MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75502	NC_012225	TCT	2	6	2877183	2877188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621450
75503	NC_012225	ATC	2	6	2877207	2877212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621450
75504	NC_012225	AGT	2	6	2877249	2877254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621450
75505	NC_012225	TGT	2	6	2877255	2877260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621450
75506	NC_012225	GAT	2	6	2877262	2877267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621450
75507	NC_012225	GAA	2	6	2877268	2877273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621450
75508	NC_012225	TAC	2	6	2877291	2877296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621450
75509	NC_012225	AAT	2	6	2877316	2877321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621450
75510	NC_012225	GCC	2	6	2877322	2877327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225621450
75511	NC_012225	ATTT	2	8	2877667	2877674	25 %	75 %	0 %	0 %	225621451
75512	NC_012225	CAT	2	6	2877743	2877748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621451
75513	NC_012225	CTA	2	6	2877854	2877859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621451
75514	NC_012225	T	7	7	2877867	2877873	0 %	100 %	0 %	0 %	225621451
75515	NC_012225	TTC	2	6	2877876	2877881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621451
75516	NC_012225	CTA	2	6	2877908	2877913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621451
75517	NC_012225	TTA	2	6	2877994	2877999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621451
75518	NC_012225	CTGT	2	8	2878082	2878089	0 %	50 %	25 %	25 %	225621451
75519	NC_012225	TAA	2	6	2878185	2878190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621451
75520	NC_012225	ACT	2	6	2878252	2878257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621451
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75524	NC_012225	TTTAT	2	10	2878381	2878390	20 %	80 %	0 %	0 %	225621451
75525	NC_012225	AGCT	2	8	2878400	2878407	25 %	25 %	25 %	25 %	225621451
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75527	NC_012225	TCAT	2	8	2878504	2878511	25 %	50 %	0 %	25 %	225621451
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75533	NC_012225	TGA	2	6	2878668	2878673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621451
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75536	NC_012225	TA	3	6	2878831	2878836	50 %	50 %	0 %	0 %	225621452
75537	NC_012225	AT	3	6	2878847	2878852	50 %	50 %	0 %	0 %	225621452
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75542	NC_012225	TTA	2	6	2879057	2879062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621452
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75544	NC_012225	T	7	7	2879133	2879139	0 %	100 %	0 %	0 %	225621452
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75550	NC_012225	T	6	6	2879248	2879253	0 %	100 %	0 %	0 %	225621452
75551	NC_012225	TATCAT	2	12	2879277	2879288	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225621452
75552	NC_012225	TAATA	2	10	2879302	2879311	60 %	40 %	0 %	0 %	225621452
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75557	NC_012225	TAT	2	6	2879487	2879492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621452
75558	NC_012225	ATCT	2	8	2879581	2879588	25 %	50 %	0 %	25 %	225621452
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75560	NC_012225	TAT	2	6	2879610	2879615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621452
75561	NC_012225	T	7	7	2879654	2879660	0 %	100 %	0 %	0 %	225621452
75562	NC_012225	TA	3	6	2879662	2879667	50 %	50 %	0 %	0 %	225621452
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75621	NC_012225	T	7	7	2882220	2882226	0 %	100 %	0 %	0 %	225621455
75622	NC_012225	TAT	2	6	2882250	2882255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621455
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75973	NC_012225	AAT	2	6	2894985	2894990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621468
75974	NC_012225	T	6	6	2895045	2895050	0 %	100 %	0 %	0 %	225621469
75975	NC_012225	CAAGC	2	10	2895084	2895093	40 %	0 %	20 %	40 %	225621469
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75978	NC_012225	TTC	2	6	2895133	2895138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621469
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75980	NC_012225	TCA	2	6	2895224	2895229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621469
75981	NC_012225	TA	4	8	2895310	2895317	50 %	50 %	0 %	0 %	225621469
75982	NC_012225	CTT	2	6	2895342	2895347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621469
75983	NC_012225	AT	3	6	2895350	2895355	50 %	50 %	0 %	0 %	225621469
75984	NC_012225	AGC	2	6	2895379	2895384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621469
75985	NC_012225	AGC	2	6	2895391	2895396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621469
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75992	NC_012225	TTG	3	9	2895765	2895773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621469
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75994	NC_012225	T	7	7	2895851	2895857	0 %	100 %	0 %	0 %	225621469
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