MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014616	GC	3	6	25440	25445	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
502	NC_014616	TGC	2	6	25499	25504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
503	NC_014616	CCG	2	6	25508	25513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
504	NC_014616	TTG	2	6	25526	25531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
505	NC_014616	GTCG	2	8	25540	25547	0 %	25 %	50 %	25 %	310286543
506	NC_014616	CGGC	2	8	25598	25605	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
507	NC_014616	CTG	2	6	25612	25617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
508	NC_014616	CGT	2	6	25654	25659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
509	NC_014616	CGCGCC	2	12	25738	25749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
510	NC_014616	CGG	2	6	25776	25781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
511	NC_014616	GAT	2	6	25789	25794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
512	NC_014616	GTC	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
513	NC_014616	GCT	2	6	25828	25833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
514	NC_014616	GCC	2	6	25837	25842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
515	NC_014616	GTT	2	6	25843	25848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
516	NC_014616	GCCG	2	8	25864	25871	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
517	NC_014616	GGT	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
518	NC_014616	GGCGTC	2	12	25933	25944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310286543
519	NC_014616	GCT	2	6	25982	25987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
520	NC_014616	GCC	2	6	25997	26002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
521	NC_014616	GTGAT	2	10	26037	26046	20 %	40 %	40 %	0 %	310286543
522	NC_014616	GAT	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286544
523	NC_014616	GAT	2	6	26976	26981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286544
524	NC_014616	GCG	2	6	26988	26993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
525	NC_014616	TGG	2	6	27028	27033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286544
526	NC_014616	CGT	2	6	27179	27184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
527	NC_014616	CGG	2	6	27185	27190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
528	NC_014616	ATC	2	6	27234	27239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
529	NC_014616	GC	3	6	27247	27252	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
530	NC_014616	CTA	2	6	27305	27310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
531	NC_014616	CG	3	6	27322	27327	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
532	NC_014616	GTACAA	2	12	27380	27391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310286544
533	NC_014616	CGA	2	6	27428	27433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
534	NC_014616	CAT	2	6	27479	27484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
535	NC_014616	CGA	2	6	27491	27496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
536	NC_014616	GC	3	6	27502	27507	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
537	NC_014616	CG	3	6	27571	27576	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
538	NC_014616	CAC	2	6	27645	27650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286544
539	NC_014616	GCG	2	6	27745	27750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
540	NC_014616	CGC	2	6	27798	27803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
541	NC_014616	GCT	2	6	27941	27946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
542	NC_014616	TCG	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
543	NC_014616	CGG	2	6	28027	28032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
544	NC_014616	GCT	2	6	28049	28054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
545	NC_014616	CGA	2	6	28064	28069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
546	NC_014616	AAC	2	6	28077	28082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286544
547	NC_014616	CG	3	6	28094	28099	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
548	NC_014616	GC	3	6	28201	28206	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
549	NC_014616	GCG	2	6	28252	28257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
550	NC_014616	GAA	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286544
551	NC_014616	CTG	2	6	28273	28278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
552	NC_014616	ATGCCG	2	12	28285	28296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286544
553	NC_014616	CCG	3	9	28294	28302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
554	NC_014616	GTC	2	6	28305	28310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
555	NC_014616	GCC	2	6	28323	28328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
556	NC_014616	CGA	2	6	28373	28378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
557	NC_014616	GGT	2	6	28386	28391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286544
558	NC_014616	GC	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
559	NC_014616	GCG	2	6	28423	28428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
560	NC_014616	GGC	2	6	28488	28493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
561	NC_014616	GCC	2	6	28515	28520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
562	NC_014616	GACG	2	8	28578	28585	25 %	0 %	50 %	25 %	310286544
563	NC_014616	CTG	2	6	28668	28673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
564	NC_014616	TGA	2	6	28688	28693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286544
565	NC_014616	TGC	2	6	28708	28713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
566	NC_014616	CGC	2	6	28723	28728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
567	NC_014616	CG	3	6	28737	28742	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
568	NC_014616	GCT	2	6	28760	28765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
569	NC_014616	GCC	3	9	28788	28796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
570	NC_014616	GCC	2	6	28848	28853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
571	NC_014616	GCG	2	6	28898	28903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
572	NC_014616	TCA	2	6	28912	28917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
573	NC_014616	CG	3	6	28941	28946	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
574	NC_014616	CGGAAT	2	12	29080	29091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310286544
575	NC_014616	TCG	3	9	29624	29632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
576	NC_014616	GCG	2	6	29694	29699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
577	NC_014616	TGC	2	6	29730	29735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
578	NC_014616	TGA	2	6	29748	29753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286545
579	NC_014616	CGG	2	6	29785	29790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
580	NC_014616	CGA	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286545
581	NC_014616	GCG	2	6	29805	29810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
582	NC_014616	GCC	2	6	29822	29827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286545
583	NC_014616	TGACCT	2	12	29850	29861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310286545
584	NC_014616	TCG	2	6	29918	29923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
585	NC_014616	CGT	2	6	29979	29984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
586	NC_014616	TCA	2	6	30036	30041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286545
587	NC_014616	CGG	2	6	30084	30089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
588	NC_014616	TCG	2	6	30182	30187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
589	NC_014616	GCG	2	6	30291	30296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
590	NC_014616	ACC	2	6	30302	30307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286545
591	NC_014616	CGG	2	6	30320	30325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
592	NC_014616	GTC	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286545
593	NC_014616	CAG	3	9	30379	30387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286545
594	NC_014616	GTCG	2	8	30448	30455	0 %	25 %	50 %	25 %	310286545
595	NC_014616	ATG	2	6	30464	30469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286545
596	NC_014616	GGC	2	6	30508	30513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
597	NC_014616	CCG	2	6	30540	30545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286545
598	NC_014616	TGT	2	6	30567	30572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286545
599	NC_014616	GCG	2	6	30583	30588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
600	NC_014616	CG	3	6	30624	30629	0 %	0 %	50 %	50 %	310286545
601	NC_014616	GCG	2	6	30635	30640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
602	NC_014616	TGG	2	6	31099	31104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286546
603	NC_014616	CAC	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286546
604	NC_014616	GAT	2	6	31139	31144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286546
605	NC_014616	TCGCGC	2	12	31192	31203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286546
606	NC_014616	CCCG	2	8	31207	31214	0 %	0 %	25 %	75 %	310286546
607	NC_014616	CAA	2	6	31277	31282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286546
608	NC_014616	AAG	2	6	31383	31388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286546
609	NC_014616	ATGTCA	2	12	31663	31674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310286547
610	NC_014616	CCG	2	6	31735	31740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286547
611	NC_014616	CAC	3	9	31763	31771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286547
612	NC_014616	TCA	2	6	31783	31788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286547
613	NC_014616	CGA	2	6	31805	31810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286547
614	NC_014616	TCA	2	6	31938	31943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
615	NC_014616	CAT	2	6	31981	31986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
616	NC_014616	AGCGC	2	10	32013	32022	20 %	0 %	40 %	40 %	310286548
617	NC_014616	GGC	2	6	32050	32055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286548
618	NC_014616	CGT	2	6	32089	32094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286548
619	NC_014616	GC	3	6	32142	32147	0 %	0 %	50 %	50 %	310286548
620	NC_014616	CGT	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286548
621	NC_014616	CCA	2	6	32160	32165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
622	NC_014616	TCA	2	6	32172	32177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
623	NC_014616	CCAG	2	8	32190	32197	25 %	0 %	25 %	50 %	310286548
624	NC_014616	CCT	2	6	32205	32210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286548
625	NC_014616	CAT	2	6	32218	32223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
626	NC_014616	TGC	3	9	32244	32252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286548
627	NC_014616	CG	3	6	32254	32259	0 %	0 %	50 %	50 %	310286548
628	NC_014616	CCA	2	6	32293	32298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
629	NC_014616	CCA	2	6	32313	32318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
630	NC_014616	GTG	2	6	32327	32332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286548
631	NC_014616	ACC	2	6	32355	32360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
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633	NC_014616	ATC	2	6	32375	32380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
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642	NC_014616	CCA	2	6	32691	32696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
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653	NC_014616	GGT	2	6	33059	33064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286548
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656	NC_014616	GCCG	2	8	33118	33125	0 %	0 %	50 %	50 %	310286548
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660	NC_014616	CGC	3	9	33277	33285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286548
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741	NC_014616	CGTTG	2	10	37176	37185	0 %	40 %	40 %	20 %	310286552
742	NC_014616	CAG	2	6	37200	37205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286552
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744	NC_014616	GC	3	6	37339	37344	0 %	0 %	50 %	50 %	310286552
745	NC_014616	CGA	2	6	37361	37366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286552
746	NC_014616	CGT	2	6	37388	37393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286552
747	NC_014616	CGTGTT	2	12	37425	37436	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310286552
748	NC_014616	CTC	2	6	37452	37457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286552
749	NC_014616	GAT	2	6	37539	37544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286552
750	NC_014616	GAT	2	6	37665	37670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286552
751	NC_014616	TGG	2	6	37685	37690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286552
752	NC_014616	GCG	2	6	37699	37704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286552
753	NC_014616	ACG	2	6	37732	37737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286552
754	NC_014616	CGA	2	6	37758	37763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286552
755	NC_014616	TTG	2	6	37828	37833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286552
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759	NC_014616	CGG	2	6	38241	38246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286553
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772	NC_014616	GCA	2	6	39104	39109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286554
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775	NC_014616	GAT	2	6	39284	39289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286554
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