MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_012815	GCC	2	6	1000905	1000910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196306
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20005	NC_012815	CGG	2	6	1001252	1001257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196307
20006	NC_012815	AGCG	2	8	1001262	1001269	25 %	0 %	50 %	25 %	241196307
20007	NC_012815	TCG	2	6	1001315	1001320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196307
20008	NC_012815	TGC	2	6	1001326	1001331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196307
20009	NC_012815	GCC	2	6	1001342	1001347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196307
20010	NC_012815	TAT	2	6	1001355	1001360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196307
20011	NC_012815	CGT	2	6	1001368	1001373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196307
20012	NC_012815	CGG	2	6	1001379	1001384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196307
20013	NC_012815	AT	3	6	1001695	1001700	50 %	50 %	0 %	0 %	241196308
20014	NC_012815	CG	3	6	1001719	1001724	0 %	0 %	50 %	50 %	241196308
20015	NC_012815	GGC	2	6	1001819	1001824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196308
20016	NC_012815	GAG	2	6	1001873	1001878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196308
20017	NC_012815	TGAGAT	2	12	1001887	1001898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196308
20018	NC_012815	ATA	2	6	1001949	1001954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196308
20019	NC_012815	ACT	2	6	1001961	1001966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196308
20020	NC_012815	TTCG	2	8	1001983	1001990	0 %	50 %	25 %	25 %	241196308
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20114	NC_012815	CGA	2	6	1007021	1007026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20115	NC_012815	GCG	2	6	1007040	1007045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196314
20116	NC_012815	GCC	2	6	1007123	1007128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196314
20117	NC_012815	CGA	2	6	1007131	1007136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20118	NC_012815	GAT	2	6	1007174	1007179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196314
20119	NC_012815	GT	3	6	1007221	1007226	0 %	50 %	50 %	0 %	241196314
20120	NC_012815	CGC	2	6	1007302	1007307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196314
20121	NC_012815	GTG	2	6	1007311	1007316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196314
20122	NC_012815	AGC	2	6	1007346	1007351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20123	NC_012815	TCG	2	6	1007355	1007360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20124	NC_012815	TGCGG	2	10	1007376	1007385	0 %	20 %	60 %	20 %	241196314
20125	NC_012815	GTGCAC	2	12	1007465	1007476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20126	NC_012815	GCA	2	6	1007656	1007661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20127	NC_012815	CGT	2	6	1007683	1007688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20128	NC_012815	GTCG	2	8	1007774	1007781	0 %	25 %	50 %	25 %	241196314
20129	NC_012815	GCCCG	2	10	1007788	1007797	0 %	0 %	40 %	60 %	241196314
20130	NC_012815	TGG	2	6	1007803	1007808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196314
20131	NC_012815	GTG	2	6	1007846	1007851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196314
20132	NC_012815	TGC	2	6	1007865	1007870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196314
20133	NC_012815	GC	3	6	1007914	1007919	0 %	0 %	50 %	50 %	241196314
20134	NC_012815	ATG	2	6	1007973	1007978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196314
20135	NC_012815	GCG	2	6	1008003	1008008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196314
20136	NC_012815	CCT	2	6	1008211	1008216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196315
20137	NC_012815	TCG	3	9	1008243	1008251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196315
20138	NC_012815	GGT	2	6	1008290	1008295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196315
20139	NC_012815	TGTT	2	8	1008360	1008367	0 %	75 %	25 %	0 %	241196315
20140	NC_012815	GCC	2	6	1008377	1008382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196315
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20142	NC_012815	CCA	2	6	1008412	1008417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196315
20143	NC_012815	TGA	2	6	1008460	1008465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196315
20144	NC_012815	ACCGT	2	10	1008476	1008485	20 %	20 %	20 %	40 %	241196315
20145	NC_012815	GTG	2	6	1008519	1008524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196315
20146	NC_012815	GGCA	2	8	1008569	1008576	25 %	0 %	50 %	25 %	241196315
20147	NC_012815	GAT	3	9	1008584	1008592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196315
20148	NC_012815	CCT	2	6	1008630	1008635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196316
20149	NC_012815	TCG	2	6	1008665	1008670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196316
20150	NC_012815	TTC	2	6	1008713	1008718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196316
20151	NC_012815	GGC	2	6	1008733	1008738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196316
20152	NC_012815	CG	3	6	1008777	1008782	0 %	0 %	50 %	50 %	241196316
20153	NC_012815	GCA	2	6	1008792	1008797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196316
20154	NC_012815	CGCAGG	2	12	1008854	1008865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241196316
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20157	NC_012815	CCT	2	6	1008954	1008959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196316
20158	NC_012815	GGCGT	2	10	1008974	1008983	0 %	20 %	60 %	20 %	241196316
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20164	NC_012815	CCTT	2	8	1009259	1009266	0 %	50 %	0 %	50 %	241196316
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20168	NC_012815	CGCGTG	2	12	1009418	1009429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196316
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20171	NC_012815	TGCGA	2	10	1009488	1009497	20 %	20 %	40 %	20 %	241196316
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20174	NC_012815	TCG	2	6	1009550	1009555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196316
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20177	NC_012815	GAT	2	6	1009812	1009817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196317
20178	NC_012815	ATGCC	2	10	1009901	1009910	20 %	20 %	20 %	40 %	241196317
20179	NC_012815	GCA	2	6	1009930	1009935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196317
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20183	NC_012815	CG	3	6	1010076	1010081	0 %	0 %	50 %	50 %	241196317
20184	NC_012815	CCAC	2	8	1010157	1010164	25 %	0 %	0 %	75 %	241196317
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20188	NC_012815	GA	3	6	1010264	1010269	50 %	0 %	50 %	0 %	241196318
20189	NC_012815	CTG	2	6	1010284	1010289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20190	NC_012815	CGCC	2	8	1010371	1010378	0 %	0 %	25 %	75 %	241196318
20191	NC_012815	GC	3	6	1010401	1010406	0 %	0 %	50 %	50 %	241196318
20192	NC_012815	TCC	2	6	1010447	1010452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196318
20193	NC_012815	CCA	2	6	1010472	1010477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196318
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20195	NC_012815	TGC	2	6	1010534	1010539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20196	NC_012815	GCA	2	6	1010544	1010549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196318
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20199	NC_012815	GC	3	6	1010771	1010776	0 %	0 %	50 %	50 %	241196318
20200	NC_012815	GTA	2	6	1010815	1010820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196318
20201	NC_012815	CTC	2	6	1010821	1010826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196318
20202	NC_012815	ACG	2	6	1010846	1010851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20203	NC_012815	CAT	2	6	1010926	1010931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196318
20204	NC_012815	CGAA	2	8	1010958	1010965	50 %	0 %	25 %	25 %	241196318
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20210	NC_012815	GAT	2	6	1011148	1011153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196318
20211	NC_012815	GGC	2	6	1011243	1011248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196318
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20213	NC_012815	CGC	2	6	1011268	1011273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196318
20214	NC_012815	ATC	2	6	1011286	1011291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196318
20215	NC_012815	TGA	2	6	1011300	1011305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196318
20216	NC_012815	GC	3	6	1011340	1011345	0 %	0 %	50 %	50 %	241196318
20217	NC_012815	GTC	2	6	1011355	1011360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20218	NC_012815	TTG	2	6	1011392	1011397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196318
20219	NC_012815	GAACC	2	10	1011494	1011503	40 %	0 %	20 %	40 %	241196318
20220	NC_012815	CCAGC	2	10	1011520	1011529	20 %	0 %	20 %	60 %	241196318
20221	NC_012815	GCA	2	6	1011567	1011572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20222	NC_012815	CGG	2	6	1011618	1011623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196318
20223	NC_012815	GCC	2	6	1011647	1011652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196318
20224	NC_012815	GGC	2	6	1011673	1011678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196318
20225	NC_012815	GCTC	2	8	1011699	1011706	0 %	25 %	25 %	50 %	241196318
20226	NC_012815	TCG	2	6	1011719	1011724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20227	NC_012815	GCA	2	6	1011744	1011749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20228	NC_012815	GTA	2	6	1011757	1011762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196318
20229	NC_012815	CTGC	2	8	1011787	1011794	0 %	25 %	25 %	50 %	241196318
20230	NC_012815	TCG	2	6	1011800	1011805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196318
20231	NC_012815	CCA	2	6	1011813	1011818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196318
20232	NC_012815	CTC	2	6	1011820	1011825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196318
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20334	NC_012815	GCAG	2	8	1017044	1017051	25 %	0 %	50 %	25 %	241196321
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20339	NC_012815	AAGCTC	2	12	1017549	1017560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241196322
20340	NC_012815	CTC	2	6	1017579	1017584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196322
20341	NC_012815	GAGT	2	8	1017591	1017598	25 %	25 %	50 %	0 %	241196322
20342	NC_012815	CGT	3	9	1017606	1017614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196322
20343	NC_012815	ATC	2	6	1017700	1017705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196322
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20345	NC_012815	GTC	3	9	1017829	1017837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196322
20346	NC_012815	CGA	2	6	1017845	1017850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196322
20347	NC_012815	ATG	2	6	1017919	1017924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196322
20348	NC_012815	AGA	2	6	1017979	1017984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196322
20349	NC_012815	CCA	2	6	1017987	1017992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196322
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20352	NC_012815	GCC	2	6	1018275	1018280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196322
20353	NC_012815	GC	4	8	1018285	1018292	0 %	0 %	50 %	50 %	241196322
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20359	NC_012815	GTC	2	6	1018654	1018659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196323
20360	NC_012815	CGG	2	6	1018707	1018712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196323
20361	NC_012815	GAT	2	6	1018845	1018850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196323
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20366	NC_012815	CG	4	8	1018914	1018921	0 %	0 %	50 %	50 %	241196323
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20374	NC_012815	CCG	2	6	1019196	1019201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196323
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20461	NC_012815	GGCC	3	12	1023274	1023285	0 %	0 %	50 %	50 %	241196327
20462	NC_012815	CGA	2	6	1023292	1023297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196327
20463	NC_012815	GGC	2	6	1023327	1023332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196327
20464	NC_012815	GAT	2	6	1023368	1023373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196327
20465	NC_012815	TCG	2	6	1023381	1023386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196327
20466	NC_012815	ATC	2	6	1023393	1023398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196327
20467	NC_012815	CGG	2	6	1023401	1023406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196327
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20472	NC_012815	GAT	2	6	1023548	1023553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196327
20473	NC_012815	GGC	2	6	1023608	1023613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196327
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20476	NC_012815	CA	3	6	1023787	1023792	50 %	0 %	0 %	50 %	241196328
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20478	NC_012815	GGC	2	6	1023837	1023842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196328
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20480	NC_012815	ACTC	2	8	1023893	1023900	25 %	25 %	0 %	50 %	241196328
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20482	NC_012815	CGG	2	6	1023941	1023946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196328
20483	NC_012815	AAC	2	6	1023969	1023974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196328
20484	NC_012815	TCA	2	6	1023988	1023993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196328
20485	NC_012815	GC	3	6	1024010	1024015	0 %	0 %	50 %	50 %	241196328
20486	NC_012815	GGC	2	6	1024020	1024025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196328
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20488	NC_012815	CAC	2	6	1024119	1024124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196328
20489	NC_012815	GCC	2	6	1024128	1024133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196328
20490	NC_012815	CCA	2	6	1024169	1024174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196328
20491	NC_012815	CGGC	2	8	1024219	1024226	0 %	0 %	50 %	50 %	241196328
20492	NC_012815	GTCG	2	8	1024308	1024315	0 %	25 %	50 %	25 %	241196328
20493	NC_012815	GCC	2	6	1024332	1024337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196328
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