MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 1130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	A	7	7	649	655	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
2	NC_013130	ATTAAT	2	12	663	674	50 %	50 %	0 %	0 %	256055274
3	NC_013130	AC	3	6	710	715	50 %	0 %	0 %	50 %	256055274
4	NC_013130	A	8	8	766	773	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
5	NC_013130	ATTT	2	8	797	804	25 %	75 %	0 %	0 %	256055274
6	NC_013130	TGG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055274
7	NC_013130	ATTTA	2	10	867	876	40 %	60 %	0 %	0 %	256055274
8	NC_013130	ATT	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
9	NC_013130	AGCA	2	8	960	967	50 %	0 %	25 %	25 %	256055274
10	NC_013130	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
11	NC_013130	A	7	7	1039	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
12	NC_013130	A	7	7	1117	1123	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
13	NC_013130	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
14	NC_013130	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	256055275
15	NC_013130	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
16	NC_013130	ATG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
17	NC_013130	AAC	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055275
18	NC_013130	TGA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
19	NC_013130	GAATT	2	10	1587	1596	40 %	40 %	20 %	0 %	256055275
20	NC_013130	AGCAA	2	10	1598	1607	60 %	0 %	20 %	20 %	256055275
21	NC_013130	TTAAAC	2	12	1634	1645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256055275
22	NC_013130	TTA	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
23	NC_013130	TAG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
24	NC_013130	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
25	NC_013130	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
26	NC_013130	A	6	6	1841	1846	100 %	0 %	0 %	0 %	256055275
27	NC_013130	AGA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
28	NC_013130	TAA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055275
29	NC_013130	TA	3	6	1957	1962	50 %	50 %	0 %	0 %	256055275
30	NC_013130	T	7	7	2034	2040	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
31	NC_013130	TTAA	2	8	2043	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	256055276
32	NC_013130	TTTTA	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	256055276
33	NC_013130	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
34	NC_013130	T	7	7	2101	2107	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
35	NC_013130	T	6	6	2160	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
36	NC_013130	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
37	NC_013130	T	6	6	2252	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
38	NC_013130	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
39	NC_013130	CT	4	8	2418	2425	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
40	NC_013130	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055276
41	NC_013130	TAT	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
42	NC_013130	GGCAT	2	10	2448	2457	20 %	20 %	40 %	20 %	256055276
43	NC_013130	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
44	NC_013130	CAAA	2	8	2542	2549	75 %	0 %	0 %	25 %	256055276
45	NC_013130	ATTT	2	8	2650	2657	25 %	75 %	0 %	0 %	256055276
46	NC_013130	A	6	6	2722	2727	100 %	0 %	0 %	0 %	256055276
47	NC_013130	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
48	NC_013130	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
49	NC_013130	TC	3	6	2813	2818	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
50	NC_013130	ATC	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055276
51	NC_013130	TA	3	6	3042	3047	50 %	50 %	0 %	0 %	256055277
52	NC_013130	T	6	6	3057	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
53	NC_013130	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
54	NC_013130	TAA	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
55	NC_013130	ACT	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
56	NC_013130	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
57	NC_013130	CAA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
58	NC_013130	TCT	3	9	3355	3363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
59	NC_013130	GTA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055277
60	NC_013130	T	6	6	3430	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
61	NC_013130	AAG	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
62	NC_013130	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
63	NC_013130	T	6	6	3482	3487	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
64	NC_013130	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
65	NC_013130	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055277
66	NC_013130	TTG	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
67	NC_013130	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
68	NC_013130	TCT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
69	NC_013130	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
70	NC_013130	CAAT	2	8	3614	3621	50 %	25 %	0 %	25 %	256055277
71	NC_013130	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
72	NC_013130	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
73	NC_013130	CTGTAT	2	12	3706	3717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256055277
74	NC_013130	TCA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
75	NC_013130	CCAC	2	8	3747	3754	25 %	0 %	0 %	75 %	256055277
76	NC_013130	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
77	NC_013130	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
78	NC_013130	CTT	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
79	NC_013130	T	6	6	3988	3993	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
80	NC_013130	T	7	7	4035	4041	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
81	NC_013130	T	8	8	4054	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
82	NC_013130	T	7	7	4120	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
83	NC_013130	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055277
84	NC_013130	GTG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055277
85	NC_013130	TCT	3	9	4174	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
86	NC_013130	AACA	2	8	4203	4210	75 %	0 %	0 %	25 %	256055277
87	NC_013130	TAA	3	9	4220	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
88	NC_013130	TAAAT	2	10	4250	4259	60 %	40 %	0 %	0 %	256055277
89	NC_013130	CAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
90	NC_013130	TAG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055278
91	NC_013130	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	256055278
92	NC_013130	TGC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055278
93	NC_013130	CTTT	2	8	4835	4842	0 %	75 %	0 %	25 %	256055278
94	NC_013130	AAC	2	6	4859	4864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055278
95	NC_013130	AGCA	2	8	4868	4875	50 %	0 %	25 %	25 %	256055278
96	NC_013130	TTAAA	2	10	4897	4906	60 %	40 %	0 %	0 %	256055278
97	NC_013130	ACC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055278
98	NC_013130	A	6	6	4955	4960	100 %	0 %	0 %	0 %	256055278
99	NC_013130	CTT	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055278
100	NC_013130	TCA	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
101	NC_013130	AAT	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
102	NC_013130	AAGAA	2	10	5092	5101	80 %	0 %	20 %	0 %	256055278
103	NC_013130	TAA	2	6	5102	5107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
104	NC_013130	ATA	2	6	5116	5121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
105	NC_013130	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055279
106	NC_013130	AAC	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055279
107	NC_013130	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055279
108	NC_013130	T	7	7	5398	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	256055279
109	NC_013130	T	9	9	5511	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	256055279
110	NC_013130	ACAATA	2	12	5581	5592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256055279
111	NC_013130	T	6	6	5595	5600	0 %	100 %	0 %	0 %	256055279
112	NC_013130	A	6	6	5677	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	256055280
113	NC_013130	AGA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
114	NC_013130	A	8	8	5704	5711	100 %	0 %	0 %	0 %	256055280
115	NC_013130	CAATT	2	10	5750	5759	40 %	40 %	0 %	20 %	256055280
116	NC_013130	ATA	2	6	5766	5771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
117	NC_013130	ACAA	2	8	5794	5801	75 %	0 %	0 %	25 %	256055280
118	NC_013130	T	6	6	5824	5829	0 %	100 %	0 %	0 %	256055280
119	NC_013130	TAAAA	2	10	5831	5840	80 %	20 %	0 %	0 %	256055280
120	NC_013130	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
121	NC_013130	TAC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
122	NC_013130	A	8	8	6022	6029	100 %	0 %	0 %	0 %	256055280
123	NC_013130	GCAA	2	8	6062	6069	50 %	0 %	25 %	25 %	256055280
124	NC_013130	CTA	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
125	NC_013130	ATTGAG	2	12	6111	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
126	NC_013130	A	9	9	6142	6150	100 %	0 %	0 %	0 %	256055280
127	NC_013130	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
128	NC_013130	AGT	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
129	NC_013130	ACA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055280
130	NC_013130	ATT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
131	NC_013130	ATG	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
132	NC_013130	A	8	8	6395	6402	100 %	0 %	0 %	0 %	256055280
133	NC_013130	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	256055280
134	NC_013130	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
135	NC_013130	ATT	3	9	6465	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
136	NC_013130	ACAA	2	8	6480	6487	75 %	0 %	0 %	25 %	256055280
137	NC_013130	CTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055280
138	NC_013130	A	6	6	6587	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	256055281
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