MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_012815	CCG	2	6	1662716	1662721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196838
33003	NC_012815	GCC	2	6	1662754	1662759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196838
33004	NC_012815	AGC	2	6	1662787	1662792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196838
33005	NC_012815	GTT	2	6	1662822	1662827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196838
33006	NC_012815	GC	3	6	1662849	1662854	0 %	0 %	50 %	50 %	241196838
33007	NC_012815	GCC	2	6	1662864	1662869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196838
33008	NC_012815	TTC	2	6	1662895	1662900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196838
33009	NC_012815	ACC	2	6	1662901	1662906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196838
33010	NC_012815	AGC	2	6	1662925	1662930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196838
33011	NC_012815	CAGG	2	8	1662969	1662976	25 %	0 %	50 %	25 %	241196838
33012	NC_012815	GC	3	6	1663044	1663049	0 %	0 %	50 %	50 %	241196838
33013	NC_012815	GTTCT	2	10	1663101	1663110	0 %	60 %	20 %	20 %	241196838
33014	NC_012815	GTC	2	6	1663415	1663420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33015	NC_012815	CAT	2	6	1663436	1663441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196839
33016	NC_012815	GC	3	6	1663447	1663452	0 %	0 %	50 %	50 %	241196839
33017	NC_012815	CGA	2	6	1663468	1663473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33018	NC_012815	TGT	2	6	1663492	1663497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196839
33019	NC_012815	CGC	2	6	1663552	1663557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196839
33020	NC_012815	CAC	2	6	1663589	1663594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196839
33021	NC_012815	CGA	2	6	1663621	1663626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33022	NC_012815	CG	3	6	1663627	1663632	0 %	0 %	50 %	50 %	241196839
33023	NC_012815	CGT	2	6	1663687	1663692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33024	NC_012815	TGT	2	6	1663708	1663713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196839
33025	NC_012815	GCC	2	6	1663721	1663726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196839
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33028	NC_012815	CGA	2	6	1663843	1663848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33029	NC_012815	GAT	2	6	1663871	1663876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196839
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33032	NC_012815	TCG	2	6	1664026	1664031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33033	NC_012815	GCA	3	9	1664047	1664055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
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33035	NC_012815	TGAA	2	8	1664073	1664080	50 %	25 %	25 %	0 %	241196839
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33039	NC_012815	CGT	2	6	1664266	1664271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196839
33040	NC_012815	CTGC	2	8	1664287	1664294	0 %	25 %	25 %	50 %	241196839
33041	NC_012815	CGC	2	6	1664305	1664310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196839
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33049	NC_012815	TGCG	2	8	1664545	1664552	0 %	25 %	50 %	25 %	241196839
33050	NC_012815	TTG	3	9	1664625	1664633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196839
33051	NC_012815	GCA	2	6	1664638	1664643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
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33053	NC_012815	CGG	2	6	1664665	1664670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196839
33054	NC_012815	CGA	2	6	1664707	1664712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196839
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33060	NC_012815	GCAC	2	8	1664838	1664845	25 %	0 %	25 %	50 %	241196839
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33073	NC_012815	AGCG	2	8	1665442	1665449	25 %	0 %	50 %	25 %	241196840
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33088	NC_012815	GTC	2	6	1666012	1666017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196840
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33090	NC_012815	TCG	2	6	1666184	1666189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196840
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33092	NC_012815	CG	3	6	1666204	1666209	0 %	0 %	50 %	50 %	241196840
33093	NC_012815	CTC	2	6	1666219	1666224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196840
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33098	NC_012815	TCG	2	6	1666349	1666354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196840
33099	NC_012815	TCG	2	6	1666391	1666396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196840
33100	NC_012815	GCG	2	6	1666400	1666405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196840
33101	NC_012815	AGT	2	6	1666455	1666460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196840
33102	NC_012815	GCC	2	6	1666534	1666539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196840
33103	NC_012815	TCG	2	6	1666631	1666636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196840
33104	NC_012815	CCA	2	6	1666647	1666652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196840
33105	NC_012815	GCC	2	6	1666658	1666663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196840
33106	NC_012815	TGA	2	6	1666686	1666691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196840
33107	NC_012815	CGG	2	6	1666713	1666718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196840
33108	NC_012815	TTC	2	6	1666787	1666792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196840
33109	NC_012815	GGC	2	6	1666804	1666809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196840
33110	NC_012815	GC	3	6	1666830	1666835	0 %	0 %	50 %	50 %	241196840
33111	NC_012815	CAT	2	6	1667206	1667211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196841
33112	NC_012815	GAGG	2	8	1667226	1667233	25 %	0 %	75 %	0 %	241196841
33113	NC_012815	CAG	2	6	1667283	1667288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196841
33114	NC_012815	CAA	2	6	1667324	1667329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196841
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33116	NC_012815	GGC	3	9	1667373	1667381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196841
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33118	NC_012815	GTA	2	6	1667463	1667468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196841
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33232	NC_012815	CTG	2	6	1672933	1672938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196846
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33347	NC_012815	GCA	2	6	1679122	1679127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196852
33348	NC_012815	CAC	2	6	1679141	1679146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196852
33349	NC_012815	TGA	2	6	1679152	1679157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196852
33350	NC_012815	CGC	2	6	1679188	1679193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196852
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33353	NC_012815	GTA	2	6	1679315	1679320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196852
33354	NC_012815	GCT	2	6	1679356	1679361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196852
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33359	NC_012815	CTT	2	6	1679699	1679704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196853
33360	NC_012815	TCT	2	6	1679767	1679772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196853
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33363	NC_012815	TCG	2	6	1679881	1679886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196853
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33374	NC_012815	CGT	2	6	1680325	1680330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196853
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33453	NC_012815	ATG	2	6	1683809	1683814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196857
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33458	NC_012815	TCGAA	2	10	1684327	1684336	40 %	20 %	20 %	20 %	241196858
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33460	NC_012815	GC	4	8	1684446	1684453	0 %	0 %	50 %	50 %	241196858
33461	NC_012815	GTC	2	6	1684480	1684485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196858
33462	NC_012815	TCC	2	6	1684550	1684555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196858
33463	NC_012815	TCG	2	6	1684802	1684807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196858
33464	NC_012815	GCC	2	6	1684844	1684849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196858
33465	NC_012815	GGA	2	6	1684891	1684896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196858
33466	NC_012815	AAT	2	6	1684926	1684931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196858
33467	NC_012815	CGT	2	6	1684983	1684988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196858
33468	NC_012815	GCG	2	6	1685100	1685105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196858
33469	NC_012815	CGTCTC	2	12	1685131	1685142	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241196858
33470	NC_012815	TCT	2	6	1685145	1685150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196858
33471	NC_012815	CCG	2	6	1685264	1685269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196858
33472	NC_012815	CTC	2	6	1685413	1685418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196859
33473	NC_012815	GGC	2	6	1685419	1685424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196859
33474	NC_012815	AGC	2	6	1685447	1685452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33475	NC_012815	CAG	2	6	1685473	1685478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33476	NC_012815	ATG	2	6	1685480	1685485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196859
33477	NC_012815	CTG	2	6	1685542	1685547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33478	NC_012815	ATG	2	6	1685666	1685671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196859
33479	NC_012815	CAC	2	6	1685701	1685706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196859
33480	NC_012815	CAC	2	6	1685713	1685718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196859
33481	NC_012815	AC	3	6	1685751	1685756	50 %	0 %	0 %	50 %	241196859
33482	NC_012815	TGC	2	6	1685802	1685807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33483	NC_012815	CCA	2	6	1685859	1685864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196859
33484	NC_012815	GCGA	2	8	1685885	1685892	25 %	0 %	50 %	25 %	241196859
33485	NC_012815	ACCG	2	8	1685917	1685924	25 %	0 %	25 %	50 %	241196859
33486	NC_012815	AC	3	6	1685970	1685975	50 %	0 %	0 %	50 %	241196859
33487	NC_012815	GGT	2	6	1685992	1685997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196859
33488	NC_012815	GCG	2	6	1686016	1686021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196859
33489	NC_012815	CGT	3	9	1686034	1686042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33490	NC_012815	TTC	2	6	1686053	1686058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196859
33491	NC_012815	AGA	2	6	1686078	1686083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196859
33492	NC_012815	CCA	2	6	1686127	1686132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196859
33493	NC_012815	GCG	2	6	1686188	1686193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196859
33494	NC_012815	GACCA	2	10	1686260	1686269	40 %	0 %	20 %	40 %	241196859
33495	NC_012815	ACG	2	6	1686272	1686277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196859
33496	NC_012815	GCCAC	2	10	1686287	1686296	20 %	0 %	20 %	60 %	241196859
33497	NC_012815	AGCC	2	8	1686338	1686345	25 %	0 %	25 %	50 %	241196859
33498	NC_012815	GCC	2	6	1686373	1686378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196859
33499	NC_012815	TGCA	2	8	1686436	1686443	25 %	25 %	25 %	25 %	241196859
33500	NC_012815	CAC	2	6	1686463	1686468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196859

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