MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013714	GGC	2	6	640517	640522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455471
12502	NC_013714	GAC	2	6	640550	640555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455471
12503	NC_013714	CGA	2	6	640561	640566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455471
12504	NC_013714	CTG	2	6	640598	640603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12505	NC_013714	TCG	3	9	640626	640634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12506	NC_013714	GCG	2	6	640635	640640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455472
12507	NC_013714	CGCA	2	8	640744	640751	25 %	0 %	25 %	50 %	283455472
12508	NC_013714	GAG	2	6	640754	640759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455472
12509	NC_013714	TCA	2	6	640776	640781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455472
12510	NC_013714	TGG	2	6	640830	640835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455472
12511	NC_013714	CCG	2	6	640857	640862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455472
12512	NC_013714	GC	3	6	640868	640873	0 %	0 %	50 %	50 %	283455472
12513	NC_013714	ACCT	2	8	640937	640944	25 %	25 %	0 %	50 %	283455472
12514	NC_013714	CTT	2	6	640990	640995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455472
12515	NC_013714	ACA	2	6	641010	641015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455472
12516	NC_013714	ACT	2	6	641028	641033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455472
12517	NC_013714	CGG	2	6	641203	641208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455472
12518	NC_013714	CTG	2	6	641267	641272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12519	NC_013714	ACG	2	6	641349	641354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12520	NC_013714	AGC	2	6	641355	641360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12521	NC_013714	CTA	2	6	641428	641433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455472
12522	NC_013714	GGCCC	2	10	641435	641444	0 %	0 %	40 %	60 %	283455472
12523	NC_013714	CCG	2	6	641478	641483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455472
12524	NC_013714	GCT	3	9	641494	641502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12525	NC_013714	CTG	2	6	641546	641551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455472
12526	NC_013714	GGT	2	6	641629	641634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455472
12527	NC_013714	ATG	2	6	641639	641644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455472
12528	NC_013714	GGC	2	6	641650	641655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455472
12529	NC_013714	CAT	2	6	641662	641667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455472
12530	NC_013714	CCA	2	6	641691	641696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455472
12531	NC_013714	GAC	2	6	642148	642153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12532	NC_013714	GCT	2	6	642307	642312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12533	NC_013714	TGC	2	6	642327	642332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12534	NC_013714	CGA	2	6	642346	642351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12535	NC_013714	CTG	2	6	642374	642379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12536	NC_013714	CG	3	6	642480	642485	0 %	0 %	50 %	50 %	283455473
12537	NC_013714	CGA	2	6	642496	642501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455473
12538	NC_013714	CGG	2	6	642571	642576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455473
12539	NC_013714	TCA	2	6	642582	642587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455473
12540	NC_013714	TCA	2	6	642639	642644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455473
12541	NC_013714	CGGC	2	8	642663	642670	0 %	0 %	50 %	50 %	283455473
12542	NC_013714	CGGC	2	8	642687	642694	0 %	0 %	50 %	50 %	283455473
12543	NC_013714	CGG	2	6	642727	642732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455473
12544	NC_013714	GCG	3	9	642740	642748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455473
12545	NC_013714	GGT	2	6	642767	642772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455473
12546	NC_013714	CAT	2	6	642795	642800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12547	NC_013714	ATG	2	6	642847	642852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455474
12548	NC_013714	CAT	2	6	642864	642869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12549	NC_013714	CGGCGC	2	12	642882	642893	0 %	0 %	50 %	50 %	283455474
12550	NC_013714	TCG	2	6	642896	642901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12551	NC_013714	CGG	2	6	642939	642944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455474
12552	NC_013714	ATGGTG	2	12	642976	642987	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283455474
12553	NC_013714	GCG	2	6	642992	642997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455474
12554	NC_013714	ATC	2	6	643018	643023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12555	NC_013714	TCG	2	6	643223	643228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12556	NC_013714	ATC	2	6	643243	643248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12557	NC_013714	ATG	2	6	643252	643257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455474
12558	NC_013714	GCT	2	6	643281	643286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12559	NC_013714	CAG	2	6	643305	643310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12560	NC_013714	CAT	2	6	643329	643334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12561	NC_013714	CTG	2	6	643342	643347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12562	NC_013714	TGC	2	6	643352	643357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12563	NC_013714	ATG	2	6	643423	643428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455474
12564	NC_013714	GCG	2	6	643462	643467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455474
12565	NC_013714	GCG	2	6	643510	643515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455474
12566	NC_013714	CTG	2	6	643522	643527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12567	NC_013714	TCG	2	6	643532	643537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12568	NC_013714	GTG	2	6	643546	643551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455474
12569	NC_013714	GAA	2	6	643578	643583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455474
12570	NC_013714	ACCT	2	8	643693	643700	25 %	25 %	0 %	50 %	283455474
12571	NC_013714	GAT	2	6	643725	643730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455474
12572	NC_013714	ATC	2	6	643804	643809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455474
12573	NC_013714	TGC	2	6	643829	643834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12574	NC_013714	GCG	2	6	643889	643894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455474
12575	NC_013714	TCG	2	6	644137	644142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12576	NC_013714	GCAGG	2	10	644145	644154	20 %	0 %	60 %	20 %	283455474
12577	NC_013714	CTG	2	6	644203	644208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12578	NC_013714	TGC	2	6	644210	644215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455474
12579	NC_013714	CGTTG	2	10	644226	644235	0 %	40 %	40 %	20 %	283455474
12580	NC_013714	CGC	2	6	644304	644309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455474
12581	NC_013714	CGGT	2	8	644436	644443	0 %	25 %	50 %	25 %	283455475
12582	NC_013714	CAG	2	6	644466	644471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12583	NC_013714	CGC	3	9	644481	644489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455475
12584	NC_013714	CCGTA	2	10	644618	644627	20 %	20 %	20 %	40 %	283455475
12585	NC_013714	GTC	2	6	644643	644648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12586	NC_013714	TCG	2	6	644661	644666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12587	NC_013714	CCG	2	6	644683	644688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455475
12588	NC_013714	CGG	2	6	644691	644696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455475
12589	NC_013714	CGA	2	6	644702	644707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12590	NC_013714	CGC	2	6	644711	644716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455475
12591	NC_013714	CGG	2	6	644729	644734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455475
12592	NC_013714	CCATCG	2	12	644743	644754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283455475
12593	NC_013714	GGT	2	6	644771	644776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455475
12594	NC_013714	CGA	2	6	644792	644797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12595	NC_013714	CCA	2	6	644815	644820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455475
12596	NC_013714	GCA	2	6	644866	644871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12597	NC_013714	TCG	2	6	644929	644934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12598	NC_013714	GCG	2	6	644935	644940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455475
12599	NC_013714	TGC	2	6	644947	644952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12600	NC_013714	GGGC	2	8	644988	644995	0 %	0 %	75 %	25 %	283455475
12601	NC_013714	CG	3	6	645023	645028	0 %	0 %	50 %	50 %	283455475
12602	NC_013714	AGC	2	6	645037	645042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12603	NC_013714	GTT	2	6	645080	645085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455475
12604	NC_013714	GAT	2	6	645090	645095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455475
12605	NC_013714	TAT	2	6	645138	645143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283455475
12606	NC_013714	GC	3	6	645172	645177	0 %	0 %	50 %	50 %	283455475
12607	NC_013714	GGA	2	6	645284	645289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455475
12608	NC_013714	CGG	2	6	645334	645339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455475
12609	NC_013714	CT	3	6	645371	645376	0 %	50 %	0 %	50 %	283455475
12610	NC_013714	TGC	2	6	645397	645402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12611	NC_013714	ACA	2	6	645412	645417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455475
12612	NC_013714	CTG	2	6	645441	645446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
12613	NC_013714	ATG	2	6	645543	645548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455475
12614	NC_013714	GGA	2	6	645566	645571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455475
12615	NC_013714	GCA	2	6	645605	645610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455475
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12617	NC_013714	TCG	2	6	645670	645675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455475
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12732	NC_013714	GC	3	6	650605	650610	0 %	0 %	50 %	50 %	283455480
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12734	NC_013714	ACG	2	6	650620	650625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455480
12735	NC_013714	GTG	2	6	650661	650666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455480
12736	NC_013714	TGGC	2	8	650712	650719	0 %	25 %	50 %	25 %	283455480
12737	NC_013714	CGGC	2	8	650725	650732	0 %	0 %	50 %	50 %	283455480
12738	NC_013714	ACG	2	6	650779	650784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455480
12739	NC_013714	TCA	2	6	650848	650853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455480
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12743	NC_013714	AGTA	2	8	651150	651157	50 %	25 %	25 %	0 %	283455480
12744	NC_013714	CG	3	6	651230	651235	0 %	0 %	50 %	50 %	283455481
12745	NC_013714	GAC	2	6	651344	651349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455481
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12755	NC_013714	CGC	2	6	651696	651701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455481
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12759	NC_013714	CTGG	2	8	651967	651974	0 %	25 %	50 %	25 %	283455481
12760	NC_013714	GC	3	6	652002	652007	0 %	0 %	50 %	50 %	283455481
12761	NC_013714	CTG	2	6	652028	652033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455481
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12767	NC_013714	CGC	2	6	652302	652307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455481
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12772	NC_013714	CGT	2	6	652465	652470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455481
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12839	NC_013714	GCG	2	6	656480	656485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455485
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12849	NC_013714	CGA	2	6	657066	657071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455485
12850	NC_013714	CAGC	2	8	657084	657091	25 %	0 %	25 %	50 %	283455485
12851	NC_013714	ATC	2	6	657112	657117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455485
12852	NC_013714	CGA	2	6	657123	657128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455485
12853	NC_013714	GAT	2	6	657360	657365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455486
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12970	NC_013714	CAT	2	6	665293	665298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455492
12971	NC_013714	TCC	2	6	665300	665305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455492
12972	NC_013714	TGA	2	6	665313	665318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455492
12973	NC_013714	TGT	2	6	665532	665537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455492
12974	NC_013714	CGC	2	6	665568	665573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455492
12975	NC_013714	GTG	2	6	665579	665584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455492
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12980	NC_013714	TGTGG	2	10	666354	666363	0 %	40 %	60 %	0 %	283455493
12981	NC_013714	CCA	2	6	666371	666376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455493
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12985	NC_013714	ATGG	2	8	666475	666482	25 %	25 %	50 %	0 %	283455493
12986	NC_013714	TCTT	2	8	666527	666534	0 %	75 %	0 %	25 %	283455493
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12990	NC_013714	TTTG	2	8	666717	666724	0 %	75 %	25 %	0 %	283455493
12991	NC_013714	CGA	2	6	666749	666754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455493
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12999	NC_013714	TCT	2	6	667038	667043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455493
13000	NC_013714	AAG	2	6	667117	667122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455493

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