MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012815	GCC	2	6	651200	651205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195998
13502	NC_012815	AGCA	2	8	651236	651243	50 %	0 %	25 %	25 %	241195998
13503	NC_012815	CGT	2	6	651265	651270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195998
13504	NC_012815	AAG	2	6	651395	651400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195998
13505	NC_012815	GGC	2	6	651430	651435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195998
13506	NC_012815	GAC	2	6	651452	651457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195998
13507	NC_012815	GAA	2	6	651543	651548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195998
13508	NC_012815	AAGCC	2	10	651796	651805	40 %	0 %	20 %	40 %	241195999
13509	NC_012815	TCG	2	6	651826	651831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13510	NC_012815	ATC	2	6	651837	651842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195999
13511	NC_012815	CGC	2	6	651854	651859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195999
13512	NC_012815	TCA	2	6	651877	651882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195999
13513	NC_012815	GTG	2	6	651906	651911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195999
13514	NC_012815	TGC	2	6	651961	651966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13515	NC_012815	GTG	2	6	652005	652010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195999
13516	NC_012815	TTC	2	6	652074	652079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195999
13517	NC_012815	GC	3	6	652271	652276	0 %	0 %	50 %	50 %	241195999
13518	NC_012815	AGG	2	6	652303	652308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195999
13519	NC_012815	GCC	2	6	652311	652316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195999
13520	NC_012815	GAT	2	6	652340	652345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195999
13521	NC_012815	ATC	2	6	652383	652388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195999
13522	NC_012815	CCG	2	6	652389	652394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195999
13523	NC_012815	GAC	2	6	652424	652429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13524	NC_012815	GCCGT	2	10	652443	652452	0 %	20 %	40 %	40 %	241195999
13525	NC_012815	CGA	2	6	652474	652479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13526	NC_012815	TGC	2	6	652516	652521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13527	NC_012815	TCA	2	6	652546	652551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195999
13528	NC_012815	AGC	2	6	652636	652641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13529	NC_012815	CGC	2	6	652642	652647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195999
13530	NC_012815	GACG	2	8	652658	652665	25 %	0 %	50 %	25 %	241195999
13531	NC_012815	GAC	2	6	652677	652682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195999
13532	NC_012815	AGCGA	2	10	652758	652767	40 %	0 %	40 %	20 %	241196000
13533	NC_012815	CGA	2	6	652790	652795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13534	NC_012815	CGC	3	9	652841	652849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196000
13535	NC_012815	TCA	2	6	652993	652998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196000
13536	NC_012815	CGG	2	6	653018	653023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196000
13537	NC_012815	GAT	2	6	653045	653050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196000
13538	NC_012815	CGCC	2	8	653105	653112	0 %	0 %	25 %	75 %	241196000
13539	NC_012815	GC	3	6	653114	653119	0 %	0 %	50 %	50 %	241196000
13540	NC_012815	TGC	2	6	653203	653208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13541	NC_012815	ACT	2	6	653281	653286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196000
13542	NC_012815	CGG	2	6	653303	653308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196000
13543	NC_012815	CAG	3	9	653310	653318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13544	NC_012815	GC	5	10	653331	653340	0 %	0 %	50 %	50 %	241196000
13545	NC_012815	CGA	2	6	653369	653374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13546	NC_012815	TCG	2	6	653401	653406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13547	NC_012815	GCTC	2	8	653428	653435	0 %	25 %	25 %	50 %	241196000
13548	NC_012815	ACG	2	6	653440	653445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13549	NC_012815	GAT	2	6	653453	653458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196000
13550	NC_012815	AGG	2	6	653488	653493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196000
13551	NC_012815	GTG	2	6	653529	653534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196000
13552	NC_012815	CAT	2	6	653552	653557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196000
13553	NC_012815	ATC	2	6	653560	653565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196000
13554	NC_012815	AGG	2	6	653569	653574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196000
13555	NC_012815	GCA	2	6	653594	653599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196000
13556	NC_012815	TGCT	2	8	654105	654112	0 %	50 %	25 %	25 %	241196001
13557	NC_012815	GCG	2	6	654120	654125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196001
13558	NC_012815	CGT	2	6	654146	654151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
13559	NC_012815	CGC	2	6	654179	654184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196001
13560	NC_012815	GCT	2	6	654227	654232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
13561	NC_012815	CAA	2	6	654293	654298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196001
13562	NC_012815	TCTT	2	8	654344	654351	0 %	75 %	0 %	25 %	241196001
13563	NC_012815	A	6	6	654364	654369	100 %	0 %	0 %	0 %	241196001
13564	NC_012815	AAT	2	6	654405	654410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196001
13565	NC_012815	CGC	3	9	654431	654439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196001
13566	NC_012815	GTG	2	6	654535	654540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196001
13567	NC_012815	TTC	2	6	654567	654572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196001
13568	NC_012815	GCA	2	6	654578	654583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196001
13569	NC_012815	TG	4	8	654603	654610	0 %	50 %	50 %	0 %	241196001
13570	NC_012815	TCG	2	6	654696	654701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
13571	NC_012815	CGT	2	6	654722	654727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
13572	NC_012815	GGC	2	6	654762	654767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196001
13573	NC_012815	CTCG	2	8	654932	654939	0 %	25 %	25 %	50 %	241196001
13574	NC_012815	TGCA	2	8	654947	654954	25 %	25 %	25 %	25 %	241196001
13575	NC_012815	CG	3	6	656567	656572	0 %	0 %	50 %	50 %	241196002
13576	NC_012815	CTG	2	6	656747	656752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196002
13577	NC_012815	CAA	2	6	656801	656806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196002
13578	NC_012815	AGC	2	6	656847	656852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196002
13579	NC_012815	CA	3	6	657014	657019	50 %	0 %	0 %	50 %	241196002
13580	NC_012815	TGG	2	6	657039	657044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196002
13581	NC_012815	CAG	2	6	657081	657086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196002
13582	NC_012815	CGT	2	6	657142	657147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196002
13583	NC_012815	CCA	2	6	657151	657156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196002
13584	NC_012815	CGG	2	6	657578	657583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196003
13585	NC_012815	TGG	2	6	657593	657598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196003
13586	NC_012815	CGGGTG	2	12	657613	657624	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241196003
13587	NC_012815	GAA	2	6	657627	657632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196003
13588	NC_012815	GTC	2	6	657638	657643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13589	NC_012815	TGG	2	6	657653	657658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196003
13590	NC_012815	CGA	2	6	657719	657724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13591	NC_012815	ATG	2	6	657737	657742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196003
13592	NC_012815	ATGG	2	8	657766	657773	25 %	25 %	50 %	0 %	241196003
13593	NC_012815	ATC	2	6	657784	657789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196003
13594	NC_012815	ATC	2	6	657799	657804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196003
13595	NC_012815	GGC	2	6	657879	657884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196003
13596	NC_012815	GCT	2	6	657888	657893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13597	NC_012815	CGGG	2	8	657926	657933	0 %	0 %	75 %	25 %	241196003
13598	NC_012815	GCC	2	6	658007	658012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196003
13599	NC_012815	CGC	2	6	658046	658051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196003
13600	NC_012815	TCG	3	9	658052	658060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13601	NC_012815	GGC	2	6	658098	658103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196003
13602	NC_012815	TCG	2	6	658106	658111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13603	NC_012815	GATC	2	8	658134	658141	25 %	25 %	25 %	25 %	241196003
13604	NC_012815	TGA	2	6	658154	658159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196003
13605	NC_012815	GTG	2	6	658201	658206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196003
13606	NC_012815	GAG	2	6	658294	658299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196003
13607	NC_012815	GCA	2	6	658346	658351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13608	NC_012815	GAT	2	6	658392	658397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196003
13609	NC_012815	ATC	2	6	658405	658410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196003
13610	NC_012815	CGT	2	6	658430	658435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13611	NC_012815	TGG	2	6	658445	658450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196003
13612	NC_012815	GGTGGA	2	12	658485	658496	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	241196003
13613	NC_012815	CGC	2	6	658535	658540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196003
13614	NC_012815	TGG	3	9	658547	658555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196003
13615	NC_012815	CGA	2	6	658721	658726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196003
13616	NC_012815	TCG	2	6	658733	658738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196003
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13618	NC_012815	ACTC	2	8	658826	658833	25 %	25 %	0 %	50 %	241196003
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13736	NC_012815	TCG	2	6	664179	664184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196008
13737	NC_012815	AC	3	6	664190	664195	50 %	0 %	0 %	50 %	241196008
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13972	NC_012815	ATG	2	6	676369	676374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196022
13973	NC_012815	GGCAT	2	10	676392	676401	20 %	20 %	40 %	20 %	241196022
13974	NC_012815	AGC	2	6	676462	676467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
13975	NC_012815	ACA	2	6	676481	676486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196023
13976	NC_012815	AACCG	2	10	676512	676521	40 %	0 %	20 %	40 %	241196023
13977	NC_012815	TCG	2	6	676544	676549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
13978	NC_012815	GAG	2	6	676657	676662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196023
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13980	NC_012815	ATC	2	6	676777	676782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
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13986	NC_012815	TCG	2	6	677044	677049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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13992	NC_012815	GTC	2	6	677287	677292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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13998	NC_012815	TCA	2	6	677577	677582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
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