MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012815	GTCGC	2	10	477047	477056	0 %	20 %	40 %	40 %	241195855
10002	NC_012815	GAGG	2	8	477079	477086	25 %	0 %	75 %	0 %	241195855
10003	NC_012815	CCG	2	6	477154	477159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10004	NC_012815	CAA	2	6	477167	477172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195856
10005	NC_012815	CGA	2	6	477173	477178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10006	NC_012815	CGT	2	6	477180	477185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10007	NC_012815	GCC	2	6	477187	477192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10008	NC_012815	CAA	2	6	477194	477199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195856
10009	NC_012815	GTG	2	6	477202	477207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195856
10010	NC_012815	CGC	2	6	477216	477221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10011	NC_012815	CCG	2	6	477227	477232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10012	NC_012815	CGT	2	6	477237	477242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10013	NC_012815	ACGAGA	2	12	477253	477264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241195856
10014	NC_012815	CGT	2	6	477275	477280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10015	NC_012815	GT	3	6	477292	477297	0 %	50 %	50 %	0 %	241195856
10016	NC_012815	GGC	2	6	477312	477317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195856
10017	NC_012815	CGC	2	6	477332	477337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10018	NC_012815	TCG	2	6	477340	477345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10019	NC_012815	CGG	2	6	477403	477408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195856
10020	NC_012815	AAG	2	6	477435	477440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195856
10021	NC_012815	ACCC	2	8	477477	477484	25 %	0 %	0 %	75 %	241195856
10022	NC_012815	TGC	2	6	477517	477522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10023	NC_012815	CGGCT	2	10	477554	477563	0 %	20 %	40 %	40 %	241195856
10024	NC_012815	GTGC	2	8	477564	477571	0 %	25 %	50 %	25 %	241195856
10025	NC_012815	AGC	2	6	477667	477672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195856
10026	NC_012815	GGA	2	6	477683	477688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195856
10027	NC_012815	CGC	2	6	477699	477704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195856
10028	NC_012815	GC	3	6	477749	477754	0 %	0 %	50 %	50 %	241195856
10029	NC_012815	GTGA	2	8	477820	477827	25 %	25 %	50 %	0 %	241195856
10030	NC_012815	AAG	2	6	477875	477880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195857
10031	NC_012815	TCG	2	6	477947	477952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195857
10032	NC_012815	CGT	2	6	477970	477975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195857
10033	NC_012815	GAG	2	6	477995	478000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195857
10034	NC_012815	AGGA	2	8	478072	478079	50 %	0 %	50 %	0 %	241195858
10035	NC_012815	GTG	2	6	478097	478102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195858
10036	NC_012815	AAG	2	6	478147	478152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195858
10037	NC_012815	GGC	2	6	478180	478185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195858
10038	NC_012815	TGC	2	6	478266	478271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195858
10039	NC_012815	GA	3	6	478298	478303	50 %	0 %	50 %	0 %	241195858
10040	NC_012815	TGG	2	6	478319	478324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195858
10041	NC_012815	GTGC	2	8	478336	478343	0 %	25 %	50 %	25 %	241195858
10042	NC_012815	CCG	2	6	478382	478387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195858
10043	NC_012815	CAT	4	12	478773	478784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195859
10044	NC_012815	CAA	2	6	478860	478865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195859
10045	NC_012815	TGC	2	6	478913	478918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10046	NC_012815	ATCG	2	8	478962	478969	25 %	25 %	25 %	25 %	241195859
10047	NC_012815	GCT	2	6	478977	478982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10048	NC_012815	GC	3	6	478983	478988	0 %	0 %	50 %	50 %	241195859
10049	NC_012815	AGG	2	6	479018	479023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195859
10050	NC_012815	TTACC	2	10	479061	479070	20 %	40 %	0 %	40 %	241195859
10051	NC_012815	TGC	2	6	479084	479089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10052	NC_012815	CG	3	6	479112	479117	0 %	0 %	50 %	50 %	241195859
10053	NC_012815	GC	3	6	479123	479128	0 %	0 %	50 %	50 %	241195859
10054	NC_012815	CAA	2	6	479145	479150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195859
10055	NC_012815	GTC	2	6	479182	479187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10056	NC_012815	TGA	2	6	479198	479203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195859
10057	NC_012815	CGG	2	6	479205	479210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195859
10058	NC_012815	CGT	2	6	479382	479387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10059	NC_012815	GCT	2	6	479388	479393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10060	NC_012815	CGC	2	6	479458	479463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195859
10061	NC_012815	GGC	2	6	479485	479490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195859
10062	NC_012815	TCC	2	6	479491	479496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195859
10063	NC_012815	ACCT	2	8	479497	479504	25 %	25 %	0 %	50 %	241195859
10064	NC_012815	GCG	2	6	479525	479530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195859
10065	NC_012815	CCG	2	6	479536	479541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195859
10066	NC_012815	TCG	2	6	479551	479556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10067	NC_012815	CAGC	2	8	479595	479602	25 %	0 %	25 %	50 %	241195859
10068	NC_012815	ACG	2	6	479641	479646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10069	NC_012815	TGA	2	6	479675	479680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195859
10070	NC_012815	TTC	2	6	479686	479691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195859
10071	NC_012815	TTC	2	6	479695	479700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195859
10072	NC_012815	ACA	2	6	479738	479743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195859
10073	NC_012815	CTG	2	6	479848	479853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10074	NC_012815	TCG	2	6	479855	479860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10075	NC_012815	TGC	2	6	479864	479869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10076	NC_012815	TCA	2	6	479879	479884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195859
10077	NC_012815	ACG	2	6	479923	479928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10078	NC_012815	CTG	2	6	479929	479934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195859
10079	NC_012815	ATC	2	6	479935	479940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195859
10080	NC_012815	CAGTAC	2	12	479989	480000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241195859
10081	NC_012815	ATG	2	6	480054	480059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195859
10082	NC_012815	CTG	2	6	480236	480241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10083	NC_012815	CA	3	6	480271	480276	50 %	0 %	0 %	50 %	241195860
10084	NC_012815	GCT	2	6	480283	480288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10085	NC_012815	CGA	2	6	480309	480314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10086	NC_012815	CG	3	6	480335	480340	0 %	0 %	50 %	50 %	241195860
10087	NC_012815	AAG	2	6	480368	480373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195860
10088	NC_012815	CGA	2	6	480409	480414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10089	NC_012815	GAT	2	6	480452	480457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195860
10090	NC_012815	GAA	2	6	480460	480465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195860
10091	NC_012815	GC	3	6	480510	480515	0 %	0 %	50 %	50 %	241195860
10092	NC_012815	CGA	2	6	480517	480522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10093	NC_012815	AGC	2	6	480543	480548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10094	NC_012815	CCA	2	6	480576	480581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195860
10095	NC_012815	TGC	2	6	480585	480590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10096	NC_012815	GC	3	6	480607	480612	0 %	0 %	50 %	50 %	241195860
10097	NC_012815	AGG	3	9	480615	480623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195860
10098	NC_012815	CGA	2	6	480631	480636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10099	NC_012815	CAG	2	6	480707	480712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195860
10100	NC_012815	GAG	2	6	480764	480769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195860
10101	NC_012815	TTGAAG	2	12	481070	481081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195861
10102	NC_012815	TTC	2	6	481190	481195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195861
10103	NC_012815	GTG	2	6	481207	481212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195861
10104	NC_012815	AAGTA	2	10	481264	481273	60 %	20 %	20 %	0 %	241195861
10105	NC_012815	CGT	2	6	481359	481364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195862
10106	NC_012815	AGC	2	6	481405	481410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195862
10107	NC_012815	AGC	2	6	481711	481716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195863
10108	NC_012815	CGT	2	6	481770	481775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195863
10109	NC_012815	CGC	2	6	481794	481799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195863
10110	NC_012815	ACGC	2	8	481876	481883	25 %	0 %	25 %	50 %	241195863
10111	NC_012815	AAG	3	9	481917	481925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195863
10112	NC_012815	CCA	2	6	481927	481932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195863
10113	NC_012815	CGCA	2	8	482034	482041	25 %	0 %	25 %	50 %	241195864
10114	NC_012815	CGC	2	6	482050	482055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195864
10115	NC_012815	CGGT	2	8	482072	482079	0 %	25 %	50 %	25 %	241195864
10116	NC_012815	AAC	2	6	482104	482109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195864
10117	NC_012815	CAT	2	6	482112	482117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195864
10118	NC_012815	TCCG	2	8	482130	482137	0 %	25 %	25 %	50 %	241195864
10119	NC_012815	CGC	2	6	482205	482210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195864
10120	NC_012815	TGGCA	2	10	482211	482220	20 %	20 %	40 %	20 %	241195864
10121	NC_012815	AAG	2	6	482260	482265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195864
10122	NC_012815	CCA	2	6	482389	482394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195864
10123	NC_012815	CGC	2	6	482401	482406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195864
10124	NC_012815	TCA	2	6	482552	482557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195865
10125	NC_012815	CAC	2	6	482679	482684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195865
10126	NC_012815	TTG	2	6	482719	482724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195865
10127	NC_012815	GCG	2	6	482795	482800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195865
10128	NC_012815	CCGG	2	8	482827	482834	0 %	0 %	50 %	50 %	241195865
10129	NC_012815	CCCAG	2	10	482931	482940	20 %	0 %	20 %	60 %	241195865
10130	NC_012815	CGC	2	6	483422	483427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195865
10131	NC_012815	CAA	2	6	483441	483446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195865
10132	NC_012815	GGC	2	6	483454	483459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195865
10133	NC_012815	CTT	2	6	483462	483467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195865
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10135	NC_012815	CCA	2	6	483644	483649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195866
10136	NC_012815	CAC	3	9	483672	483680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195866
10137	NC_012815	CGT	2	6	483792	483797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195866
10138	NC_012815	AGC	2	6	483833	483838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195866
10139	NC_012815	GGC	2	6	483844	483849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195866
10140	NC_012815	GCC	2	6	483898	483903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195866
10141	NC_012815	ATC	2	6	483904	483909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195866
10142	NC_012815	GAA	2	6	483936	483941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195866
10143	NC_012815	GAAGCC	2	12	483955	483966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195866
10144	NC_012815	ATG	2	6	484407	484412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195867
10145	NC_012815	GAT	2	6	484416	484421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195867
10146	NC_012815	CCAT	2	8	484426	484433	25 %	25 %	0 %	50 %	241195867
10147	NC_012815	CG	3	6	484463	484468	0 %	0 %	50 %	50 %	241195867
10148	NC_012815	CG	4	8	484511	484518	0 %	0 %	50 %	50 %	241195867
10149	NC_012815	ACCG	2	8	484557	484564	25 %	0 %	25 %	50 %	241195867
10150	NC_012815	TGCCGC	2	12	484589	484600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241195867
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10152	NC_012815	G	6	6	484649	484654	0 %	0 %	100 %	0 %	241195867
10153	NC_012815	GCT	2	6	484763	484768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195867
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10155	NC_012815	TCGC	2	8	484811	484818	0 %	25 %	25 %	50 %	241195867
10156	NC_012815	TGGGCA	2	12	484840	484851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241195867
10157	NC_012815	CGA	3	9	484961	484969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195867
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10159	NC_012815	AGG	2	6	485396	485401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195868
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10161	NC_012815	GTC	2	6	485535	485540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195868
10162	NC_012815	CG	4	8	485558	485565	0 %	0 %	50 %	50 %	241195868
10163	NC_012815	GGGTGC	2	12	485588	485599	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241195868
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10166	NC_012815	TGC	2	6	485709	485714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195868
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10171	NC_012815	GCG	2	6	485942	485947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195868
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10185	NC_012815	CTG	2	6	486862	486867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195869
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10223	NC_012815	GGC	2	6	488499	488504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195870
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10232	NC_012815	CGG	2	6	488711	488716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195870
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10234	NC_012815	GGCCAC	2	12	488846	488857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241195870
10235	NC_012815	CGA	2	6	488867	488872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195870
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10358	NC_012815	GCA	2	6	494036	494041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195874
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10361	NC_012815	CGGCG	2	10	494111	494120	0 %	0 %	60 %	40 %	241195874
10362	NC_012815	GCA	2	6	494129	494134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195874
10363	NC_012815	CACG	2	8	494199	494206	25 %	0 %	25 %	50 %	241195874
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10475	NC_012815	TCG	2	6	500525	500530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195878
10476	NC_012815	CGC	2	6	500547	500552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195878
10477	NC_012815	ACT	2	6	500573	500578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195878
10478	NC_012815	GAAT	2	8	500592	500599	50 %	25 %	25 %	0 %	241195878
10479	NC_012815	CGC	2	6	500826	500831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195879
10480	NC_012815	ATC	2	6	500833	500838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195879
10481	NC_012815	CGT	2	6	500853	500858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195879
10482	NC_012815	CGT	2	6	500884	500889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195879
10483	NC_012815	GAAC	2	8	500904	500911	50 %	0 %	25 %	25 %	241195879
10484	NC_012815	CGGC	2	8	500963	500970	0 %	0 %	50 %	50 %	241195879
10485	NC_012815	CG	4	8	500975	500982	0 %	0 %	50 %	50 %	241195879
10486	NC_012815	CAT	2	6	501021	501026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195879
10487	NC_012815	GTG	2	6	501097	501102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195879
10488	NC_012815	GCG	2	6	501113	501118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195879
10489	NC_012815	GGC	2	6	501151	501156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195879
10490	NC_012815	CCATG	2	10	501162	501171	20 %	20 %	20 %	40 %	241195879
10491	NC_012815	CAT	2	6	501174	501179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195879
10492	NC_012815	GGTG	2	8	501225	501232	0 %	25 %	75 %	0 %	241195879
10493	NC_012815	GGC	2	6	501240	501245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195879
10494	NC_012815	GCT	2	6	501300	501305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195879
10495	NC_012815	ACC	2	6	501308	501313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195879
10496	NC_012815	ATC	2	6	501343	501348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195879
10497	NC_012815	TGA	2	6	501371	501376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195879
10498	NC_012815	CGA	2	6	501378	501383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195879
10499	NC_012815	AAG	2	6	501400	501405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195879
10500	NC_012815	GTG	2	6	501475	501480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195879

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