MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013714	GGCAT	2	10	287806	287815	20 %	20 %	40 %	20 %	283455169
5502	NC_013714	CCA	2	6	287816	287821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455169
5503	NC_013714	GCC	2	6	287824	287829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5504	NC_013714	CGC	2	6	287849	287854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5505	NC_013714	TGG	2	6	287945	287950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455169
5506	NC_013714	GAC	2	6	287962	287967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5507	NC_013714	ACG	2	6	287970	287975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5508	NC_013714	CAT	2	6	288003	288008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455169
5509	NC_013714	CGA	2	6	288012	288017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5510	NC_013714	CAA	2	6	288117	288122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455169
5511	NC_013714	GTG	2	6	288124	288129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455169
5512	NC_013714	CGTG	2	8	288135	288142	0 %	25 %	50 %	25 %	283455169
5513	NC_013714	AAG	2	6	288190	288195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455169
5514	NC_013714	GCCGT	2	10	288214	288223	0 %	20 %	40 %	40 %	283455169
5515	NC_013714	GGC	2	6	288288	288293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169
5516	NC_013714	CTG	2	6	288298	288303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5517	NC_013714	CCG	3	9	288326	288334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5518	NC_013714	GACG	2	8	288381	288388	25 %	0 %	50 %	25 %	283455169
5519	NC_013714	CGG	2	6	288422	288427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169
5520	NC_013714	CCG	2	6	288458	288463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5521	NC_013714	CGA	2	6	288471	288476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5522	NC_013714	ACG	2	6	288524	288529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5523	NC_013714	GAC	2	6	288580	288585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5524	NC_013714	GCC	2	6	288598	288603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5525	NC_013714	CCGAT	2	10	288647	288656	20 %	20 %	20 %	40 %	283455169
5526	NC_013714	GAT	2	6	288697	288702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455169
5527	NC_013714	GCA	2	6	288732	288737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5528	NC_013714	GCA	2	6	288783	288788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5529	NC_013714	GGC	2	6	288807	288812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169
5530	NC_013714	GAT	2	6	288823	288828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455169
5531	NC_013714	CGC	2	6	288846	288851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5532	NC_013714	CGG	2	6	288989	288994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169
5533	NC_013714	GAA	2	6	289002	289007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455169
5534	NC_013714	GAA	2	6	289026	289031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455169
5535	NC_013714	CGA	2	6	289038	289043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5536	NC_013714	GAG	2	6	289195	289200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455170
5537	NC_013714	TG	3	6	289269	289274	0 %	50 %	50 %	0 %	283455170
5538	NC_013714	GT	4	8	289294	289301	0 %	50 %	50 %	0 %	283455170
5539	NC_013714	TCG	2	6	289308	289313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455170
5540	NC_013714	GTG	2	6	289333	289338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455170
5541	NC_013714	GAG	2	6	289339	289344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455170
5542	NC_013714	TGA	2	6	289355	289360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455170
5543	NC_013714	CG	3	6	289373	289378	0 %	0 %	50 %	50 %	283455170
5544	NC_013714	CGG	2	6	289404	289409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455170
5545	NC_013714	AGG	2	6	289493	289498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455170
5546	NC_013714	CCA	3	9	289535	289543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455170
5547	NC_013714	GCT	2	6	289557	289562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455170
5548	NC_013714	GCG	2	6	289613	289618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455170
5549	NC_013714	CGA	2	6	289632	289637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455170
5550	NC_013714	CGC	2	6	289666	289671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455170
5551	NC_013714	GGC	2	6	289887	289892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455171
5552	NC_013714	TCC	2	6	289893	289898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455171
5553	NC_013714	CAT	2	6	289937	289942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455171
5554	NC_013714	GAA	2	6	289949	289954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455171
5555	NC_013714	ATG	2	6	289963	289968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455171
5556	NC_013714	CGT	2	6	289973	289978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455171
5557	NC_013714	ACC	2	6	289998	290003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455171
5558	NC_013714	GATC	2	8	290012	290019	25 %	25 %	25 %	25 %	283455171
5559	NC_013714	CCG	2	6	290043	290048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455171
5560	NC_013714	TGA	2	6	290068	290073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455171
5561	NC_013714	CA	3	6	290194	290199	50 %	0 %	0 %	50 %	283455171
5562	NC_013714	GTG	2	6	290287	290292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455171
5563	NC_013714	CCA	2	6	290296	290301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455171
5564	NC_013714	CCG	2	6	290401	290406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455171
5565	NC_013714	GCC	2	6	290424	290429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455171
5566	NC_013714	CGC	2	6	290430	290435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455171
5567	NC_013714	CTTGC	2	10	290493	290502	0 %	40 %	20 %	40 %	283455171
5568	NC_013714	ACA	2	6	290679	290684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455172
5569	NC_013714	ATC	2	6	290729	290734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455172
5570	NC_013714	CGT	2	6	290777	290782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455172
5571	NC_013714	GCC	2	6	290804	290809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455172
5572	NC_013714	GCCTCC	2	12	290864	290875	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	283455172
5573	NC_013714	CCG	2	6	290883	290888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455172
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5575	NC_013714	TGC	2	6	290937	290942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455172
5576	NC_013714	TCGACG	2	12	290976	290987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455172
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5579	NC_013714	CGA	2	6	291070	291075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455172
5580	NC_013714	TGA	2	6	291090	291095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455172
5581	NC_013714	CGC	2	6	291118	291123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455172
5582	NC_013714	ACG	2	6	291147	291152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455172
5583	NC_013714	GTG	2	6	291206	291211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455172
5584	NC_013714	CGG	2	6	291214	291219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455172
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5586	NC_013714	CCG	2	6	291705	291710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455173
5587	NC_013714	GCG	2	6	291711	291716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455173
5588	NC_013714	GGC	2	6	291778	291783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455173
5589	NC_013714	GCC	2	6	291800	291805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455173
5590	NC_013714	CTT	2	6	291821	291826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455173
5591	NC_013714	CGG	2	6	291895	291900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455173
5592	NC_013714	CGA	2	6	291928	291933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455173
5593	NC_013714	CTC	2	6	291935	291940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455173
5594	NC_013714	TGA	2	6	291964	291969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455173
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5598	NC_013714	TTCC	2	8	292229	292236	0 %	50 %	0 %	50 %	283455173
5599	NC_013714	TGG	2	6	292323	292328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455173
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5601	NC_013714	TGT	2	6	292402	292407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455173
5602	NC_013714	CG	3	6	292451	292456	0 %	0 %	50 %	50 %	283455173
5603	NC_013714	GAC	2	6	292538	292543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455173
5604	NC_013714	CCG	2	6	292590	292595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455173
5605	NC_013714	CTT	2	6	292600	292605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455173
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5608	NC_013714	AGC	2	6	293076	293081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455174
5609	NC_013714	ATCGT	2	10	293085	293094	20 %	40 %	20 %	20 %	283455174
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5612	NC_013714	CG	3	6	293214	293219	0 %	0 %	50 %	50 %	283455174
5613	NC_013714	TCAA	2	8	293255	293262	50 %	25 %	0 %	25 %	283455174
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5620	NC_013714	TG	3	6	293633	293638	0 %	50 %	50 %	0 %	283455174
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5740	NC_013714	CGA	2	6	300392	300397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455178
5741	NC_013714	AAT	2	6	300423	300428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283455178
5742	NC_013714	CCAC	2	8	300433	300440	25 %	0 %	0 %	75 %	283455178
5743	NC_013714	GGCG	2	8	300485	300492	0 %	0 %	75 %	25 %	283455178
5744	NC_013714	GATC	2	8	300506	300513	25 %	25 %	25 %	25 %	283455178
5745	NC_013714	GCG	2	6	300523	300528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455178
5746	NC_013714	CGG	2	6	300590	300595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455178
5747	NC_013714	TCG	2	6	300847	300852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455178
5748	NC_013714	GCA	2	6	300878	300883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455178
5749	NC_013714	GCA	2	6	300889	300894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455178
5750	NC_013714	ATC	2	6	300954	300959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455178
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5752	NC_013714	CGG	2	6	301090	301095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455178
5753	NC_013714	TGACC	2	10	301106	301115	20 %	20 %	20 %	40 %	283455178
5754	NC_013714	ATG	2	6	301213	301218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455178
5755	NC_013714	CGGT	2	8	301265	301272	0 %	25 %	50 %	25 %	283455178
5756	NC_013714	CTGA	2	8	301405	301412	25 %	25 %	25 %	25 %	283455178
5757	NC_013714	GGC	2	6	301570	301575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455179
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5759	NC_013714	CAT	2	6	301723	301728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455179
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5761	NC_013714	CG	3	6	301842	301847	0 %	0 %	50 %	50 %	283455179
5762	NC_013714	CAG	2	6	301877	301882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455179
5763	NC_013714	CCG	2	6	302115	302120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455179
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5765	NC_013714	ATGC	2	8	302306	302313	25 %	25 %	25 %	25 %	283455179
5766	NC_013714	CGA	2	6	302374	302379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455179
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5772	NC_013714	TCCGG	2	10	302945	302954	0 %	20 %	40 %	40 %	283455180
5773	NC_013714	GCATC	2	10	302983	302992	20 %	20 %	20 %	40 %	283455180
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5780	NC_013714	GGA	2	6	303553	303558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455180
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5850	NC_013714	TCCTGT	2	12	307195	307206	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283455183
5851	NC_013714	TTC	2	6	307221	307226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455183
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5853	NC_013714	CGTT	2	8	307338	307345	0 %	50 %	25 %	25 %	283455183
5854	NC_013714	GGA	2	6	307364	307369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455183
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5978	NC_013714	TCG	2	6	312632	312637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455186
5979	NC_013714	TCA	2	6	312644	312649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455186
5980	NC_013714	GAG	2	6	312670	312675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455186
5981	NC_013714	CGC	3	9	312693	312701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455186
5982	NC_013714	ACT	2	6	313115	313120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455187
5983	NC_013714	GAG	2	6	313125	313130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455187
5984	NC_013714	CTG	2	6	313140	313145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455187
5985	NC_013714	GTAC	2	8	313197	313204	25 %	25 %	25 %	25 %	283455187
5986	NC_013714	GCC	2	6	313212	313217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455187
5987	NC_013714	CTCGG	2	10	313228	313237	0 %	20 %	40 %	40 %	283455187
5988	NC_013714	CTC	2	6	313248	313253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455187
5989	NC_013714	GC	3	6	313257	313262	0 %	0 %	50 %	50 %	283455187
5990	NC_013714	TCG	2	6	313306	313311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455187
5991	NC_013714	CTC	2	6	313335	313340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455187
5992	NC_013714	CAC	2	6	313344	313349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455187
5993	NC_013714	TCA	2	6	313442	313447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455187
5994	NC_013714	TCG	2	6	313471	313476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455187
5995	NC_013714	CCT	2	6	313484	313489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455187
5996	NC_013714	ACC	2	6	313561	313566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455187
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5998	NC_013714	TTG	2	6	313594	313599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455187
5999	NC_013714	TCG	2	6	313612	313617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455187
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