MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012815	CTG	2	6	838197	838202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196155
17002	NC_012815	CCTC	2	8	838249	838256	0 %	25 %	0 %	75 %	241196155
17003	NC_012815	CGC	3	9	838391	838399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196155
17004	NC_012815	GCT	3	9	838426	838434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196155
17005	NC_012815	CCT	2	6	838551	838556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196156
17006	NC_012815	TCG	2	6	838590	838595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196156
17007	NC_012815	GC	3	6	838619	838624	0 %	0 %	50 %	50 %	241196156
17008	NC_012815	GCT	2	6	839030	839035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196157
17009	NC_012815	GTG	2	6	839043	839048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196157
17010	NC_012815	CGC	2	6	839099	839104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196157
17011	NC_012815	ATC	2	6	839106	839111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196157
17012	NC_012815	TCG	2	6	839146	839151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196157
17013	NC_012815	A	6	6	839262	839267	100 %	0 %	0 %	0 %	241196157
17014	NC_012815	GCG	2	6	839305	839310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196157
17015	NC_012815	TTC	2	6	839331	839336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196157
17016	NC_012815	GGC	2	6	839361	839366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196157
17017	NC_012815	CGT	2	6	839375	839380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196157
17018	NC_012815	CAC	2	6	839390	839395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196157
17019	NC_012815	GC	3	6	839407	839412	0 %	0 %	50 %	50 %	241196157
17020	NC_012815	TCG	2	6	839413	839418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196157
17021	NC_012815	GCCGT	2	10	839488	839497	0 %	20 %	40 %	40 %	241196157
17022	NC_012815	GCG	2	6	839500	839505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196157
17023	NC_012815	ACG	2	6	839590	839595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17024	NC_012815	TGC	2	6	839696	839701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17025	NC_012815	CCA	2	6	839729	839734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196158
17026	NC_012815	GCG	2	6	839803	839808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196158
17027	NC_012815	GGA	2	6	839832	839837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196158
17028	NC_012815	CGG	2	6	839844	839849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196158
17029	NC_012815	TGG	2	6	839874	839879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17030	NC_012815	CG	4	8	839895	839902	0 %	0 %	50 %	50 %	241196158
17031	NC_012815	TGC	2	6	839918	839923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17032	NC_012815	GTG	2	6	839968	839973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17033	NC_012815	GGC	2	6	840091	840096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196158
17034	NC_012815	CTCGCC	2	12	840109	840120	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241196158
17035	NC_012815	TGC	3	9	840146	840154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17036	NC_012815	CGA	2	6	840156	840161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
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17038	NC_012815	GGT	2	6	840198	840203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17039	NC_012815	CGA	2	6	840239	840244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17040	NC_012815	GTG	3	9	840295	840303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17041	NC_012815	CGA	2	6	840321	840326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17042	NC_012815	GCG	2	6	840347	840352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196158
17043	NC_012815	CAG	2	6	840485	840490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17044	NC_012815	TGC	2	6	840560	840565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17045	NC_012815	ACGTC	2	10	840790	840799	20 %	20 %	20 %	40 %	241196158
17046	NC_012815	CGA	2	6	840867	840872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17047	NC_012815	GAG	2	6	840907	840912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196158
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17049	NC_012815	TGC	2	6	841049	841054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17050	NC_012815	CGA	2	6	841059	841064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17051	NC_012815	GGACA	2	10	841075	841084	40 %	0 %	40 %	20 %	241196158
17052	NC_012815	TCG	3	9	841145	841153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17053	NC_012815	GTG	2	6	841195	841200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17054	NC_012815	CGA	2	6	841236	841241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17055	NC_012815	TGC	2	6	841245	841250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
17056	NC_012815	CGC	2	6	841257	841262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196158
17057	NC_012815	GGA	2	6	841332	841337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196158
17058	NC_012815	TCAA	2	8	841372	841379	50 %	25 %	0 %	25 %	241196158
17059	NC_012815	CCTCG	2	10	841407	841416	0 %	20 %	20 %	60 %	241196158
17060	NC_012815	GTG	2	6	841477	841482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
17061	NC_012815	TGC	2	6	841568	841573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196158
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17063	NC_012815	TGG	2	6	841600	841605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196158
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17065	NC_012815	ACCG	2	8	841627	841634	25 %	0 %	25 %	50 %	241196158
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17067	NC_012815	CTGCG	2	10	841658	841667	0 %	20 %	40 %	40 %	241196158
17068	NC_012815	CAT	2	6	841692	841697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196158
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17070	NC_012815	GAC	2	6	841816	841821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
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17072	NC_012815	CGA	2	6	841863	841868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196158
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17083	NC_012815	GCT	2	6	842407	842412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196159
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17086	NC_012815	GGTG	2	8	842675	842682	0 %	25 %	75 %	0 %	241196159
17087	NC_012815	TGA	2	6	842695	842700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196159
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17089	NC_012815	CGA	2	6	842737	842742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196159
17090	NC_012815	TCC	2	6	842798	842803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196159
17091	NC_012815	TG	3	6	842877	842882	0 %	50 %	50 %	0 %	241196159
17092	NC_012815	GTTTCG	2	12	842889	842900	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241196159
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17094	NC_012815	CCGAT	2	10	843035	843044	20 %	20 %	20 %	40 %	241196160
17095	NC_012815	CATC	2	8	843051	843058	25 %	25 %	0 %	50 %	241196160
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17105	NC_012815	AGC	2	6	843391	843396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196160
17106	NC_012815	CTT	2	6	843426	843431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196160
17107	NC_012815	ACG	2	6	843526	843531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196160
17108	NC_012815	GTC	2	6	843621	843626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196160
17109	NC_012815	GCG	2	6	843709	843714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196160
17110	NC_012815	GGC	2	6	843792	843797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196160
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17112	NC_012815	GCC	2	6	843846	843851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196160
17113	NC_012815	TCT	2	6	843911	843916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196160
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17118	NC_012815	GGCCG	2	10	844125	844134	0 %	0 %	60 %	40 %	241196160
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17123	NC_012815	TCG	2	6	844484	844489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196161
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17230	NC_012815	CAG	2	6	849827	849832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196165
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17351	NC_012815	GCA	2	6	856321	856326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196171
17352	NC_012815	CGA	2	6	856389	856394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196171
17353	NC_012815	TCA	2	6	856403	856408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196171
17354	NC_012815	GCCGA	2	10	856436	856445	20 %	0 %	40 %	40 %	241196171
17355	NC_012815	ATCTC	2	10	856459	856468	20 %	40 %	0 %	40 %	241196171
17356	NC_012815	GTG	2	6	856680	856685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196172
17357	NC_012815	GC	3	6	856708	856713	0 %	0 %	50 %	50 %	241196172
17358	NC_012815	AT	3	6	856738	856743	50 %	50 %	0 %	0 %	241196172
17359	NC_012815	CGA	2	6	856756	856761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196172
17360	NC_012815	TGCA	2	8	856778	856785	25 %	25 %	25 %	25 %	241196172
17361	NC_012815	CCCG	2	8	856842	856849	0 %	0 %	25 %	75 %	241196172
17362	NC_012815	GCG	2	6	856874	856879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196172
17363	NC_012815	GGGCAA	2	12	856918	856929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241196172
17364	NC_012815	TG	3	6	857098	857103	0 %	50 %	50 %	0 %	241196172
17365	NC_012815	CCA	2	6	857151	857156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196172
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17367	NC_012815	AAGG	2	8	857225	857232	50 %	0 %	50 %	0 %	241196172
17368	NC_012815	GAG	2	6	857282	857287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196172
17369	NC_012815	CCG	2	6	857293	857298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196172
17370	NC_012815	TGG	2	6	857346	857351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196172
17371	NC_012815	TCA	2	6	857397	857402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196172
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17374	NC_012815	TCA	2	6	857538	857543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196172
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17377	NC_012815	GTG	3	9	857603	857611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196172
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17386	NC_012815	GCT	2	6	858337	858342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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17389	NC_012815	TGC	2	6	858471	858476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
17390	NC_012815	CGTGGC	2	12	858571	858582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196173
17391	NC_012815	TCGA	2	8	858617	858624	25 %	25 %	25 %	25 %	241196173
17392	NC_012815	CATGGC	2	12	858667	858678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196173
17393	NC_012815	ATC	3	9	858710	858718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196173
17394	NC_012815	TCG	2	6	858773	858778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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17397	NC_012815	CG	3	6	858897	858902	0 %	0 %	50 %	50 %	241196173
17398	NC_012815	TGC	3	9	858954	858962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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17402	NC_012815	GAA	2	6	859069	859074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196173
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17413	NC_012815	TGT	2	6	859737	859742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196174
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17425	NC_012815	GTCA	2	8	860266	860273	25 %	25 %	25 %	25 %	241196174
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17472	NC_012815	CGA	2	6	862814	862819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196177
17473	NC_012815	ATG	2	6	862885	862890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196177
17474	NC_012815	CGT	2	6	862938	862943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196177
17475	NC_012815	AAC	2	6	862944	862949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196177
17476	NC_012815	GAT	2	6	862965	862970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196177
17477	NC_012815	CCG	2	6	862973	862978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196177
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17479	NC_012815	AACG	2	8	863013	863020	50 %	0 %	25 %	25 %	241196177
17480	NC_012815	GCC	2	6	863325	863330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196177
17481	NC_012815	AAG	2	6	863499	863504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196177
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17485	NC_012815	CGA	2	6	863798	863803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196177
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17488	NC_012815	CGA	2	6	863897	863902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196177
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17499	NC_012815	TCA	2	6	864363	864368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196178
17500	NC_012815	TCG	2	6	864371	864376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196178

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