MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_012225	ATTT	2	8	418505	418512	25 %	75 %	0 %	0 %	225619322
11003	NC_012225	A	6	6	418542	418547	100 %	0 %	0 %	0 %	225619322
11004	NC_012225	AT	3	6	418564	418569	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11005	NC_012225	TAT	2	6	418588	418593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619322
11006	NC_012225	GAA	2	6	418617	418622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619322
11007	NC_012225	AT	3	6	418627	418632	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11008	NC_012225	AGA	2	6	418704	418709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619322
11009	NC_012225	A	7	7	418770	418776	100 %	0 %	0 %	0 %	225619322
11010	NC_012225	AGA	2	6	418787	418792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619322
11011	NC_012225	GAA	2	6	418839	418844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619322
11012	NC_012225	CTTT	2	8	418845	418852	0 %	75 %	0 %	25 %	225619322
11013	NC_012225	GAA	2	6	418863	418868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619322
11014	NC_012225	ATT	2	6	418877	418882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619322
11015	NC_012225	AT	3	6	418892	418897	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11016	NC_012225	ATG	2	6	418942	418947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619322
11017	NC_012225	AG	3	6	418948	418953	50 %	0 %	50 %	0 %	225619322
11018	NC_012225	ATA	2	6	418954	418959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619322
11019	NC_012225	AT	3	6	419042	419047	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11020	NC_012225	CTA	2	6	419056	419061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619322
11021	NC_012225	CTTAT	2	10	419104	419113	20 %	60 %	0 %	20 %	225619322
11022	NC_012225	AT	3	6	419130	419135	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11023	NC_012225	TAA	2	6	419173	419178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619322
11024	NC_012225	AT	3	6	419212	419217	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11025	NC_012225	ATG	2	6	419244	419249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619322
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11027	NC_012225	TAA	2	6	419315	419320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619322
11028	NC_012225	GCA	2	6	419335	419340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619322
11029	NC_012225	A	7	7	419344	419350	100 %	0 %	0 %	0 %	225619322
11030	NC_012225	AATA	2	8	419358	419365	75 %	25 %	0 %	0 %	225619322
11031	NC_012225	TA	3	6	419462	419467	50 %	50 %	0 %	0 %	225619322
11032	NC_012225	ATT	2	6	419475	419480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
11033	NC_012225	ATA	2	6	419501	419506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619323
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11035	NC_012225	TA	3	6	419536	419541	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11036	NC_012225	TTA	2	6	419628	419633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
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11039	NC_012225	ATT	2	6	419791	419796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
11040	NC_012225	GA	3	6	419814	419819	50 %	0 %	50 %	0 %	225619323
11041	NC_012225	TAT	3	9	419842	419850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
11042	NC_012225	TAT	2	6	419856	419861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
11043	NC_012225	AT	4	8	419863	419870	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11044	NC_012225	AAG	2	6	419913	419918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619323
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11054	NC_012225	TC	3	6	420203	420208	0 %	50 %	0 %	50 %	225619323
11055	NC_012225	AAT	2	6	420230	420235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619323
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11058	NC_012225	TAT	3	9	420288	420296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
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11063	NC_012225	CAT	2	6	420472	420477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619323
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11069	NC_012225	ATT	3	9	420757	420765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
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11073	NC_012225	ATT	2	6	420799	420804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
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11087	NC_012225	TCCTG	2	10	421196	421205	0 %	40 %	20 %	40 %	225619323
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11093	NC_012225	T	8	8	421322	421329	0 %	100 %	0 %	0 %	225619323
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11101	NC_012225	AT	3	6	421513	421518	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11102	NC_012225	ATAAA	2	10	421530	421539	80 %	20 %	0 %	0 %	225619323
11103	NC_012225	TAT	2	6	421545	421550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619323
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11105	NC_012225	T	6	6	421571	421576	0 %	100 %	0 %	0 %	225619323
11106	NC_012225	T	6	6	421578	421583	0 %	100 %	0 %	0 %	225619323
11107	NC_012225	A	6	6	421609	421614	100 %	0 %	0 %	0 %	225619323
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11109	NC_012225	TA	3	6	421665	421670	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11110	NC_012225	T	7	7	421729	421735	0 %	100 %	0 %	0 %	225619323
11111	NC_012225	TA	3	6	421739	421744	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11112	NC_012225	TA	3	6	421792	421797	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
11113	NC_012225	A	7	7	421849	421855	100 %	0 %	0 %	0 %	225619323
11114	NC_012225	A	7	7	421885	421891	100 %	0 %	0 %	0 %	225619323
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11119	NC_012225	TA	3	6	422016	422021	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
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11122	NC_012225	CTG	2	6	422077	422082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619323
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11124	NC_012225	TA	3	6	422222	422227	50 %	50 %	0 %	0 %	225619323
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11368	NC_012225	AT	3	6	432069	432074	50 %	50 %	0 %	0 %	225619334
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11371	NC_012225	T	6	6	432165	432170	0 %	100 %	0 %	0 %	225619334
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11488	NC_012225	CAT	2	6	435903	435908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619336
11489	NC_012225	ATG	3	9	435936	435944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619336
11490	NC_012225	AT	4	8	435949	435956	50 %	50 %	0 %	0 %	225619336
11491	NC_012225	TAT	2	6	435960	435965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619336
11492	NC_012225	ATA	2	6	436033	436038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619336
11493	NC_012225	ATTG	2	8	436099	436106	25 %	50 %	25 %	0 %	225619336
11494	NC_012225	TAAT	2	8	436155	436162	50 %	50 %	0 %	0 %	225619336
11495	NC_012225	TTA	2	6	436176	436181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619336
11496	NC_012225	ATTTT	2	10	436190	436199	20 %	80 %	0 %	0 %	225619336
11497	NC_012225	ATG	2	6	436202	436207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619336
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11500	NC_012225	A	6	6	436327	436332	100 %	0 %	0 %	0 %	225619337

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