MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 chromosome 2

Total Repeats: 69860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012721	TCGA	2	8	238325	238332	25 %	25 %	25 %	25 %	238023682
5502	NC_012721	CGA	2	6	238381	238386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023682
5503	NC_012721	T	6	6	238394	238399	0 %	100 %	0 %	0 %	238023682
5504	NC_012721	CCG	2	6	238847	238852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023683
5505	NC_012721	CTC	2	6	238873	238878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238023683
5506	NC_012721	CG	3	6	238884	238889	0 %	0 %	50 %	50 %	238023683
5507	NC_012721	CGA	2	6	238917	238922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023683
5508	NC_012721	CCG	2	6	238943	238948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023683
5509	NC_012721	TCG	2	6	239018	239023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023683
5510	NC_012721	TCC	2	6	239027	239032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238023683
5511	NC_012721	AGC	2	6	239039	239044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023683
5512	NC_012721	GC	3	6	239052	239057	0 %	0 %	50 %	50 %	238023683
5513	NC_012721	TCG	2	6	239078	239083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023683
5514	NC_012721	TGG	3	9	239157	239165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238023683
5515	NC_012721	CCG	2	6	239240	239245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023683
5516	NC_012721	GGC	2	6	239265	239270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023683
5517	NC_012721	TGG	2	6	239325	239330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238023683
5518	NC_012721	GAC	2	6	240096	240101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023684
5519	NC_012721	TCG	2	6	240137	240142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023684
5520	NC_012721	GAA	2	6	240149	240154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238023684
5521	NC_012721	CAG	3	9	240267	240275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023684
5522	NC_012721	CGATCA	2	12	240350	240361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023684
5523	NC_012721	AGC	2	6	240367	240372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023684
5524	NC_012721	TC	3	6	240413	240418	0 %	50 %	0 %	50 %	238023684
5525	NC_012721	GAT	2	6	240670	240675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023685
5526	NC_012721	GCA	2	6	240703	240708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023685
5527	NC_012721	GTA	2	6	240722	240727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023685
5528	NC_012721	CAG	2	6	240740	240745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023685
5529	NC_012721	GATC	2	8	240757	240764	25 %	25 %	25 %	25 %	238023685
5530	NC_012721	GC	3	6	240832	240837	0 %	0 %	50 %	50 %	238023685
5531	NC_012721	CGC	2	6	240842	240847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023685
5532	NC_012721	TTC	2	6	240861	240866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238023685
5533	NC_012721	TGGC	2	8	240909	240916	0 %	25 %	50 %	25 %	238023685
5534	NC_012721	GTC	2	6	240920	240925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023685
5535	NC_012721	GAT	2	6	241014	241019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023685
5536	NC_012721	ATC	2	6	241040	241045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023685
5537	NC_012721	CGC	2	6	241091	241096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023685
5538	NC_012721	TCC	2	6	241098	241103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238023685
5539	NC_012721	CATGG	2	10	241148	241157	20 %	20 %	40 %	20 %	238023685
5540	NC_012721	ACCG	2	8	241244	241251	25 %	0 %	25 %	50 %	238023685
5541	NC_012721	GCC	2	6	241263	241268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023685
5542	NC_012721	CAAG	2	8	241271	241278	50 %	0 %	25 %	25 %	238023685
5543	NC_012721	CTG	2	6	241279	241284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023685
5544	NC_012721	CCTT	2	8	241285	241292	0 %	50 %	0 %	50 %	238023685
5545	NC_012721	A	6	6	242085	242090	100 %	0 %	0 %	0 %	238023686
5546	NC_012721	CTCGC	2	10	242103	242112	0 %	20 %	20 %	60 %	238023686
5547	NC_012721	TGT	2	6	242130	242135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238023686
5548	NC_012721	CTG	2	6	242144	242149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023686
5549	NC_012721	AAC	2	6	242216	242221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238023686
5550	NC_012721	CAG	2	6	242321	242326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023686
5551	NC_012721	CG	3	6	242329	242334	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5552	NC_012721	CCA	2	6	242406	242411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238023686
5553	NC_012721	CG	3	6	242569	242574	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5554	NC_012721	GAAC	2	8	242608	242615	50 %	0 %	25 %	25 %	238023686
5555	NC_012721	GGC	2	6	242617	242622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5556	NC_012721	GGC	2	6	242656	242661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5557	NC_012721	TCG	2	6	242673	242678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023686
5558	NC_012721	GCTC	2	8	242697	242704	0 %	25 %	25 %	50 %	238023686
5559	NC_012721	GCC	2	6	242705	242710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023686
5560	NC_012721	TCA	2	6	242715	242720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023686
5561	NC_012721	CG	3	6	242721	242726	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5562	NC_012721	GCG	2	6	242745	242750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5563	NC_012721	GCCG	2	8	242752	242759	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5564	NC_012721	AGG	2	6	242766	242771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023686
5565	NC_012721	GC	3	6	242774	242779	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5566	NC_012721	CGGC	2	8	242787	242794	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5567	NC_012721	GAG	2	6	242819	242824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023686
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5569	NC_012721	ATCG	2	8	242911	242918	25 %	25 %	25 %	25 %	238023686
5570	NC_012721	GAG	2	6	242972	242977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023686
5571	NC_012721	GGC	2	6	242980	242985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5572	NC_012721	GGA	2	6	242992	242997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023686
5573	NC_012721	CGG	2	6	243027	243032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5574	NC_012721	CGGCCA	2	12	243087	243098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238023686
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5577	NC_012721	CGA	2	6	243132	243137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023686
5578	NC_012721	GGA	2	6	243139	243144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023686
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5580	NC_012721	CGG	2	6	243231	243236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5581	NC_012721	GGC	2	6	243241	243246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5582	NC_012721	GGGGC	2	10	243262	243271	0 %	0 %	80 %	20 %	238023686
5583	NC_012721	GGT	2	6	243277	243282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238023686
5584	NC_012721	GGCG	2	8	243283	243290	0 %	0 %	75 %	25 %	238023686
5585	NC_012721	GCGCA	2	10	243305	243314	20 %	0 %	40 %	40 %	238023686
5586	NC_012721	CGG	2	6	243321	243326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
5587	NC_012721	CGA	2	6	243405	243410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023686
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5589	NC_012721	GCA	2	6	243433	243438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023686
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5591	NC_012721	GTCA	2	8	243515	243522	25 %	25 %	25 %	25 %	238023686
5592	NC_012721	GCA	2	6	243538	243543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023686
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5594	NC_012721	GGCCTC	2	12	243565	243576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238023686
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5599	NC_012721	GCCG	2	8	243664	243671	0 %	0 %	50 %	50 %	238023686
5600	NC_012721	GCG	2	6	243705	243710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023686
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5608	NC_012721	GAAT	2	8	245910	245917	50 %	25 %	25 %	0 %	238023688
5609	NC_012721	CGT	2	6	245940	245945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023688
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5612	NC_012721	CG	4	8	246075	246082	0 %	0 %	50 %	50 %	238023688
5613	NC_012721	AGCC	2	8	246118	246125	25 %	0 %	25 %	50 %	238023688
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5620	NC_012721	GGC	2	6	246412	246417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023688
5621	NC_012721	GAT	2	6	246432	246437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023688
5622	NC_012721	GCT	2	6	246477	246482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023688
5623	NC_012721	GGC	4	12	246501	246512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023688
5624	NC_012721	GCA	2	6	246541	246546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023688
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5626	NC_012721	GGC	2	6	246576	246581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023688
5627	NC_012721	ACT	2	6	246599	246604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023688
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5630	NC_012721	GTGC	2	8	246724	246731	0 %	25 %	50 %	25 %	238023688
5631	NC_012721	GAG	2	6	246742	246747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023688
5632	NC_012721	CGT	2	6	246791	246796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023688
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5634	NC_012721	GTGC	2	8	246843	246850	0 %	25 %	50 %	25 %	238023688
5635	NC_012721	GGCG	2	8	246867	246874	0 %	0 %	75 %	25 %	238023688
5636	NC_012721	GGA	2	6	246882	246887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023688
5637	NC_012721	CCGA	2	8	246937	246944	25 %	0 %	25 %	50 %	238023688
5638	NC_012721	CGAGTT	2	12	246966	246977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238023688
5639	NC_012721	CTT	2	6	247032	247037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238023688
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5641	NC_012721	CG	3	6	247107	247112	0 %	0 %	50 %	50 %	238023688
5642	NC_012721	CTG	2	6	247129	247134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023688
5643	NC_012721	GCTCGA	2	12	247203	247214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023688
5644	NC_012721	AAC	2	6	247219	247224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238023688
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5647	NC_012721	TCA	2	6	247355	247360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023688
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5649	NC_012721	GAGC	2	8	247627	247634	25 %	0 %	50 %	25 %	238023689
5650	NC_012721	GGT	2	6	247690	247695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238023689
5651	NC_012721	CGGC	2	8	247696	247703	0 %	0 %	50 %	50 %	238023689
5652	NC_012721	GCC	2	6	247792	247797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023689
5653	NC_012721	CAT	2	6	247816	247821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023689
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5656	NC_012721	CCA	2	6	248014	248019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238023689
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5658	NC_012721	AGA	2	6	248118	248123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238023689
5659	NC_012721	CGA	2	6	248149	248154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023689
5660	NC_012721	GGCG	2	8	248305	248312	0 %	0 %	75 %	25 %	238023689
5661	NC_012721	GCT	2	6	248317	248322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023689
5662	NC_012721	CGC	2	6	248335	248340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023689
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5666	NC_012721	CGCC	2	8	248419	248426	0 %	0 %	25 %	75 %	238023689
5667	NC_012721	CTGG	2	8	248485	248492	0 %	25 %	50 %	25 %	238023689
5668	NC_012721	GGCG	2	8	248494	248501	0 %	0 %	75 %	25 %	238023689
5669	NC_012721	TCA	2	6	248550	248555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023689
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5672	NC_012721	CG	3	6	248624	248629	0 %	0 %	50 %	50 %	238023689
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5723	NC_012721	CCGA	2	8	251740	251747	25 %	0 %	25 %	50 %	238023692
5724	NC_012721	TTC	3	9	251785	251793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238023692
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5728	NC_012721	GA	3	6	251897	251902	50 %	0 %	50 %	0 %	238023692
5729	NC_012721	CTA	2	6	251931	251936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023692
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5732	NC_012721	TGGC	2	8	252062	252069	0 %	25 %	50 %	25 %	238023692
5733	NC_012721	GAA	2	6	252117	252122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238023692
5734	NC_012721	GTC	2	6	252151	252156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
5735	NC_012721	GAT	2	6	252232	252237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023692
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5737	NC_012721	GC	4	8	252265	252272	0 %	0 %	50 %	50 %	238023692
5738	NC_012721	ACG	2	6	252281	252286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023692
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5740	NC_012721	GCT	2	6	252393	252398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
5741	NC_012721	CGC	3	9	252423	252431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023692
5742	NC_012721	AG	3	6	252623	252628	50 %	0 %	50 %	0 %	238023692
5743	NC_012721	GTC	2	6	252672	252677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
5744	NC_012721	GT	3	6	252780	252785	0 %	50 %	50 %	0 %	238023692
5745	NC_012721	TGG	2	6	252891	252896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238023692
5746	NC_012721	TGC	2	6	252956	252961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
5747	NC_012721	TTGAT	2	10	252989	252998	20 %	60 %	20 %	0 %	238023692
5748	NC_012721	AAC	2	6	253071	253076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238023692
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5751	NC_012721	ATG	3	9	253588	253596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023692
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5755	NC_012721	CTG	2	6	253687	253692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
5756	NC_012721	CACGA	2	10	253696	253705	40 %	0 %	20 %	40 %	238023692
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5759	NC_012721	AGG	2	6	253796	253801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238023692
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5762	NC_012721	CAGG	2	8	253842	253849	25 %	0 %	50 %	25 %	238023692
5763	NC_012721	CGC	2	6	253865	253870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023692
5764	NC_012721	C	8	8	253870	253877	0 %	0 %	0 %	100 %	238023692
5765	NC_012721	GTC	2	6	253887	253892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023692
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5772	NC_012721	GAC	2	6	254243	254248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023693
5773	NC_012721	CGT	2	6	254264	254269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023693
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5781	NC_012721	TGA	2	6	254497	254502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238023693
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5841	NC_012721	CTGGCG	2	12	257496	257507	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023696
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5850	NC_012721	TGCGC	2	10	257787	257796	0 %	20 %	40 %	40 %	238023696
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5853	NC_012721	CGT	2	6	257955	257960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023696
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5984	NC_012721	GCG	2	6	263569	263574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023699
5985	NC_012721	CGC	3	9	263577	263585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023699
5986	NC_012721	GCA	2	6	263588	263593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023699
5987	NC_012721	GCCC	2	8	263610	263617	0 %	0 %	25 %	75 %	238023699
5988	NC_012721	CCG	2	6	263624	263629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023699
5989	NC_012721	CG	4	8	263634	263641	0 %	0 %	50 %	50 %	238023699
5990	NC_012721	CGT	3	9	263646	263654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023699
5991	NC_012721	CCTCGC	2	12	263655	263666	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	238023699
5992	NC_012721	GCCG	2	8	263692	263699	0 %	0 %	50 %	50 %	238023699
5993	NC_012721	GCC	2	6	263708	263713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023699
5994	NC_012721	GC	3	6	263837	263842	0 %	0 %	50 %	50 %	238023699
5995	NC_012721	ACG	2	6	263889	263894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023699
5996	NC_012721	CGGC	2	8	263941	263948	0 %	0 %	50 %	50 %	238023699
5997	NC_012721	GGC	2	6	263962	263967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023699
5998	NC_012721	GC	3	6	263980	263985	0 %	0 %	50 %	50 %	238023699
5999	NC_012721	AGC	2	6	264059	264064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023699
6000	NC_012721	TGCGCG	2	12	264086	264097	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023699

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