MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012815	TGAG	2	8	947484	947491	25 %	25 %	50 %	0 %	241196259
19002	NC_012815	GCA	2	6	947525	947530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196259
19003	NC_012815	TCC	2	6	947640	947645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196260
19004	NC_012815	TCC	2	6	947667	947672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196260
19005	NC_012815	ACG	2	6	947673	947678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196260
19006	NC_012815	GTTC	2	8	947701	947708	0 %	50 %	25 %	25 %	241196260
19007	NC_012815	TCG	2	6	947754	947759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196260
19008	NC_012815	CGT	3	9	947761	947769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196260
19009	NC_012815	GCA	2	6	947824	947829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196260
19010	NC_012815	TTC	2	6	947855	947860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196260
19011	NC_012815	TGA	2	6	947908	947913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196260
19012	NC_012815	CTG	3	9	947957	947965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196260
19013	NC_012815	CTT	2	6	947966	947971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196260
19014	NC_012815	CAT	2	6	947993	947998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196260
19015	NC_012815	CAT	2	6	948029	948034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196260
19016	NC_012815	AT	3	6	948033	948038	50 %	50 %	0 %	0 %	241196260
19017	NC_012815	CAT	2	6	948114	948119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196261
19018	NC_012815	CGT	2	6	948129	948134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196261
19019	NC_012815	CCT	2	6	948252	948257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196261
19020	NC_012815	CCA	2	6	948261	948266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196261
19021	NC_012815	GTT	2	6	948277	948282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196261
19022	NC_012815	AG	3	6	948372	948377	50 %	0 %	50 %	0 %	241196261
19023	NC_012815	GTG	2	6	948471	948476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196261
19024	NC_012815	TCC	2	6	948515	948520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196261
19025	NC_012815	GC	3	6	948614	948619	0 %	0 %	50 %	50 %	241196261
19026	NC_012815	GTG	2	6	948647	948652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196261
19027	NC_012815	AGA	2	6	948691	948696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196261
19028	NC_012815	CCA	2	6	948714	948719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196261
19029	NC_012815	TCC	2	6	948737	948742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196261
19030	NC_012815	TA	3	6	948748	948753	50 %	50 %	0 %	0 %	241196261
19031	NC_012815	CAG	2	6	948754	948759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196261
19032	NC_012815	TCC	2	6	948761	948766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196261
19033	NC_012815	GCG	2	6	948767	948772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196261
19034	NC_012815	AAC	2	6	948800	948805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196261
19035	NC_012815	GGA	2	6	948941	948946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196261
19036	NC_012815	GCA	2	6	948989	948994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196261
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19038	NC_012815	CCTC	2	8	949195	949202	0 %	25 %	0 %	75 %	241196262
19039	NC_012815	TCC	2	6	949250	949255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196262
19040	NC_012815	GGA	2	6	949276	949281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196262
19041	NC_012815	CTG	2	6	949300	949305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196262
19042	NC_012815	CCAGC	2	10	949321	949330	20 %	0 %	20 %	60 %	241196262
19043	NC_012815	ACC	2	6	949346	949351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196262
19044	NC_012815	TGCGT	2	10	949377	949386	0 %	40 %	40 %	20 %	241196262
19045	NC_012815	GAT	2	6	949444	949449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196262
19046	NC_012815	GTC	2	6	949498	949503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196262
19047	NC_012815	CGT	2	6	949506	949511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196262
19048	NC_012815	GTC	2	6	949528	949533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196262
19049	NC_012815	GGA	2	6	949599	949604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196262
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19051	NC_012815	TGC	2	6	949890	949895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196263
19052	NC_012815	CGC	2	6	949945	949950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196263
19053	NC_012815	TTGAGA	2	12	950034	950045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196263
19054	NC_012815	CCA	2	6	950053	950058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196263
19055	NC_012815	TCT	2	6	950074	950079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196263
19056	NC_012815	TTGCCG	2	12	950085	950096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196263
19057	NC_012815	TCGG	2	8	950115	950122	0 %	25 %	50 %	25 %	241196263
19058	NC_012815	GCG	2	6	950154	950159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196263
19059	NC_012815	GCCG	2	8	950174	950181	0 %	0 %	50 %	50 %	241196263
19060	NC_012815	AC	3	6	950224	950229	50 %	0 %	0 %	50 %	241196263
19061	NC_012815	GAAT	2	8	950251	950258	50 %	25 %	25 %	0 %	241196263
19062	NC_012815	CA	3	6	950272	950277	50 %	0 %	0 %	50 %	241196263
19063	NC_012815	CGT	2	6	950281	950286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196263
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19065	NC_012815	CGG	2	6	950361	950366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196263
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19067	NC_012815	CGT	2	6	950467	950472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196264
19068	NC_012815	TCG	2	6	950517	950522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196264
19069	NC_012815	GC	3	6	950549	950554	0 %	0 %	50 %	50 %	241196264
19070	NC_012815	GTC	2	6	950555	950560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196264
19071	NC_012815	TTC	2	6	950580	950585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196264
19072	NC_012815	GAC	2	6	950672	950677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196264
19073	NC_012815	TCG	2	6	950694	950699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196264
19074	NC_012815	TCG	2	6	950742	950747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196264
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19084	NC_012815	TGA	2	6	951109	951114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196264
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19086	NC_012815	CTT	2	6	951155	951160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196264
19087	NC_012815	TGG	2	6	951166	951171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196264
19088	NC_012815	GGC	2	6	951348	951353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196265
19089	NC_012815	GC	3	6	951352	951357	0 %	0 %	50 %	50 %	241196265
19090	NC_012815	GCG	2	6	951382	951387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196265
19091	NC_012815	TGC	2	6	951421	951426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196265
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19098	NC_012815	CG	3	6	951835	951840	0 %	0 %	50 %	50 %	241196265
19099	NC_012815	CGG	2	6	951909	951914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196265
19100	NC_012815	GCG	2	6	951954	951959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196265
19101	NC_012815	GC	3	6	951996	952001	0 %	0 %	50 %	50 %	241196265
19102	NC_012815	TCGA	2	8	952013	952020	25 %	25 %	25 %	25 %	241196265
19103	NC_012815	CCA	2	6	952035	952040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196265
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19106	NC_012815	ATGCAG	2	12	952099	952110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196265
19107	NC_012815	CCG	2	6	952121	952126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196265
19108	NC_012815	TGG	2	6	952143	952148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196265
19109	NC_012815	GAG	2	6	952211	952216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196265
19110	NC_012815	CCTG	2	8	952255	952262	0 %	25 %	25 %	50 %	241196265
19111	NC_012815	GGCG	2	8	952302	952309	0 %	0 %	75 %	25 %	241196265
19112	NC_012815	GAT	2	6	952363	952368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196265
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19115	NC_012815	TCC	2	6	952546	952551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196266
19116	NC_012815	GCG	2	6	952591	952596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196266
19117	NC_012815	CCT	2	6	952646	952651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196266
19118	NC_012815	ATCG	2	8	952680	952687	25 %	25 %	25 %	25 %	241196266
19119	NC_012815	CACT	2	8	952691	952698	25 %	25 %	0 %	50 %	241196266
19120	NC_012815	GC	3	6	952722	952727	0 %	0 %	50 %	50 %	241196266
19121	NC_012815	GCG	2	6	952731	952736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196266
19122	NC_012815	GAC	2	6	952770	952775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196266
19123	NC_012815	GGC	2	6	952865	952870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196266
19124	NC_012815	CCT	2	6	952922	952927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196266
19125	NC_012815	CGT	2	6	953078	953083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196266
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19127	NC_012815	GCAA	2	8	953191	953198	50 %	0 %	25 %	25 %	241196266
19128	NC_012815	CG	3	6	953212	953217	0 %	0 %	50 %	50 %	241196266
19129	NC_012815	GA	3	6	953270	953275	50 %	0 %	50 %	0 %	241196266
19130	NC_012815	TCCGT	2	10	953302	953311	0 %	40 %	20 %	40 %	241196266
19131	NC_012815	ACCGA	2	10	953356	953365	40 %	0 %	20 %	40 %	241196266
19132	NC_012815	GCA	2	6	953392	953397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196266
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19134	NC_012815	GCCAT	2	10	953450	953459	20 %	20 %	20 %	40 %	241196266
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19136	NC_012815	GAT	2	6	953698	953703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196267
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19138	NC_012815	CGTGCA	2	12	953765	953776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196267
19139	NC_012815	ACGA	2	8	953786	953793	50 %	0 %	25 %	25 %	241196267
19140	NC_012815	TGC	2	6	953863	953868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196267
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19147	NC_012815	GATGC	2	10	954074	954083	20 %	20 %	40 %	20 %	241196267
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19230	NC_012815	ACG	2	6	961044	961049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196274
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19233	NC_012815	CGG	2	6	961144	961149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196274
19234	NC_012815	GCG	2	6	961167	961172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196274
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19236	NC_012815	GTC	2	6	961301	961306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196274
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19238	NC_012815	GTC	2	6	961331	961336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196274
19239	NC_012815	CGT	2	6	961400	961405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196274
19240	NC_012815	TGG	2	6	961450	961455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196274
19241	NC_012815	GAT	3	9	961457	961465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196274
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19243	NC_012815	CGG	2	6	961578	961583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196274
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19245	NC_012815	GAT	2	6	961619	961624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196274
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19256	NC_012815	ATGTG	2	10	962447	962456	20 %	40 %	40 %	0 %	241196275
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19358	NC_012815	GCCATC	2	12	967361	967372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241196278
19359	NC_012815	GATC	2	8	967411	967418	25 %	25 %	25 %	25 %	241196278
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19476	NC_012815	ATT	2	6	972471	972476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196283
19477	NC_012815	CT	3	6	972575	972580	0 %	50 %	0 %	50 %	241196283
19478	NC_012815	ATC	2	6	972639	972644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196283
19479	NC_012815	GCCA	2	8	972667	972674	25 %	0 %	25 %	50 %	241196283
19480	NC_012815	CGCGG	2	10	972719	972728	0 %	0 %	60 %	40 %	241196283
19481	NC_012815	GTG	2	6	972853	972858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196283
19482	NC_012815	CAT	2	6	973112	973117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196284
19483	NC_012815	GAT	2	6	973127	973132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196284
19484	NC_012815	CAG	2	6	973184	973189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196284
19485	NC_012815	TGTT	2	8	973203	973210	0 %	75 %	25 %	0 %	241196284
19486	NC_012815	GTTG	2	8	973304	973311	0 %	50 %	50 %	0 %	241196284
19487	NC_012815	GAT	3	9	973316	973324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196284
19488	NC_012815	ATGC	2	8	973608	973615	25 %	25 %	25 %	25 %	241196284
19489	NC_012815	GTT	2	6	973741	973746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196284
19490	NC_012815	AATG	2	8	973793	973800	50 %	25 %	25 %	0 %	241196284
19491	NC_012815	ATG	3	9	973947	973955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196285
19492	NC_012815	GAT	2	6	973973	973978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196285
19493	NC_012815	TTC	2	6	973998	974003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196285
19494	NC_012815	GCC	3	9	974039	974047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196285
19495	NC_012815	GCC	3	9	974063	974071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196285
19496	NC_012815	AGC	2	6	974103	974108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196285
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19498	NC_012815	TGT	2	6	974246	974251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196286
19499	NC_012815	GGC	2	6	974297	974302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196286
19500	NC_012815	CTC	2	6	974333	974338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196286

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