MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014150	CTG	2	6	112389	112394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125148
3002	NC_014150	GAA	2	6	112398	112403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125148
3003	NC_014150	TCT	2	6	112407	112412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125148
3004	NC_014150	CTT	3	9	112429	112437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125148
3005	NC_014150	T	8	8	112436	112443	0 %	100 %	0 %	0 %	296125148
3006	NC_014150	CAG	3	9	112465	112473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125148
3007	NC_014150	AAG	2	6	112598	112603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125148
3008	NC_014150	CTT	2	6	112641	112646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125148
3009	NC_014150	TAA	2	6	112655	112660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125148
3010	NC_014150	ACTC	2	8	112681	112688	25 %	25 %	0 %	50 %	296125148
3011	NC_014150	TAG	2	6	112690	112695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125148
3012	NC_014150	TAT	2	6	112774	112779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125148
3013	NC_014150	TAA	2	6	112784	112789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125148
3014	NC_014150	AAAT	2	8	112846	112853	75 %	25 %	0 %	0 %	296125148
3015	NC_014150	TCA	2	6	112854	112859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125148
3016	NC_014150	A	6	6	112937	112942	100 %	0 %	0 %	0 %	296125149
3017	NC_014150	AAC	2	6	112948	112953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125149
3018	NC_014150	T	7	7	113022	113028	0 %	100 %	0 %	0 %	296125149
3019	NC_014150	TGT	2	6	113044	113049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125149
3020	NC_014150	TAA	2	6	113100	113105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125149
3021	NC_014150	TTA	2	6	113142	113147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125149
3022	NC_014150	GTA	2	6	113189	113194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125149
3023	NC_014150	ATTA	2	8	113317	113324	50 %	50 %	0 %	0 %	296125150
3024	NC_014150	AAAT	2	8	113357	113364	75 %	25 %	0 %	0 %	296125150
3025	NC_014150	CTA	2	6	113377	113382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125150
3026	NC_014150	T	7	7	113388	113394	0 %	100 %	0 %	0 %	296125150
3027	NC_014150	T	6	6	113411	113416	0 %	100 %	0 %	0 %	296125150
3028	NC_014150	TGA	2	6	113512	113517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125150
3029	NC_014150	TTA	2	6	113603	113608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3030	NC_014150	CTT	2	6	113668	113673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125151
3031	NC_014150	CTTT	2	8	113703	113710	0 %	75 %	0 %	25 %	296125151
3032	NC_014150	AAT	2	6	113778	113783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3033	NC_014150	TAT	2	6	113840	113845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3034	NC_014150	TCA	2	6	113919	113924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125151
3035	NC_014150	TTA	3	9	113949	113957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3036	NC_014150	ATA	2	6	113958	113963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3037	NC_014150	TTAC	2	8	113985	113992	25 %	50 %	0 %	25 %	296125151
3038	NC_014150	TG	3	6	114017	114022	0 %	50 %	50 %	0 %	296125151
3039	NC_014150	CTG	2	6	114032	114037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125151
3040	NC_014150	TTA	2	6	114057	114062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3041	NC_014150	GCC	2	6	114078	114083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296125151
3042	NC_014150	TAG	2	6	114133	114138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125151
3043	NC_014150	CT	3	6	114153	114158	0 %	50 %	0 %	50 %	296125151
3044	NC_014150	ATT	2	6	114176	114181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3045	NC_014150	AT	3	6	114184	114189	50 %	50 %	0 %	0 %	296125151
3046	NC_014150	T	7	7	114195	114201	0 %	100 %	0 %	0 %	296125151
3047	NC_014150	TTC	2	6	114281	114286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125151
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3049	NC_014150	TATT	2	8	114327	114334	25 %	75 %	0 %	0 %	296125151
3050	NC_014150	AAT	2	6	114393	114398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3051	NC_014150	AT	3	6	114450	114455	50 %	50 %	0 %	0 %	296125151
3052	NC_014150	TTG	2	6	114463	114468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125151
3053	NC_014150	TA	3	6	114522	114527	50 %	50 %	0 %	0 %	296125151
3054	NC_014150	TTC	2	6	114548	114553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125151
3055	NC_014150	ACA	2	6	114591	114596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125151
3056	NC_014150	TCA	2	6	114597	114602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125151
3057	NC_014150	TAA	2	6	114617	114622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3058	NC_014150	TAA	2	6	114693	114698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3059	NC_014150	CTA	2	6	114742	114747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125151
3060	NC_014150	TCTG	2	8	114753	114760	0 %	50 %	25 %	25 %	296125151
3061	NC_014150	CT	3	6	114776	114781	0 %	50 %	0 %	50 %	296125151
3062	NC_014150	CAT	2	6	114791	114796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125151
3063	NC_014150	TAT	2	6	114820	114825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3064	NC_014150	ATA	2	6	114837	114842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3065	NC_014150	ATATT	2	10	114847	114856	40 %	60 %	0 %	0 %	296125151
3066	NC_014150	ATT	2	6	114884	114889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3067	NC_014150	ATA	2	6	114915	114920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
3068	NC_014150	ATG	2	6	115050	115055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125151
3069	NC_014150	TC	3	6	115066	115071	0 %	50 %	0 %	50 %	296125151
3070	NC_014150	ATT	2	6	115107	115112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
3071	NC_014150	AGCA	2	8	115145	115152	50 %	0 %	25 %	25 %	296125151
3072	NC_014150	ATC	2	6	115274	115279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125151
3073	NC_014150	TTC	2	6	115286	115291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125151
3074	NC_014150	T	7	7	115308	115314	0 %	100 %	0 %	0 %	296125151
3075	NC_014150	TTA	2	6	115326	115331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125151
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3079	NC_014150	AAT	2	6	115483	115488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125151
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3082	NC_014150	CTT	2	6	115941	115946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125152
3083	NC_014150	CTG	2	6	115947	115952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125152
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3089	NC_014150	TCT	2	6	116130	116135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125152
3090	NC_014150	TAAA	2	8	116170	116177	75 %	25 %	0 %	0 %	296125152
3091	NC_014150	AT	3	6	116327	116332	50 %	50 %	0 %	0 %	296125152
3092	NC_014150	A	6	6	116363	116368	100 %	0 %	0 %	0 %	296125152
3093	NC_014150	CATA	2	8	116383	116390	50 %	25 %	0 %	25 %	296125152
3094	NC_014150	CTC	2	6	116440	116445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125152
3095	NC_014150	TGC	2	6	116453	116458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125152
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3099	NC_014150	AAT	2	6	116530	116535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125152
3100	NC_014150	AAC	2	6	116609	116614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125152
3101	NC_014150	AT	3	6	116616	116621	50 %	50 %	0 %	0 %	296125152
3102	NC_014150	TACA	2	8	116729	116736	50 %	25 %	0 %	25 %	296125152
3103	NC_014150	TGA	2	6	116741	116746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125152
3104	NC_014150	T	8	8	116785	116792	0 %	100 %	0 %	0 %	296125152
3105	NC_014150	T	7	7	116813	116819	0 %	100 %	0 %	0 %	296125152
3106	NC_014150	AT	3	6	116840	116845	50 %	50 %	0 %	0 %	296125152
3107	NC_014150	TCA	2	6	116856	116861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125152
3108	NC_014150	ATTT	2	8	116893	116900	25 %	75 %	0 %	0 %	296125152
3109	NC_014150	TA	3	6	116915	116920	50 %	50 %	0 %	0 %	296125152
3110	NC_014150	TAA	3	9	116951	116959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125152
3111	NC_014150	ATT	2	6	116966	116971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125152
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3113	NC_014150	ATT	2	6	117035	117040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125152
3114	NC_014150	TAAC	2	8	117109	117116	50 %	25 %	0 %	25 %	296125152
3115	NC_014150	AT	3	6	117133	117138	50 %	50 %	0 %	0 %	296125152
3116	NC_014150	TAAA	2	8	117142	117149	75 %	25 %	0 %	0 %	296125152
3117	NC_014150	TTTA	2	8	117158	117165	25 %	75 %	0 %	0 %	296125152
3118	NC_014150	AAT	2	6	117193	117198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125152
3119	NC_014150	T	6	6	117241	117246	0 %	100 %	0 %	0 %	296125152
3120	NC_014150	ATT	2	6	117296	117301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125152
3121	NC_014150	A	7	7	117326	117332	100 %	0 %	0 %	0 %	296125152
3122	NC_014150	TAT	2	6	117377	117382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125152
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3124	NC_014150	TAT	3	9	117400	117408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125152
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3245	NC_014150	TA	3	6	123032	123037	50 %	50 %	0 %	0 %	296125157
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3247	NC_014150	AT	3	6	123063	123068	50 %	50 %	0 %	0 %	296125157
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3498	NC_014150	AGT	2	6	132031	132036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125165
3499	NC_014150	ATC	2	6	132065	132070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125165
3500	NC_014150	TAAC	2	8	132090	132097	50 %	25 %	0 %	25 %	296125165

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