MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	GAAT	2	8	155	162	50 %	25 %	25 %	0 %	296125059
2	NC_014150	ATT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
3	NC_014150	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
4	NC_014150	TTG	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125059
5	NC_014150	ATA	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
6	NC_014150	GCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
7	NC_014150	TGC	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
8	NC_014150	A	7	7	290	296	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
9	NC_014150	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
10	NC_014150	T	6	6	321	326	0 %	100 %	0 %	0 %	296125059
11	NC_014150	ATA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
12	NC_014150	GAA	3	9	402	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
13	NC_014150	A	6	6	427	432	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
14	NC_014150	ATA	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
15	NC_014150	A	7	7	464	470	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
16	NC_014150	TAA	3	9	479	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
17	NC_014150	ATT	2	6	502	507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
18	NC_014150	AAT	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
19	NC_014150	AGC	2	6	557	562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
20	NC_014150	GTAT	2	8	566	573	25 %	50 %	25 %	0 %	296125059
21	NC_014150	TA	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
22	NC_014150	A	6	6	750	755	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
23	NC_014150	GAT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
24	NC_014150	CTT	2	6	816	821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
25	NC_014150	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
26	NC_014150	GCA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
27	NC_014150	CCT	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
28	NC_014150	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
29	NC_014150	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
30	NC_014150	CCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
31	NC_014150	TAT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
32	NC_014150	ATT	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
33	NC_014150	AT	3	6	1070	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
34	NC_014150	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125059
35	NC_014150	AAGA	2	8	1100	1107	75 %	0 %	25 %	0 %	296125059
36	NC_014150	TGA	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
37	NC_014150	ATT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
38	NC_014150	A	6	6	1226	1231	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
39	NC_014150	A	7	7	1251	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
40	NC_014150	ATT	2	6	1267	1272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
41	NC_014150	TCT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
42	NC_014150	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
43	NC_014150	A	7	7	1367	1373	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
44	NC_014150	ATA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
45	NC_014150	AAG	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
46	NC_014150	ATTT	2	8	1468	1475	25 %	75 %	0 %	0 %	296125059
47	NC_014150	GAA	3	9	2054	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
48	NC_014150	TAA	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
49	NC_014150	AAT	2	6	2111	2116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
50	NC_014150	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
51	NC_014150	ATA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
52	NC_014150	AAAG	2	8	2147	2154	75 %	0 %	25 %	0 %	296125060
53	NC_014150	GAA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
54	NC_014150	GCT	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125060
55	NC_014150	ATG	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
56	NC_014150	A	6	6	2198	2203	100 %	0 %	0 %	0 %	296125060
57	NC_014150	GCA	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125060
58	NC_014150	AT	3	6	2245	2250	50 %	50 %	0 %	0 %	296125060
59	NC_014150	A	6	6	2298	2303	100 %	0 %	0 %	0 %	296125060
60	NC_014150	ATT	3	9	2332	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125060
61	NC_014150	GTT	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125060
62	NC_014150	ATG	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
63	NC_014150	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
64	NC_014150	CCT	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125060
65	NC_014150	TAAA	2	8	2669	2676	75 %	25 %	0 %	0 %	296125060
66	NC_014150	TTA	2	6	2719	2724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125061
67	NC_014150	A	6	6	2741	2746	100 %	0 %	0 %	0 %	296125061
68	NC_014150	TTC	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125061
69	NC_014150	AAG	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125061
70	NC_014150	TAC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125061
71	NC_014150	TGT	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125061
72	NC_014150	AAT	2	6	3000	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
73	NC_014150	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
74	NC_014150	GTA	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
75	NC_014150	AACA	2	8	3072	3079	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
76	NC_014150	AAC	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
77	NC_014150	TAG	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
78	NC_014150	TAG	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
79	NC_014150	TAAC	2	8	3167	3174	50 %	25 %	0 %	25 %	296125062
80	NC_014150	AGA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
81	NC_014150	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
82	NC_014150	GGAA	2	8	3300	3307	50 %	0 %	50 %	0 %	296125062
83	NC_014150	CTC	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125062
84	NC_014150	AAAC	2	8	3352	3359	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
85	NC_014150	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
86	NC_014150	TAT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
87	NC_014150	CTA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
88	NC_014150	AAT	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
89	NC_014150	CAG	3	9	3500	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
90	NC_014150	TATGG	2	10	3517	3526	20 %	40 %	40 %	0 %	296125062
91	NC_014150	A	6	6	3542	3547	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
92	NC_014150	GGT	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296125062
93	NC_014150	AT	3	6	3581	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	296125062
94	NC_014150	TGA	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
95	NC_014150	TAAT	2	8	3674	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	296125062
96	NC_014150	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
97	NC_014150	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
98	NC_014150	AAG	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
99	NC_014150	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
100	NC_014150	CAG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
101	NC_014150	A	6	6	3908	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
102	NC_014150	AGG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125062
103	NC_014150	TAA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
104	NC_014150	CAAA	2	8	4049	4056	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
105	NC_014150	AGC	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
106	NC_014150	TAT	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
107	NC_014150	CTT	3	9	4135	4143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125062
108	NC_014150	ACT	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
109	NC_014150	ACAA	2	8	4225	4232	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
110	NC_014150	A	6	6	4231	4236	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
111	NC_014150	CAG	3	9	4250	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
112	NC_014150	CAAT	2	8	4260	4267	50 %	25 %	0 %	25 %	296125062
113	NC_014150	GAAA	2	8	4297	4304	75 %	0 %	25 %	0 %	296125062
114	NC_014150	ACA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
115	NC_014150	A	6	6	4457	4462	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
116	NC_014150	AGAAT	2	10	4465	4474	60 %	20 %	20 %	0 %	296125062
117	NC_014150	GAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
118	NC_014150	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
119	NC_014150	GAA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
120	NC_014150	CAGA	2	8	4600	4607	50 %	0 %	25 %	25 %	296125062
121	NC_014150	ATT	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
122	NC_014150	AATG	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	296125062
123	NC_014150	CAG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
124	NC_014150	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
125	NC_014150	ATA	2	6	4712	4717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
126	NC_014150	AGC	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
127	NC_014150	GGA	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125062
128	NC_014150	CAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
129	NC_014150	TGA	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
130	NC_014150	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
131	NC_014150	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
132	NC_014150	AGT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125063
133	NC_014150	TTA	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125063
134	NC_014150	A	6	6	5194	5199	100 %	0 %	0 %	0 %	296125063
135	NC_014150	A	6	6	5381	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	296125063
136	NC_014150	ATA	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125063
137	NC_014150	TAA	2	6	5433	5438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125063
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405	NC_014150	ATT	2	6	15433	15438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125072
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444	NC_014150	AT	3	6	16687	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	296125073
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