MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beutenbergia cavernae DSM 12333 chromosome

Total Repeats: 138270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012669	GGC	3	9	324	332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818503
2	NC_012669	CTC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818503
3	NC_012669	GCTC	2	8	416	423	0 %	25 %	25 %	50 %	229818503
4	NC_012669	GC	3	6	425	430	0 %	0 %	50 %	50 %	229818503
5	NC_012669	CGA	2	6	474	479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
6	NC_012669	CGT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818503
7	NC_012669	GAG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818503
8	NC_012669	GCC	2	6	667	672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818503
9	NC_012669	CCGC	2	8	695	702	0 %	0 %	25 %	75 %	229818503
10	NC_012669	GC	3	6	701	706	0 %	0 %	50 %	50 %	229818503
11	NC_012669	CCG	2	6	743	748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818503
12	NC_012669	GCC	2	6	826	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818503
13	NC_012669	CCG	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818503
14	NC_012669	CCT	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818503
15	NC_012669	GGA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818503
16	NC_012669	TCA	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818503
17	NC_012669	CGA	2	6	1017	1022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
18	NC_012669	TCC	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818503
19	NC_012669	CGA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
20	NC_012669	GGA	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818503
21	NC_012669	TTC	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229818503
22	NC_012669	GTC	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818503
23	NC_012669	TCA	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818503
24	NC_012669	GCC	2	6	1257	1262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818503
25	NC_012669	AAG	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229818503
26	NC_012669	AGCG	2	8	1306	1313	25 %	0 %	50 %	25 %	229818503
27	NC_012669	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
28	NC_012669	CGA	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
29	NC_012669	GC	3	6	1385	1390	0 %	0 %	50 %	50 %	229818503
30	NC_012669	TCA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818503
31	NC_012669	CGA	3	9	1476	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
32	NC_012669	GCCG	2	8	1500	1507	0 %	0 %	50 %	50 %	229818503
33	NC_012669	TCA	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818503
34	NC_012669	ACT	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818503
35	NC_012669	TCGA	2	8	1543	1550	25 %	25 %	25 %	25 %	229818503
36	NC_012669	CGCC	2	8	1590	1597	0 %	0 %	25 %	75 %	229818503
37	NC_012669	CGG	2	6	1662	1667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818503
38	NC_012669	ACCAC	2	10	1673	1682	40 %	0 %	0 %	60 %	229818503
39	NC_012669	AGC	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
40	NC_012669	AGC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818503
41	NC_012669	GC	3	6	2452	2457	0 %	0 %	50 %	50 %	229818504
42	NC_012669	CGG	2	6	2506	2511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818504
43	NC_012669	CCGG	2	8	2542	2549	0 %	0 %	50 %	50 %	229818504
44	NC_012669	CTC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818504
45	NC_012669	CGA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
46	NC_012669	GCC	2	6	2693	2698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818504
47	NC_012669	CGC	2	6	2756	2761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818504
48	NC_012669	CGA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
49	NC_012669	GCT	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
50	NC_012669	CTC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818504
51	NC_012669	ACCG	2	8	2838	2845	25 %	0 %	25 %	50 %	229818504
52	NC_012669	TCG	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
53	NC_012669	CGG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818504
54	NC_012669	CCG	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818504
55	NC_012669	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
56	NC_012669	GCT	2	6	3041	3046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
57	NC_012669	CCCG	2	8	3062	3069	0 %	0 %	25 %	75 %	229818504
58	NC_012669	GCG	2	6	3071	3076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818504
59	NC_012669	ACG	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
60	NC_012669	CCA	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229818504
61	NC_012669	TCG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
62	NC_012669	GGC	2	6	3134	3139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818504
63	NC_012669	GCG	2	6	3140	3145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818504
64	NC_012669	TCG	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
65	NC_012669	AC	3	6	3169	3174	50 %	0 %	0 %	50 %	229818504
66	NC_012669	GGCC	2	8	3215	3222	0 %	0 %	50 %	50 %	229818504
67	NC_012669	GAC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
68	NC_012669	ACG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
69	NC_012669	CGT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818504
70	NC_012669	CACG	2	8	3356	3363	25 %	0 %	25 %	50 %	229818504
71	NC_012669	GCCG	2	8	3371	3378	0 %	0 %	50 %	50 %	229818504
72	NC_012669	GAC	3	9	3405	3413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818504
73	NC_012669	TCG	2	6	3538	3543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818505
74	NC_012669	TCGG	2	8	3547	3554	0 %	25 %	50 %	25 %	229818505
75	NC_012669	AGC	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818505
76	NC_012669	TGG	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818505
77	NC_012669	GTG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818505
78	NC_012669	CGG	2	6	3700	3705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
79	NC_012669	CACG	2	8	3713	3720	25 %	0 %	25 %	50 %	229818505
80	NC_012669	CCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818505
81	NC_012669	CGC	2	6	3749	3754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818505
82	NC_012669	CGG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
83	NC_012669	CGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818505
84	NC_012669	GGT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818505
85	NC_012669	CGG	2	6	3902	3907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
86	NC_012669	GAC	2	6	3915	3920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818505
87	NC_012669	GGC	2	6	4085	4090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
88	NC_012669	GAC	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818505
89	NC_012669	CGG	2	6	4115	4120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
90	NC_012669	GGT	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818505
91	NC_012669	CTC	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229818505
92	NC_012669	GC	4	8	4181	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	229818505
93	NC_012669	CGG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
94	NC_012669	AGG	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818505
95	NC_012669	AGG	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818505
96	NC_012669	GCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818505
97	NC_012669	CGG	2	6	4382	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818505
98	NC_012669	CGC	2	6	4403	4408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818505
99	NC_012669	TCG	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
100	NC_012669	TCG	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
101	NC_012669	CGC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818506
102	NC_012669	GC	3	6	4626	4631	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
103	NC_012669	GGT	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818506
104	NC_012669	GCCC	2	8	4660	4667	0 %	0 %	25 %	75 %	229818506
105	NC_012669	TCG	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
106	NC_012669	GC	3	6	4698	4703	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
107	NC_012669	GCC	3	9	4820	4828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818506
108	NC_012669	CGA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818506
109	NC_012669	TGC	2	6	4898	4903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
110	NC_012669	GCT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
111	NC_012669	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818506
112	NC_012669	CGGCG	2	10	4937	4946	0 %	0 %	60 %	40 %	229818506
113	NC_012669	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818506
114	NC_012669	TCG	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
115	NC_012669	CG	3	6	5128	5133	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
116	NC_012669	GAG	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818506
117	NC_012669	CGA	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818506
118	NC_012669	CG	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
119	NC_012669	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
120	NC_012669	GC	3	6	5221	5226	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
121	NC_012669	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	229818506
122	NC_012669	CGA	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818506
123	NC_012669	GCCTC	2	10	5384	5393	0 %	20 %	20 %	60 %	229818506
124	NC_012669	GCT	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
125	NC_012669	CGA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818506
126	NC_012669	GGCG	2	8	5421	5428	0 %	0 %	75 %	25 %	229818506
127	NC_012669	GTCCTC	2	12	5443	5454	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	229818506
128	NC_012669	GAC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818506
129	NC_012669	TCG	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818506
130	NC_012669	CCG	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818506
131	NC_012669	GGA	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818506
132	NC_012669	GGA	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818506
133	NC_012669	CGC	2	6	5632	5637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818507
134	NC_012669	CGA	2	6	5641	5646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818507
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163	NC_012669	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818508
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258	NC_012669	GGC	2	6	10275	10280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
259	NC_012669	GCG	2	6	10291	10296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
260	NC_012669	GAC	2	6	10311	10316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
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262	NC_012669	CTT	2	6	10328	10333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229818509
263	NC_012669	GAC	3	9	10337	10345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
264	NC_012669	CAC	2	6	10347	10352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229818509
265	NC_012669	GCT	2	6	10355	10360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818509
266	NC_012669	TTC	2	6	10362	10367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229818509
267	NC_012669	CGCGA	2	10	10422	10431	20 %	0 %	40 %	40 %	229818509
268	NC_012669	GAA	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229818509
269	NC_012669	CGG	2	6	10592	10597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
270	NC_012669	CGA	2	6	10622	10627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
271	NC_012669	CGG	2	6	10628	10633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
272	NC_012669	GTC	2	6	10647	10652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818509
273	NC_012669	GGA	2	6	10673	10678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818509
274	NC_012669	CTG	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818509
275	NC_012669	GACG	2	8	10727	10734	25 %	0 %	50 %	25 %	229818509
276	NC_012669	CG	3	6	10788	10793	0 %	0 %	50 %	50 %	229818509
277	NC_012669	GAC	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
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279	NC_012669	GTG	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229818509
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281	NC_012669	GGC	2	6	10857	10862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
282	NC_012669	TCG	3	9	10969	10977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818509
283	NC_012669	CGA	3	9	10982	10990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
284	NC_012669	TCA	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818509
285	NC_012669	CCG	2	6	11029	11034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818509
286	NC_012669	CGA	2	6	11036	11041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
287	NC_012669	CAT	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229818509
288	NC_012669	GAG	2	6	11127	11132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818509
289	NC_012669	GAG	2	6	11154	11159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818509
290	NC_012669	GGA	2	6	11165	11170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818509
291	NC_012669	CGG	2	6	11200	11205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818509
292	NC_012669	CGT	2	6	11221	11226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229818509
293	NC_012669	AGGA	2	8	11251	11258	50 %	0 %	50 %	0 %	229818509
294	NC_012669	AGC	2	6	11267	11272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818509
295	NC_012669	ACG	2	6	11286	11291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229818510
296	NC_012669	CG	3	6	11293	11298	0 %	0 %	50 %	50 %	229818510
297	NC_012669	CCG	2	6	11312	11317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818510
298	NC_012669	CCCG	2	8	11323	11330	0 %	0 %	25 %	75 %	229818510
299	NC_012669	CCCG	2	8	11360	11367	0 %	0 %	25 %	75 %	229818510
300	NC_012669	GC	3	6	11393	11398	0 %	0 %	50 %	50 %	229818510
301	NC_012669	CGC	3	9	11461	11469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818510
302	NC_012669	ACC	3	9	11483	11491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229818510
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304	NC_012669	GCC	2	6	11525	11530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229818510
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336	NC_012669	CACC	2	8	12919	12926	25 %	0 %	0 %	75 %	229818512
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377	NC_012669	CGGG	2	8	14579	14586	0 %	0 %	75 %	25 %	229818516
378	NC_012669	GAG	2	6	14603	14608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229818516
379	NC_012669	GGCGCG	2	12	14644	14655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818516
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383	NC_012669	CG	4	8	14793	14800	0 %	0 %	50 %	50 %	229818516
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385	NC_012669	CGG	2	6	14843	14848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229818516
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