MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012815	TCA	2	6	550852	550857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195916
11502	NC_012815	GCGTC	2	10	551060	551069	0 %	20 %	40 %	40 %	241195917
11503	NC_012815	GAG	2	6	551113	551118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195917
11504	NC_012815	ACGA	2	8	551132	551139	50 %	0 %	25 %	25 %	241195917
11505	NC_012815	GGT	3	9	551250	551258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195917
11506	NC_012815	TGA	2	6	551294	551299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195917
11507	NC_012815	TGA	2	6	551406	551411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195917
11508	NC_012815	TGC	2	6	551459	551464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195917
11509	NC_012815	CGG	2	6	551501	551506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195917
11510	NC_012815	GAG	2	6	551533	551538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195917
11511	NC_012815	CTTCGA	2	12	551550	551561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241195917
11512	NC_012815	CGG	2	6	551582	551587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195917
11513	NC_012815	GAG	2	6	551680	551685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195917
11514	NC_012815	CGG	2	6	551759	551764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195917
11515	NC_012815	GCGGA	2	10	551802	551811	20 %	0 %	60 %	20 %	241195917
11516	NC_012815	GGA	2	6	551841	551846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195917
11517	NC_012815	CGA	2	6	551862	551867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195917
11518	NC_012815	TTC	2	6	551872	551877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195917
11519	NC_012815	TCT	2	6	551927	551932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195917
11520	NC_012815	CGA	2	6	551934	551939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195917
11521	NC_012815	GC	3	6	551999	552004	0 %	0 %	50 %	50 %	241195917
11522	NC_012815	CCG	2	6	552322	552327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195918
11523	NC_012815	GACATC	2	12	552365	552376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241195918
11524	NC_012815	GAC	2	6	552449	552454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195918
11525	NC_012815	CGA	2	6	552525	552530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195918
11526	NC_012815	GTG	2	6	552536	552541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195918
11527	NC_012815	TA	3	6	552560	552565	50 %	50 %	0 %	0 %	241195918
11528	NC_012815	AC	3	6	552585	552590	50 %	0 %	0 %	50 %	241195918
11529	NC_012815	GCG	2	6	552686	552691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195918
11530	NC_012815	CCG	2	6	552785	552790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195919
11531	NC_012815	TGG	2	6	552802	552807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195919
11532	NC_012815	GAAT	2	8	552812	552819	50 %	25 %	25 %	0 %	241195919
11533	NC_012815	TCC	2	6	552828	552833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195919
11534	NC_012815	CCG	2	6	552871	552876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195919
11535	NC_012815	GCG	2	6	552897	552902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195919
11536	NC_012815	ACG	2	6	552952	552957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11537	NC_012815	CGT	2	6	553046	553051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11538	NC_012815	TTCC	2	8	553097	553104	0 %	50 %	0 %	50 %	241195919
11539	NC_012815	CGA	2	6	553136	553141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11540	NC_012815	AGG	2	6	553168	553173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195919
11541	NC_012815	CG	3	6	553205	553210	0 %	0 %	50 %	50 %	241195919
11542	NC_012815	CTC	2	6	553220	553225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195919
11543	NC_012815	AGC	2	6	553381	553386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11544	NC_012815	CGA	2	6	553451	553456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11545	NC_012815	TCG	2	6	553468	553473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11546	NC_012815	CGA	2	6	553504	553509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11547	NC_012815	AGG	2	6	553537	553542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195919
11548	NC_012815	AGA	2	6	553552	553557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195919
11549	NC_012815	CAT	2	6	553580	553585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195919
11550	NC_012815	TCG	3	9	553609	553617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11551	NC_012815	GC	3	6	553619	553624	0 %	0 %	50 %	50 %	241195919
11552	NC_012815	CGG	2	6	553628	553633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195919
11553	NC_012815	GAC	2	6	553668	553673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11554	NC_012815	GCT	2	6	553676	553681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11555	NC_012815	CCG	2	6	553720	553725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195919
11556	NC_012815	GTG	2	6	553737	553742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195919
11557	NC_012815	CG	3	6	553758	553763	0 %	0 %	50 %	50 %	241195919
11558	NC_012815	TCG	2	6	553765	553770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11559	NC_012815	CGT	2	6	553814	553819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11560	NC_012815	GCT	2	6	553820	553825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11561	NC_012815	GT	3	6	553864	553869	0 %	50 %	50 %	0 %	241195919
11562	NC_012815	CGG	2	6	554077	554082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195919
11563	NC_012815	GCACG	2	10	554098	554107	20 %	0 %	40 %	40 %	241195919
11564	NC_012815	CAG	2	6	554109	554114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11565	NC_012815	GC	3	6	554156	554161	0 %	0 %	50 %	50 %	241195919
11566	NC_012815	CGTGC	2	10	554172	554181	0 %	20 %	40 %	40 %	241195919
11567	NC_012815	TGC	2	6	554188	554193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
11568	NC_012815	GTGCG	2	10	554487	554496	0 %	20 %	60 %	20 %	241195920
11569	NC_012815	GC	3	6	554508	554513	0 %	0 %	50 %	50 %	241195920
11570	NC_012815	ACGC	2	8	554571	554578	25 %	0 %	25 %	50 %	241195920
11571	NC_012815	CCG	2	6	554600	554605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195920
11572	NC_012815	CGTG	2	8	554771	554778	0 %	25 %	50 %	25 %	241195921
11573	NC_012815	ACGA	2	8	554781	554788	50 %	0 %	25 %	25 %	241195921
11574	NC_012815	CGG	2	6	554798	554803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195921
11575	NC_012815	GCA	2	6	554822	554827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11576	NC_012815	GCA	2	6	554963	554968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11577	NC_012815	TGC	2	6	554974	554979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11578	NC_012815	TGG	3	9	555001	555009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195921
11579	NC_012815	GC	3	6	555022	555027	0 %	0 %	50 %	50 %	241195921
11580	NC_012815	CGAA	2	8	555040	555047	50 %	0 %	25 %	25 %	241195921
11581	NC_012815	ACG	2	6	555241	555246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11582	NC_012815	CGA	2	6	555295	555300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11583	NC_012815	TGC	2	6	555332	555337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11584	NC_012815	TCG	2	6	555344	555349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11585	NC_012815	GCAT	2	8	555355	555362	25 %	25 %	25 %	25 %	241195921
11586	NC_012815	AT	3	6	555370	555375	50 %	50 %	0 %	0 %	241195921
11587	NC_012815	GGCG	2	8	555376	555383	0 %	0 %	75 %	25 %	241195921
11588	NC_012815	CGA	2	6	555484	555489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11589	NC_012815	GCA	2	6	555511	555516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
11590	NC_012815	GAC	2	6	555572	555577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11591	NC_012815	AAGGCG	2	12	555578	555589	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241195922
11592	NC_012815	GCA	2	6	555625	555630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11593	NC_012815	GGC	2	6	555679	555684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195922
11594	NC_012815	CGA	2	6	555745	555750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11595	NC_012815	GCG	2	6	555839	555844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195922
11596	NC_012815	AGC	2	6	555906	555911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11597	NC_012815	GTG	2	6	555963	555968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195922
11598	NC_012815	GCA	2	6	555988	555993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11599	NC_012815	TGG	2	6	556101	556106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195922
11600	NC_012815	CAA	2	6	556141	556146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195922
11601	NC_012815	GTTC	2	8	556158	556165	0 %	50 %	25 %	25 %	241195922
11602	NC_012815	GCA	2	6	556206	556211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11603	NC_012815	ACG	2	6	556236	556241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11604	NC_012815	GGA	2	6	556246	556251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195922
11605	NC_012815	GAA	2	6	556294	556299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
11606	NC_012815	GAC	2	6	556309	556314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11607	NC_012815	CTT	2	6	556339	556344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195922
11608	NC_012815	TCG	2	6	556440	556445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11609	NC_012815	GAT	2	6	556501	556506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195922
11610	NC_012815	GC	3	6	556567	556572	0 %	0 %	50 %	50 %	241195922
11611	NC_012815	GAA	2	6	556654	556659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
11612	NC_012815	CGA	2	6	556675	556680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
11613	NC_012815	TCGA	2	8	556691	556698	25 %	25 %	25 %	25 %	241195922
11614	NC_012815	AGA	2	6	556707	556712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
11615	NC_012815	GAA	2	6	556714	556719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
11616	NC_012815	AAG	2	6	556760	556765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
11617	NC_012815	AGG	2	6	556770	556775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195922
11618	NC_012815	CGA	2	6	556806	556811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
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11623	NC_012815	TGC	3	9	557099	557107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195923
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11957	NC_012815	G	6	6	573718	573723	0 %	0 %	100 %	0 %	241195934
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11966	NC_012815	AGT	2	6	574559	574564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195936
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11968	NC_012815	GAGG	2	8	574623	574630	25 %	0 %	75 %	0 %	241195936
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11972	NC_012815	TCC	2	6	574755	574760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195936
11973	NC_012815	CAG	2	6	574872	574877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195936
11974	NC_012815	GAG	2	6	574944	574949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195936
11975	NC_012815	TCA	2	6	574954	574959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195936
11976	NC_012815	AGC	2	6	574960	574965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195936
11977	NC_012815	TGG	2	6	575039	575044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195936
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11979	NC_012815	ATCGA	2	10	575077	575086	40 %	20 %	20 %	20 %	241195936
11980	NC_012815	CGC	2	6	575099	575104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195936
11981	NC_012815	GTA	2	6	575118	575123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195936
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11983	NC_012815	GCC	2	6	575152	575157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195936
11984	NC_012815	GTA	2	6	575160	575165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195936
11985	NC_012815	TCT	2	6	575183	575188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195936
11986	NC_012815	TTG	2	6	575221	575226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195936
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11988	NC_012815	GAC	2	6	575290	575295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195936
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11992	NC_012815	CAG	2	6	576016	576021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195937
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11998	NC_012815	CGA	2	6	576433	576438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195937
11999	NC_012815	GTCG	2	8	576475	576482	0 %	25 %	50 %	25 %	241195937
12000	NC_012815	GTA	2	6	576503	576508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195937

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