667
3068	NC_014616	GGA	2	6	154271	154276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286667
3069	NC_014616	GCG	2	6	154331	154336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286667
3070	NC_014616	CGG	2	6	154341	154346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286667
3071	NC_014616	CAT	2	6	154405	154410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286667
3072	NC_014616	GC	3	6	154461	154466	0 %	0 %	50 %	50 %	310286667
3073	NC_014616	TGC	2	6	154488	154493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3074	NC_014616	CGC	2	6	154606	154611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286667
3075	NC_014616	CCG	2	6	154620	154625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286667
3076	NC_014616	TCG	2	6	154662	154667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286667
3077	NC_014616	TGA	2	6	154674	154679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286667
3078	NC_014616	CATG	2	8	154971	154978	25 %	25 %	25 %	25 %	310286668
3079	NC_014616	TGT	2	6	155061	155066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286668
3080	NC_014616	GGC	2	6	155089	155094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286668
3081	NC_014616	CGGCG	2	10	155169	155178	0 %	0 %	60 %	40 %	310286668
3082	NC_014616	TCG	3	9	155186	155194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286668
3083	NC_014616	CAT	2	6	155196	155201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286668
3084	NC_014616	TCG	2	6	155276	155281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286668
3085	NC_014616	CGT	2	6	155283	155288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286668
3086	NC_014616	GCT	2	6	155316	155321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286668
3087	NC_014616	CAA	2	6	155401	155406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286668
3088	NC_014616	GAG	2	6	155413	155418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286668
3089	NC_014616	GACG	2	8	155478	155485	25 %	0 %	50 %	25 %	310286668
3090	NC_014616	CG	3	6	155554	155559	0 %	0 %	50 %	50 %	310286668
3091	NC_014616	GGC	2	6	155627	155632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286668
3092	NC_014616	CAT	2	6	155673	155678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286668
3093	NC_014616	GTC	2	6	155938	155943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286669
3094	NC_014616	GCT	2	6	155946	155951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286669
3095	NC_014616	CGG	2	6	156015	156020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286669
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3098	NC_014616	GTG	2	6	156172	156177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286669
3099	NC_014616	CGC	2	6	156198	156203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286669
3100	NC_014616	AGCGC	2	10	156287	156296	20 %	0 %	40 %	40 %	310286669
3101	NC_014616	GC	4	8	156293	156300	0 %	0 %	50 %	50 %	310286669
3102	NC_014616	GAGC	2	8	156410	156417	25 %	0 %	50 %	25 %	310286670
3103	NC_014616	ACA	2	6	156432	156437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286670
3104	NC_014616	AAC	2	6	156438	156443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286670
3105	NC_014616	CGG	2	6	156463	156468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286670
3106	NC_014616	CGGT	2	8	156562	156569	0 %	25 %	50 %	25 %	310286670
3107	NC_014616	CCT	2	6	156595	156600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286670
3108	NC_014616	GT	3	6	156609	156614	0 %	50 %	50 %	0 %	310286670
3109	NC_014616	CGC	2	6	156629	156634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286670
3110	NC_014616	CACGCT	2	12	156680	156691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286670
3111	NC_014616	GGC	2	6	156748	156753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286670
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3113	NC_014616	GACGC	2	10	156780	156789	20 %	0 %	40 %	40 %	310286670
3114	NC_014616	CGC	2	6	156806	156811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286670
3115	NC_014616	AGC	2	6	156817	156822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286670
3116	NC_014616	GCCC	3	12	156836	156847	0 %	0 %	25 %	75 %	310286670
3117	NC_014616	GCC	2	6	156948	156953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286670
3118	NC_014616	CGG	2	6	156969	156974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286670
3119	NC_014616	ACG	2	6	157066	157071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286670
3120	NC_014616	GCG	2	6	157108	157113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286670
3121	NC_014616	GTT	2	6	157118	157123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286670
3122	NC_014616	CG	3	6	157129	157134	0 %	0 %	50 %	50 %	310286670
3123	NC_014616	ATC	2	6	157210	157215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286670
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3142	NC_014616	TGC	2	6	157884	157889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286671
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3230	NC_014616	GCA	2	6	163146	163151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286675
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3232	NC_014616	CGCC	2	8	163266	163273	0 %	0 %	25 %	75 %	310286675
3233	NC_014616	TGA	2	6	163401	163406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286676
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3235	NC_014616	GCATG	2	10	163462	163471	20 %	20 %	40 %	20 %	310286676
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3237	NC_014616	TGC	2	6	163494	163499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286676
3238	NC_014616	AT	3	6	163559	163564	50 %	50 %	0 %	0 %	310286676
3239	NC_014616	CG	3	6	163607	163612	0 %	0 %	50 %	50 %	310286676
3240	NC_014616	CGA	2	6	163654	163659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286676
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3242	NC_014616	GGT	2	6	163777	163782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286676
3243	NC_014616	TCG	2	6	163798	163803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286676
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3350	NC_014616	ACG	2	6	168592	168597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286679
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3359	NC_014616	GGCAAC	2	12	168822	168833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286679
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3361	NC_014616	ACGGCA	2	12	168850	168861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286679
3362	NC_014616	CAA	2	6	168881	168886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286679
3363	NC_014616	CGG	2	6	168899	168904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286679
3364	NC_014616	ATCT	2	8	169323	169330	25 %	50 %	0 %	25 %	310286680
3365	NC_014616	TG	3	6	169342	169347	0 %	50 %	50 %	0 %	310286680
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3469	NC_014616	GGTCT	2	10	173394	173403	0 %	40 %	40 %	20 %	310286682
3470	NC_014616	CG	3	6	173460	173465	0 %	0 %	50 %	50 %	310286682
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3477	NC_014616	CT	3	6	173867	173872	0 %	50 %	0 %	50 %	310286682
3478	NC_014616	CGA	2	6	173912	173917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286682
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3481	NC_014616	CG	4	8	174059	174066	0 %	0 %	50 %	50 %	310286682
3482	NC_014616	CACC	2	8	174090	174097	25 %	0 %	0 %	75 %	310286682
3483	NC_014616	CGA	2	6	174101	174106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286682
3484	NC_014616	CGG	3	9	174158	174166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286682
3485	NC_014616	CAG	2	6	174167	174172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286682
3486	NC_014616	TA	3	6	174927	174932	50 %	50 %	0 %	0 %	310286683
3487	NC_014616	CGA	2	6	174934	174939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3488	NC_014616	GC	3	6	174941	174946	0 %	0 %	50 %	50 %	310286683
3489	NC_014616	GAT	2	6	175067	175072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286683
3490	NC_014616	AGG	2	6	175204	175209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286683
3491	NC_014616	GTAG	2	8	175255	175262	25 %	25 %	50 %	0 %	310286683
3492	NC_014616	TGA	2	6	175333	175338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286683
3493	NC_014616	GA	3	6	175337	175342	50 %	0 %	50 %	0 %	310286683
3494	NC_014616	TCG	2	6	175383	175388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3495	NC_014616	CGA	2	6	175408	175413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286683
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