MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_014150	TAG	2	6	1812866	1812871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47003	NC_014150	T	7	7	1812888	1812894	0 %	100 %	0 %	0 %	296126613
47004	NC_014150	CTG	2	6	1812914	1812919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296126613
47005	NC_014150	TTC	2	6	1812929	1812934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296126613
47006	NC_014150	TTA	2	6	1812973	1812978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47007	NC_014150	CTT	2	6	1813034	1813039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296126613
47008	NC_014150	TGCT	2	8	1813109	1813116	0 %	50 %	25 %	25 %	296126613
47009	NC_014150	TCA	2	6	1813129	1813134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126613
47010	NC_014150	ATG	2	6	1813227	1813232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47011	NC_014150	AT	3	6	1813257	1813262	50 %	50 %	0 %	0 %	296126613
47012	NC_014150	A	7	7	1813293	1813299	100 %	0 %	0 %	0 %	296126613
47013	NC_014150	T	6	6	1813326	1813331	0 %	100 %	0 %	0 %	296126613
47014	NC_014150	AGT	2	6	1813332	1813337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47015	NC_014150	AAG	2	6	1813385	1813390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296126613
47016	NC_014150	ACAGTA	2	12	1813402	1813413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296126613
47017	NC_014150	CAA	2	6	1813451	1813456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296126613
47018	NC_014150	AAAGG	2	10	1813457	1813466	60 %	0 %	40 %	0 %	296126613
47019	NC_014150	GTA	2	6	1813483	1813488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47020	NC_014150	AGA	2	6	1813539	1813544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296126613
47021	NC_014150	AGA	2	6	1813571	1813576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296126613
47022	NC_014150	AT	3	6	1813577	1813582	50 %	50 %	0 %	0 %	296126613
47023	NC_014150	ACA	2	6	1813591	1813596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296126613
47024	NC_014150	CCA	2	6	1813607	1813612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296126613
47025	NC_014150	ATACCA	2	12	1813615	1813626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296126613
47026	NC_014150	ATA	2	6	1813648	1813653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296126613
47027	NC_014150	AGT	2	6	1813659	1813664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47028	NC_014150	AAT	2	6	1813695	1813700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296126613
47029	NC_014150	TAT	2	6	1813722	1813727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47030	NC_014150	ATAA	2	8	1813748	1813755	75 %	25 %	0 %	0 %	296126613
47031	NC_014150	TAT	2	6	1813764	1813769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47032	NC_014150	ATT	2	6	1813821	1813826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47033	NC_014150	TCTTT	2	10	1813893	1813902	0 %	80 %	0 %	20 %	296126613
47034	NC_014150	CAG	2	6	1813961	1813966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296126613
47035	NC_014150	TAA	2	6	1813982	1813987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296126613
47036	NC_014150	TCA	2	6	1813999	1814004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126613
47037	NC_014150	TAG	2	6	1814018	1814023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47038	NC_014150	TAT	2	6	1814048	1814053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47039	NC_014150	CAA	2	6	1814069	1814074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296126613
47040	NC_014150	ATC	2	6	1814085	1814090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126613
47041	NC_014150	AGT	2	6	1814109	1814114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47042	NC_014150	CCT	2	6	1814266	1814271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296126613
47043	NC_014150	TGT	2	6	1814393	1814398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296126613
47044	NC_014150	CAT	2	6	1814432	1814437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126613
47045	NC_014150	TCTA	2	8	1814457	1814464	25 %	50 %	0 %	25 %	296126613
47046	NC_014150	CT	3	6	1814469	1814474	0 %	50 %	0 %	50 %	296126613
47047	NC_014150	CTT	2	6	1814540	1814545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296126613
47048	NC_014150	CCT	2	6	1814561	1814566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296126613
47049	NC_014150	ATT	2	6	1814571	1814576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47050	NC_014150	TGA	2	6	1814580	1814585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47051	NC_014150	ATT	2	6	1814599	1814604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126613
47052	NC_014150	CTT	2	6	1814624	1814629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296126613
47053	NC_014150	AGT	2	6	1814649	1814654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126613
47054	NC_014150	TAA	2	6	1814663	1814668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296126613
47055	NC_014150	ATAA	2	8	1814800	1814807	75 %	25 %	0 %	0 %	296126613
47056	NC_014150	AATA	2	8	1814847	1814854	75 %	25 %	0 %	0 %	296126614
47057	NC_014150	TAT	2	6	1814856	1814861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126614
47058	NC_014150	TAT	2	6	1814868	1814873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126614
47059	NC_014150	TAG	2	6	1814892	1814897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126614
47060	NC_014150	TTG	3	9	1814898	1814906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296126614
47061	NC_014150	AGC	3	9	1814914	1814922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296126614
47062	NC_014150	TGT	2	6	1814935	1814940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296126614
47063	NC_014150	GTTT	2	8	1814942	1814949	0 %	75 %	25 %	0 %	296126614
47064	NC_014150	AGT	2	6	1814953	1814958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126614
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47067	NC_014150	GCA	2	6	1814990	1814995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296126614
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47069	NC_014150	AT	3	6	1815059	1815064	50 %	50 %	0 %	0 %	296126614
47070	NC_014150	TAG	2	6	1815072	1815077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126614
47071	NC_014150	TCTAT	2	10	1815086	1815095	20 %	60 %	0 %	20 %	296126614
47072	NC_014150	T	6	6	1815110	1815115	0 %	100 %	0 %	0 %	296126614
47073	NC_014150	AAC	2	6	1815136	1815141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296126614
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47083	NC_014150	TTA	2	6	1815416	1815421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296126614
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47088	NC_014150	AGT	3	9	1815661	1815669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296126614
47089	NC_014150	GCATAA	2	12	1815701	1815712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296126614
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47091	NC_014150	CTTC	2	8	1815770	1815777	0 %	50 %	0 %	50 %	296126614
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47094	NC_014150	CAG	2	6	1815849	1815854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296126614
47095	NC_014150	GCT	2	6	1815893	1815898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296126614
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47097	NC_014150	T	6	6	1815926	1815931	0 %	100 %	0 %	0 %	296126614
47098	NC_014150	T	6	6	1815946	1815951	0 %	100 %	0 %	0 %	296126614
47099	NC_014150	ACAAA	2	10	1815972	1815981	80 %	0 %	0 %	20 %	296126614
47100	NC_014150	ATA	2	6	1815987	1815992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296126614
47101	NC_014150	T	8	8	1816011	1816018	0 %	100 %	0 %	0 %	296126614
47102	NC_014150	ATC	2	6	1816019	1816024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126614
47103	NC_014150	AT	3	6	1816082	1816087	50 %	50 %	0 %	0 %	296126615
47104	NC_014150	AAGC	2	8	1816099	1816106	50 %	0 %	25 %	25 %	296126615
47105	NC_014150	TAC	2	6	1816121	1816126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296126615
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47107	NC_014150	CCT	2	6	1816161	1816166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296126615
47108	NC_014150	GCT	2	6	1816200	1816205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296126615
47109	NC_014150	CTG	2	6	1816272	1816277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296126615
47110	NC_014150	ACTT	2	8	1816310	1816317	25 %	50 %	0 %	25 %	296126615
47111	NC_014150	TTC	2	6	1816343	1816348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296126615
47112	NC_014150	AGA	2	6	1816364	1816369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296126615
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47114	NC_014150	T	6	6	1816440	1816445	0 %	100 %	0 %	0 %	296126615
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47342	NC_014150	AAAT	2	8	1825266	1825273	75 %	25 %	0 %	0 %	296126622
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