MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013714	TCA	2	6	2392982	2392987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456921
44002	NC_013714	ACGC	2	8	2392998	2393005	25 %	0 %	25 %	50 %	283456921
44003	NC_013714	CCG	2	6	2393008	2393013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456921
44004	NC_013714	GAAT	2	8	2393051	2393058	50 %	25 %	25 %	0 %	283456921
44005	NC_013714	TGG	2	6	2393102	2393107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456921
44006	NC_013714	GAA	2	6	2393211	2393216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456921
44007	NC_013714	GCG	2	6	2393266	2393271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456921
44008	NC_013714	GATC	2	8	2393321	2393328	25 %	25 %	25 %	25 %	283456921
44009	NC_013714	GC	3	6	2393356	2393361	0 %	0 %	50 %	50 %	283456921
44010	NC_013714	CTACG	2	10	2393501	2393510	20 %	20 %	20 %	40 %	283456921
44011	NC_013714	CGG	2	6	2393652	2393657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456921
44012	NC_013714	CGT	2	6	2393678	2393683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456921
44013	NC_013714	CTT	2	6	2393721	2393726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456921
44014	NC_013714	AGC	2	6	2393739	2393744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456921
44015	NC_013714	CATA	2	8	2393764	2393771	50 %	25 %	0 %	25 %	283456921
44016	NC_013714	CTG	2	6	2393826	2393831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456921
44017	NC_013714	CGG	2	6	2393877	2393882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456921
44018	NC_013714	TGAT	2	8	2393905	2393912	25 %	50 %	25 %	0 %	283456921
44019	NC_013714	CTC	2	6	2394211	2394216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456922
44020	NC_013714	CA	3	6	2394237	2394242	50 %	0 %	0 %	50 %	283456922
44021	NC_013714	ATG	2	6	2394271	2394276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456922
44022	NC_013714	CCA	2	6	2394314	2394319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456922
44023	NC_013714	GCCT	2	8	2394327	2394334	0 %	25 %	25 %	50 %	283456922
44024	NC_013714	GGA	2	6	2394376	2394381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456922
44025	NC_013714	ATC	2	6	2394405	2394410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456922
44026	NC_013714	CAT	2	6	2394483	2394488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456922
44027	NC_013714	GTT	2	6	2394576	2394581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456922
44028	NC_013714	CCA	2	6	2394590	2394595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456922
44029	NC_013714	CGG	2	6	2394620	2394625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456922
44030	NC_013714	CCG	2	6	2394683	2394688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456922
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44032	NC_013714	GCT	2	6	2394884	2394889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456922
44033	NC_013714	TTC	2	6	2394912	2394917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456922
44034	NC_013714	ATCA	2	8	2394993	2395000	50 %	25 %	0 %	25 %	283456922
44035	NC_013714	AGCA	2	8	2395005	2395012	50 %	0 %	25 %	25 %	283456922
44036	NC_013714	AGT	2	6	2395016	2395021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456922
44037	NC_013714	CG	3	6	2395122	2395127	0 %	0 %	50 %	50 %	283456922
44038	NC_013714	CGC	2	6	2395166	2395171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456922
44039	NC_013714	CGG	2	6	2395205	2395210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456922
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44041	NC_013714	GGT	2	6	2395799	2395804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456923
44042	NC_013714	TCA	2	6	2395911	2395916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456923
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44044	NC_013714	GAT	3	9	2395964	2395972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456923
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44048	NC_013714	CAGA	2	8	2396203	2396210	50 %	0 %	25 %	25 %	283456923
44049	NC_013714	GGC	2	6	2396215	2396220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456923
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44052	NC_013714	ATC	2	6	2396439	2396444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456923
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44054	NC_013714	TCA	2	6	2396469	2396474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456923
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44100	NC_013714	GAGGTA	2	12	2399784	2399795	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	283456925
44101	NC_013714	ATGG	2	8	2399844	2399851	25 %	25 %	50 %	0 %	283456925
44102	NC_013714	CGG	2	6	2399855	2399860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456925
44103	NC_013714	CAGG	3	12	2399878	2399889	25 %	0 %	50 %	25 %	283456925
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44105	NC_013714	GGCGCC	2	12	2399955	2399966	0 %	0 %	50 %	50 %	283456925
44106	NC_013714	GA	4	8	2399994	2400001	50 %	0 %	50 %	0 %	283456925
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44231	NC_013714	TGC	2	6	2405905	2405910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456930
44232	NC_013714	GCG	2	6	2406002	2406007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456930
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44329	NC_013714	ATC	2	6	2411071	2411076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456933
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44332	NC_013714	TGC	2	6	2411329	2411334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456933
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44334	NC_013714	CGAA	2	8	2411361	2411368	50 %	0 %	25 %	25 %	283456933
44335	NC_013714	CTA	2	6	2411394	2411399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456933
44336	NC_013714	GCG	2	6	2411417	2411422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456933
44337	NC_013714	ATT	2	6	2411573	2411578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283456933
44338	NC_013714	GC	3	6	2411581	2411586	0 %	0 %	50 %	50 %	283456933
44339	NC_013714	AGC	2	6	2411627	2411632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456933
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44341	NC_013714	CG	3	6	2411705	2411710	0 %	0 %	50 %	50 %	283456933
44342	NC_013714	CAG	2	6	2412212	2412217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456934
44343	NC_013714	CTC	2	6	2412218	2412223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456934
44344	NC_013714	ATG	2	6	2412306	2412311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456934
44345	NC_013714	GGT	2	6	2412334	2412339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456934
44346	NC_013714	CCT	2	6	2412358	2412363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456934
44347	NC_013714	AGGATC	2	12	2412399	2412410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283456934
44348	NC_013714	AGT	2	6	2412423	2412428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456934
44349	NC_013714	CG	4	8	2412430	2412437	0 %	0 %	50 %	50 %	283456934
44350	NC_013714	CCG	2	6	2412460	2412465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456934
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44364	NC_013714	TAG	2	6	2413110	2413115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456934
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44457	NC_013714	TCG	2	6	2418157	2418162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456937
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44460	NC_013714	GCC	2	6	2418279	2418284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456937
44461	NC_013714	AGC	2	6	2418289	2418294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456937
44462	NC_013714	AGA	2	6	2418391	2418396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456937
44463	NC_013714	GAT	2	6	2418516	2418521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456937
44464	NC_013714	CAT	2	6	2418534	2418539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456937
44465	NC_013714	CGGTGG	2	12	2418548	2418559	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283456937
44466	NC_013714	GA	3	6	2418595	2418600	50 %	0 %	50 %	0 %	283456937
44467	NC_013714	CTT	2	6	2418609	2418614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456937
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44471	NC_013714	TTG	2	6	2418920	2418925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456937
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44473	NC_013714	CGAA	2	8	2419668	2419675	50 %	0 %	25 %	25 %	283456938
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44475	NC_013714	TGA	2	6	2419796	2419801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456938
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44482	NC_013714	CTGG	2	8	2420376	2420383	0 %	25 %	50 %	25 %	283456938
44483	NC_013714	CGG	2	6	2420463	2420468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456938
44484	NC_013714	TCG	2	6	2420495	2420500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456938
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44488	NC_013714	ACG	2	6	2420677	2420682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456938
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44490	NC_013714	CTG	2	6	2420833	2420838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456938
44491	NC_013714	CGA	2	6	2420850	2420855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456938
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44493	NC_013714	CG	3	6	2420931	2420936	0 %	0 %	50 %	50 %	283456938
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