MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013714	TTC	2	6	29286	29291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454982
502	NC_013714	GCTG	2	8	29294	29301	0 %	25 %	50 %	25 %	283454982
503	NC_013714	GTG	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
504	NC_013714	ACA	2	6	29341	29346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454982
505	NC_013714	CA	3	6	29387	29392	50 %	0 %	0 %	50 %	283454982
506	NC_013714	GC	3	6	29458	29463	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
507	NC_013714	AAG	2	6	29577	29582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454982
508	NC_013714	ATC	2	6	29589	29594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
509	NC_013714	CCA	2	6	29596	29601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454982
510	NC_013714	GT	3	6	29606	29611	0 %	50 %	50 %	0 %	283454982
511	NC_013714	GCG	2	6	29626	29631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
512	NC_013714	ATG	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454982
513	NC_013714	GTG	2	6	29709	29714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
514	NC_013714	TG	3	6	29740	29745	0 %	50 %	50 %	0 %	283454982
515	NC_013714	CGT	2	6	29747	29752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
516	NC_013714	CGC	2	6	29768	29773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454982
517	NC_013714	CTC	2	6	29783	29788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454982
518	NC_013714	ATC	2	6	29802	29807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
519	NC_013714	ATG	2	6	29877	29882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454982
520	NC_013714	GC	3	6	29886	29891	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
521	NC_013714	GCT	2	6	29897	29902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
522	NC_013714	GGCC	2	8	29978	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
523	NC_013714	CAA	2	6	30038	30043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454982
524	NC_013714	TCA	2	6	30103	30108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
525	NC_013714	CGG	2	6	30116	30121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
526	NC_013714	CTG	2	6	30165	30170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
527	NC_013714	GTG	2	6	30177	30182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
528	NC_013714	CGC	2	6	30281	30286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454982
529	NC_013714	CGG	2	6	30295	30300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
530	NC_013714	CG	3	6	30309	30314	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
531	NC_013714	TTCG	2	8	30555	30562	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
532	NC_013714	TTG	2	6	30568	30573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454983
533	NC_013714	CAT	2	6	30575	30580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454983
534	NC_013714	GTG	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
535	NC_013714	CGG	2	6	30749	30754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
536	NC_013714	CAG	2	6	30759	30764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454983
537	NC_013714	GCGG	2	8	30776	30783	0 %	0 %	75 %	25 %	283454983
538	NC_013714	CTT	2	6	30828	30833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
539	NC_013714	TGG	2	6	30842	30847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
540	NC_013714	CGG	2	6	30854	30859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
541	NC_013714	ATG	2	6	30871	30876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
542	NC_013714	CGGC	2	8	30947	30954	0 %	0 %	50 %	50 %	283454983
543	NC_013714	CTT	2	6	30972	30977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
544	NC_013714	CGTT	2	8	30985	30992	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
545	NC_013714	ACG	2	6	30996	31001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454983
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549	NC_013714	CGG	2	6	31274	31279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
550	NC_013714	GGT	2	6	31326	31331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
551	NC_013714	CGGT	2	8	31336	31343	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
552	NC_013714	GAT	3	9	31362	31370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
553	NC_013714	AGT	2	6	31424	31429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
554	NC_013714	GGC	2	6	31442	31447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
555	NC_013714	CGGT	3	12	31448	31459	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
556	NC_013714	TCC	2	6	31492	31497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454983
557	NC_013714	GCGTC	2	10	31508	31517	0 %	20 %	40 %	40 %	283454983
558	NC_013714	TTC	2	6	31525	31530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
559	NC_013714	GCG	2	6	31531	31536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
560	NC_013714	TCATT	2	10	31550	31559	20 %	60 %	0 %	20 %	283454983
561	NC_013714	CTG	2	6	31575	31580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454983
562	NC_013714	GTC	2	6	31590	31595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454983
563	NC_013714	TCA	2	6	31598	31603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454983
564	NC_013714	CAG	2	6	31757	31762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454984
565	NC_013714	ACC	2	6	31790	31795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454984
566	NC_013714	CCG	2	6	31917	31922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454984
567	NC_013714	AGC	2	6	31929	31934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454984
568	NC_013714	GAT	2	6	31952	31957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454984
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570	NC_013714	CCA	2	6	32001	32006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454984
571	NC_013714	GCC	2	6	32030	32035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454984
572	NC_013714	CA	3	6	32046	32051	50 %	0 %	0 %	50 %	283454984
573	NC_013714	GAA	2	6	32089	32094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454984
574	NC_013714	GACT	2	8	32099	32106	25 %	25 %	25 %	25 %	283454984
575	NC_013714	GCA	2	6	32210	32215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454985
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579	NC_013714	TCCA	2	8	32370	32377	25 %	25 %	0 %	50 %	283454985
580	NC_013714	CAG	2	6	32442	32447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454985
581	NC_013714	GA	3	6	32500	32505	50 %	0 %	50 %	0 %	283454985
582	NC_013714	TCG	2	6	32533	32538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454985
583	NC_013714	TGA	2	6	32555	32560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454985
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591	NC_013714	GCT	2	6	33206	33211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454986
592	NC_013714	GTC	2	6	33276	33281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454986
593	NC_013714	CGG	2	6	33311	33316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454986
594	NC_013714	GTC	2	6	33322	33327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454986
595	NC_013714	GCC	2	6	33330	33335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454986
596	NC_013714	ACT	2	6	33454	33459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
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598	NC_013714	CGG	2	6	33521	33526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454986
599	NC_013714	GTC	2	6	33531	33536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454986
600	NC_013714	GAG	2	6	33537	33542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283454986
601	NC_013714	AAG	2	6	33549	33554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454986
602	NC_013714	GC	3	6	33578	33583	0 %	0 %	50 %	50 %	283454986
603	NC_013714	ACG	2	6	33661	33666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454986
604	NC_013714	CAA	2	6	33686	33691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454986
605	NC_013714	AGC	2	6	33796	33801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454986
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607	NC_013714	TCCA	2	8	33822	33829	25 %	25 %	0 %	50 %	283454986
608	NC_013714	TCT	2	6	33844	33849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454986
609	NC_013714	ACCC	2	8	33915	33922	25 %	0 %	0 %	75 %	283454986
610	NC_013714	CAA	2	6	34001	34006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454986
611	NC_013714	CTG	2	6	34080	34085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454986
612	NC_013714	ATC	2	6	34101	34106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
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616	NC_013714	C	6	6	34345	34350	0 %	0 %	0 %	100 %	283454986
617	NC_013714	TCA	2	6	34357	34362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
618	NC_013714	TCA	2	6	34390	34395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
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621	NC_013714	CGC	2	6	34490	34495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454986
622	NC_013714	CAA	2	6	34508	34513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454986
623	NC_013714	CCG	2	6	34675	34680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454986
624	NC_013714	ACG	2	6	34681	34686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454986
625	NC_013714	GTG	2	6	34701	34706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454986
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627	NC_013714	CTA	2	6	34730	34735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
628	NC_013714	TCA	2	6	34759	34764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454986
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643	NC_013714	CCG	2	6	36438	36443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454987
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748	NC_013714	CGG	2	6	41913	41918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454992
749	NC_013714	GCAAG	2	10	41959	41968	40 %	0 %	40 %	20 %	283454992
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