MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_012815	GAT	2	6	107051	107056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195562
2004	NC_012815	CA	3	6	107063	107068	50 %	0 %	0 %	50 %	241195562
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2121	NC_012815	GGC	2	6	114052	114057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2122	NC_012815	CAT	2	6	114136	114141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195569
2123	NC_012815	AGC	2	6	114170	114175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2124	NC_012815	TCT	2	6	114213	114218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2125	NC_012815	CGG	2	6	114219	114224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2126	NC_012815	GCA	2	6	114261	114266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2127	NC_012815	GAT	2	6	114304	114309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2128	NC_012815	CTT	2	6	114322	114327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2129	NC_012815	TCT	2	6	114347	114352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2130	NC_012815	GCA	2	6	114414	114419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2131	NC_012815	GC	3	6	114424	114429	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2132	NC_012815	TCG	2	6	114467	114472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2133	NC_012815	CGC	2	6	114499	114504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195569
2134	NC_012815	CCACCT	2	12	114609	114620	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	241195569
2135	NC_012815	ACC	2	6	114677	114682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2136	NC_012815	CCT	2	6	114780	114785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195569
2137	NC_012815	CGG	2	6	114789	114794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2138	NC_012815	CGA	2	6	114795	114800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2139	NC_012815	CCA	2	6	114834	114839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2140	NC_012815	CAC	2	6	114907	114912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2141	NC_012815	GCT	2	6	114918	114923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2142	NC_012815	GAA	2	6	114949	114954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195569
2143	NC_012815	TGA	2	6	114999	115004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2144	NC_012815	TCT	2	6	115008	115013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2145	NC_012815	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	241195569
2146	NC_012815	AGC	2	6	115064	115069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2147	NC_012815	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	241195569
2148	NC_012815	CGA	2	6	115134	115139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2149	NC_012815	GAT	2	6	115156	115161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2150	NC_012815	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
2151	NC_012815	CGG	2	6	115185	115190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2152	NC_012815	CAC	2	6	115195	115200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2153	NC_012815	GGC	2	6	115201	115206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2154	NC_012815	GC	3	6	115205	115210	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2155	NC_012815	CTC	2	6	115213	115218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195569
2156	NC_012815	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	241195569
2157	NC_012815	CTG	2	6	115243	115248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2158	NC_012815	CGT	2	6	115273	115278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2159	NC_012815	ATC	3	9	115283	115291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195569
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2161	NC_012815	AGC	2	6	115400	115405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2162	NC_012815	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
2163	NC_012815	CGT	2	6	115464	115469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2164	NC_012815	CTG	2	6	115543	115548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2165	NC_012815	CGC	2	6	115584	115589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195569
2166	NC_012815	GCG	2	6	115629	115634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2167	NC_012815	TGA	2	6	115641	115646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2168	NC_012815	CG	3	6	115662	115667	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2169	NC_012815	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	241195569
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2172	NC_012815	ACG	2	6	115728	115733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
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2177	NC_012815	AGGA	2	8	115969	115976	50 %	0 %	50 %	0 %	241195569
2178	NC_012815	GAT	2	6	115999	116004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
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2181	NC_012815	GTTGCG	2	12	116358	116369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241195570
2182	NC_012815	TTG	3	9	116371	116379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2183	NC_012815	CGT	2	6	116390	116395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2184	NC_012815	TGT	2	6	116396	116401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2185	NC_012815	GTT	3	9	116418	116426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2186	NC_012815	GTT	2	6	116448	116453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2187	NC_012815	TGC	2	6	116471	116476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2191	NC_012815	AGT	2	6	116597	116602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195570
2192	NC_012815	TGT	2	6	116603	116608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2193	NC_012815	GCT	2	6	116665	116670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2194	NC_012815	CGA	2	6	116681	116686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2197	NC_012815	TCG	2	6	116794	116799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2198	NC_012815	GCCGAT	2	12	116835	116846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2200	NC_012815	CGA	2	6	116886	116891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2201	NC_012815	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	241195570
2202	NC_012815	GCC	2	6	116931	116936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195570
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2210	NC_012815	CGAC	2	8	117362	117369	25 %	0 %	25 %	50 %	241195570
2211	NC_012815	GTT	2	6	117444	117449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2212	NC_012815	GCT	2	6	117459	117464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2215	NC_012815	ATG	2	6	117568	117573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195570
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2217	NC_012815	CTG	2	6	117600	117605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2219	NC_012815	TGT	2	6	117829	117834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2220	NC_012815	CTG	2	6	117849	117854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2221	NC_012815	CGT	2	6	117873	117878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2222	NC_012815	CTG	2	6	117882	117887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2223	NC_012815	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	241195570
2224	NC_012815	TTC	2	6	117970	117975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195570
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2227	NC_012815	GTC	2	6	118152	118157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2228	NC_012815	CCG	2	6	118354	118359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
2229	NC_012815	GTG	2	6	118407	118412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195571
2230	NC_012815	CCCG	2	8	118424	118431	0 %	0 %	25 %	75 %	241195571
2231	NC_012815	TTC	2	6	118446	118451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195571
2232	NC_012815	ATGACC	2	12	118453	118464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241195571
2233	NC_012815	GC	4	8	118488	118495	0 %	0 %	50 %	50 %	241195571
2234	NC_012815	CGC	3	9	118493	118501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
2235	NC_012815	CGA	2	6	118526	118531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195571
2236	NC_012815	CTG	3	9	118575	118583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195571
2237	NC_012815	CG	3	6	118590	118595	0 %	0 %	50 %	50 %	241195571
2238	NC_012815	GCC	2	6	118650	118655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
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2240	NC_012815	TCG	2	6	118843	118848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195571
2241	NC_012815	CCG	2	6	118855	118860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
2242	NC_012815	CGC	4	12	118865	118876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
2243	NC_012815	CCG	2	6	118912	118917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
2244	NC_012815	CG	3	6	118926	118931	0 %	0 %	50 %	50 %	241195571
2245	NC_012815	CTG	2	6	118932	118937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195571
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2350	NC_012815	TCGA	2	8	123894	123901	25 %	25 %	25 %	25 %	241195575
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2353	NC_012815	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	241195575
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2359	NC_012815	CGA	2	6	124289	124294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195575
2360	NC_012815	CGC	2	6	124312	124317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195575
2361	NC_012815	CGC	2	6	124322	124327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195575
2362	NC_012815	CGC	2	6	124333	124338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195575
2363	NC_012815	CGGCGA	2	12	124351	124362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241195575
2364	NC_012815	CTG	2	6	124428	124433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195575
2365	NC_012815	GCGGTC	2	12	124494	124505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241195575
2366	NC_012815	GCC	2	6	124548	124553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195575
2367	NC_012815	CGT	2	6	124561	124566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195575
2368	NC_012815	CGA	2	6	124648	124653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195575
2369	NC_012815	GCGA	2	8	124737	124744	25 %	0 %	50 %	25 %	241195575
2370	NC_012815	GC	4	8	124775	124782	0 %	0 %	50 %	50 %	241195575
2371	NC_012815	GACG	2	8	125006	125013	25 %	0 %	50 %	25 %	241195576
2372	NC_012815	TCG	2	6	125029	125034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195576
2373	NC_012815	CGA	2	6	125081	125086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195576
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2375	NC_012815	ATC	2	6	125136	125141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195576
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2378	NC_012815	GC	3	6	125370	125375	0 %	0 %	50 %	50 %	241195576
2379	NC_012815	AGC	2	6	125392	125397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195576
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2385	NC_012815	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	241195576
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2392	NC_012815	CGC	2	6	125986	125991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195577
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2429	NC_012815	TGA	2	6	127914	127919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195579
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2433	NC_012815	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	241195580
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2444	NC_012815	CAT	2	6	128404	128409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195580
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2453	NC_012815	GGC	2	6	129407	129412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195581
2454	NC_012815	ACG	2	6	129489	129494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195581
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2457	NC_012815	TCGG	2	8	129647	129654	0 %	25 %	50 %	25 %	241195581
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2461	NC_012815	TCG	2	6	129786	129791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195581
2462	NC_012815	TCG	2	6	129815	129820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195581
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2466	NC_012815	CGC	2	6	130083	130088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195582
2467	NC_012815	CGA	2	6	130115	130120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195582
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2469	NC_012815	AGC	2	6	130234	130239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195582
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2472	NC_012815	TGC	2	6	130364	130369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195582
2473	NC_012815	GTG	2	6	130450	130455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195582
2474	NC_012815	CG	3	6	130484	130489	0 %	0 %	50 %	50 %	241195582
2475	NC_012815	TTCG	2	8	130500	130507	0 %	50 %	25 %	25 %	241195582
2476	NC_012815	CCT	2	6	130568	130573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195582
2477	NC_012815	GC	4	8	130604	130611	0 %	0 %	50 %	50 %	241195582
2478	NC_012815	AGC	2	6	130651	130656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195582
2479	NC_012815	CG	3	6	130711	130716	0 %	0 %	50 %	50 %	241195582
2480	NC_012815	GCA	2	6	130736	130741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195582
2481	NC_012815	GTCT	2	8	130761	130768	0 %	50 %	25 %	25 %	241195582
2482	NC_012815	GTT	2	6	130787	130792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195582
2483	NC_012815	GCCA	2	8	130800	130807	25 %	0 %	25 %	50 %	241195582
2484	NC_012815	GAGC	2	8	130838	130845	25 %	0 %	50 %	25 %	241195583
2485	NC_012815	ACG	2	6	130977	130982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195583
2486	NC_012815	GCC	2	6	131036	131041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195583
2487	NC_012815	GATG	2	8	131080	131087	25 %	25 %	50 %	0 %	241195583
2488	NC_012815	CGT	2	6	131194	131199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195583
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2490	NC_012815	GAA	2	6	131432	131437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195584
2491	NC_012815	GAT	2	6	131504	131509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195584
2492	NC_012815	CAG	2	6	131510	131515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195584
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2495	NC_012815	CGA	2	6	131666	131671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195584
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2498	NC_012815	GTA	2	6	131732	131737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195584
2499	NC_012815	CGT	2	6	131767	131772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195584
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