MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014616	CAG	2	6	256917	256922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5002	NC_014616	GAT	2	6	256962	256967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286742
5003	NC_014616	GC	3	6	257003	257008	0 %	0 %	50 %	50 %	310286742
5004	NC_014616	GTC	2	6	257041	257046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5005	NC_014616	CGG	2	6	257073	257078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286742
5006	NC_014616	TGG	2	6	257141	257146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286742
5007	NC_014616	GGC	2	6	257157	257162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286742
5008	NC_014616	TCG	2	6	257180	257185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5009	NC_014616	AGC	2	6	257230	257235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5010	NC_014616	AGT	2	6	257291	257296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286742
5011	NC_014616	GTA	2	6	257301	257306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286742
5012	NC_014616	TGC	2	6	257308	257313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5013	NC_014616	GATGGT	2	12	257319	257330	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	310286742
5014	NC_014616	GCA	2	6	257402	257407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286742
5015	NC_014616	CCG	2	6	257419	257424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286742
5016	NC_014616	ACC	2	6	257895	257900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286743
5017	NC_014616	TGT	2	6	257944	257949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286743
5018	NC_014616	CCG	2	6	258088	258093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286743
5019	NC_014616	GAG	2	6	258138	258143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286743
5020	NC_014616	TCA	2	6	258154	258159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286743
5021	NC_014616	GC	3	6	258223	258228	0 %	0 %	50 %	50 %	310286743
5022	NC_014616	ATC	2	6	258360	258365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286743
5023	NC_014616	GTC	2	6	258366	258371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286743
5024	NC_014616	CTG	2	6	258405	258410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286743
5025	NC_014616	GCG	2	6	258528	258533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286743
5026	NC_014616	GAGT	2	8	258540	258547	25 %	25 %	50 %	0 %	310286743
5027	NC_014616	GCG	2	6	258863	258868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286744
5028	NC_014616	GAC	2	6	258995	259000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5029	NC_014616	GTC	2	6	259053	259058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5030	NC_014616	TCG	2	6	259068	259073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5031	NC_014616	CGC	2	6	259084	259089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5032	NC_014616	ACG	2	6	259101	259106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5033	NC_014616	ACT	2	6	259116	259121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286744
5034	NC_014616	GAT	2	6	259181	259186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286744
5035	NC_014616	GCC	2	6	259241	259246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5036	NC_014616	GCC	2	6	259253	259258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5037	NC_014616	GGT	2	6	259259	259264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286744
5038	NC_014616	GCC	3	9	259265	259273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5039	NC_014616	GCC	2	6	259277	259282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5040	NC_014616	TGC	2	6	259294	259299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5041	NC_014616	ACGGTG	2	12	259340	259351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310286744
5042	NC_014616	TGC	2	6	259365	259370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5043	NC_014616	GATC	2	8	259375	259382	25 %	25 %	25 %	25 %	310286744
5044	NC_014616	CG	4	8	259395	259402	0 %	0 %	50 %	50 %	310286744
5045	NC_014616	AGC	2	6	259473	259478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5046	NC_014616	GTC	2	6	259480	259485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5047	NC_014616	TGA	2	6	259488	259493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286744
5048	NC_014616	ACG	3	9	259512	259520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5049	NC_014616	GAGT	2	8	259567	259574	25 %	25 %	50 %	0 %	310286744
5050	NC_014616	GAC	2	6	259589	259594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5051	NC_014616	GCC	2	6	259607	259612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5052	NC_014616	AGG	2	6	259635	259640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286744
5053	NC_014616	CAA	2	6	259651	259656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286744
5054	NC_014616	CGC	2	6	259666	259671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286744
5055	NC_014616	CGA	2	6	259690	259695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286744
5056	NC_014616	CGT	3	9	260008	260016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5057	NC_014616	GTC	2	6	260030	260035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5058	NC_014616	GAG	2	6	260042	260047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286745
5059	NC_014616	TGA	2	6	260065	260070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286745
5060	NC_014616	CAG	3	9	260075	260083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286745
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5063	NC_014616	GGC	2	6	260222	260227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286745
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5065	NC_014616	GGCG	2	8	260254	260261	0 %	0 %	75 %	25 %	310286745
5066	NC_014616	CGA	2	6	260398	260403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286745
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5068	NC_014616	TGA	2	6	260461	260466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286745
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5072	NC_014616	GCCGAT	2	12	260534	260545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5073	NC_014616	CGAT	2	8	260638	260645	25 %	25 %	25 %	25 %	310286745
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5080	NC_014616	GCG	2	6	261086	261091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286746
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5089	NC_014616	GGC	2	6	261351	261356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286746
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5091	NC_014616	CGA	2	6	261461	261466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286746
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5102	NC_014616	TTC	2	6	262558	262563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286747
5103	NC_014616	GGACG	2	10	262569	262578	20 %	0 %	60 %	20 %	310286747
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5112	NC_014616	ACG	2	6	262940	262945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286747
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5115	NC_014616	CGG	2	6	263066	263071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286747
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5117	NC_014616	GATGT	2	10	263199	263208	20 %	40 %	40 %	0 %	310286747
5118	NC_014616	CGC	2	6	264394	264399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286748
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5120	NC_014616	GTT	2	6	264774	264779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286749
5121	NC_014616	CGG	2	6	264804	264809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286749
5122	NC_014616	GCTG	2	8	264890	264897	0 %	25 %	50 %	25 %	310286749
5123	NC_014616	GGC	2	6	264928	264933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286749
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5162	NC_014616	TTG	2	6	266697	266702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286750
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5225	NC_014616	GGCG	2	8	271521	271528	0 %	0 %	75 %	25 %	310286754
5226	NC_014616	GAC	2	6	271651	271656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286754
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5228	NC_014616	CCA	2	6	271784	271789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286754
5229	NC_014616	GC	3	6	271791	271796	0 %	0 %	50 %	50 %	310286754
5230	NC_014616	CGC	3	9	271794	271802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286754
5231	NC_014616	CGA	2	6	271902	271907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286754
5232	NC_014616	GCC	2	6	271918	271923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286754
5233	NC_014616	TCG	2	6	271970	271975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286754
5234	NC_014616	CG	3	6	271988	271993	0 %	0 %	50 %	50 %	310286754
5235	NC_014616	GAAG	2	8	272010	272017	50 %	0 %	50 %	0 %	310286754
5236	NC_014616	GCT	2	6	272066	272071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286754
5237	NC_014616	CGCA	2	8	272170	272177	25 %	0 %	25 %	50 %	310286754
5238	NC_014616	CGCC	2	8	272186	272193	0 %	0 %	25 %	75 %	310286754
5239	NC_014616	CGC	3	9	272196	272204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286754
5240	NC_014616	TCG	2	6	272227	272232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286754
5241	NC_014616	CCG	2	6	272234	272239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286754
5242	NC_014616	CAC	2	6	272408	272413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286755
5243	NC_014616	GGCGTG	2	12	272421	272432	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310286755
5244	NC_014616	ATC	2	6	272466	272471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286755
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5246	NC_014616	CG	3	6	272626	272631	0 %	0 %	50 %	50 %	310286755
5247	NC_014616	GTG	2	6	272670	272675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286755
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5263	NC_014616	GGGC	2	8	273055	273062	0 %	0 %	75 %	25 %	310286755
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5290	NC_014616	TACG	2	8	274351	274358	25 %	25 %	25 %	25 %	310286756
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5295	NC_014616	CGGGCG	2	12	274605	274616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286756
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5324	NC_014616	CGCTG	2	10	275671	275680	0 %	20 %	40 %	40 %	310286756
5325	NC_014616	CGA	2	6	275764	275769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
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5329	NC_014616	GC	3	6	275977	275982	0 %	0 %	50 %	50 %	310286756
5330	NC_014616	CAG	2	6	275987	275992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
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5332	NC_014616	CGGCCG	2	12	276036	276047	0 %	0 %	50 %	50 %	310286756
5333	NC_014616	CGA	2	6	276052	276057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
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5339	NC_014616	GCTCG	2	10	276298	276307	0 %	20 %	40 %	40 %	310286756
5340	NC_014616	GCG	2	6	276348	276353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286756
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5342	NC_014616	TCGT	2	8	276380	276387	0 %	50 %	25 %	25 %	310286756
5343	NC_014616	TCA	2	6	276456	276461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286756
5344	NC_014616	AGC	2	6	276480	276485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5345	NC_014616	AGC	3	9	276507	276515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5346	NC_014616	TGC	2	6	276605	276610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5347	NC_014616	CCG	2	6	276675	276680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286756
5348	NC_014616	CAG	2	6	276692	276697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5349	NC_014616	GC	3	6	276728	276733	0 %	0 %	50 %	50 %	310286756
5350	NC_014616	CAT	2	6	276763	276768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286756
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5352	NC_014616	GCCG	2	8	276794	276801	0 %	0 %	50 %	50 %	310286756
5353	NC_014616	TCT	2	6	276813	276818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286756
5354	NC_014616	GAA	2	6	276904	276909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286756
5355	NC_014616	TGG	2	6	276924	276929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286756
5356	NC_014616	CGACG	2	10	276943	276952	20 %	0 %	40 %	40 %	310286756
5357	NC_014616	GTG	2	6	277033	277038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286756
5358	NC_014616	GAG	2	6	277136	277141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286756
5359	NC_014616	GCA	2	6	277161	277166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5360	NC_014616	AGAC	2	8	277167	277174	50 %	0 %	25 %	25 %	310286756
5361	NC_014616	TCC	2	6	277202	277207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286756
5362	NC_014616	GAC	2	6	277241	277246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5363	NC_014616	CTG	2	6	277256	277261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286756
5364	NC_014616	TGA	2	6	277340	277345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286757
5365	NC_014616	GCGT	2	8	277346	277353	0 %	25 %	50 %	25 %	310286757
5366	NC_014616	AAG	2	6	277354	277359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286757
5367	NC_014616	TGA	2	6	277361	277366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286757
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5369	NC_014616	TGT	2	6	277434	277439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286757
5370	NC_014616	TGCCG	2	10	277440	277449	0 %	20 %	40 %	40 %	310286757
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5382	NC_014616	CAT	2	6	278865	278870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286758
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5384	NC_014616	CGG	2	6	278973	278978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286758
5385	NC_014616	GAT	2	6	279009	279014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286758
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5389	NC_014616	ACA	2	6	279176	279181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286758
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5392	NC_014616	TGC	2	6	279431	279436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286758
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5445	NC_014616	GCC	2	6	282012	282017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286760
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5461	NC_014616	TGCA	2	8	282832	282839	25 %	25 %	25 %	25 %	310286761
5462	NC_014616	CAG	2	6	282855	282860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286761
5463	NC_014616	GCATC	2	10	282878	282887	20 %	20 %	20 %	40 %	310286761
5464	NC_014616	GAT	2	6	282918	282923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286761
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5468	NC_014616	CAG	2	6	283260	283265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286761
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5472	NC_014616	GCC	2	6	283393	283398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286761
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5476	NC_014616	CTGA	2	8	283488	283495	25 %	25 %	25 %	25 %	310286761
5477	NC_014616	GCA	2	6	283538	283543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286761
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5479	NC_014616	GAT	2	6	283623	283628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286761
5480	NC_014616	CGG	3	9	283637	283645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286761
5481	NC_014616	CGAGCG	2	12	283655	283666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310286761
5482	NC_014616	CGG	2	6	283676	283681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286761
5483	NC_014616	CGC	2	6	283683	283688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286761
5484	NC_014616	GCG	2	6	283710	283715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286761
5485	NC_014616	CGC	2	6	283736	283741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286761
5486	NC_014616	ATC	2	6	283759	283764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286761
5487	NC_014616	ACGA	2	8	283768	283775	50 %	0 %	25 %	25 %	310286761
5488	NC_014616	GGAT	2	8	283784	283791	25 %	25 %	50 %	0 %	310286761
5489	NC_014616	GCA	2	6	283847	283852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286761
5490	NC_014616	CGA	2	6	283886	283891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286761
5491	NC_014616	TTGCGG	2	12	283941	283952	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310286761
5492	NC_014616	GTG	2	6	284026	284031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286761
5493	NC_014616	TGG	2	6	284036	284041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286761
5494	NC_014616	GCC	2	6	284285	284290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286762
5495	NC_014616	TTG	2	6	284297	284302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286762
5496	NC_014616	CGG	2	6	284305	284310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286762
5497	NC_014616	CGCTGC	2	12	284311	284322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286762
5498	NC_014616	CAT	2	6	284339	284344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286762
5499	NC_014616	CCGT	2	8	284346	284353	0 %	25 %	25 %	50 %	310286762
5500	NC_014616	TGG	2	6	284407	284412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286762

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