MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_012225	CAA	2	6	2480049	2480054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225621088
65003	NC_012225	T	6	6	2480071	2480076	0 %	100 %	0 %	0 %	225621088
65004	NC_012225	CCT	2	6	2480078	2480083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225621088
65005	NC_012225	CAA	2	6	2480118	2480123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225621088
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65008	NC_012225	ACA	2	6	2480171	2480176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225621088
65009	NC_012225	ATGA	2	8	2480180	2480187	50 %	25 %	25 %	0 %	225621088
65010	NC_012225	TAA	2	6	2480215	2480220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621088
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65012	NC_012225	TATCAT	2	12	2480248	2480259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225621088
65013	NC_012225	AAT	2	6	2480291	2480296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621088
65014	NC_012225	AAT	3	9	2480333	2480341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621088
65015	NC_012225	CCG	2	6	2480375	2480380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225621088
65016	NC_012225	CTG	2	6	2480436	2480441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621088
65017	NC_012225	CTG	2	6	2480449	2480454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225621088
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65019	NC_012225	TTCT	2	8	2480499	2480506	0 %	75 %	0 %	25 %	225621088
65020	NC_012225	AT	3	6	2480569	2480574	50 %	50 %	0 %	0 %	225621088
65021	NC_012225	CAT	2	6	2480622	2480627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621088
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65023	NC_012225	TAC	2	6	2480647	2480652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621088
65024	NC_012225	ATTT	2	8	2480664	2480671	25 %	75 %	0 %	0 %	225621088
65025	NC_012225	TA	3	6	2480683	2480688	50 %	50 %	0 %	0 %	225621088
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65034	NC_012225	TTA	2	6	2481006	2481011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621088
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65038	NC_012225	TAAA	2	8	2481058	2481065	75 %	25 %	0 %	0 %	225621088
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65042	NC_012225	TTC	2	6	2481151	2481156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621088
65043	NC_012225	TAC	2	6	2481163	2481168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621088
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65049	NC_012225	TA	3	6	2481355	2481360	50 %	50 %	0 %	0 %	225621088
65050	NC_012225	CTTTT	2	10	2481458	2481467	0 %	80 %	0 %	20 %	225621088
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65052	NC_012225	CTT	2	6	2481492	2481497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621088
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65055	NC_012225	GCA	2	6	2481629	2481634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621088
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65058	NC_012225	CCTG	2	8	2481713	2481720	0 %	25 %	25 %	50 %	225621088
65059	NC_012225	AT	3	6	2481732	2481737	50 %	50 %	0 %	0 %	225621088
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65065	NC_012225	GAT	2	6	2481925	2481930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621088
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65100	NC_012225	TTTG	2	8	2483314	2483321	0 %	75 %	25 %	0 %	225621089
65101	NC_012225	AT	3	6	2483358	2483363	50 %	50 %	0 %	0 %	225621089
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65107	NC_012225	TA	3	6	2483936	2483941	50 %	50 %	0 %	0 %	225621089
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65115	NC_012225	A	6	6	2484204	2484209	100 %	0 %	0 %	0 %	225621089
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65118	NC_012225	AGC	2	6	2484488	2484493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621089
65119	NC_012225	TTTG	2	8	2484507	2484514	0 %	75 %	25 %	0 %	225621089
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65126	NC_012225	TTC	2	6	2484772	2484777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621090
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65133	NC_012225	TAT	2	6	2484984	2484989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621090
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65233	NC_012225	A	8	8	2488762	2488769	100 %	0 %	0 %	0 %	225621096
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65477	NC_012225	GAA	2	6	2498297	2498302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621105
65478	NC_012225	TC	3	6	2498346	2498351	0 %	50 %	0 %	50 %	225621105
65479	NC_012225	A	6	6	2498354	2498359	100 %	0 %	0 %	0 %	225621105
65480	NC_012225	AT	3	6	2498372	2498377	50 %	50 %	0 %	0 %	225621105
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65492	NC_012225	A	6	6	2499126	2499131	100 %	0 %	0 %	0 %	225621106
65493	NC_012225	TA	3	6	2499171	2499176	50 %	50 %	0 %	0 %	225621106
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