MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	A	7	7	640	646	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
2	NC_013129	ATTAAT	2	12	654	665	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
3	NC_013129	AC	3	6	701	706	50 %	0 %	0 %	50 %	256041952
4	NC_013129	A	8	8	757	764	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
5	NC_013129	ATTT	2	8	788	795	25 %	75 %	0 %	0 %	256041952
6	NC_013129	TGG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041952
7	NC_013129	ATTTA	2	10	858	867	40 %	60 %	0 %	0 %	256041952
8	NC_013129	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
9	NC_013129	AT	4	8	930	937	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
10	NC_013129	AGCA	2	8	951	958	50 %	0 %	25 %	25 %	256041952
11	NC_013129	TTA	2	6	986	991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
12	NC_013129	A	7	7	1030	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
13	NC_013129	A	7	7	1108	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
14	NC_013129	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
15	NC_013129	A	7	7	1448	1454	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
16	NC_013129	ATT	2	6	1457	1462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
17	NC_013129	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
18	NC_013129	AAC	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041953
19	NC_013129	TGA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
20	NC_013129	GAATT	2	10	1578	1587	40 %	40 %	20 %	0 %	256041953
21	NC_013129	AGCAA	2	10	1589	1598	60 %	0 %	20 %	20 %	256041953
22	NC_013129	TTAAAC	2	12	1625	1636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256041953
23	NC_013129	TTA	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
24	NC_013129	TAG	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
25	NC_013129	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
26	NC_013129	AGA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
27	NC_013129	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
28	NC_013129	AGA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
29	NC_013129	TAA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041953
30	NC_013129	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	256041953
31	NC_013129	T	7	7	2025	2031	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
32	NC_013129	TTAA	2	8	2034	2041	50 %	50 %	0 %	0 %	256041954
33	NC_013129	TTTTA	2	10	2066	2075	20 %	80 %	0 %	0 %	256041954
34	NC_013129	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
35	NC_013129	T	7	7	2092	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
36	NC_013129	T	6	6	2151	2156	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
37	NC_013129	ATT	2	6	2210	2215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
38	NC_013129	T	6	6	2243	2248	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
39	NC_013129	TTA	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
40	NC_013129	CT	4	8	2409	2416	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
41	NC_013129	AGT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041954
42	NC_013129	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
43	NC_013129	GGCAT	2	10	2439	2448	20 %	20 %	40 %	20 %	256041954
44	NC_013129	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
45	NC_013129	CAAA	2	8	2533	2540	75 %	0 %	0 %	25 %	256041954
46	NC_013129	ATTT	2	8	2641	2648	25 %	75 %	0 %	0 %	256041954
47	NC_013129	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	256041954
48	NC_013129	TAA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
49	NC_013129	TTA	2	6	2790	2795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
50	NC_013129	TC	3	6	2804	2809	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
51	NC_013129	ATC	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041954
52	NC_013129	TA	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	256041955
53	NC_013129	T	6	6	3048	3053	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
54	NC_013129	TTG	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
55	NC_013129	TAA	2	6	3073	3078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
56	NC_013129	ACT	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
57	NC_013129	TCT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
58	NC_013129	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
59	NC_013129	TCT	3	9	3346	3354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
60	NC_013129	GTA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041955
61	NC_013129	T	6	6	3421	3426	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
62	NC_013129	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
63	NC_013129	TTG	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
64	NC_013129	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
65	NC_013129	CAA	2	6	3485	3490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
66	NC_013129	ACC	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041955
67	NC_013129	TTG	2	6	3537	3542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
68	NC_013129	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
69	NC_013129	TCT	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
70	NC_013129	AAT	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
71	NC_013129	CAAT	2	8	3605	3612	50 %	25 %	0 %	25 %	256041955
72	NC_013129	AGA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
73	NC_013129	T	6	6	3655	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
74	NC_013129	CTGTAT	2	12	3697	3708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256041955
75	NC_013129	TCA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
76	NC_013129	CCAC	2	8	3738	3745	25 %	0 %	0 %	75 %	256041955
77	NC_013129	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
78	NC_013129	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
79	NC_013129	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
80	NC_013129	T	6	6	3979	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
81	NC_013129	T	7	7	4026	4032	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
82	NC_013129	T	8	8	4045	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
83	NC_013129	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
84	NC_013129	TTA	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041955
85	NC_013129	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041955
86	NC_013129	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
87	NC_013129	AACA	2	8	4194	4201	75 %	0 %	0 %	25 %	256041955
88	NC_013129	TAA	3	9	4211	4219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
89	NC_013129	TAAAT	2	10	4241	4250	60 %	40 %	0 %	0 %	256041955
90	NC_013129	CAT	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041956
91	NC_013129	T	6	6	4677	4682	0 %	100 %	0 %	0 %	256041956
92	NC_013129	TAG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041956
93	NC_013129	T	6	6	4750	4755	0 %	100 %	0 %	0 %	256041956
94	NC_013129	CTTT	2	8	4826	4833	0 %	75 %	0 %	25 %	256041956
95	NC_013129	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041956
96	NC_013129	TTAAA	2	10	4888	4897	60 %	40 %	0 %	0 %	256041956
97	NC_013129	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	256041956
98	NC_013129	CTT	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041956
99	NC_013129	ATC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041956
100	NC_013129	AAT	2	6	5065	5070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
101	NC_013129	AAGAA	2	10	5083	5092	80 %	0 %	20 %	0 %	256041956
102	NC_013129	TAA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
103	NC_013129	ATA	2	6	5107	5112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
104	NC_013129	TGA	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041957
105	NC_013129	AAC	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041957
106	NC_013129	GAA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041957
107	NC_013129	T	7	7	5389	5395	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
108	NC_013129	T	9	9	5502	5510	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
109	NC_013129	ACAATA	2	12	5572	5583	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256041957
110	NC_013129	T	6	6	5586	5591	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
111	NC_013129	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
112	NC_013129	AGA	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
113	NC_013129	A	8	8	5695	5702	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
114	NC_013129	CAATT	2	10	5741	5750	40 %	40 %	0 %	20 %	256041958
115	NC_013129	ATA	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041958
116	NC_013129	ACAA	2	8	5785	5792	75 %	0 %	0 %	25 %	256041958
117	NC_013129	T	6	6	5815	5820	0 %	100 %	0 %	0 %	256041958
118	NC_013129	TAAAA	2	10	5822	5831	80 %	20 %	0 %	0 %	256041958
119	NC_013129	AGA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
120	NC_013129	TAC	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041958
121	NC_013129	A	8	8	6013	6020	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
122	NC_013129	GCAA	2	8	6053	6060	50 %	0 %	25 %	25 %	256041958
123	NC_013129	CTA	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041958
124	NC_013129	ATTGAG	2	12	6102	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
125	NC_013129	A	9	9	6133	6141	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
126	NC_013129	AAG	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
127	NC_013129	AGT	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
128	NC_013129	ACA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041958
129	NC_013129	ATT	2	6	6330	6335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041958
130	NC_013129	ATG	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
131	NC_013129	A	8	8	6386	6393	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
132	NC_013129	CA	3	6	6395	6400	50 %	0 %	0 %	50 %	256041958
133	NC_013129	TAA	2	6	6425	6430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041958
134	NC_013129	ATT	3	9	6456	6464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041958
135	NC_013129	ACAA	2	8	6471	6478	75 %	0 %	0 %	25 %	256041958
136	NC_013129	CTT	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041958
137	NC_013129	A	6	6	6578	6583	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
138	NC_013129	AG	3	6	6593	6598	50 %	0 %	50 %	0 %	256041959
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