MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012815	GCC	2	6	892650	892655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196203
18002	NC_012815	ATG	2	6	892656	892661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196203
18003	NC_012815	CTG	2	6	892689	892694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196203
18004	NC_012815	ACG	2	6	892768	892773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196203
18005	NC_012815	CG	3	6	892772	892777	0 %	0 %	50 %	50 %	241196203
18006	NC_012815	CTA	2	6	892790	892795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196203
18007	NC_012815	CCA	2	6	892903	892908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196203
18008	NC_012815	TCG	2	6	892948	892953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196203
18009	NC_012815	GCAA	2	8	892962	892969	50 %	0 %	25 %	25 %	241196203
18010	NC_012815	AAC	2	6	892990	892995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196203
18011	NC_012815	CTC	2	6	893025	893030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196203
18012	NC_012815	G	6	6	893044	893049	0 %	0 %	100 %	0 %	241196203
18013	NC_012815	GCA	2	6	893061	893066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196203
18014	NC_012815	TCG	2	6	893211	893216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196204
18015	NC_012815	AC	3	6	893301	893306	50 %	0 %	0 %	50 %	241196204
18016	NC_012815	GC	3	6	893325	893330	0 %	0 %	50 %	50 %	241196204
18017	NC_012815	CTA	2	6	893341	893346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196204
18018	NC_012815	GAC	2	6	893357	893362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196204
18019	NC_012815	ACG	2	6	893397	893402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196204
18020	NC_012815	TGC	2	6	893520	893525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196204
18021	NC_012815	CTA	2	6	893605	893610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196204
18022	NC_012815	AC	3	6	893691	893696	50 %	0 %	0 %	50 %	241196204
18023	NC_012815	CCG	4	12	893791	893802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196205
18024	NC_012815	GCAAG	2	10	893807	893816	40 %	0 %	40 %	20 %	241196205
18025	NC_012815	CTG	2	6	893820	893825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196205
18026	NC_012815	GTC	2	6	893832	893837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196205
18027	NC_012815	CGG	2	6	893867	893872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196205
18028	NC_012815	GCAC	2	8	893900	893907	25 %	0 %	25 %	50 %	241196205
18029	NC_012815	GGT	2	6	893921	893926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196205
18030	NC_012815	CGA	2	6	893960	893965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196205
18031	NC_012815	CGG	2	6	893986	893991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196205
18032	NC_012815	CAA	2	6	894056	894061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196205
18033	NC_012815	AC	3	6	894164	894169	50 %	0 %	0 %	50 %	241196205
18034	NC_012815	CG	3	6	894194	894199	0 %	0 %	50 %	50 %	241196205
18035	NC_012815	GGT	2	6	894209	894214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196205
18036	NC_012815	GAC	2	6	894218	894223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196205
18037	NC_012815	CTG	2	6	894267	894272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196205
18038	NC_012815	CGG	2	6	894287	894292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196205
18039	NC_012815	CG	3	6	894366	894371	0 %	0 %	50 %	50 %	241196205
18040	NC_012815	ATGT	2	8	894475	894482	25 %	50 %	25 %	0 %	241196205
18041	NC_012815	GCTG	2	8	894488	894495	0 %	25 %	50 %	25 %	241196205
18042	NC_012815	CCA	2	6	894553	894558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196205
18043	NC_012815	TGG	2	6	894685	894690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196205
18044	NC_012815	TGG	2	6	894709	894714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196205
18045	NC_012815	TG	3	6	895025	895030	0 %	50 %	50 %	0 %	241196206
18046	NC_012815	CGCGA	2	10	895044	895053	20 %	0 %	40 %	40 %	241196206
18047	NC_012815	TGA	2	6	895091	895096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196206
18048	NC_012815	GTG	2	6	895097	895102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196206
18049	NC_012815	ATG	2	6	895121	895126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196206
18050	NC_012815	CTTG	2	8	895264	895271	0 %	50 %	25 %	25 %	241196206
18051	NC_012815	TGT	2	6	895374	895379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196206
18052	NC_012815	GCG	2	6	895391	895396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196206
18053	NC_012815	GAT	2	6	895432	895437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196206
18054	NC_012815	TG	3	6	895451	895456	0 %	50 %	50 %	0 %	241196206
18055	NC_012815	GAT	2	6	895457	895462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196206
18056	NC_012815	TGC	2	6	895467	895472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196206
18057	NC_012815	GTC	2	6	895486	895491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196206
18058	NC_012815	TGA	2	6	895871	895876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196207
18059	NC_012815	TTA	2	6	895928	895933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196207
18060	NC_012815	GGC	2	6	895958	895963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196207
18061	NC_012815	AGG	2	6	895969	895974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196207
18062	NC_012815	TCG	2	6	895977	895982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196207
18063	NC_012815	CT	3	6	896004	896009	0 %	50 %	0 %	50 %	241196207
18064	NC_012815	TGG	2	6	896065	896070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196207
18065	NC_012815	GCC	2	6	896127	896132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196207
18066	NC_012815	TGC	2	6	896485	896490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196208
18067	NC_012815	TGC	2	6	896494	896499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196208
18068	NC_012815	GCA	2	6	896504	896509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196208
18069	NC_012815	CTG	2	6	896514	896519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196208
18070	NC_012815	CGCT	2	8	896557	896564	0 %	25 %	25 %	50 %	241196208
18071	NC_012815	TCG	2	6	896568	896573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196208
18072	NC_012815	CATGG	2	10	896583	896592	20 %	20 %	40 %	20 %	241196208
18073	NC_012815	GATT	2	8	896665	896672	25 %	50 %	25 %	0 %	241196208
18074	NC_012815	CCGG	2	8	896687	896694	0 %	0 %	50 %	50 %	241196208
18075	NC_012815	TGG	2	6	896794	896799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196208
18076	NC_012815	GGT	2	6	896810	896815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196208
18077	NC_012815	TCGG	2	8	896910	896917	0 %	25 %	50 %	25 %	241196208
18078	NC_012815	CACAT	3	15	897059	897073	40 %	20 %	0 %	40 %	241196209
18079	NC_012815	GTCGGC	2	12	897074	897085	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196209
18080	NC_012815	GATC	2	8	897103	897110	25 %	25 %	25 %	25 %	241196209
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18082	NC_012815	GTC	2	6	897182	897187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196209
18083	NC_012815	CCA	2	6	897280	897285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196209
18084	NC_012815	AT	3	6	897331	897336	50 %	50 %	0 %	0 %	241196209
18085	NC_012815	TCA	2	6	897408	897413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196209
18086	NC_012815	CTTC	2	8	897455	897462	0 %	50 %	0 %	50 %	241196209
18087	NC_012815	CAC	2	6	897476	897481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196209
18088	NC_012815	GGA	2	6	897515	897520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196209
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18090	NC_012815	TCG	2	6	897667	897672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196209
18091	NC_012815	ACATC	2	10	897679	897688	40 %	20 %	0 %	40 %	241196209
18092	NC_012815	GTG	2	6	897705	897710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196209
18093	NC_012815	ATCGAG	2	12	897881	897892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196209
18094	NC_012815	CTG	2	6	897905	897910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196209
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18101	NC_012815	GGT	2	6	898448	898453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196209
18102	NC_012815	TGG	3	9	898465	898473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196209
18103	NC_012815	CA	3	6	898513	898518	50 %	0 %	0 %	50 %	241196209
18104	NC_012815	AGCC	2	8	898525	898532	25 %	0 %	25 %	50 %	241196209
18105	NC_012815	ATG	2	6	898557	898562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196209
18106	NC_012815	GCT	2	6	898703	898708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196210
18107	NC_012815	GCC	2	6	898815	898820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196210
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18109	NC_012815	TCT	2	6	898952	898957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196210
18110	NC_012815	GGC	2	6	899001	899006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196210
18111	NC_012815	GAGC	2	8	899148	899155	25 %	0 %	50 %	25 %	241196210
18112	NC_012815	CCA	2	6	899159	899164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196210
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18115	NC_012815	CGT	2	6	899264	899269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196210
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18117	NC_012815	CGC	2	6	899393	899398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196210
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18119	NC_012815	TGT	2	6	899573	899578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196210
18120	NC_012815	ACC	2	6	899607	899612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196210
18121	NC_012815	CTC	2	6	899667	899672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196210
18122	NC_012815	TCG	2	6	899683	899688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196210
18123	NC_012815	TCG	2	6	899872	899877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196210
18124	NC_012815	ACC	2	6	899890	899895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196210
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18131	NC_012815	CGG	2	6	900547	900552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196211
18132	NC_012815	CGG	2	6	900626	900631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196211
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18135	NC_012815	GCA	2	6	900838	900843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196211
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18142	NC_012815	CTG	2	6	901651	901656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196212
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18144	NC_012815	CTG	2	6	901723	901728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196212
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18223	NC_012815	CGA	2	6	905676	905681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196215
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18232	NC_012815	CGC	2	6	906223	906228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196216
18233	NC_012815	GAAG	2	8	906250	906257	50 %	0 %	50 %	0 %	241196216
18234	NC_012815	GAA	2	6	906263	906268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196216
18235	NC_012815	GGTC	2	8	906298	906305	0 %	25 %	50 %	25 %	241196216
18236	NC_012815	AAG	2	6	906350	906355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196216
18237	NC_012815	TCG	2	6	906378	906383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196216
18238	NC_012815	GAT	2	6	906385	906390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196216
18239	NC_012815	GCC	2	6	906410	906415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196216
18240	NC_012815	GCC	2	6	906428	906433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196216
18241	NC_012815	CGA	2	6	906472	906477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196216
18242	NC_012815	CGT	2	6	906490	906495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196216
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18244	NC_012815	TCG	2	6	906567	906572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196216
18245	NC_012815	GTC	2	6	906576	906581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196216
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18250	NC_012815	TTC	2	6	907054	907059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196217
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18252	NC_012815	TGA	2	6	907130	907135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196217
18253	NC_012815	GT	3	6	907385	907390	0 %	50 %	50 %	0 %	241196217
18254	NC_012815	CCG	2	6	907394	907399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196217
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18256	NC_012815	ATGGCC	2	12	907492	907503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196217
18257	NC_012815	ACA	2	6	907508	907513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196217
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18264	NC_012815	CCA	2	6	907835	907840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196218
18265	NC_012815	CTG	2	6	907966	907971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196218
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18272	NC_012815	CAT	2	6	908441	908446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196219
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18274	NC_012815	TGG	2	6	908488	908493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196219
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18301	NC_012815	TGA	2	6	910128	910133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196220
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18311	NC_012815	ATC	2	6	910995	911000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196221
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18318	NC_012815	TGA	2	6	911547	911552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196222
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18320	NC_012815	TCA	2	6	911636	911641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196222
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18325	NC_012815	CCATCG	2	12	911822	911833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241196222
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18330	NC_012815	TTC	2	6	911984	911989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196223
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18335	NC_012815	TCGCC	2	10	912186	912195	0 %	20 %	20 %	60 %	241196223
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18338	NC_012815	GCGT	2	8	912306	912313	0 %	25 %	50 %	25 %	241196223
18339	NC_012815	TGA	2	6	912387	912392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196223
18340	NC_012815	GTGG	2	8	912404	912411	0 %	25 %	75 %	0 %	241196223
18341	NC_012815	TG	3	6	912412	912417	0 %	50 %	50 %	0 %	241196223
18342	NC_012815	GCG	2	6	912555	912560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196223
18343	NC_012815	GAGCAT	2	12	912802	912813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196224
18344	NC_012815	CCTG	2	8	912837	912844	0 %	25 %	25 %	50 %	241196224
18345	NC_012815	GACG	2	8	912854	912861	25 %	0 %	50 %	25 %	241196224
18346	NC_012815	CGT	2	6	913006	913011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196224
18347	NC_012815	TGC	2	6	913089	913094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196224
18348	NC_012815	TGCGG	2	10	913097	913106	0 %	20 %	60 %	20 %	241196224
18349	NC_012815	GGTGCT	2	12	913183	913194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241196224
18350	NC_012815	AGC	2	6	913224	913229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196224
18351	NC_012815	TGG	2	6	913295	913300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196224
18352	NC_012815	GAG	2	6	913313	913318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196224
18353	NC_012815	TGC	2	6	913335	913340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196224
18354	NC_012815	GATG	2	8	913348	913355	25 %	25 %	50 %	0 %	241196224
18355	NC_012815	GCA	2	6	913366	913371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196224
18356	NC_012815	GAT	2	6	913387	913392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196224
18357	NC_012815	GGT	2	6	913408	913413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196224
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18473	NC_012815	GGA	2	6	920127	920132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196231
18474	NC_012815	TG	5	10	920169	920178	0 %	50 %	50 %	0 %	241196231
18475	NC_012815	GCT	2	6	920197	920202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196231
18476	NC_012815	CAAGG	2	10	920203	920212	40 %	0 %	40 %	20 %	241196231
18477	NC_012815	GC	3	6	920287	920292	0 %	0 %	50 %	50 %	241196231
18478	NC_012815	GGC	2	6	920319	920324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196231
18479	NC_012815	ACGC	2	8	920357	920364	25 %	0 %	25 %	50 %	241196231
18480	NC_012815	GAC	2	6	920469	920474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196232
18481	NC_012815	CCAT	2	8	920494	920501	25 %	25 %	0 %	50 %	241196232
18482	NC_012815	TGC	2	6	920552	920557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196232
18483	NC_012815	CAT	2	6	920562	920567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196232
18484	NC_012815	ACC	2	6	920635	920640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196232
18485	NC_012815	TGG	2	6	920642	920647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196232
18486	NC_012815	TCG	2	6	920663	920668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196232
18487	NC_012815	CAT	2	6	920685	920690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196232
18488	NC_012815	CAC	2	6	920691	920696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196232
18489	NC_012815	TTC	2	6	920707	920712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196232
18490	NC_012815	CGG	2	6	920754	920759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196232
18491	NC_012815	GCG	2	6	920786	920791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196232
18492	NC_012815	GCATGG	2	12	920800	920811	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241196232
18493	NC_012815	GCT	2	6	920865	920870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196232
18494	NC_012815	CAC	2	6	920931	920936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196232
18495	NC_012815	GCTCAA	2	12	920949	920960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241196232
18496	NC_012815	GAT	2	6	921054	921059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196232
18497	NC_012815	GCC	2	6	921076	921081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196232
18498	NC_012815	ATC	2	6	921085	921090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196232
18499	NC_012815	ATGTG	2	10	921146	921155	20 %	40 %	40 %	0 %	241196232
18500	NC_012815	TGC	2	6	921185	921190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196232

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