MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012225	AGA	2	6	436379	436384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619337
11502	NC_012225	TTA	2	6	436419	436424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619337
11503	NC_012225	TA	3	6	436459	436464	50 %	50 %	0 %	0 %	225619337
11504	NC_012225	ATA	2	6	436473	436478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619337
11505	NC_012225	TAT	2	6	436486	436491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619337
11506	NC_012225	ATT	2	6	436493	436498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619337
11507	NC_012225	ATT	2	6	436503	436508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619337
11508	NC_012225	TCT	2	6	436584	436589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619337
11509	NC_012225	TAA	2	6	436637	436642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619337
11510	NC_012225	CTG	2	6	436678	436683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619337
11511	NC_012225	ATT	2	6	436688	436693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619337
11512	NC_012225	AT	3	6	436929	436934	50 %	50 %	0 %	0 %	225619338
11513	NC_012225	TA	3	6	436946	436951	50 %	50 %	0 %	0 %	225619338
11514	NC_012225	TTA	2	6	437019	437024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619338
11515	NC_012225	CCA	2	6	437037	437042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225619338
11516	NC_012225	ATC	2	6	437066	437071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619338
11517	NC_012225	AT	3	6	437123	437128	50 %	50 %	0 %	0 %	225619338
11518	NC_012225	T	6	6	437169	437174	0 %	100 %	0 %	0 %	225619338
11519	NC_012225	AT	3	6	437175	437180	50 %	50 %	0 %	0 %	225619338
11520	NC_012225	ATA	2	6	437282	437287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619338
11521	NC_012225	AAC	2	6	437351	437356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619338
11522	NC_012225	ATA	2	6	437372	437377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619338
11523	NC_012225	ATT	2	6	437388	437393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619338
11524	NC_012225	TTA	4	12	437403	437414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619338
11525	NC_012225	TCA	2	6	438160	438165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619339
11526	NC_012225	TCTAAT	2	12	438172	438183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225619339
11527	NC_012225	GCA	2	6	438184	438189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619339
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11529	NC_012225	TTC	2	6	438221	438226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619339
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11531	NC_012225	CTT	2	6	438254	438259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619339
11532	NC_012225	TTG	2	6	438269	438274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619339
11533	NC_012225	AAG	2	6	438284	438289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619339
11534	NC_012225	A	6	6	438306	438311	100 %	0 %	0 %	0 %	225619339
11535	NC_012225	TAT	3	9	438312	438320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619339
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11539	NC_012225	TTG	2	6	438500	438505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619339
11540	NC_012225	ATA	2	6	438509	438514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619339
11541	NC_012225	GGA	2	6	438523	438528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619339
11542	NC_012225	ATT	2	6	438576	438581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619339
11543	NC_012225	A	6	6	438666	438671	100 %	0 %	0 %	0 %	225619339
11544	NC_012225	AT	3	6	438696	438701	50 %	50 %	0 %	0 %	225619339
11545	NC_012225	CAG	2	6	438733	438738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619339
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11550	NC_012225	CAGC	2	8	438970	438977	25 %	0 %	25 %	50 %	225619339
11551	NC_012225	TA	3	6	439067	439072	50 %	50 %	0 %	0 %	225619339
11552	NC_012225	TAA	2	6	439078	439083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619339
11553	NC_012225	T	7	7	439219	439225	0 %	100 %	0 %	0 %	225619340
11554	NC_012225	GCA	2	6	439239	439244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619340
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11556	NC_012225	T	6	6	439401	439406	0 %	100 %	0 %	0 %	225619340
11557	NC_012225	T	6	6	439409	439414	0 %	100 %	0 %	0 %	225619340
11558	NC_012225	T	6	6	439445	439450	0 %	100 %	0 %	0 %	225619340
11559	NC_012225	CTT	2	6	439570	439575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619340
11560	NC_012225	TAT	2	6	439580	439585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619340
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11588	NC_012225	ATG	2	6	440790	440795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619341
11589	NC_012225	TA	3	6	440810	440815	50 %	50 %	0 %	0 %	225619341
11590	NC_012225	A	6	6	440835	440840	100 %	0 %	0 %	0 %	225619341
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11594	NC_012225	CTGTA	2	10	441256	441265	20 %	40 %	20 %	20 %	225619342
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11601	NC_012225	AT	3	6	441498	441503	50 %	50 %	0 %	0 %	225619342
11602	NC_012225	TAT	2	6	441506	441511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619342
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11605	NC_012225	TA	4	8	441547	441554	50 %	50 %	0 %	0 %	225619342
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11607	NC_012225	AT	3	6	441586	441591	50 %	50 %	0 %	0 %	225619342
11608	NC_012225	TC	3	6	441611	441616	0 %	50 %	0 %	50 %	225619342
11609	NC_012225	TGA	2	6	441641	441646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619342
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11615	NC_012225	AT	3	6	441984	441989	50 %	50 %	0 %	0 %	225619343
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11620	NC_012225	T	6	6	442137	442142	0 %	100 %	0 %	0 %	225619343
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11622	NC_012225	AAG	2	6	442211	442216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619343
11623	NC_012225	CTG	3	9	442259	442267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619343
11624	NC_012225	TCC	2	6	442268	442273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619343
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11626	NC_012225	TAT	2	6	442408	442413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619343
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11652	NC_012225	TCT	2	6	443159	443164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619344
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11731	NC_012225	AT	4	8	446305	446312	50 %	50 %	0 %	0 %	225619346
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11991	NC_012225	CTTT	2	8	455512	455519	0 %	75 %	0 %	25 %	225619350
11992	NC_012225	TA	3	6	455547	455552	50 %	50 %	0 %	0 %	225619350
11993	NC_012225	CTG	2	6	455584	455589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619350
11994	NC_012225	ATT	2	6	455590	455595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619350
11995	NC_012225	GATA	2	8	455597	455604	50 %	25 %	25 %	0 %	225619350
11996	NC_012225	AGA	2	6	455630	455635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619350
11997	NC_012225	TTC	2	6	455693	455698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619350
11998	NC_012225	ACA	2	6	455742	455747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619350
11999	NC_012225	ATG	2	6	455809	455814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619350
12000	NC_012225	TTG	2	6	455872	455877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619350

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