MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013714	TGG	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455000
1002	NC_013714	GCC	2	6	53216	53221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455000
1003	NC_013714	TGC	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455000
1004	NC_013714	CGG	2	6	53353	53358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455000
1005	NC_013714	CAA	2	6	53369	53374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455000
1006	NC_013714	GTC	2	6	53375	53380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455000
1007	NC_013714	GTG	2	6	53410	53415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455000
1008	NC_013714	TCG	2	6	53433	53438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455000
1009	NC_013714	CAC	2	6	53458	53463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455000
1010	NC_013714	GCGG	2	8	53572	53579	0 %	0 %	75 %	25 %	283455000
1011	NC_013714	CGC	2	6	53704	53709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455000
1012	NC_013714	CCG	2	6	53726	53731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455000
1013	NC_013714	ACTG	2	8	53732	53739	25 %	25 %	25 %	25 %	283455000
1014	NC_013714	CAT	2	6	53809	53814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455000
1015	NC_013714	GCTCAT	2	12	53842	53853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283455000
1016	NC_013714	GCC	2	6	53918	53923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455000
1017	NC_013714	ACG	2	6	53973	53978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455000
1018	NC_013714	CTG	2	6	53996	54001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455000
1019	NC_013714	CG	4	8	54270	54277	0 %	0 %	50 %	50 %	283455001
1020	NC_013714	GCG	2	6	54323	54328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455001
1021	NC_013714	GTGGCC	2	12	54409	54420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283455001
1022	NC_013714	TCG	2	6	54449	54454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1023	NC_013714	GC	3	6	54470	54475	0 %	0 %	50 %	50 %	283455001
1024	NC_013714	ATC	2	6	54500	54505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1025	NC_013714	ACC	2	6	54628	54633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1026	NC_013714	TAC	2	6	54652	54657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1027	NC_013714	CGA	2	6	54717	54722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1028	NC_013714	CCG	2	6	54746	54751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455001
1029	NC_013714	CCA	2	6	54794	54799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1030	NC_013714	ACC	2	6	54847	54852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1031	NC_013714	CGA	2	6	54876	54881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1032	NC_013714	CTCA	2	8	54900	54907	25 %	25 %	0 %	50 %	283455001
1033	NC_013714	ACC	2	6	54919	54924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1034	NC_013714	CAA	2	6	54945	54950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455001
1035	NC_013714	ACC	2	6	54994	54999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1036	NC_013714	CGA	2	6	55043	55048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1037	NC_013714	AGA	2	6	55184	55189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455001
1038	NC_013714	GGT	2	6	55216	55221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455001
1039	NC_013714	GCA	2	6	55284	55289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1040	NC_013714	GC	3	6	55300	55305	0 %	0 %	50 %	50 %	283455001
1041	NC_013714	AGC	3	9	55322	55330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1042	NC_013714	CAA	2	6	55347	55352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455001
1043	NC_013714	CCG	2	6	55421	55426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455001
1044	NC_013714	CAAA	2	8	55433	55440	75 %	0 %	0 %	25 %	283455001
1045	NC_013714	CAT	2	6	55473	55478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1046	NC_013714	CCA	2	6	55514	55519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1047	NC_013714	CTG	2	6	55579	55584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1048	NC_013714	GAC	2	6	55594	55599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1049	NC_013714	CAC	2	6	55617	55622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455001
1050	NC_013714	GAC	2	6	55648	55653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1051	NC_013714	TCG	2	6	55796	55801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1052	NC_013714	CCGA	2	8	55807	55814	25 %	0 %	25 %	50 %	283455001
1053	NC_013714	CCG	2	6	55826	55831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455001
1054	NC_013714	CGG	2	6	55866	55871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455001
1055	NC_013714	CGA	2	6	55911	55916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1056	NC_013714	GCT	2	6	55962	55967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1057	NC_013714	ATC	2	6	55996	56001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1058	NC_013714	CAT	2	6	56094	56099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1059	NC_013714	CGC	2	6	56109	56114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455001
1060	NC_013714	GAT	2	6	56199	56204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455001
1061	NC_013714	TTC	2	6	56212	56217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455001
1062	NC_013714	ACT	2	6	56297	56302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1063	NC_013714	TGG	2	6	56357	56362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455001
1064	NC_013714	CGA	2	6	56397	56402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1065	NC_013714	TGA	2	6	56423	56428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455001
1066	NC_013714	AACGC	2	10	56435	56444	40 %	0 %	20 %	40 %	283455001
1067	NC_013714	CAGT	2	8	56454	56461	25 %	25 %	25 %	25 %	283455001
1068	NC_013714	CTG	2	6	56599	56604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1069	NC_013714	CTG	2	6	56608	56613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455001
1070	NC_013714	TCA	2	6	56615	56620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1071	NC_013714	ATC	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455001
1072	NC_013714	CG	3	6	56715	56720	0 %	0 %	50 %	50 %	283455001
1073	NC_013714	CGC	2	6	56840	56845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455002
1074	NC_013714	ACC	2	6	56977	56982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455002
1075	NC_013714	GCG	2	6	57048	57053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455002
1076	NC_013714	ATG	2	6	57084	57089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455002
1077	NC_013714	CACC	2	8	57100	57107	25 %	0 %	0 %	75 %	283455002
1078	NC_013714	A	6	6	57142	57147	100 %	0 %	0 %	0 %	283455002
1079	NC_013714	CGA	2	6	57173	57178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1080	NC_013714	TGC	2	6	57262	57267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1081	NC_013714	CCA	2	6	57337	57342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455002
1082	NC_013714	GCT	2	6	57422	57427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1083	NC_013714	GC	3	6	57456	57461	0 %	0 %	50 %	50 %	283455002
1084	NC_013714	GAC	2	6	57567	57572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1085	NC_013714	ATC	2	6	57650	57655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455002
1086	NC_013714	CGGA	2	8	57736	57743	25 %	0 %	50 %	25 %	283455002
1087	NC_013714	CGC	3	9	57836	57844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455002
1088	NC_013714	GCC	2	6	57858	57863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455002
1089	NC_013714	GCG	2	6	57868	57873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455002
1090	NC_013714	CAG	2	6	57891	57896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1091	NC_013714	ACG	2	6	57912	57917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1092	NC_013714	CAC	2	6	57932	57937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455002
1093	NC_013714	CGG	2	6	58073	58078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455002
1094	NC_013714	CGGC	2	8	58144	58151	0 %	0 %	50 %	50 %	283455002
1095	NC_013714	TAG	2	6	58202	58207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455002
1096	NC_013714	ATCGC	2	10	58212	58221	20 %	20 %	20 %	40 %	283455002
1097	NC_013714	GCT	2	6	58253	58258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1098	NC_013714	TGGG	2	8	58350	58357	0 %	25 %	75 %	0 %	283455002
1099	NC_013714	CAT	2	6	58361	58366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455002
1100	NC_013714	TGG	2	6	58369	58374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455002
1101	NC_013714	CAT	2	6	58376	58381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455002
1102	NC_013714	CTG	2	6	58536	58541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1103	NC_013714	GCT	2	6	58544	58549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1104	NC_013714	AGC	2	6	58603	58608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1105	NC_013714	GGT	2	6	58643	58648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455002
1106	NC_013714	GTG	2	6	58710	58715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455002
1107	NC_013714	CTG	2	6	58716	58721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1108	NC_013714	GGC	2	6	58743	58748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455002
1109	NC_013714	TTC	2	6	58776	58781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455002
1110	NC_013714	ATGC	2	8	58827	58834	25 %	25 %	25 %	25 %	283455002
1111	NC_013714	CTG	2	6	58896	58901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1112	NC_013714	CGT	2	6	58903	58908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1113	NC_013714	TGC	2	6	58909	58914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
1114	NC_013714	CAA	2	6	58949	58954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455002
1115	NC_013714	TGC	2	6	58960	58965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455002
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1117	NC_013714	GCCT	2	8	59150	59157	0 %	25 %	25 %	50 %	283455003
1118	NC_013714	TGC	2	6	59243	59248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455003
1119	NC_013714	ACG	2	6	59250	59255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455003
1120	NC_013714	CG	3	6	59274	59279	0 %	0 %	50 %	50 %	283455003
1121	NC_013714	CGG	2	6	59289	59294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455003
1122	NC_013714	GTC	2	6	59312	59317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455003
1123	NC_013714	CATGA	2	10	59432	59441	40 %	20 %	20 %	20 %	283455003
1124	NC_013714	GCG	2	6	59568	59573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455003
1125	NC_013714	GAT	2	6	59638	59643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455003
1126	NC_013714	CGG	2	6	59649	59654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455003
1127	NC_013714	CG	3	6	59674	59679	0 %	0 %	50 %	50 %	283455003
1128	NC_013714	TCG	3	9	59682	59690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455003
1129	NC_013714	CAATCT	2	12	59752	59763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455003
1130	NC_013714	GC	3	6	59789	59794	0 %	0 %	50 %	50 %	283455003
1131	NC_013714	CGA	2	6	59824	59829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455003
1132	NC_013714	GCG	2	6	59846	59851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455003
1133	NC_013714	GCT	2	6	59935	59940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455003
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1136	NC_013714	GC	3	6	60120	60125	0 %	0 %	50 %	50 %	283455003
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1139	NC_013714	TTG	2	6	60715	60720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455004
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1144	NC_013714	GCG	2	6	60894	60899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455004
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1154	NC_013714	CTTC	2	8	61397	61404	0 %	50 %	0 %	50 %	283455004
1155	NC_013714	ATG	2	6	61474	61479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455004
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1160	NC_013714	TGCG	2	8	61786	61793	0 %	25 %	50 %	25 %	283455005
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1242	NC_013714	GCC	2	6	66780	66785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455009
1243	NC_013714	CTT	2	6	66804	66809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455009
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1246	NC_013714	GCA	2	6	66857	66862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455009
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1250	NC_013714	CGC	2	6	67017	67022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455009
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1362	NC_013714	ACC	2	6	72581	72586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455012
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1366	NC_013714	CGATGC	2	12	72720	72731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455012
1367	NC_013714	TGA	3	9	72813	72821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455012
1368	NC_013714	GCC	2	6	72823	72828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455012
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1370	NC_013714	CGGCCA	2	12	72879	72890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283455012
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1492	NC_013714	CG	3	6	79455	79460	0 %	0 %	50 %	50 %	283455016
1493	NC_013714	GAT	3	9	79594	79602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455016
1494	NC_013714	CCG	2	6	79659	79664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455016
1495	NC_013714	TCAGC	2	10	80230	80239	20 %	20 %	20 %	40 %	283455017
1496	NC_013714	TGC	2	6	80279	80284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455017
1497	NC_013714	GATG	2	8	80286	80293	25 %	25 %	50 %	0 %	283455017
1498	NC_013714	GCC	2	6	80419	80424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455017
1499	NC_013714	TCC	2	6	80523	80528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455017
1500	NC_013714	CGGGAA	2	12	80603	80614	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283455017

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