MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 70369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
2	NC_014330	AGA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
3	NC_014330	ATTA	2	8	1249	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
4	NC_014330	A	6	6	1320	1325	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
5	NC_014330	TA	3	6	1341	1346	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
6	NC_014330	A	6	6	1407	1412	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
7	NC_014330	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
8	NC_014330	AGA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
9	NC_014330	TTGGGG	2	12	1510	1521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
10	NC_014330	ATA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
11	NC_014330	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
12	NC_014330	AAAT	2	8	1573	1580	75 %	25 %	0 %	0 %	300869641
13	NC_014330	ATT	3	9	1611	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
14	NC_014330	AT	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
15	NC_014330	AT	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
16	NC_014330	TAG	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
17	NC_014330	AATAA	2	10	1802	1811	80 %	20 %	0 %	0 %	300869641
18	NC_014330	TA	3	6	1839	1844	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
19	NC_014330	T	8	8	1911	1918	0 %	100 %	0 %	0 %	300869641
20	NC_014330	ATA	2	6	1940	1945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
21	NC_014330	A	9	9	1947	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
22	NC_014330	TA	3	6	1956	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
23	NC_014330	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
24	NC_014330	AGA	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
25	NC_014330	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
26	NC_014330	TAGA	2	8	2082	2089	50 %	25 %	25 %	0 %	300869641
27	NC_014330	AGCA	2	8	2103	2110	50 %	0 %	25 %	25 %	300869641
28	NC_014330	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
29	NC_014330	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
30	NC_014330	A	7	7	2187	2193	100 %	0 %	0 %	0 %	300869641
31	NC_014330	TGA	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
32	NC_014330	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
33	NC_014330	AAATT	2	10	2246	2255	60 %	40 %	0 %	0 %	300869641
34	NC_014330	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
35	NC_014330	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
36	NC_014330	TGA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
37	NC_014330	AT	3	6	2305	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	300869641
38	NC_014330	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
39	NC_014330	TAA	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
40	NC_014330	TGG	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
41	NC_014330	AAG	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
42	NC_014330	AGACC	10	50	2432	2481	40 %	0 %	20 %	40 %	300869641
43	NC_014330	TAA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
44	NC_014330	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
45	NC_014330	ATA	2	6	2632	2637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
46	NC_014330	TGG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869642
47	NC_014330	A	6	6	2685	2690	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
48	NC_014330	A	7	7	2697	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
49	NC_014330	AGA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
50	NC_014330	AAAAT	2	10	2729	2738	80 %	20 %	0 %	0 %	300869642
51	NC_014330	TAA	2	6	2781	2786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
52	NC_014330	A	6	6	2785	2790	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
53	NC_014330	A	6	6	2799	2804	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
54	NC_014330	ATTT	2	8	2812	2819	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
55	NC_014330	T	6	6	2856	2861	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
56	NC_014330	AT	3	6	2865	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
57	NC_014330	GTTTT	2	10	2932	2941	0 %	80 %	20 %	0 %	300869642
58	NC_014330	T	6	6	2938	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
59	NC_014330	AT	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
60	NC_014330	ATT	3	9	2990	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
61	NC_014330	AGA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
62	NC_014330	T	7	7	3015	3021	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
63	NC_014330	ATT	3	9	3053	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
64	NC_014330	TAA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
65	NC_014330	A	6	6	3110	3115	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
66	NC_014330	AG	3	6	3155	3160	50 %	0 %	50 %	0 %	300869642
67	NC_014330	AAT	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
68	NC_014330	TA	3	6	3176	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
69	NC_014330	TA	3	6	3189	3194	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
70	NC_014330	TA	3	6	3221	3226	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
71	NC_014330	T	7	7	3237	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
72	NC_014330	TAA	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
73	NC_014330	ATT	2	6	3302	3307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
74	NC_014330	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
75	NC_014330	ATTTTA	2	12	3320	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
76	NC_014330	ATATA	2	10	3429	3438	60 %	40 %	0 %	0 %	300869642
77	NC_014330	GTA	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
78	NC_014330	AGA	3	9	3465	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
79	NC_014330	TAA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
80	NC_014330	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	300869642
81	NC_014330	ATA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
82	NC_014330	ATT	2	6	3543	3548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
83	NC_014330	TTAT	2	8	3549	3556	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
84	NC_014330	TAA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
85	NC_014330	AGT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
86	NC_014330	GGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869642
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88	NC_014330	T	6	6	3768	3773	0 %	100 %	0 %	0 %	300869642
89	NC_014330	AT	3	6	3794	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
90	NC_014330	TTAA	2	8	3832	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	300869642
91	NC_014330	ATTT	2	8	3846	3853	25 %	75 %	0 %	0 %	300869642
92	NC_014330	TTTA	2	8	4033	4040	25 %	75 %	0 %	0 %	300869643
93	NC_014330	TA	4	8	4099	4106	50 %	50 %	0 %	0 %	300869643
94	NC_014330	TCA	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869643
95	NC_014330	TAT	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
96	NC_014330	A	7	7	4172	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
97	NC_014330	TCT	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869643
98	NC_014330	A	6	6	4243	4248	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
99	NC_014330	ATA	2	6	4290	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869643
100	NC_014330	AAG	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
101	NC_014330	AGG	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869643
102	NC_014330	A	6	6	4392	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
103	NC_014330	T	6	6	4420	4425	0 %	100 %	0 %	0 %	300869643
104	NC_014330	TGC	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869643
105	NC_014330	ATT	2	6	4461	4466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
106	NC_014330	TTTC	2	8	4481	4488	0 %	75 %	0 %	25 %	300869643
107	NC_014330	TAG	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869643
108	NC_014330	TAT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
109	NC_014330	TATTT	2	10	4558	4567	20 %	80 %	0 %	0 %	300869643
110	NC_014330	AGA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
111	NC_014330	TAT	2	6	4639	4644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
112	NC_014330	GAT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869643
113	NC_014330	TA	4	8	4779	4786	50 %	50 %	0 %	0 %	300869643
114	NC_014330	A	7	7	4790	4796	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
115	NC_014330	T	6	6	4798	4803	0 %	100 %	0 %	0 %	300869643
116	NC_014330	A	8	8	4811	4818	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
117	NC_014330	AGA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
118	NC_014330	TA	3	6	4832	4837	50 %	50 %	0 %	0 %	300869643
119	NC_014330	GA	3	6	4847	4852	50 %	0 %	50 %	0 %	300869643
120	NC_014330	A	7	7	4852	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
121	NC_014330	A	6	6	4866	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
122	NC_014330	A	6	6	4914	4919	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
123	NC_014330	A	6	6	4921	4926	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
124	NC_014330	A	7	7	4940	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
125	NC_014330	TTA	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
126	NC_014330	A	6	6	5057	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	300869643
127	NC_014330	ATA	2	6	5079	5084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869643
128	NC_014330	ATAA	2	8	5104	5111	75 %	25 %	0 %	0 %	300869643
129	NC_014330	A	7	7	5352	5358	100 %	0 %	0 %	0 %	300869644
130	NC_014330	TGC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869644
131	NC_014330	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869644
132	NC_014330	TAT	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869644
133	NC_014330	AG	4	8	5573	5580	50 %	0 %	50 %	0 %	300869644
134	NC_014330	CTA	2	6	5608	5613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869644
135	NC_014330	AGA	2	6	5642	5647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869644
136	NC_014330	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869644
137	NC_014330	TAC	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869644
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139	NC_014330	TAA	2	6	5717	5722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869644
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404	NC_014330	AT	3	6	14900	14905	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
405	NC_014330	TAA	2	6	14907	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869654
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411	NC_014330	TCA	2	6	15061	15066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
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454	NC_014330	AGTT	2	8	15887	15894	25 %	50 %	25 %	0 %	300869654
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489	NC_014330	A	6	6	17132	17137	100 %	0 %	0 %	0 %	300869655
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