MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 2

Total Repeats: 64467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014540	CTCA	2	8	1083	1090	25 %	25 %	0 %	50 %	307725551
2	NC_014540	CTG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
3	NC_014540	GAT	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
4	NC_014540	GGT	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725551
5	NC_014540	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725551
6	NC_014540	GTA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
7	NC_014540	TCG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
8	NC_014540	TGATCG	2	12	1332	1343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307725551
9	NC_014540	GCAG	2	8	1425	1432	25 %	0 %	50 %	25 %	307725551
10	NC_014540	GCTC	2	8	1446	1453	0 %	25 %	25 %	50 %	307725551
11	NC_014540	GAG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307725551
12	NC_014540	TTC	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725551
13	NC_014540	GGCG	2	8	1486	1493	0 %	0 %	75 %	25 %	307725551
14	NC_014540	TGA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725551
15	NC_014540	CGT	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725551
16	NC_014540	ACC	3	9	1619	1627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725551
17	NC_014540	GCG	2	6	1691	1696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725551
18	NC_014540	CG	3	6	1730	1735	0 %	0 %	50 %	50 %	307725551
19	NC_014540	CTT	2	6	1785	1790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725551
20	NC_014540	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725551
21	NC_014540	GCC	2	6	1881	1886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725551
22	NC_014540	CGC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725551
23	NC_014540	CATG	2	8	2141	2148	25 %	25 %	25 %	25 %	307725552
24	NC_014540	CGGG	2	8	2200	2207	0 %	0 %	75 %	25 %	307725552
25	NC_014540	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307725552
26	NC_014540	GC	3	6	2254	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	307725552
27	NC_014540	TGCG	2	8	2305	2312	0 %	25 %	50 %	25 %	307725552
28	NC_014540	GAAG	2	8	2381	2388	50 %	0 %	50 %	0 %	307725552
29	NC_014540	TCA	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
30	NC_014540	CGT	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725552
31	NC_014540	TCA	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
32	NC_014540	CGT	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725552
33	NC_014540	CG	3	6	2591	2596	0 %	0 %	50 %	50 %	307725552
34	NC_014540	GGC	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725552
35	NC_014540	CAG	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725552
36	NC_014540	ACG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725552
37	NC_014540	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
38	NC_014540	CGC	2	6	2809	2814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
39	NC_014540	GTTCCT	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307725552
40	NC_014540	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725552
41	NC_014540	ATC	2	6	2880	2885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725552
42	NC_014540	CGG	2	6	2894	2899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725552
43	NC_014540	AAC	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725553
44	NC_014540	GGC	2	6	3036	3041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725553
45	NC_014540	TGCA	2	8	3044	3051	25 %	25 %	25 %	25 %	307725553
46	NC_014540	CCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725553
47	NC_014540	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725553
48	NC_014540	GCG	2	6	3180	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725553
49	NC_014540	CAG	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
50	NC_014540	GAA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
51	NC_014540	CAG	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
52	NC_014540	GT	3	6	3380	3385	0 %	50 %	50 %	0 %	307725553
53	NC_014540	GAA	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
54	NC_014540	ATC	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725553
55	NC_014540	ACA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725553
56	NC_014540	CG	3	6	3566	3571	0 %	0 %	50 %	50 %	307725553
57	NC_014540	GAC	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
58	NC_014540	CGA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
59	NC_014540	GAC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
60	NC_014540	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725553
61	NC_014540	GCGA	2	8	3817	3824	25 %	0 %	50 %	25 %	307725553
62	NC_014540	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725553
63	NC_014540	TTC	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725553
64	NC_014540	GC	3	6	3863	3868	0 %	0 %	50 %	50 %	307725553
65	NC_014540	CAG	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725553
66	NC_014540	GC	3	6	4098	4103	0 %	0 %	50 %	50 %	307725554
67	NC_014540	CTGC	2	8	4104	4111	0 %	25 %	25 %	50 %	307725554
68	NC_014540	CGT	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725554
69	NC_014540	TAGC	2	8	4151	4158	25 %	25 %	25 %	25 %	307725554
70	NC_014540	CGG	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725554
71	NC_014540	CGG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725554
72	NC_014540	CGAA	2	8	4308	4315	50 %	0 %	25 %	25 %	307725554
73	NC_014540	AAC	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725554
74	NC_014540	ACC	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
75	NC_014540	CCA	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
76	NC_014540	GCCT	2	8	4919	4926	0 %	25 %	25 %	50 %	307725555
77	NC_014540	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
78	NC_014540	CTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725555
79	NC_014540	GCA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
80	NC_014540	GTC	2	6	4973	4978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725555
81	NC_014540	GCAG	2	8	5014	5021	25 %	0 %	50 %	25 %	307725555
82	NC_014540	CTC	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307725555
83	NC_014540	ACGC	2	8	5051	5058	25 %	0 %	25 %	50 %	307725555
84	NC_014540	GCG	2	6	5080	5085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725555
85	NC_014540	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725555
86	NC_014540	GCC	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
87	NC_014540	CGG	2	6	5170	5175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725555
88	NC_014540	CGC	2	6	5176	5181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
89	NC_014540	GCC	2	6	5208	5213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
90	NC_014540	GCC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725555
91	NC_014540	CCTGC	2	10	5278	5287	0 %	20 %	20 %	60 %	307725555
92	NC_014540	CGGC	2	8	5303	5310	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
93	NC_014540	ACG	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
94	NC_014540	CG	3	6	5405	5410	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
95	NC_014540	CGA	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725555
96	NC_014540	GTCG	2	8	5453	5460	0 %	25 %	50 %	25 %	307725555
97	NC_014540	CCA	2	6	5462	5467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
98	NC_014540	CGAT	2	8	5499	5506	25 %	25 %	25 %	25 %	307725555
99	NC_014540	CTG	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725555
100	NC_014540	ATC	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725555
101	NC_014540	GGT	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725555
102	NC_014540	ACC	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725555
103	NC_014540	CGGC	2	8	5676	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	307725555
104	NC_014540	CGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725556
105	NC_014540	CGG	2	6	6356	6361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725556
106	NC_014540	GTG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725556
107	NC_014540	GCT	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725556
108	NC_014540	GGC	2	6	6387	6392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725556
109	NC_014540	CAG	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725556
110	NC_014540	CCGAA	2	10	6461	6470	40 %	0 %	20 %	40 %	307725556
111	NC_014540	CGAG	2	8	6503	6510	25 %	0 %	50 %	25 %	307725556
112	NC_014540	TTC	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725556
113	NC_014540	GC	3	6	6572	6577	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
114	NC_014540	CTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725556
115	NC_014540	AGCG	2	8	6585	6592	25 %	0 %	50 %	25 %	307725556
116	NC_014540	CAC	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725556
117	NC_014540	ACG	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725556
118	NC_014540	CG	4	8	6707	6714	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
119	NC_014540	ATGC	2	8	6731	6738	25 %	25 %	25 %	25 %	307725556
120	NC_014540	CGA	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725556
121	NC_014540	CG	3	6	6780	6785	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
122	NC_014540	CCT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307725556
123	NC_014540	GTCG	2	8	6822	6829	0 %	25 %	50 %	25 %	307725556
124	NC_014540	CGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725556
125	NC_014540	GAT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725556
126	NC_014540	TTC	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307725556
127	NC_014540	GCG	2	6	6900	6905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725556
128	NC_014540	TCG	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725556
129	NC_014540	CG	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
130	NC_014540	GC	3	6	6938	6943	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
131	NC_014540	CGCA	2	8	6949	6956	25 %	0 %	25 %	50 %	307725556
132	NC_014540	CTG	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725556
133	NC_014540	GC	3	6	6997	7002	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
134	NC_014540	CCG	2	6	7015	7020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725556
135	NC_014540	GC	3	6	7031	7036	0 %	0 %	50 %	50 %	307725556
136	NC_014540	GCC	2	6	7107	7112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725556
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138	NC_014540	GCCGC	2	10	7134	7143	0 %	0 %	40 %	60 %	307725556
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249	NC_014540	CG	3	6	11533	11538	0 %	0 %	50 %	50 %	307725561
250	NC_014540	GA	3	6	11545	11550	50 %	0 %	50 %	0 %	307725561
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261	NC_014540	CGA	3	9	12049	12057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725561
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263	NC_014540	CG	3	6	12101	12106	0 %	0 %	50 %	50 %	307725561
264	NC_014540	CCG	2	6	12108	12113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725561
265	NC_014540	GGC	2	6	12191	12196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725561
266	NC_014540	GC	3	6	12336	12341	0 %	0 %	50 %	50 %	307725561
267	NC_014540	GAT	2	6	12614	12619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307725561
268	NC_014540	GCC	3	9	12620	12628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725561
269	NC_014540	GAC	2	6	12726	12731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725562
270	NC_014540	GCC	2	6	12743	12748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725562
271	NC_014540	GC	3	6	12784	12789	0 %	0 %	50 %	50 %	307725562
272	NC_014540	GC	3	6	12811	12816	0 %	0 %	50 %	50 %	307725562
273	NC_014540	GGT	2	6	12852	12857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307725562
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275	NC_014540	CGA	2	6	12909	12914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725562
276	NC_014540	GCG	2	6	12915	12920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725562
277	NC_014540	CGA	2	6	13189	13194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725562
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279	NC_014540	GCG	2	6	13295	13300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725562
280	NC_014540	CAGC	2	8	13345	13352	25 %	0 %	25 %	50 %	307725562
281	NC_014540	AGCGCC	2	12	13373	13384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	307725562
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288	NC_014540	TTG	2	6	13841	13846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307725563
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292	NC_014540	GCA	2	6	14124	14129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725563
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294	NC_014540	GC	3	6	14186	14191	0 %	0 %	50 %	50 %	307725563
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299	NC_014540	GCG	2	6	14315	14320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725563
300	NC_014540	CGA	2	6	14331	14336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725563
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304	NC_014540	CGT	2	6	14932	14937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725564
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342	NC_014540	CGG	2	6	16327	16332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725565
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352	NC_014540	CGGC	2	8	16799	16806	0 %	0 %	50 %	50 %	307725565
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374	NC_014540	GAC	3	9	17884	17892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725566
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379	NC_014540	CGC	2	6	18165	18170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725566
380	NC_014540	AGC	2	6	18220	18225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725567
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382	NC_014540	GCC	3	9	18324	18332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725567
383	NC_014540	AGA	2	6	18334	18339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307725567
384	NC_014540	ACA	2	6	18389	18394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725567
385	NC_014540	GCA	2	6	18473	18478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725567
386	NC_014540	CCG	3	9	18508	18516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307725567
387	NC_014540	ATC	2	6	18517	18522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725567
388	NC_014540	CAC	2	6	18531	18536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307725567
389	NC_014540	ATC	2	6	18586	18591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307725567
390	NC_014540	ACGGC	2	10	18611	18620	20 %	0 %	40 %	40 %	307725567
391	NC_014540	GCA	2	6	18638	18643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725567
392	NC_014540	CAA	2	6	18663	18668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307725567
393	NC_014540	TGC	2	6	18692	18697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725567
394	NC_014540	GCA	2	6	18700	18705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725567
395	NC_014540	CGA	2	6	18719	18724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725567
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414	NC_014540	CGA	2	6	19615	19620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307725568
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424	NC_014540	CGT	2	6	19951	19956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307725568
425	NC_014540	CG	3	6	19961	19966	0 %	0 %	50 %	50 %	307725568
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430	NC_014540	CG	3	6	20105	20110	0 %	0 %	50 %	50 %	307725568
431	NC_014540	ATCG	2	8	20130	20137	25 %	25 %	25 %	25 %	307725568
432	NC_014540	TCGCG	2	10	20293	20302	0 %	20 %	40 %	40 %	307725568
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495	NC_014540	GCG	3	9	22565	22573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307725570
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