MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014616	CAT	2	6	549991	549996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286974
11002	NC_014616	AGGTTC	2	12	549997	550008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310286974
11003	NC_014616	GAT	2	6	550025	550030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286974
11004	NC_014616	ATG	2	6	550035	550040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286974
11005	NC_014616	GGC	2	6	550091	550096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11006	NC_014616	ATG	3	9	550187	550195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286974
11007	NC_014616	GCT	2	6	550213	550218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11008	NC_014616	GTCGC	2	10	550219	550228	0 %	20 %	40 %	40 %	310286974
11009	NC_014616	CGA	2	6	550237	550242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11010	NC_014616	GAC	2	6	550243	550248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11011	NC_014616	GGCG	2	8	550267	550274	0 %	0 %	75 %	25 %	310286974
11012	NC_014616	GAAG	2	8	550315	550322	50 %	0 %	50 %	0 %	310286974
11013	NC_014616	CGC	2	6	550330	550335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286974
11014	NC_014616	TCGACA	2	12	550353	550364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310286974
11015	NC_014616	TCG	2	6	550368	550373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11016	NC_014616	GTCG	2	8	550435	550442	0 %	25 %	50 %	25 %	310286974
11017	NC_014616	TCG	2	6	550473	550478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11018	NC_014616	TCATG	2	10	550506	550515	20 %	40 %	20 %	20 %	310286974
11019	NC_014616	AGG	2	6	550539	550544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286974
11020	NC_014616	CGG	2	6	550551	550556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11021	NC_014616	GTG	2	6	550577	550582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286974
11022	NC_014616	TGA	2	6	550584	550589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286974
11023	NC_014616	CCAT	2	8	550590	550597	25 %	25 %	0 %	50 %	310286974
11024	NC_014616	CGCCGT	2	12	550621	550632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286974
11025	NC_014616	CGG	3	9	550705	550713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11026	NC_014616	GTTC	2	8	550754	550761	0 %	50 %	25 %	25 %	310286974
11027	NC_014616	GAC	2	6	550769	550774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11028	NC_014616	ACG	2	6	550833	550838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11029	NC_014616	CGA	3	9	550897	550905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11030	NC_014616	GCA	2	6	550923	550928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11031	NC_014616	CTG	2	6	551006	551011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11032	NC_014616	AAGA	2	8	551054	551061	75 %	0 %	25 %	0 %	310286974
11033	NC_014616	GCT	2	6	551065	551070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11034	NC_014616	TTC	2	6	551357	551362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286974
11035	NC_014616	GTC	2	6	551396	551401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11036	NC_014616	GGA	2	6	551425	551430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286974
11037	NC_014616	GCG	2	6	551442	551447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11038	NC_014616	GGCC	2	8	551457	551464	0 %	0 %	50 %	50 %	310286974
11039	NC_014616	CGG	2	6	551497	551502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11040	NC_014616	CGA	2	6	551530	551535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11041	NC_014616	CTG	2	6	551546	551551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11042	NC_014616	CCG	2	6	551635	551640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286974
11043	NC_014616	CTG	2	6	551654	551659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11044	NC_014616	ACGG	2	8	551664	551671	25 %	0 %	50 %	25 %	310286974
11045	NC_014616	CG	3	6	551760	551765	0 %	0 %	50 %	50 %	310286974
11046	NC_014616	CGC	2	6	551776	551781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286974
11047	NC_014616	TCA	2	6	551820	551825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286974
11048	NC_014616	CAAT	2	8	551843	551850	50 %	25 %	0 %	25 %	310286974
11049	NC_014616	CAG	2	6	551881	551886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11050	NC_014616	CGGC	2	8	551901	551908	0 %	0 %	50 %	50 %	310286974
11051	NC_014616	CTG	2	6	551939	551944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11052	NC_014616	GAAAT	2	10	551963	551972	60 %	20 %	20 %	0 %	310286974
11053	NC_014616	AC	3	6	551976	551981	50 %	0 %	0 %	50 %	310286974
11054	NC_014616	TCG	2	6	552075	552080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11055	NC_014616	CGG	2	6	552139	552144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286974
11056	NC_014616	CGA	2	6	552162	552167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11057	NC_014616	TCG	2	6	552180	552185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11058	NC_014616	GCT	3	9	552259	552267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286974
11059	NC_014616	CTA	2	6	552313	552318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286974
11060	NC_014616	TGAG	2	8	552321	552328	25 %	25 %	50 %	0 %	310286974
11061	NC_014616	TGA	2	6	552331	552336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286974
11062	NC_014616	GC	4	8	552339	552346	0 %	0 %	50 %	50 %	310286974
11063	NC_014616	CG	3	6	552359	552364	0 %	0 %	50 %	50 %	310286974
11064	NC_014616	ACA	2	6	552579	552584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286975
11065	NC_014616	CCA	2	6	552597	552602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286975
11066	NC_014616	CCG	2	6	552621	552626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286975
11067	NC_014616	GGAC	2	8	552663	552670	25 %	0 %	50 %	25 %	310286975
11068	NC_014616	CGT	2	6	552694	552699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286975
11069	NC_014616	GGA	2	6	552715	552720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286975
11070	NC_014616	CGGCAA	2	12	552750	552761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286975
11071	NC_014616	GAG	2	6	552773	552778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286975
11072	NC_014616	GAC	2	6	552830	552835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286975
11073	NC_014616	GCC	2	6	552878	552883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286975
11074	NC_014616	TGC	2	6	552921	552926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286975
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11078	NC_014616	CAAGC	2	10	553028	553037	40 %	0 %	20 %	40 %	310286975
11079	NC_014616	CGC	2	6	553045	553050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286975
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11082	NC_014616	TCG	2	6	553188	553193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286975
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11085	NC_014616	CGC	2	6	553342	553347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286975
11086	NC_014616	CGG	2	6	553356	553361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286975
11087	NC_014616	GAC	2	6	553388	553393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286975
11088	NC_014616	CAG	2	6	553444	553449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286976
11089	NC_014616	TCGCA	2	10	553460	553469	20 %	20 %	20 %	40 %	310286976
11090	NC_014616	GAT	2	6	553551	553556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286976
11091	NC_014616	TCGCCG	2	12	553637	553648	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286976
11092	NC_014616	CG	3	6	553665	553670	0 %	0 %	50 %	50 %	310286976
11093	NC_014616	GCG	2	6	553692	553697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286976
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11101	NC_014616	CCCG	2	8	554058	554065	0 %	0 %	25 %	75 %	310286976
11102	NC_014616	CGT	2	6	554082	554087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286976
11103	NC_014616	CGC	2	6	554088	554093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286976
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11109	NC_014616	GCT	2	6	554478	554483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286976
11110	NC_014616	GC	3	6	554617	554622	0 %	0 %	50 %	50 %	310286976
11111	NC_014616	ACC	2	6	554650	554655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286976
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11113	NC_014616	ATG	2	6	554731	554736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286976
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11118	NC_014616	AAT	2	6	555870	555875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310286979
11119	NC_014616	CGG	3	9	555908	555916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286979
11120	NC_014616	GGCG	2	8	555942	555949	0 %	0 %	75 %	25 %	310286979
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11126	NC_014616	TA	3	6	556368	556373	50 %	50 %	0 %	0 %	310286980
11127	NC_014616	ACGG	2	8	556398	556405	25 %	0 %	50 %	25 %	310286980
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11142	NC_014616	GC	3	6	556896	556901	0 %	0 %	50 %	50 %	310286980
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11222	NC_014616	GAT	2	6	560189	560194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286982
11223	NC_014616	GTC	2	6	560202	560207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286982
11224	NC_014616	CAT	2	6	560225	560230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286982
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11226	NC_014616	CG	3	6	560513	560518	0 %	0 %	50 %	50 %	310286983
11227	NC_014616	ACG	2	6	560535	560540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286983
11228	NC_014616	ATC	2	6	560607	560612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286983
11229	NC_014616	ACG	2	6	560617	560622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286983
11230	NC_014616	GCC	2	6	560680	560685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286983
11231	NC_014616	CG	3	6	560804	560809	0 %	0 %	50 %	50 %	310286983
11232	NC_014616	AGG	2	6	560917	560922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286983
11233	NC_014616	CGA	2	6	560927	560932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286983
11234	NC_014616	TCA	2	6	560935	560940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286983
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11236	NC_014616	CAC	2	6	561062	561067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286983
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11467	NC_014616	TCG	2	6	571501	571506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286991
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11473	NC_014616	CGC	2	6	571805	571810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286991
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