MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42004	NC_013714	CCTT	2	8	2274308	2274315	0 %	50 %	0 %	50 %	283456834
42005	NC_013714	ACC	2	6	2274446	2274451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456834
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42115	NC_013714	CAG	2	6	2281537	2281542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42116	NC_013714	GATCG	2	10	2281552	2281561	20 %	20 %	40 %	20 %	283456841
42117	NC_013714	ATG	2	6	2281586	2281591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456841
42118	NC_013714	CCA	2	6	2281617	2281622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456841
42119	NC_013714	CCG	2	6	2281712	2281717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456841
42120	NC_013714	GGGA	2	8	2281722	2281729	25 %	0 %	75 %	0 %	283456841
42121	NC_013714	CAG	2	6	2281759	2281764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42122	NC_013714	TGA	2	6	2281803	2281808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456841
42123	NC_013714	TCA	2	6	2281824	2281829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456841
42124	NC_013714	TGA	2	6	2281866	2281871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456841
42125	NC_013714	AAC	2	6	2281916	2281921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456841
42126	NC_013714	GTC	2	6	2281922	2281927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42127	NC_013714	CG	3	6	2282127	2282132	0 %	0 %	50 %	50 %	283456841
42128	NC_013714	CGC	2	6	2282154	2282159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456841
42129	NC_013714	GCG	2	6	2282256	2282261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456841
42130	NC_013714	CAG	2	6	2282287	2282292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42131	NC_013714	CCA	2	6	2282418	2282423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456841
42132	NC_013714	CAG	2	6	2282431	2282436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42133	NC_013714	GGCC	2	8	2282499	2282506	0 %	0 %	50 %	50 %	283456841
42134	NC_013714	GTC	2	6	2282539	2282544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42135	NC_013714	GTG	2	6	2282549	2282554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456841
42136	NC_013714	ATC	2	6	2282600	2282605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456841
42137	NC_013714	AAG	2	6	2282633	2282638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456841
42138	NC_013714	CAC	2	6	2282678	2282683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456841
42139	NC_013714	ACG	2	6	2282697	2282702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456841
42140	NC_013714	CAGC	2	8	2282941	2282948	25 %	0 %	25 %	50 %	283456842
42141	NC_013714	TGCC	2	8	2282966	2282973	0 %	25 %	25 %	50 %	283456842
42142	NC_013714	CAG	2	6	2282995	2283000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456842
42143	NC_013714	GAC	2	6	2283007	2283012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456842
42144	NC_013714	ACG	2	6	2283017	2283022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456842
42145	NC_013714	CAC	2	6	2283046	2283051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456842
42146	NC_013714	CA	3	6	2283069	2283074	50 %	0 %	0 %	50 %	283456842
42147	NC_013714	GCCGC	2	10	2283104	2283113	0 %	0 %	40 %	60 %	283456842
42148	NC_013714	CGGC	2	8	2283114	2283121	0 %	0 %	50 %	50 %	283456842
42149	NC_013714	GAC	2	6	2283312	2283317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456843
42150	NC_013714	ATG	2	6	2283322	2283327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456843
42151	NC_013714	CGGC	2	8	2283364	2283371	0 %	0 %	50 %	50 %	283456843
42152	NC_013714	AGG	2	6	2283421	2283426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456843
42153	NC_013714	CCA	2	6	2283437	2283442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456843
42154	NC_013714	ACG	2	6	2283446	2283451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456843
42155	NC_013714	ACG	2	6	2283548	2283553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456843
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42158	NC_013714	TGG	2	6	2284267	2284272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456844
42159	NC_013714	ATCGCA	2	12	2284273	2284284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283456844
42160	NC_013714	GCT	2	6	2284318	2284323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456844
42161	NC_013714	CGA	3	9	2284346	2284354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456844
42162	NC_013714	CTG	2	6	2284402	2284407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456844
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42168	NC_013714	CGA	2	6	2285175	2285180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456845
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42171	NC_013714	CGCA	2	8	2285420	2285427	25 %	0 %	25 %	50 %	283456845
42172	NC_013714	GCG	2	6	2285444	2285449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456845
42173	NC_013714	CCG	2	6	2285645	2285650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456845
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42177	NC_013714	GCA	2	6	2285739	2285744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456845
42178	NC_013714	CCA	2	6	2285772	2285777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456845
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42180	NC_013714	CAGGC	2	10	2285903	2285912	20 %	0 %	40 %	40 %	283456845
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42182	NC_013714	CGG	2	6	2285976	2285981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456845
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42184	NC_013714	TCGC	2	8	2285999	2286006	0 %	25 %	25 %	50 %	283456845
42185	NC_013714	GC	3	6	2286063	2286068	0 %	0 %	50 %	50 %	283456845
42186	NC_013714	CAT	2	6	2286151	2286156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456845
42187	NC_013714	GGA	2	6	2286189	2286194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456845
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42189	NC_013714	GGC	3	9	2286229	2286237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456845
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42195	NC_013714	GCA	2	6	2286654	2286659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456846
42196	NC_013714	TCT	2	6	2286668	2286673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456846
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42199	NC_013714	CAT	2	6	2286830	2286835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456846
42200	NC_013714	CATG	2	8	2286848	2286855	25 %	25 %	25 %	25 %	283456846
42201	NC_013714	CTCCC	2	10	2286907	2286916	0 %	20 %	0 %	80 %	283456846
42202	NC_013714	CGC	2	6	2287034	2287039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456846
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42204	NC_013714	TGC	2	6	2287546	2287551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456847
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42211	NC_013714	ACCT	2	8	2287947	2287954	25 %	25 %	0 %	50 %	283456847
42212	NC_013714	CTG	3	9	2288104	2288112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42213	NC_013714	CGG	2	6	2288146	2288151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456848
42214	NC_013714	GGTC	2	8	2288165	2288172	0 %	25 %	50 %	25 %	283456848
42215	NC_013714	CTG	2	6	2288198	2288203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42216	NC_013714	GCG	2	6	2288205	2288210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456848
42217	NC_013714	CGG	2	6	2288232	2288237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456848
42218	NC_013714	CTG	2	6	2288240	2288245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42219	NC_013714	TGG	2	6	2288258	2288263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456848
42220	NC_013714	ACCG	2	8	2288278	2288285	25 %	0 %	25 %	50 %	283456848
42221	NC_013714	CTG	2	6	2288300	2288305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42222	NC_013714	CCTG	2	8	2288313	2288320	0 %	25 %	25 %	50 %	283456848
42223	NC_013714	CT	3	6	2288333	2288338	0 %	50 %	0 %	50 %	283456848
42224	NC_013714	CTG	2	6	2288342	2288347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42225	NC_013714	GCT	2	6	2288362	2288367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42226	NC_013714	TGC	2	6	2288385	2288390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42227	NC_013714	CG	3	6	2288429	2288434	0 %	0 %	50 %	50 %	283456848
42228	NC_013714	ACC	2	6	2288540	2288545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456848
42229	NC_013714	GAT	2	6	2288600	2288605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456848
42230	NC_013714	ATCG	2	8	2288623	2288630	25 %	25 %	25 %	25 %	283456848
42231	NC_013714	CCT	2	6	2288650	2288655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456848
42232	NC_013714	CGA	2	6	2288671	2288676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42233	NC_013714	CATC	2	8	2288691	2288698	25 %	25 %	0 %	50 %	283456848
42234	NC_013714	GC	3	6	2288727	2288732	0 %	0 %	50 %	50 %	283456848
42235	NC_013714	ACCGG	2	10	2288762	2288771	20 %	0 %	40 %	40 %	283456848
42236	NC_013714	CGGG	2	8	2288793	2288800	0 %	0 %	75 %	25 %	283456848
42237	NC_013714	CAGG	2	8	2288833	2288840	25 %	0 %	50 %	25 %	283456848
42238	NC_013714	TGGCGG	2	12	2288910	2288921	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283456848
42239	NC_013714	GCT	2	6	2288935	2288940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42240	NC_013714	CCGA	2	8	2288978	2288985	25 %	0 %	25 %	50 %	283456848
42241	NC_013714	CGA	2	6	2289058	2289063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456848
42242	NC_013714	ATC	2	6	2289104	2289109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456848
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42244	NC_013714	GGA	2	6	2289142	2289147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456848
42245	NC_013714	CA	3	6	2289168	2289173	50 %	0 %	0 %	50 %	283456848
42246	NC_013714	CGA	2	6	2289703	2289708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456849
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42252	NC_013714	GGT	2	6	2289905	2289910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456849
42253	NC_013714	GGC	2	6	2289929	2289934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456849
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42333	NC_013714	CCGTG	2	10	2294178	2294187	0 %	20 %	40 %	40 %	283456854
42334	NC_013714	AG	3	6	2294203	2294208	50 %	0 %	50 %	0 %	283456854
42335	NC_013714	TCT	3	9	2294425	2294433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456855
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42338	NC_013714	AGC	2	6	2294484	2294489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456855
42339	NC_013714	GGT	2	6	2294516	2294521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456855
42340	NC_013714	CGA	2	6	2294524	2294529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456855
42341	NC_013714	GGA	2	6	2294531	2294536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456855
42342	NC_013714	GAT	2	6	2294570	2294575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456855
42343	NC_013714	CCACG	2	10	2294623	2294632	20 %	0 %	20 %	60 %	283456855
42344	NC_013714	GAC	2	6	2294672	2294677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456855
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42454	NC_013714	CATGGC	2	12	2301756	2301767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283456859
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42459	NC_013714	TCCG	2	8	2302122	2302129	0 %	25 %	25 %	50 %	283456860
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42461	NC_013714	CAA	2	6	2302272	2302277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456860
42462	NC_013714	CGC	2	6	2302278	2302283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456860
42463	NC_013714	CTG	2	6	2302326	2302331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456860
42464	NC_013714	CGG	2	6	2302409	2302414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456860
42465	NC_013714	CGA	2	6	2302480	2302485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456860
42466	NC_013714	CGC	2	6	2302488	2302493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456860
42467	NC_013714	TCA	2	6	2302654	2302659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456860
42468	NC_013714	GGCAT	2	10	2302702	2302711	20 %	20 %	40 %	20 %	283456860
42469	NC_013714	CAT	2	6	2302865	2302870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456860
42470	NC_013714	ACG	2	6	2302885	2302890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456860
42471	NC_013714	ATG	2	6	2302972	2302977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456860
42472	NC_013714	T	6	6	2303116	2303121	0 %	100 %	0 %	0 %	283456861
42473	NC_013714	CCA	2	6	2303126	2303131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456861
42474	NC_013714	CAA	2	6	2303139	2303144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456861
42475	NC_013714	AGA	2	6	2303206	2303211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456861
42476	NC_013714	CA	3	6	2303259	2303264	50 %	0 %	0 %	50 %	283456861
42477	NC_013714	T	6	6	2303319	2303324	0 %	100 %	0 %	0 %	283456861
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42480	NC_013714	ATA	2	6	2303432	2303437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456861
42481	NC_013714	TAA	2	6	2303515	2303520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456861
42482	NC_013714	AAT	2	6	2303528	2303533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456861
42483	NC_013714	TTC	2	6	2303567	2303572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456861
42484	NC_013714	ATA	2	6	2303613	2303618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456861
42485	NC_013714	GAAC	2	8	2303751	2303758	50 %	0 %	25 %	25 %	283456861
42486	NC_013714	GAT	2	6	2303838	2303843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456861
42487	NC_013714	AAT	2	6	2303859	2303864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456861
42488	NC_013714	GAA	2	6	2303918	2303923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456861
42489	NC_013714	CTTT	2	8	2303952	2303959	0 %	75 %	0 %	25 %	283456861
42490	NC_013714	GA	3	6	2303963	2303968	50 %	0 %	50 %	0 %	283456861
42491	NC_013714	CAA	2	6	2304057	2304062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456861
42492	NC_013714	CAA	2	6	2304069	2304074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456861
42493	NC_013714	GTT	2	6	2304077	2304082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456861
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42495	NC_013714	T	6	6	2304112	2304117	0 %	100 %	0 %	0 %	283456861
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42500	NC_013714	AGC	2	6	2304499	2304504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456861

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