MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 1927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	TCA	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025582
2	NC_012723	AGG	2	6	128	133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025582
3	NC_012723	GAG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025582
4	NC_012723	GCTC	2	8	284	291	0 %	25 %	25 %	50 %	238025582
5	NC_012723	TCG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025582
6	NC_012723	GC	3	6	361	366	0 %	0 %	50 %	50 %	238025582
7	NC_012723	CAA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025582
8	NC_012723	ACTC	2	8	527	534	25 %	25 %	0 %	50 %	238025582
9	NC_012723	CTG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025582
10	NC_012723	AG	3	6	628	633	50 %	0 %	50 %	0 %	238025582
11	NC_012723	GAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025582
12	NC_012723	CGAT	2	8	706	713	25 %	25 %	25 %	25 %	238025582
13	NC_012723	ATC	2	6	738	743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025582
14	NC_012723	AAG	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025583
15	NC_012723	GCG	2	6	815	820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025583
16	NC_012723	GCC	2	6	871	876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025583
17	NC_012723	CTT	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025583
18	NC_012723	GA	3	6	1119	1124	50 %	0 %	50 %	0 %	238025583
19	NC_012723	GCCA	2	8	1186	1193	25 %	0 %	25 %	50 %	238025583
20	NC_012723	GGAA	2	8	1275	1282	50 %	0 %	50 %	0 %	238025583
21	NC_012723	CAAG	2	8	1383	1390	50 %	0 %	25 %	25 %	238025583
22	NC_012723	GCC	3	9	1400	1408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025583
23	NC_012723	ACT	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025583
24	NC_012723	CT	4	8	1424	1431	0 %	50 %	0 %	50 %	238025583
25	NC_012723	ATCTC	2	10	1491	1500	20 %	40 %	0 %	40 %	238025583
26	NC_012723	GCC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025583
27	NC_012723	CGC	2	6	1544	1549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025583
28	NC_012723	GCT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025583
29	NC_012723	CGG	2	6	1574	1579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025583
30	NC_012723	CG	3	6	1590	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	238025583
31	NC_012723	AAC	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025583
32	NC_012723	TCG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025584
33	NC_012723	AGC	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
34	NC_012723	CG	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	238025584
35	NC_012723	GAC	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
36	NC_012723	TCTT	2	8	2758	2765	0 %	75 %	0 %	25 %	238025584
37	NC_012723	GT	3	6	2827	2832	0 %	50 %	50 %	0 %	238025584
38	NC_012723	ACG	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
39	NC_012723	GCAG	2	8	2900	2907	25 %	0 %	50 %	25 %	238025584
40	NC_012723	CAA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025584
41	NC_012723	GGAA	2	8	2977	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	238025584
42	NC_012723	GAC	3	9	3060	3068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
43	NC_012723	AGC	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
44	NC_012723	TAC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025584
45	NC_012723	TCCG	2	8	3168	3175	0 %	25 %	25 %	50 %	238025584
46	NC_012723	GTT	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238025584
47	NC_012723	CG	3	6	3225	3230	0 %	0 %	50 %	50 %	238025584
48	NC_012723	GAA	2	6	3236	3241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025584
49	NC_012723	CGA	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025584
50	NC_012723	CTT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025584
51	NC_012723	CGTG	2	8	3314	3321	0 %	25 %	50 %	25 %	238025584
52	NC_012723	CGT	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025584
53	NC_012723	GCG	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025585
54	NC_012723	GCTG	2	8	3714	3721	0 %	25 %	50 %	25 %	238025585
55	NC_012723	CGA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025585
56	NC_012723	GAG	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025585
57	NC_012723	TTG	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238025585
58	NC_012723	GCG	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025585
59	NC_012723	CTGG	2	8	4096	4103	0 %	25 %	50 %	25 %	238025585
60	NC_012723	CCCA	2	8	4112	4119	25 %	0 %	0 %	75 %	238025585
61	NC_012723	CG	4	8	4147	4154	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
62	NC_012723	CGC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025585
63	NC_012723	CGG	2	6	4168	4173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025585
64	NC_012723	ACA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025585
65	NC_012723	CCG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025585
66	NC_012723	GC	3	6	4240	4245	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
67	NC_012723	CG	3	6	4252	4257	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
68	NC_012723	GCC	2	6	4310	4315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025585
69	NC_012723	TCG	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
70	NC_012723	AGA	2	6	4338	4343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025585
71	NC_012723	AGC	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025585
72	NC_012723	TGC	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
73	NC_012723	TCG	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
74	NC_012723	GCT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
75	NC_012723	CGT	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
76	NC_012723	TCA	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025585
77	NC_012723	CTG	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
78	NC_012723	CTG	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025585
79	NC_012723	GCG	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025585
80	NC_012723	GGC	2	6	4973	4978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025586
81	NC_012723	GACG	2	8	5023	5030	25 %	0 %	50 %	25 %	238025586
82	NC_012723	GCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025586
83	NC_012723	ACG	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025586
84	NC_012723	GTG	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025586
85	NC_012723	CAG	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025586
86	NC_012723	CGC	2	6	5133	5138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025586
87	NC_012723	CCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025586
88	NC_012723	GAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025586
89	NC_012723	GAA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025586
90	NC_012723	GCC	2	6	5250	5255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025586
91	NC_012723	TCG	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025586
92	NC_012723	AG	3	6	5383	5388	50 %	0 %	50 %	0 %	238025586
93	NC_012723	CG	3	6	5409	5414	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
94	NC_012723	GGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025586
95	NC_012723	CGT	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025586
96	NC_012723	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025586
97	NC_012723	CG	3	6	5596	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
98	NC_012723	GCG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025586
99	NC_012723	CTC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238025586
100	NC_012723	GC	4	8	5732	5739	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
101	NC_012723	CGA	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025586
102	NC_012723	AGGC	2	8	5786	5793	25 %	0 %	50 %	25 %	238025586
103	NC_012723	TCC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238025587
104	NC_012723	GTGCC	2	10	5897	5906	0 %	20 %	40 %	40 %	238025587
105	NC_012723	TGC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025587
106	NC_012723	GCA	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
107	NC_012723	TCG	3	9	5954	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025587
108	NC_012723	CAG	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
109	NC_012723	GTA	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025587
110	NC_012723	ACCG	2	8	6086	6093	25 %	0 %	25 %	50 %	238025587
111	NC_012723	GGC	2	6	6153	6158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025587
112	NC_012723	CTC	2	6	6179	6184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238025587
113	NC_012723	CGA	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
114	NC_012723	CGT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025587
115	NC_012723	GC	3	6	6296	6301	0 %	0 %	50 %	50 %	238025587
116	NC_012723	GAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025587
117	NC_012723	TGC	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025587
118	NC_012723	GCC	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025587
119	NC_012723	CGA	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
120	NC_012723	CGC	2	6	6624	6629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025587
121	NC_012723	CGT	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025587
122	NC_012723	CGG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025587
123	NC_012723	GGCGG	2	10	6727	6736	0 %	0 %	80 %	20 %	238025587
124	NC_012723	CCGC	2	8	6774	6781	0 %	0 %	25 %	75 %	238025587
125	NC_012723	GCA	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
126	NC_012723	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	238025587
127	NC_012723	GCG	2	6	6972	6977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025587
128	NC_012723	TCA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025587
129	NC_012723	TCC	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238025587
130	NC_012723	ACC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025587
131	NC_012723	ACG	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025587
132	NC_012723	TGC	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025588
133	NC_012723	CACC	2	8	7319	7326	25 %	0 %	0 %	75 %	238025588
134	NC_012723	CGA	3	9	7343	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025588
135	NC_012723	GCCG	2	8	7371	7378	0 %	0 %	50 %	50 %	238025588
136	NC_012723	GGA	2	6	7419	7424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025588
137	NC_012723	CGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025589
138	NC_012723	GCATG	2	10	7471	7480	20 %	20 %	40 %	20 %	238025589
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142	NC_012723	CCG	2	6	7608	7613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025589
143	NC_012723	CGA	2	6	7669	7674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025589
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160	NC_012723	CGA	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025590
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164	NC_012723	GCT	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025590
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245	NC_012723	GCGCC	2	10	12976	12985	0 %	0 %	40 %	60 %	238025595
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247	NC_012723	CGGC	2	8	13015	13022	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
248	NC_012723	GC	6	12	13047	13058	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
249	NC_012723	GC	3	6	13065	13070	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
250	NC_012723	GCCGG	2	10	13084	13093	0 %	0 %	60 %	40 %	238025595
251	NC_012723	GCC	2	6	13114	13119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025595
252	NC_012723	GCA	2	6	13135	13140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025595
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254	NC_012723	GGT	2	6	13190	13195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025595
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256	NC_012723	AGC	3	9	13239	13247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025595
257	NC_012723	GCC	2	6	13264	13269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025595
258	NC_012723	GC	4	8	13281	13288	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
259	NC_012723	TCCGG	2	10	13297	13306	0 %	20 %	40 %	40 %	238025595
260	NC_012723	GCA	2	6	13345	13350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025595
261	NC_012723	GCGT	2	8	13365	13372	0 %	25 %	50 %	25 %	238025595
262	NC_012723	GCG	2	6	13407	13412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025595
263	NC_012723	CG	3	6	13491	13496	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
264	NC_012723	GC	3	6	13508	13513	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
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392	NC_012723	ACC	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025599
393	NC_012723	TAC	2	6	22741	22746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025599
394	NC_012723	GTG	2	6	22796	22801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025599
395	NC_012723	CGG	2	6	22822	22827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025599
396	NC_012723	TGA	2	6	22965	22970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025599
397	NC_012723	GAG	2	6	23085	23090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025599
398	NC_012723	TAATT	2	10	23158	23167	40 %	60 %	0 %	0 %	238025599
399	NC_012723	GCTG	2	8	23179	23186	0 %	25 %	50 %	25 %	238025599
400	NC_012723	GCG	2	6	23189	23194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025599
401	NC_012723	AAT	2	6	23231	23236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238025599
402	NC_012723	TGC	2	6	23239	23244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025599
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404	NC_012723	TCG	2	6	23803	23808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
405	NC_012723	GCC	2	6	23832	23837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025600
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408	NC_012723	CGC	2	6	23934	23939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025600
409	NC_012723	CAC	2	6	23971	23976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025600
410	NC_012723	CGT	2	6	24041	24046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
411	NC_012723	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238025600
412	NC_012723	TCG	2	6	24101	24106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
413	NC_012723	CTTCG	2	10	24128	24137	0 %	40 %	20 %	40 %	238025600
414	NC_012723	CGT	2	6	24194	24199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
415	NC_012723	CGT	2	6	24332	24337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
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419	NC_012723	TCG	2	6	24754	24759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
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421	NC_012723	AAG	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025600
422	NC_012723	GCC	2	6	24837	24842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025600
423	NC_012723	CAG	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025600
424	NC_012723	ATG	2	6	24999	25004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025600
425	NC_012723	GCA	2	6	25017	25022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025600
426	NC_012723	CAG	2	6	25059	25064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025600
427	NC_012723	GCC	2	6	25139	25144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025600
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429	NC_012723	TCCGGT	2	12	25174	25185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
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431	NC_012723	TCG	2	6	25255	25260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
432	NC_012723	CGG	2	6	25380	25385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025600
433	NC_012723	GTG	2	6	25395	25400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025600
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436	NC_012723	GGC	2	6	25472	25477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025600
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442	NC_012723	CAT	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025600
443	NC_012723	GCAC	2	8	25810	25817	25 %	0 %	25 %	50 %	238025600
444	NC_012723	CGG	3	9	25832	25840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025600
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447	NC_012723	CGGCC	2	10	25971	25980	0 %	0 %	40 %	60 %	238025601
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449	NC_012723	GGC	2	6	26058	26063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025601
450	NC_012723	TCA	2	6	26069	26074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025601
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452	NC_012723	ACC	2	6	26266	26271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025601
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454	NC_012723	GC	3	6	26332	26337	0 %	0 %	50 %	50 %	238025601
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473	NC_012723	GGAT	2	8	27320	27327	25 %	25 %	50 %	0 %	238025602
474	NC_012723	CAGC	2	8	27402	27409	25 %	0 %	25 %	50 %	238025602
475	NC_012723	CGA	2	6	27472	27477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025602
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479	NC_012723	AACTG	2	10	27693	27702	40 %	20 %	20 %	20 %	238025602
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484	NC_012723	GCG	2	6	27902	27907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025602
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488	NC_012723	GCT	2	6	28172	28177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025602
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495	NC_012723	GCG	2	6	28575	28580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025602
496	NC_012723	GC	3	6	28628	28633	0 %	0 %	50 %	50 %	238025602
497	NC_012723	GCTG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	238025602
498	NC_012723	GTC	2	6	28711	28716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025602
499	NC_012723	CAG	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025603
500	NC_012723	GTC	2	6	30317	30322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025603

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