MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012225	ATGG	2	8	308707	308714	25 %	25 %	50 %	0 %	225619219
8002	NC_012225	GGATTC	2	12	308717	308728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225619219
8003	NC_012225	CTG	2	6	308730	308735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619219
8004	NC_012225	ACTT	2	8	308745	308752	25 %	50 %	0 %	25 %	225619219
8005	NC_012225	CTA	2	6	308757	308762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619219
8006	NC_012225	TTA	2	6	308793	308798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619219
8007	NC_012225	TAT	2	6	308820	308825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619219
8008	NC_012225	AGA	2	6	308881	308886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619219
8009	NC_012225	TGA	3	9	308887	308895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619219
8010	NC_012225	CTT	2	6	308928	308933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619219
8011	NC_012225	CTT	2	6	308954	308959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619219
8012	NC_012225	TTGATA	2	12	308988	308999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225619219
8013	NC_012225	AGATTA	2	12	309011	309022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225619219
8014	NC_012225	ATA	2	6	309033	309038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619219
8015	NC_012225	AAT	2	6	309040	309045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619219
8016	NC_012225	GCT	2	6	309050	309055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619219
8017	NC_012225	A	7	7	309062	309068	100 %	0 %	0 %	0 %	225619219
8018	NC_012225	A	6	6	309164	309169	100 %	0 %	0 %	0 %	225619219
8019	NC_012225	ATT	2	6	309172	309177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619219
8020	NC_012225	TAA	2	6	309291	309296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8021	NC_012225	A	6	6	309308	309313	100 %	0 %	0 %	0 %	225619220
8022	NC_012225	AGG	2	6	309346	309351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619220
8023	NC_012225	AGTAAA	2	12	309364	309375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225619220
8024	NC_012225	TGA	2	6	309430	309435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619220
8025	NC_012225	A	6	6	309439	309444	100 %	0 %	0 %	0 %	225619220
8026	NC_012225	TAT	2	6	309446	309451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619220
8027	NC_012225	CTG	2	6	309453	309458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619220
8028	NC_012225	A	6	6	309462	309467	100 %	0 %	0 %	0 %	225619220
8029	NC_012225	TAG	3	9	309489	309497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619220
8030	NC_012225	AAT	2	6	309535	309540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8031	NC_012225	AGTAAA	2	12	309610	309621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225619220
8032	NC_012225	CTA	2	6	309630	309635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619220
8033	NC_012225	TAG	2	6	309729	309734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619220
8034	NC_012225	ATA	3	9	309789	309797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8035	NC_012225	CTT	2	6	309827	309832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619220
8036	NC_012225	GGA	2	6	309845	309850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619220
8037	NC_012225	TGT	2	6	309859	309864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619220
8038	NC_012225	ATAA	2	8	309869	309876	75 %	25 %	0 %	0 %	225619220
8039	NC_012225	CTA	2	6	309882	309887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619220
8040	NC_012225	TAA	2	6	309913	309918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8041	NC_012225	GAA	2	6	309929	309934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619220
8042	NC_012225	CTG	2	6	309951	309956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619220
8043	NC_012225	AT	3	6	310032	310037	50 %	50 %	0 %	0 %	225619220
8044	NC_012225	TTC	2	6	310068	310073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619220
8045	NC_012225	TTGG	2	8	310076	310083	0 %	50 %	50 %	0 %	225619220
8046	NC_012225	ATA	2	6	310092	310097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8047	NC_012225	AAT	2	6	310109	310114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8048	NC_012225	CTA	2	6	310119	310124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619220
8049	NC_012225	TAA	2	6	310150	310155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619220
8050	NC_012225	CTG	2	6	310188	310193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619220
8051	NC_012225	A	6	6	310197	310202	100 %	0 %	0 %	0 %	225619220
8052	NC_012225	GAT	2	6	310205	310210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619220
8053	NC_012225	GTT	2	6	310226	310231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619220
8054	NC_012225	A	6	6	310265	310270	100 %	0 %	0 %	0 %	225619220
8055	NC_012225	TAAAA	2	10	310280	310289	80 %	20 %	0 %	0 %	225619220
8056	NC_012225	ATT	2	6	310353	310358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619221
8057	NC_012225	TTC	2	6	310390	310395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
8058	NC_012225	TATTT	2	10	310420	310429	20 %	80 %	0 %	0 %	225619221
8059	NC_012225	ATA	2	6	310457	310462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619221
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8061	NC_012225	TAT	2	6	310531	310536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619221
8062	NC_012225	T	6	6	310538	310543	0 %	100 %	0 %	0 %	225619221
8063	NC_012225	TAT	3	9	310566	310574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619221
8064	NC_012225	TCA	2	6	310577	310582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619221
8065	NC_012225	ATT	2	6	310649	310654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619221
8066	NC_012225	AT	3	6	310668	310673	50 %	50 %	0 %	0 %	225619221
8067	NC_012225	TCT	2	6	310691	310696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
8068	NC_012225	CTT	2	6	310746	310751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
8069	NC_012225	TTTC	2	8	310839	310846	0 %	75 %	0 %	25 %	225619221
8070	NC_012225	GA	3	6	310923	310928	50 %	0 %	50 %	0 %	225619221
8071	NC_012225	TCT	2	6	310970	310975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
8072	NC_012225	ATT	2	6	310993	310998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619221
8073	NC_012225	T	6	6	310997	311002	0 %	100 %	0 %	0 %	225619221
8074	NC_012225	ACT	2	6	311003	311008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619221
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8076	NC_012225	ATC	2	6	311086	311091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619221
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8078	NC_012225	TCT	2	6	311132	311137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
8079	NC_012225	AT	3	6	311147	311152	50 %	50 %	0 %	0 %	225619221
8080	NC_012225	T	8	8	311160	311167	0 %	100 %	0 %	0 %	225619221
8081	NC_012225	AGC	2	6	311182	311187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619221
8082	NC_012225	TCT	2	6	311239	311244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619221
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8084	NC_012225	AT	3	6	311316	311321	50 %	50 %	0 %	0 %	225619221
8085	NC_012225	AT	4	8	311490	311497	50 %	50 %	0 %	0 %	225619222
8086	NC_012225	GAT	2	6	311507	311512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619222
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8088	NC_012225	GAAT	2	8	311553	311560	50 %	25 %	25 %	0 %	225619222
8089	NC_012225	ATG	2	6	311574	311579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619222
8090	NC_012225	TAT	2	6	311593	311598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619222
8091	NC_012225	TAT	2	6	311637	311642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619222
8092	NC_012225	TAG	2	6	311646	311651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619222
8093	NC_012225	TA	3	6	311661	311666	50 %	50 %	0 %	0 %	225619222
8094	NC_012225	T	6	6	311708	311713	0 %	100 %	0 %	0 %	225619222
8095	NC_012225	TAC	2	6	311758	311763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619222
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8097	NC_012225	TAT	2	6	311850	311855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619222
8098	NC_012225	AAGA	2	8	311872	311879	75 %	0 %	25 %	0 %	225619222
8099	NC_012225	TTAA	2	8	311900	311907	50 %	50 %	0 %	0 %	225619222
8100	NC_012225	AAG	2	6	311909	311914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619222
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8103	NC_012225	CTTTAG	2	12	311973	311984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225619222
8104	NC_012225	TAA	2	6	311986	311991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
8105	NC_012225	TAA	2	6	312061	312066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
8106	NC_012225	GAA	2	6	312080	312085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619222
8107	NC_012225	ATA	2	6	312096	312101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
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8109	NC_012225	TGA	2	6	312229	312234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619222
8110	NC_012225	TTC	2	6	312252	312257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619222
8111	NC_012225	TAA	2	6	312313	312318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
8112	NC_012225	GA	3	6	312401	312406	50 %	0 %	50 %	0 %	225619222
8113	NC_012225	ATAA	2	8	312410	312417	75 %	25 %	0 %	0 %	225619222
8114	NC_012225	ATTTA	2	10	312421	312430	40 %	60 %	0 %	0 %	225619222
8115	NC_012225	TGCT	2	8	312453	312460	0 %	50 %	25 %	25 %	225619222
8116	NC_012225	CAG	2	6	312461	312466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619222
8117	NC_012225	GAG	2	6	312500	312505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619222
8118	NC_012225	A	6	6	312558	312563	100 %	0 %	0 %	0 %	225619222
8119	NC_012225	ATT	2	6	312595	312600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619222
8120	NC_012225	TGC	2	6	312607	312612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619222
8121	NC_012225	GGT	2	6	312638	312643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225619222
8122	NC_012225	TATGAC	2	12	312733	312744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225619222
8123	NC_012225	CTA	2	6	312804	312809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619222
8124	NC_012225	AT	4	8	312816	312823	50 %	50 %	0 %	0 %	225619222
8125	NC_012225	TAA	2	6	312832	312837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
8126	NC_012225	TGTT	2	8	312843	312850	0 %	75 %	25 %	0 %	225619222
8127	NC_012225	CTTG	2	8	312859	312866	0 %	50 %	25 %	25 %	225619222
8128	NC_012225	TAA	2	6	312927	312932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619222
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8135	NC_012225	TGA	2	6	313222	313227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619222
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8496	NC_012225	TGC	2	6	327592	327597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619238
8497	NC_012225	ATG	2	6	327635	327640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619238
8498	NC_012225	TAT	2	6	327648	327653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619238
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