MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_012815	ATC	2	6	809281	809286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196134
16502	NC_012815	ATGCC	2	10	809373	809382	20 %	20 %	20 %	40 %	241196134
16503	NC_012815	CAG	2	6	809487	809492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196134
16504	NC_012815	TTCC	2	8	809568	809575	0 %	50 %	0 %	50 %	241196134
16505	NC_012815	CTG	2	6	809580	809585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196134
16506	NC_012815	GCA	2	6	809606	809611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196134
16507	NC_012815	ATCGAG	2	12	809628	809639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196134
16508	NC_012815	CCT	2	6	809663	809668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196134
16509	NC_012815	GTC	2	6	809688	809693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196134
16510	NC_012815	GTG	2	6	809707	809712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196134
16511	NC_012815	CGC	2	6	809784	809789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196134
16512	NC_012815	GTT	2	6	809808	809813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196134
16513	NC_012815	CTT	2	6	809852	809857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196134
16514	NC_012815	GTT	2	6	809901	809906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196134
16515	NC_012815	GCC	2	6	810334	810339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16516	NC_012815	CGT	2	6	810342	810347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16517	NC_012815	GCATG	2	10	810389	810398	20 %	20 %	40 %	20 %	241196135
16518	NC_012815	GTT	2	6	810456	810461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196135
16519	NC_012815	ATG	2	6	810493	810498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196135
16520	NC_012815	CCT	2	6	810587	810592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196135
16521	NC_012815	CGC	2	6	810664	810669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16522	NC_012815	CGC	2	6	810693	810698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16523	NC_012815	CGT	2	6	810765	810770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16524	NC_012815	GAT	2	6	810774	810779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196135
16525	NC_012815	CGC	2	6	810791	810796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16526	NC_012815	AG	3	6	810944	810949	50 %	0 %	50 %	0 %	241196135
16527	NC_012815	CAG	2	6	810957	810962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16528	NC_012815	CA	3	6	811007	811012	50 %	0 %	0 %	50 %	241196135
16529	NC_012815	CGC	3	9	811109	811117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16530	NC_012815	CCAGCA	2	12	811298	811309	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241196135
16531	NC_012815	GAT	2	6	811326	811331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196135
16532	NC_012815	CTG	2	6	811353	811358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16533	NC_012815	GCC	2	6	811359	811364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16534	NC_012815	CGA	2	6	811406	811411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16535	NC_012815	TGGT	2	8	811462	811469	0 %	50 %	50 %	0 %	241196135
16536	NC_012815	TCG	2	6	811486	811491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16537	NC_012815	TGC	2	6	811525	811530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16538	NC_012815	CGT	2	6	811570	811575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16539	NC_012815	CCA	2	6	811601	811606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196135
16540	NC_012815	GCC	2	6	811614	811619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16541	NC_012815	GC	3	6	811634	811639	0 %	0 %	50 %	50 %	241196135
16542	NC_012815	CAG	2	6	811641	811646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16543	NC_012815	CG	3	6	811648	811653	0 %	0 %	50 %	50 %	241196135
16544	NC_012815	ATG	2	6	811684	811689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196135
16545	NC_012815	CCG	2	6	811739	811744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16546	NC_012815	GCC	2	6	811795	811800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16547	NC_012815	ATT	2	6	811804	811809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196135
16548	NC_012815	ATG	2	6	811878	811883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196135
16549	NC_012815	TGTGC	2	10	811898	811907	0 %	40 %	40 %	20 %	241196135
16550	NC_012815	GTC	2	6	811999	812004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16551	NC_012815	GC	4	8	812044	812051	0 %	0 %	50 %	50 %	241196135
16552	NC_012815	GGCGAT	2	12	812118	812129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241196135
16553	NC_012815	GTT	2	6	812132	812137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196135
16554	NC_012815	TG	3	6	812155	812160	0 %	50 %	50 %	0 %	241196135
16555	NC_012815	C	6	6	812168	812173	0 %	0 %	0 %	100 %	241196135
16556	NC_012815	TCG	2	6	812269	812274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16557	NC_012815	CGT	2	6	812283	812288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16558	NC_012815	CGT	2	6	812332	812337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16559	NC_012815	TCGGCG	2	12	812353	812364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196135
16560	NC_012815	TCG	2	6	812371	812376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16561	NC_012815	GC	3	6	812420	812425	0 %	0 %	50 %	50 %	241196135
16562	NC_012815	CGA	2	6	812477	812482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16563	NC_012815	TCG	2	6	812521	812526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196135
16564	NC_012815	CCG	2	6	812542	812547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196135
16565	NC_012815	ACG	2	6	812643	812648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196136
16566	NC_012815	GCA	2	6	812680	812685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196136
16567	NC_012815	ATC	2	6	812697	812702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196136
16568	NC_012815	TGC	2	6	812712	812717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196136
16569	NC_012815	TGA	2	6	812743	812748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196136
16570	NC_012815	GCC	2	6	812766	812771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196136
16571	NC_012815	CGG	2	6	812782	812787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196136
16572	NC_012815	GAG	2	6	812792	812797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196136
16573	NC_012815	GGCA	2	8	813023	813030	25 %	0 %	50 %	25 %	241196136
16574	NC_012815	CGA	2	6	813070	813075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196136
16575	NC_012815	CAG	2	6	813790	813795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196137
16576	NC_012815	AAG	2	6	813865	813870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196137
16577	NC_012815	ACG	2	6	813965	813970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196137
16578	NC_012815	GCG	3	9	814006	814014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196137
16579	NC_012815	CCA	2	6	814037	814042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196137
16580	NC_012815	AAGGGC	2	12	814126	814137	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241196137
16581	NC_012815	TAC	2	6	814219	814224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196137
16582	NC_012815	GTT	2	6	814254	814259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196137
16583	NC_012815	CGG	2	6	814266	814271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196137
16584	NC_012815	CGC	2	6	814332	814337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196137
16585	NC_012815	GCC	2	6	814369	814374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196137
16586	NC_012815	TAC	2	6	814375	814380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196137
16587	NC_012815	CAG	2	6	814387	814392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196137
16588	NC_012815	ATG	2	6	814776	814781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196138
16589	NC_012815	ATCGA	2	10	814836	814845	40 %	20 %	20 %	20 %	241196138
16590	NC_012815	ACGGG	2	10	814940	814949	20 %	0 %	60 %	20 %	241196138
16591	NC_012815	AAT	2	6	814992	814997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196138
16592	NC_012815	AGCG	2	8	815022	815029	25 %	0 %	50 %	25 %	241196138
16593	NC_012815	TTC	2	6	815088	815093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196138
16594	NC_012815	CGC	2	6	815186	815191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196138
16595	NC_012815	CGA	3	9	815231	815239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16596	NC_012815	GAGC	2	8	815294	815301	25 %	0 %	50 %	25 %	241196138
16597	NC_012815	GAC	2	6	815319	815324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16598	NC_012815	GCT	2	6	815399	815404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16599	NC_012815	GAC	2	6	815412	815417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16600	NC_012815	GTG	2	6	815424	815429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196138
16601	NC_012815	TGC	3	9	815461	815469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16602	NC_012815	CGA	2	6	815486	815491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16603	NC_012815	GAC	2	6	815504	815509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16604	NC_012815	GAT	2	6	815510	815515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196138
16605	NC_012815	TTC	2	6	815550	815555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196138
16606	NC_012815	CTG	2	6	815589	815594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196138
16607	NC_012815	GAG	2	6	815658	815663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196138
16608	NC_012815	TGC	2	6	815677	815682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196139
16609	NC_012815	GAC	2	6	815816	815821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196139
16610	NC_012815	AGC	2	6	815901	815906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196139
16611	NC_012815	GGC	2	6	815918	815923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196139
16612	NC_012815	TCG	2	6	815970	815975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196139
16613	NC_012815	GGT	2	6	816047	816052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196139
16614	NC_012815	AGC	2	6	816069	816074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196139
16615	NC_012815	GCC	2	6	816170	816175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196139
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16617	NC_012815	GCG	2	6	816403	816408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196139
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16737	NC_012815	CGAA	2	8	822975	822982	50 %	0 %	25 %	25 %	241196142
16738	NC_012815	ACC	2	6	822994	822999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196142
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16741	NC_012815	TAC	2	6	823253	823258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196142
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16745	NC_012815	CCCG	2	8	823384	823391	0 %	0 %	25 %	75 %	241196142
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16856	NC_012815	TG	3	6	830534	830539	0 %	50 %	50 %	0 %	241196147
16857	NC_012815	TCG	2	6	830564	830569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196147
16858	NC_012815	CAC	2	6	830634	830639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196147
16859	NC_012815	GA	3	6	830658	830663	50 %	0 %	50 %	0 %	241196147
16860	NC_012815	TGCGGA	2	12	830696	830707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241196147
16861	NC_012815	GCCC	2	8	830714	830721	0 %	0 %	25 %	75 %	241196147
16862	NC_012815	ACATGG	2	12	830734	830745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196147
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16870	NC_012815	TCG	2	6	830998	831003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196147
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16974	NC_012815	CAT	2	6	836820	836825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196153
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16977	NC_012815	GCT	2	6	836921	836926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196154
16978	NC_012815	GTT	2	6	837281	837286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196155
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