MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013714	ATTTC	2	10	667256	667265	20 %	60 %	0 %	20 %	283455493
13002	NC_013714	AGG	2	6	667322	667327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455493
13003	NC_013714	ATG	2	6	667462	667467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455493
13004	NC_013714	TTC	2	6	667723	667728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455494
13005	NC_013714	GGC	2	6	667739	667744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455494
13006	NC_013714	CTT	2	6	667754	667759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455494
13007	NC_013714	TCG	2	6	667801	667806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13008	NC_013714	AGG	2	6	667849	667854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455494
13009	NC_013714	GTC	2	6	667878	667883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13010	NC_013714	CTG	2	6	667929	667934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13011	NC_013714	CGT	2	6	667988	667993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13012	NC_013714	TGC	2	6	668029	668034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13013	NC_013714	ACCG	2	8	668036	668043	25 %	0 %	25 %	50 %	283455494
13014	NC_013714	GCG	2	6	668080	668085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455494
13015	NC_013714	GATTG	2	10	668088	668097	20 %	40 %	40 %	0 %	283455494
13016	NC_013714	TCA	2	6	668131	668136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455494
13017	NC_013714	AT	3	6	668147	668152	50 %	50 %	0 %	0 %	283455494
13018	NC_013714	GGC	2	6	668213	668218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455494
13019	NC_013714	GGC	2	6	668242	668247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455494
13020	NC_013714	CTG	2	6	668271	668276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13021	NC_013714	CGA	2	6	668281	668286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455494
13022	NC_013714	CAT	2	6	668309	668314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455494
13023	NC_013714	GTT	2	6	668327	668332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455494
13024	NC_013714	CAT	2	6	668345	668350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455494
13025	NC_013714	ACAT	2	8	668397	668404	50 %	25 %	0 %	25 %	283455494
13026	NC_013714	GCATGA	2	12	668592	668603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283455494
13027	NC_013714	ATC	3	9	668756	668764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455495
13028	NC_013714	CGAA	2	8	668774	668781	50 %	0 %	25 %	25 %	283455495
13029	NC_013714	CG	3	6	668793	668798	0 %	0 %	50 %	50 %	283455495
13030	NC_013714	TGG	2	6	668910	668915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455495
13031	NC_013714	TGC	2	6	668998	669003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455495
13032	NC_013714	ATG	2	6	669008	669013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455495
13033	NC_013714	TGC	2	6	669051	669056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455495
13034	NC_013714	ATC	3	9	669128	669136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455495
13035	NC_013714	T	6	6	669145	669150	0 %	100 %	0 %	0 %	283455495
13036	NC_013714	GAG	2	6	669173	669178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455495
13037	NC_013714	GCC	2	6	669179	669184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455495
13038	NC_013714	TTC	2	6	669212	669217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455495
13039	NC_013714	TGC	2	6	669228	669233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455495
13040	NC_013714	AGT	2	6	669281	669286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455495
13041	NC_013714	GTT	2	6	669307	669312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455495
13042	NC_013714	AGA	2	6	669453	669458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455495
13043	NC_013714	TCG	2	6	669462	669467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455495
13044	NC_013714	GAT	2	6	669566	669571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455496
13045	NC_013714	CTA	2	6	669587	669592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455496
13046	NC_013714	GTCA	2	8	669690	669697	25 %	25 %	25 %	25 %	283455496
13047	NC_013714	CAT	2	6	669718	669723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455496
13048	NC_013714	GGT	2	6	669794	669799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455496
13049	NC_013714	CCG	2	6	669838	669843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455496
13050	NC_013714	CGATC	2	10	669866	669875	20 %	20 %	20 %	40 %	283455496
13051	NC_013714	ACG	2	6	669913	669918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13052	NC_013714	GCA	2	6	669941	669946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13053	NC_013714	ATC	2	6	669967	669972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455496
13054	NC_013714	ACGA	2	8	670040	670047	50 %	0 %	25 %	25 %	283455496
13055	NC_013714	GGT	2	6	670070	670075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455496
13056	NC_013714	AGGA	2	8	670095	670102	50 %	0 %	50 %	0 %	283455496
13057	NC_013714	GGC	2	6	670131	670136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455496
13058	NC_013714	CGA	2	6	670181	670186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13059	NC_013714	TGGC	2	8	670421	670428	0 %	25 %	50 %	25 %	283455496
13060	NC_013714	CGA	2	6	670511	670516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13061	NC_013714	CGG	3	9	670598	670606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455496
13062	NC_013714	TGG	2	6	670660	670665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455496
13063	NC_013714	CGC	2	6	670668	670673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455496
13064	NC_013714	AAC	2	6	670722	670727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455496
13065	NC_013714	ACG	2	6	670759	670764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13066	NC_013714	CG	3	6	670813	670818	0 %	0 %	50 %	50 %	283455496
13067	NC_013714	ACGG	2	8	670925	670932	25 %	0 %	50 %	25 %	283455496
13068	NC_013714	CT	3	6	671007	671012	0 %	50 %	0 %	50 %	283455496
13069	NC_013714	GAT	2	6	671013	671018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455496
13070	NC_013714	CGT	2	6	671021	671026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13071	NC_013714	GGC	2	6	671037	671042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455496
13072	NC_013714	TTC	2	6	671043	671048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455496
13073	NC_013714	TCG	2	6	671059	671064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455496
13074	NC_013714	ACT	2	6	671113	671118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455496
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13077	NC_013714	TCT	2	6	671427	671432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455497
13078	NC_013714	GAT	2	6	671435	671440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455497
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13080	NC_013714	CGC	2	6	671505	671510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455497
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13085	NC_013714	CGTGAC	2	12	671740	671751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455497
13086	NC_013714	CAT	2	6	671779	671784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455497
13087	NC_013714	GTG	2	6	671798	671803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455497
13088	NC_013714	CAT	2	6	671902	671907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455497
13089	NC_013714	CCGCAA	2	12	672312	672323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	283455498
13090	NC_013714	GCA	3	9	672357	672365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13091	NC_013714	GAA	2	6	672466	672471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455498
13092	NC_013714	GGCTAC	2	12	672482	672493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13093	NC_013714	CAA	2	6	672559	672564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455498
13094	NC_013714	GTC	2	6	672581	672586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13095	NC_013714	CATC	2	8	672588	672595	25 %	25 %	0 %	50 %	283455498
13096	NC_013714	ATC	2	6	672650	672655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13097	NC_013714	ACT	2	6	672693	672698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13098	NC_013714	AAG	2	6	672776	672781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455498
13099	NC_013714	CGAC	2	8	672816	672823	25 %	0 %	25 %	50 %	283455498
13100	NC_013714	AAC	2	6	672824	672829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455498
13101	NC_013714	TAC	2	6	672836	672841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13102	NC_013714	TAC	2	6	672872	672877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13103	NC_013714	TGC	2	6	672888	672893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13104	NC_013714	CGA	2	6	672919	672924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13105	NC_013714	ACG	2	6	673011	673016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13106	NC_013714	ACG	2	6	673047	673052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13107	NC_013714	ACT	2	6	673098	673103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13108	NC_013714	TCA	2	6	673110	673115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455498
13109	NC_013714	GAT	2	6	673219	673224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455498
13110	NC_013714	CAA	2	6	673270	673275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455498
13111	NC_013714	GCT	2	6	673300	673305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455498
13112	NC_013714	AGG	2	6	673338	673343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455498
13113	NC_013714	CGG	2	6	673354	673359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455498
13114	NC_013714	AAT	2	6	673519	673524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283455499
13115	NC_013714	GCG	2	6	673628	673633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455499
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13117	NC_013714	ACG	2	6	673715	673720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455499
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13236	NC_013714	GATG	2	8	678596	678603	25 %	25 %	50 %	0 %	283455503
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13240	NC_013714	CCA	2	6	679016	679021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455504
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13334	NC_013714	GCCG	3	12	684594	684605	0 %	0 %	50 %	50 %	283455514
13335	NC_013714	GTG	2	6	684618	684623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455514
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13342	NC_013714	GCA	2	6	684878	684883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13343	NC_013714	CGG	2	6	684935	684940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455514
13344	NC_013714	TCA	2	6	684955	684960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455514
13345	NC_013714	GGCC	2	8	684998	685005	0 %	0 %	50 %	50 %	283455514
13346	NC_013714	CGA	2	6	685034	685039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13347	NC_013714	GAC	2	6	685053	685058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13348	NC_013714	GGAC	2	8	685193	685200	25 %	0 %	50 %	25 %	283455514
13349	NC_013714	GCGG	2	8	685202	685209	0 %	0 %	75 %	25 %	283455514
13350	NC_013714	CTG	2	6	685229	685234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13351	NC_013714	GCCGAC	2	12	685254	685265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283455514
13352	NC_013714	CTG	2	6	685311	685316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13353	NC_013714	CGC	2	6	685364	685369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455514
13354	NC_013714	GC	4	8	685377	685384	0 %	0 %	50 %	50 %	283455514
13355	NC_013714	CGA	2	6	685427	685432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455514
13356	NC_013714	CGGC	2	8	685484	685491	0 %	0 %	50 %	50 %	283455514
13357	NC_013714	CGC	3	9	685502	685510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455514
13358	NC_013714	CA	3	6	685530	685535	50 %	0 %	0 %	50 %	283455514
13359	NC_013714	GGC	2	6	685541	685546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455514
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13362	NC_013714	GAC	2	6	685668	685673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455514
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13473	NC_013714	CCG	2	6	690488	690493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455521
13474	NC_013714	CGC	3	9	690535	690543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455521
13475	NC_013714	ACG	3	9	690552	690560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455521
13476	NC_013714	GGA	2	6	690562	690567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455521
13477	NC_013714	CAT	2	6	690775	690780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455522
13478	NC_013714	GAC	2	6	690806	690811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455522
13479	NC_013714	ACC	2	6	690833	690838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455522
13480	NC_013714	GGC	2	6	690844	690849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455522
13481	NC_013714	TCGGC	2	10	690855	690864	0 %	20 %	40 %	40 %	283455522
13482	NC_013714	TCG	2	6	690995	691000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455522
13483	NC_013714	CCG	3	9	691008	691016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455522
13484	NC_013714	GCC	2	6	691022	691027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455522
13485	NC_013714	CGA	2	6	691039	691044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455522
13486	NC_013714	CCA	2	6	691062	691067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455522
13487	NC_013714	ACC	2	6	691076	691081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455522
13488	NC_013714	GGC	2	6	691129	691134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455522
13489	NC_013714	CGG	2	6	691156	691161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455522
13490	NC_013714	GAT	2	6	691189	691194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455522
13491	NC_013714	CGCGGG	2	12	691207	691218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455522
13492	NC_013714	CAC	2	6	691225	691230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455522
13493	NC_013714	GCTG	2	8	691246	691253	0 %	25 %	50 %	25 %	283455522
13494	NC_013714	AGG	2	6	691284	691289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455522
13495	NC_013714	GCT	2	6	691291	691296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455522
13496	NC_013714	CCG	2	6	691353	691358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455522
13497	NC_013714	GACG	2	8	691393	691400	25 %	0 %	50 %	25 %	283455522
13498	NC_013714	GCC	2	6	691460	691465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455522
13499	NC_013714	CGG	2	6	691471	691476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455522
13500	NC_013714	GACG	2	8	691480	691487	25 %	0 %	50 %	25 %	283455522

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