MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_012225	GAT	2	6	2823675	2823680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621406
74003	NC_012225	GAAA	2	8	2824002	2824009	75 %	0 %	25 %	0 %	225621407
74004	NC_012225	ATA	2	6	2824010	2824015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621407
74005	NC_012225	AAAG	2	8	2824147	2824154	75 %	0 %	25 %	0 %	225621407
74006	NC_012225	CTTT	2	8	2824196	2824203	0 %	75 %	0 %	25 %	225621407
74007	NC_012225	GAT	2	6	2824216	2824221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621407
74008	NC_012225	GAAGA	2	10	2824234	2824243	60 %	0 %	40 %	0 %	225621407
74009	NC_012225	CTA	2	6	2824268	2824273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621407
74010	NC_012225	CTG	2	6	2824283	2824288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621407
74011	NC_012225	TGT	2	6	2824305	2824310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621407
74012	NC_012225	AAGT	2	8	2824367	2824374	50 %	25 %	25 %	0 %	225621407
74013	NC_012225	A	7	7	2824383	2824389	100 %	0 %	0 %	0 %	225621407
74014	NC_012225	ATTTA	2	10	2824407	2824416	40 %	60 %	0 %	0 %	225621407
74015	NC_012225	ATG	2	6	2824427	2824432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621407
74016	NC_012225	AGA	2	6	2824473	2824478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621407
74017	NC_012225	A	6	6	2824480	2824485	100 %	0 %	0 %	0 %	225621407
74018	NC_012225	ATT	2	6	2824490	2824495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621407
74019	NC_012225	GAA	2	6	2824519	2824524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621407
74020	NC_012225	TCA	2	6	2824545	2824550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621407
74021	NC_012225	TAT	2	6	2824561	2824566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621407
74022	NC_012225	CTA	2	6	2824571	2824576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621407
74023	NC_012225	TAA	2	6	2824632	2824637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621407
74024	NC_012225	TGA	2	6	2824680	2824685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621407
74025	NC_012225	A	6	6	2824690	2824695	100 %	0 %	0 %	0 %	225621407
74026	NC_012225	TGC	2	6	2824737	2824742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621407
74027	NC_012225	GGA	2	6	2824807	2824812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225621407
74028	NC_012225	TAG	2	6	2824814	2824819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621407
74029	NC_012225	ACAGT	2	10	2824826	2824835	40 %	20 %	20 %	20 %	225621407
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74031	NC_012225	ACTAAT	2	12	2824960	2824971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225621407
74032	NC_012225	AATC	2	8	2824977	2824984	50 %	25 %	0 %	25 %	225621407
74033	NC_012225	CGG	2	6	2824998	2825003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225621407
74034	NC_012225	TAC	2	6	2825025	2825030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621407
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74036	NC_012225	A	6	6	2825062	2825067	100 %	0 %	0 %	0 %	225621407
74037	NC_012225	AGA	3	9	2825073	2825081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621407
74038	NC_012225	GAA	2	6	2825085	2825090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621407
74039	NC_012225	TAG	2	6	2825138	2825143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621407
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74042	NC_012225	TTC	2	6	2825257	2825262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621407
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74044	NC_012225	GA	3	6	2825334	2825339	50 %	0 %	50 %	0 %	225621407
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74049	NC_012225	TA	3	6	2825661	2825666	50 %	50 %	0 %	0 %	225621408
74050	NC_012225	T	6	6	2825693	2825698	0 %	100 %	0 %	0 %	225621408
74051	NC_012225	GCT	2	6	2825733	2825738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621408
74052	NC_012225	CTT	2	6	2825773	2825778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621408
74053	NC_012225	TAT	2	6	2825801	2825806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621408
74054	NC_012225	CAT	2	6	2825825	2825830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621408
74055	NC_012225	ATATTT	2	12	2825833	2825844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621408
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74058	NC_012225	TAT	2	6	2825939	2825944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621408
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74084	NC_012225	TA	3	6	2826871	2826876	50 %	50 %	0 %	0 %	225621410
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74087	NC_012225	GTT	2	6	2826960	2826965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621410
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74107	NC_012225	TCA	2	6	2827647	2827652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
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74110	NC_012225	TATT	2	8	2827711	2827718	25 %	75 %	0 %	0 %	225621410
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74113	NC_012225	TTTC	2	8	2827743	2827750	0 %	75 %	0 %	25 %	225621410
74114	NC_012225	TA	3	6	2827775	2827780	50 %	50 %	0 %	0 %	225621410
74115	NC_012225	ATC	2	6	2827802	2827807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
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74117	NC_012225	ATA	2	6	2827861	2827866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621410
74118	NC_012225	TAT	2	6	2827901	2827906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621410
74119	NC_012225	TTA	2	6	2827963	2827968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621410
74120	NC_012225	T	6	6	2827980	2827985	0 %	100 %	0 %	0 %	225621410
74121	NC_012225	AT	3	6	2827986	2827991	50 %	50 %	0 %	0 %	225621410
74122	NC_012225	ATC	2	6	2828057	2828062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
74123	NC_012225	T	6	6	2828072	2828077	0 %	100 %	0 %	0 %	225621410
74124	NC_012225	CAT	2	6	2828095	2828100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
74125	NC_012225	AAATG	2	10	2828106	2828115	60 %	20 %	20 %	0 %	225621410
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74127	NC_012225	ATC	2	6	2828129	2828134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
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74129	NC_012225	ATA	2	6	2828166	2828171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621410
74130	NC_012225	TTTA	2	8	2828186	2828193	25 %	75 %	0 %	0 %	225621410
74131	NC_012225	TGAT	2	8	2828211	2828218	25 %	50 %	25 %	0 %	225621410
74132	NC_012225	ATAA	2	8	2828219	2828226	75 %	25 %	0 %	0 %	225621410
74133	NC_012225	TCA	2	6	2828238	2828243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621410
74134	NC_012225	T	6	6	2828307	2828312	0 %	100 %	0 %	0 %	225621410
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74137	NC_012225	ATAA	2	8	2828331	2828338	75 %	25 %	0 %	0 %	225621410
74138	NC_012225	AT	3	6	2828871	2828876	50 %	50 %	0 %	0 %	225621411
74139	NC_012225	T	7	7	2828897	2828903	0 %	100 %	0 %	0 %	225621411
74140	NC_012225	AAGT	2	8	2828944	2828951	50 %	25 %	25 %	0 %	225621411
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74153	NC_012225	AAAT	2	8	2829247	2829254	75 %	25 %	0 %	0 %	225621412
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74157	NC_012225	TGA	2	6	2829349	2829354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621412
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74181	NC_012225	TAT	2	6	2830227	2830232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621412
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74222	NC_012225	CAAAG	2	10	2831938	2831947	60 %	0 %	20 %	20 %	225621414
74223	NC_012225	T	6	6	2832025	2832030	0 %	100 %	0 %	0 %	225621414
74224	NC_012225	TTC	2	6	2832097	2832102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621414
74225	NC_012225	TAT	2	6	2832141	2832146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621414
74226	NC_012225	T	6	6	2832170	2832175	0 %	100 %	0 %	0 %	225621414
74227	NC_012225	CAG	2	6	2832198	2832203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621414
74228	NC_012225	TA	3	6	2832397	2832402	50 %	50 %	0 %	0 %	225621415
74229	NC_012225	ATC	2	6	2832414	2832419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621415
74230	NC_012225	AT	3	6	2832435	2832440	50 %	50 %	0 %	0 %	225621415
74231	NC_012225	CTG	2	6	2832443	2832448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621415
74232	NC_012225	A	6	6	2832479	2832484	100 %	0 %	0 %	0 %	225621415
74233	NC_012225	T	6	6	2832609	2832614	0 %	100 %	0 %	0 %	225621415
74234	NC_012225	TAA	2	6	2832624	2832629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621415
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74465	NC_012225	T	6	6	2840996	2841001	0 %	100 %	0 %	0 %	225621423
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74470	NC_012225	CATTA	2	10	2841160	2841169	40 %	40 %	0 %	20 %	225621423
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