MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014616	GCC	2	6	503172	503177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10002	NC_014616	GCC	2	6	503214	503219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10003	NC_014616	AGA	2	6	503251	503256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286948
10004	NC_014616	GAC	2	6	503274	503279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286948
10005	NC_014616	CGG	2	6	503288	503293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286948
10006	NC_014616	ATC	2	6	503313	503318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286948
10007	NC_014616	GGT	2	6	503319	503324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286948
10008	NC_014616	CCG	2	6	503332	503337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10009	NC_014616	CGC	2	6	503338	503343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10010	NC_014616	CGC	2	6	503372	503377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10011	NC_014616	AAG	2	6	503409	503414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286948
10012	NC_014616	CGT	2	6	503519	503524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286948
10013	NC_014616	CAA	2	6	503561	503566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286948
10014	NC_014616	CGC	2	6	503639	503644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286948
10015	NC_014616	TCG	2	6	503647	503652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286948
10016	NC_014616	ACA	2	6	503686	503691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286948
10017	NC_014616	ACC	2	6	503710	503715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286948
10018	NC_014616	GGTTC	2	10	503722	503731	0 %	40 %	40 %	20 %	310286948
10019	NC_014616	GAA	2	6	503753	503758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286948
10020	NC_014616	CAAG	2	8	503818	503825	50 %	0 %	25 %	25 %	310286948
10021	NC_014616	GAC	2	6	503888	503893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286948
10022	NC_014616	CGG	2	6	503903	503908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286948
10023	NC_014616	ACGCAG	2	12	503934	503945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286948
10024	NC_014616	ACGAC	2	10	503947	503956	40 %	0 %	20 %	40 %	310286948
10025	NC_014616	CGG	2	6	503960	503965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286948
10026	NC_014616	GGC	2	6	503979	503984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286948
10027	NC_014616	ACC	2	6	503988	503993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286948
10028	NC_014616	GAA	3	9	504307	504315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286949
10029	NC_014616	GGC	2	6	504323	504328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10030	NC_014616	GCG	2	6	504366	504371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10031	NC_014616	GCC	2	6	504397	504402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286949
10032	NC_014616	CGG	2	6	504417	504422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10033	NC_014616	CG	3	6	504473	504478	0 %	0 %	50 %	50 %	310286949
10034	NC_014616	ATC	2	6	504497	504502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286949
10035	NC_014616	CGC	2	6	504540	504545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286949
10036	NC_014616	ACG	2	6	504564	504569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286949
10037	NC_014616	CGC	2	6	504577	504582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286949
10038	NC_014616	TCG	2	6	504594	504599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286949
10039	NC_014616	GGC	2	6	504625	504630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10040	NC_014616	GCT	2	6	504669	504674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286949
10041	NC_014616	CGG	2	6	504715	504720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10042	NC_014616	CG	4	8	504771	504778	0 %	0 %	50 %	50 %	310286949
10043	NC_014616	GTGCG	2	10	504834	504843	0 %	20 %	60 %	20 %	310286949
10044	NC_014616	GCG	2	6	504872	504877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10045	NC_014616	GC	3	6	504922	504927	0 %	0 %	50 %	50 %	310286949
10046	NC_014616	CGG	2	6	504937	504942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10047	NC_014616	CTG	2	6	504968	504973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286949
10048	NC_014616	GCT	2	6	505018	505023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286949
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10050	NC_014616	CGTG	2	8	505089	505096	0 %	25 %	50 %	25 %	310286949
10051	NC_014616	AGC	2	6	505101	505106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286949
10052	NC_014616	GATG	2	8	505120	505127	25 %	25 %	50 %	0 %	310286949
10053	NC_014616	CGG	2	6	505135	505140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286949
10054	NC_014616	CAT	2	6	505141	505146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286949
10055	NC_014616	CGC	2	6	505213	505218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286949
10056	NC_014616	ACC	3	9	505226	505234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286949
10057	NC_014616	TGCG	2	8	505275	505282	0 %	25 %	50 %	25 %	310286949
10058	NC_014616	GC	3	6	505342	505347	0 %	0 %	50 %	50 %	310286949
10059	NC_014616	CGC	3	9	505345	505353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286949
10060	NC_014616	GAG	2	6	505547	505552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286950
10061	NC_014616	CGC	2	6	505553	505558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286950
10062	NC_014616	CTG	2	6	505583	505588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286950
10063	NC_014616	TGA	2	6	505612	505617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286950
10064	NC_014616	CTG	2	6	505658	505663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286950
10065	NC_014616	CGC	2	6	505675	505680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286950
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10068	NC_014616	GCC	2	6	505772	505777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286950
10069	NC_014616	CTG	2	6	505784	505789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286950
10070	NC_014616	TTG	2	6	505896	505901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286950
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10073	NC_014616	AGT	2	6	506074	506079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286950
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10076	NC_014616	GTGC	2	8	506121	506128	0 %	25 %	50 %	25 %	310286950
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10078	NC_014616	CGT	2	6	506203	506208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286950
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10084	NC_014616	GCG	2	6	506470	506475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286950
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10086	NC_014616	TGA	2	6	506557	506562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286950
10087	NC_014616	GGT	2	6	506591	506596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286950
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10089	NC_014616	CACG	2	8	506659	506666	25 %	0 %	25 %	50 %	310286950
10090	NC_014616	A	6	6	506669	506674	100 %	0 %	0 %	0 %	310286950
10091	NC_014616	CGG	2	6	506710	506715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286950
10092	NC_014616	TTGGT	2	10	506807	506816	0 %	60 %	40 %	0 %	310286950
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10094	NC_014616	TC	3	6	506972	506977	0 %	50 %	0 %	50 %	310286951
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10101	NC_014616	CAC	2	6	507293	507298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286951
10102	NC_014616	GGC	2	6	507425	507430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286951
10103	NC_014616	GAT	2	6	507443	507448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286951
10104	NC_014616	GACC	2	8	507476	507483	25 %	0 %	25 %	50 %	310286951
10105	NC_014616	GTT	2	6	507512	507517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286951
10106	NC_014616	TCA	2	6	507544	507549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286951
10107	NC_014616	CGA	2	6	507551	507556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286951
10108	NC_014616	AC	3	6	507629	507634	50 %	0 %	0 %	50 %	310286951
10109	NC_014616	GAA	2	6	507636	507641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286951
10110	NC_014616	AGTG	2	8	507642	507649	25 %	25 %	50 %	0 %	310286951
10111	NC_014616	GACG	2	8	507730	507737	25 %	0 %	50 %	25 %	310286952
10112	NC_014616	CTT	2	6	507741	507746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286952
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10115	NC_014616	CCGC	2	8	507923	507930	0 %	0 %	25 %	75 %	310286952
10116	NC_014616	CCG	2	6	507947	507952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286952
10117	NC_014616	CG	3	6	507987	507992	0 %	0 %	50 %	50 %	310286952
10118	NC_014616	CGT	3	9	508044	508052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286952
10119	NC_014616	GAA	2	6	508137	508142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286952
10120	NC_014616	GCCG	2	8	508150	508157	0 %	0 %	50 %	50 %	310286952
10121	NC_014616	GCCG	2	8	508197	508204	0 %	0 %	50 %	50 %	310286952
10122	NC_014616	GTT	2	6	508231	508236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286952
10123	NC_014616	CCG	2	6	508256	508261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286952
10124	NC_014616	CGG	2	6	508428	508433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286952
10125	NC_014616	CAT	2	6	508449	508454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286952
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10128	NC_014616	GCCG	2	8	508518	508525	0 %	0 %	50 %	50 %	310286952
10129	NC_014616	CCGC	2	8	508526	508533	0 %	0 %	25 %	75 %	310286952
10130	NC_014616	CCTCG	2	10	508611	508620	0 %	20 %	20 %	60 %	310286952
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10135	NC_014616	TTC	2	6	508762	508767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286952
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10211	NC_014616	ATC	2	6	512177	512182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286955
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10215	NC_014616	CAT	2	6	512275	512280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286955
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10217	NC_014616	ATG	3	9	512297	512305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286955
10218	NC_014616	TCG	2	6	512307	512312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286955
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10223	NC_014616	GAT	2	6	512492	512497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286956
10224	NC_014616	GCT	2	6	512543	512548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286956
10225	NC_014616	GCG	2	6	512556	512561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286956
10226	NC_014616	ACA	2	6	512584	512589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286956
10227	NC_014616	CTAC	2	8	512605	512612	25 %	25 %	0 %	50 %	310286956
10228	NC_014616	GGCGA	2	10	512634	512643	20 %	0 %	60 %	20 %	310286956
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10230	NC_014616	GCC	2	6	512769	512774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286956
10231	NC_014616	CGG	2	6	512798	512803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286956
10232	NC_014616	GAG	2	6	512841	512846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286956
10233	NC_014616	CTG	2	6	512847	512852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286956
10234	NC_014616	CGCT	2	8	512856	512863	0 %	25 %	25 %	50 %	310286956
10235	NC_014616	CGTC	2	8	512899	512906	0 %	25 %	25 %	50 %	310286956
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10237	NC_014616	CAT	2	6	512963	512968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286956
10238	NC_014616	CGC	2	6	512978	512983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286956
10239	NC_014616	GC	3	6	512982	512987	0 %	0 %	50 %	50 %	310286956
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10241	NC_014616	TCG	2	6	513022	513027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286956
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10341	NC_014616	CGCAG	2	10	518951	518960	20 %	0 %	40 %	40 %	310286961
10342	NC_014616	CCCG	2	8	518963	518970	0 %	0 %	25 %	75 %	310286961
10343	NC_014616	GC	3	6	519005	519010	0 %	0 %	50 %	50 %	310286961
10344	NC_014616	TG	3	6	519035	519040	0 %	50 %	50 %	0 %	310286961
10345	NC_014616	CGG	2	6	519077	519082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286961
10346	NC_014616	GCC	2	6	519083	519088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286961
10347	NC_014616	CCCG	2	8	519110	519117	0 %	0 %	25 %	75 %	310286961
10348	NC_014616	ACCG	2	8	519136	519143	25 %	0 %	25 %	50 %	310286961
10349	NC_014616	CAT	2	6	519156	519161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286961
10350	NC_014616	GC	3	6	519174	519179	0 %	0 %	50 %	50 %	310286961
10351	NC_014616	CCTC	2	8	519251	519258	0 %	25 %	0 %	75 %	310286961
10352	NC_014616	GAC	2	6	519259	519264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286961
10353	NC_014616	CGT	2	6	519469	519474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286962
10354	NC_014616	ACG	2	6	519484	519489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286962
10355	NC_014616	CGC	2	6	519503	519508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286962
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10357	NC_014616	CTG	2	6	519602	519607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286962
10358	NC_014616	CG	3	6	519622	519627	0 %	0 %	50 %	50 %	310286962
10359	NC_014616	GAA	2	6	519646	519651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286962
10360	NC_014616	GCG	2	6	519657	519662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286962
10361	NC_014616	CGG	2	6	519702	519707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286962
10362	NC_014616	CTGC	2	8	519778	519785	0 %	25 %	25 %	50 %	310286962
10363	NC_014616	GTC	2	6	519814	519819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286962
10364	NC_014616	GCT	2	6	519874	519879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286962
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10458	NC_014616	GCC	2	6	524629	524634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
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10473	NC_014616	CCGTC	2	10	525177	525186	0 %	20 %	20 %	60 %	310286964
10474	NC_014616	CCGC	2	8	525201	525208	0 %	0 %	25 %	75 %	310286964
10475	NC_014616	CTG	2	6	525262	525267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10476	NC_014616	ACT	2	6	525281	525286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286964
10477	NC_014616	TCG	3	9	525302	525310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10478	NC_014616	TCA	2	6	525380	525385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286964
10479	NC_014616	TCG	2	6	525437	525442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10480	NC_014616	TGC	2	6	525500	525505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10481	NC_014616	AAGGC	2	10	525566	525575	40 %	0 %	40 %	20 %	310286964
10482	NC_014616	GCC	2	6	525585	525590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
10483	NC_014616	CGCT	2	8	525679	525686	0 %	25 %	25 %	50 %	310286964
10484	NC_014616	ACA	2	6	525701	525706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286964
10485	NC_014616	CCG	2	6	525716	525721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
10486	NC_014616	CGT	2	6	525729	525734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10487	NC_014616	TAC	2	6	525769	525774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286964
10488	NC_014616	GAC	2	6	525777	525782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10489	NC_014616	TGC	2	6	525908	525913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10490	NC_014616	CGT	2	6	525942	525947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10491	NC_014616	CGT	2	6	525972	525977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10492	NC_014616	ACG	2	6	525995	526000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10493	NC_014616	AAG	4	12	526087	526098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286964
10494	NC_014616	TCG	2	6	526109	526114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10495	NC_014616	GCC	2	6	526150	526155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
10496	NC_014616	CGT	2	6	526227	526232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286964
10497	NC_014616	GCC	2	6	526236	526241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
10498	NC_014616	GAG	3	9	526270	526278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286964
10499	NC_014616	CGC	2	6	526330	526335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286964
10500	NC_014616	ATC	2	6	526342	526347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286964

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