MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012815	CAT	2	6	627728	627733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195977
13002	NC_012815	TGA	2	6	627796	627801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195977
13003	NC_012815	GTCC	2	8	627823	627830	0 %	25 %	25 %	50 %	241195977
13004	NC_012815	GAA	2	6	627839	627844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195977
13005	NC_012815	GAA	2	6	627866	627871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195977
13006	NC_012815	TCG	2	6	627892	627897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195977
13007	NC_012815	CGC	2	6	627998	628003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195977
13008	NC_012815	GGCGA	2	10	628092	628101	20 %	0 %	60 %	20 %	241195977
13009	NC_012815	CGT	2	6	628122	628127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195977
13010	NC_012815	CAT	2	6	628160	628165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195977
13011	NC_012815	GGC	2	6	628167	628172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195977
13012	NC_012815	GAT	2	6	628202	628207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195977
13013	NC_012815	ACG	2	6	628260	628265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195977
13014	NC_012815	GTG	2	6	628269	628274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195977
13015	NC_012815	GGGCGT	2	12	628277	628288	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241195977
13016	NC_012815	GGC	2	6	628313	628318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195977
13017	NC_012815	CGC	2	6	628331	628336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195977
13018	NC_012815	CGTGC	2	10	628340	628349	0 %	20 %	40 %	40 %	241195977
13019	NC_012815	CGG	2	6	628358	628363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195977
13020	NC_012815	ACT	2	6	628369	628374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195977
13021	NC_012815	TCG	2	6	628396	628401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195977
13022	NC_012815	GGC	2	6	628425	628430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195977
13023	NC_012815	GAG	2	6	628446	628451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195977
13024	NC_012815	TGC	3	9	628468	628476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195977
13025	NC_012815	AAG	2	6	628539	628544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195977
13026	NC_012815	GAT	2	6	628661	628666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195977
13027	NC_012815	CGG	2	6	628667	628672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195977
13028	NC_012815	TGA	2	6	628789	628794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195977
13029	NC_012815	CCG	2	6	628795	628800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195977
13030	NC_012815	ACT	2	6	628810	628815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195977
13031	NC_012815	ACG	2	6	629034	629039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195978
13032	NC_012815	GTG	2	6	629135	629140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195978
13033	NC_012815	CGTG	2	8	629230	629237	0 %	25 %	50 %	25 %	241195978
13034	NC_012815	CGA	2	6	629263	629268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195978
13035	NC_012815	CAA	2	6	629324	629329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195978
13036	NC_012815	TCGG	2	8	629369	629376	0 %	25 %	50 %	25 %	241195978
13037	NC_012815	AAG	2	6	629384	629389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195978
13038	NC_012815	CG	3	6	629467	629472	0 %	0 %	50 %	50 %	241195978
13039	NC_012815	CGG	2	6	629484	629489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195978
13040	NC_012815	GCC	2	6	629503	629508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195978
13041	NC_012815	GAA	2	6	629509	629514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195978
13042	NC_012815	CGG	2	6	629515	629520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195978
13043	NC_012815	TCG	2	6	629541	629546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195978
13044	NC_012815	TAC	2	6	629567	629572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195978
13045	NC_012815	CAT	2	6	629581	629586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195978
13046	NC_012815	TCG	2	6	629640	629645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195978
13047	NC_012815	CGA	2	6	629646	629651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195978
13048	NC_012815	TGA	2	6	629655	629660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195978
13049	NC_012815	TCG	2	6	629795	629800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13050	NC_012815	GACGC	2	10	629812	629821	20 %	0 %	40 %	40 %	241195979
13051	NC_012815	GCA	2	6	629931	629936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13052	NC_012815	GCC	2	6	630073	630078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195979
13053	NC_012815	ACA	2	6	630092	630097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195979
13054	NC_012815	GTG	2	6	630106	630111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195979
13055	NC_012815	TG	3	6	630110	630115	0 %	50 %	50 %	0 %	241195979
13056	NC_012815	CGA	2	6	630144	630149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13057	NC_012815	TAC	2	6	630175	630180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195979
13058	NC_012815	CGA	2	6	630228	630233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13059	NC_012815	GCCGA	2	10	630271	630280	20 %	0 %	40 %	40 %	241195979
13060	NC_012815	AGC	2	6	630308	630313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13061	NC_012815	CAT	2	6	630351	630356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195979
13062	NC_012815	CG	3	6	630362	630367	0 %	0 %	50 %	50 %	241195979
13063	NC_012815	CGA	2	6	630420	630425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13064	NC_012815	CCG	2	6	630428	630433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195979
13065	NC_012815	ACG	2	6	630452	630457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13066	NC_012815	CG	3	6	630474	630479	0 %	0 %	50 %	50 %	241195979
13067	NC_012815	TTCG	2	8	630483	630490	0 %	50 %	25 %	25 %	241195979
13068	NC_012815	GC	3	6	630516	630521	0 %	0 %	50 %	50 %	241195979
13069	NC_012815	GCC	3	9	630523	630531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195979
13070	NC_012815	GAG	2	6	630553	630558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195979
13071	NC_012815	CGT	2	6	630570	630575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195979
13072	NC_012815	TCA	2	6	630867	630872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195980
13073	NC_012815	CGA	2	6	630928	630933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
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13075	NC_012815	CGA	2	6	630970	630975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
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13083	NC_012815	GAC	2	6	631229	631234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
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13086	NC_012815	GAAC	2	8	631384	631391	50 %	0 %	25 %	25 %	241195980
13087	NC_012815	CGA	2	6	631414	631419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
13088	NC_012815	TTC	2	6	631427	631432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195980
13089	NC_012815	GC	3	6	631439	631444	0 %	0 %	50 %	50 %	241195980
13090	NC_012815	GCTC	2	8	631483	631490	0 %	25 %	25 %	50 %	241195980
13091	NC_012815	AAG	2	6	631508	631513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195980
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13094	NC_012815	TCG	2	6	631620	631625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195980
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13097	NC_012815	GAT	2	6	631672	631677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195980
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13100	NC_012815	CGA	2	6	631912	631917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
13101	NC_012815	TGCGT	2	10	631918	631927	0 %	40 %	40 %	20 %	241195980
13102	NC_012815	CGA	2	6	632068	632073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195980
13103	NC_012815	CAT	2	6	632225	632230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195981
13104	NC_012815	GC	3	6	632242	632247	0 %	0 %	50 %	50 %	241195981
13105	NC_012815	TGG	2	6	632296	632301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195981
13106	NC_012815	TCA	2	6	632350	632355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195981
13107	NC_012815	GCG	2	6	632378	632383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195981
13108	NC_012815	TGA	2	6	632545	632550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195981
13109	NC_012815	GAG	2	6	632580	632585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195981
13110	NC_012815	GAC	3	9	632616	632624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195981
13111	NC_012815	GC	3	6	632625	632630	0 %	0 %	50 %	50 %	241195981
13112	NC_012815	CGCAGA	2	12	632797	632808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195982
13113	NC_012815	GCT	2	6	632824	632829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195982
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13116	NC_012815	GAG	2	6	632927	632932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195982
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13118	NC_012815	CTG	2	6	632972	632977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195982
13119	NC_012815	CG	3	6	632979	632984	0 %	0 %	50 %	50 %	241195982
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13132	NC_012815	CGA	2	6	633538	633543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195982
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13236	NC_012815	GAA	3	9	638535	638543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195985
13237	NC_012815	GAT	2	6	638700	638705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195986
13238	NC_012815	GCCG	2	8	638742	638749	0 %	0 %	50 %	50 %	241195986
13239	NC_012815	TCG	2	6	638756	638761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195986
13240	NC_012815	GCA	2	6	638762	638767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195986
13241	NC_012815	CTG	2	6	638809	638814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195986
13242	NC_012815	GC	3	6	638858	638863	0 %	0 %	50 %	50 %	241195986
13243	NC_012815	TGC	2	6	638945	638950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195986
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13274	NC_012815	CGA	2	6	640304	640309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195987
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13351	NC_012815	GCT	2	6	644661	644666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195992
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13475	NC_012815	ACC	2	6	650113	650118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195997
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