MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012225	TAT	2	6	179630	179635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619108
4502	NC_012225	GCT	2	6	179643	179648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619108
4503	NC_012225	AT	3	6	179697	179702	50 %	50 %	0 %	0 %	225619108
4504	NC_012225	TAA	2	6	179797	179802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4505	NC_012225	TTA	2	6	179813	179818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4506	NC_012225	TTA	2	6	179829	179834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4507	NC_012225	TAT	2	6	179851	179856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4508	NC_012225	CTG	2	6	179918	179923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619109
4509	NC_012225	ATTT	2	8	179925	179932	25 %	75 %	0 %	0 %	225619109
4510	NC_012225	TTA	2	6	179940	179945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4511	NC_012225	GCTGAT	2	12	179966	179977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225619109
4512	NC_012225	AT	3	6	179998	180003	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4513	NC_012225	TTA	2	6	180012	180017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4514	NC_012225	TTA	2	6	180021	180026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4515	NC_012225	GAT	3	9	180029	180037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619109
4516	NC_012225	AT	3	6	180066	180071	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4517	NC_012225	TAT	2	6	180094	180099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4518	NC_012225	AT	3	6	180144	180149	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4519	NC_012225	T	6	6	180185	180190	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4520	NC_012225	TAT	2	6	180207	180212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4521	NC_012225	TATT	2	8	180216	180223	25 %	75 %	0 %	0 %	225619109
4522	NC_012225	TAT	2	6	180226	180231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4523	NC_012225	T	6	6	180233	180238	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4524	NC_012225	TA	3	6	180241	180246	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4525	NC_012225	ATA	2	6	180262	180267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4526	NC_012225	AAT	2	6	180268	180273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4527	NC_012225	TAAT	2	8	180345	180352	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4528	NC_012225	AAT	2	6	180362	180367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4529	NC_012225	TTTCTG	2	12	180380	180391	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225619109
4530	NC_012225	ATA	2	6	180397	180402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4531	NC_012225	AAG	2	6	180409	180414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619109
4532	NC_012225	TTA	2	6	180438	180443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4533	NC_012225	AAT	2	6	180455	180460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4534	NC_012225	AGG	2	6	180466	180471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619109
4535	NC_012225	AT	3	6	180472	180477	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4536	NC_012225	ATT	2	6	180479	180484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4537	NC_012225	ATT	2	6	180488	180493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4538	NC_012225	AAAAT	2	10	180546	180555	80 %	20 %	0 %	0 %	225619109
4539	NC_012225	TAT	2	6	180643	180648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4540	NC_012225	ATT	2	6	180665	180670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4541	NC_012225	T	7	7	180718	180724	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4542	NC_012225	TA	3	6	180757	180762	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4543	NC_012225	TAA	2	6	180765	180770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4544	NC_012225	T	7	7	180782	180788	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4545	NC_012225	ATT	2	6	180799	180804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4546	NC_012225	TGCT	2	8	180816	180823	0 %	50 %	25 %	25 %	225619109
4547	NC_012225	TCTG	2	8	180838	180845	0 %	50 %	25 %	25 %	225619109
4548	NC_012225	TAT	3	9	180856	180864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4549	NC_012225	GTTA	2	8	180886	180893	25 %	50 %	25 %	0 %	225619109
4550	NC_012225	AT	3	6	180894	180899	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4551	NC_012225	ATTT	2	8	180910	180917	25 %	75 %	0 %	0 %	225619109
4552	NC_012225	TGA	2	6	180919	180924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619109
4553	NC_012225	TCA	2	6	180935	180940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619109
4554	NC_012225	TAA	2	6	180942	180947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4555	NC_012225	TGA	2	6	180958	180963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619109
4556	NC_012225	TA	3	6	180969	180974	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4557	NC_012225	AT	3	6	181037	181042	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4558	NC_012225	CAT	2	6	181065	181070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619109
4559	NC_012225	ATA	2	6	181074	181079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4560	NC_012225	T	6	6	181127	181132	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4561	NC_012225	AT	3	6	181134	181139	50 %	50 %	0 %	0 %	225619109
4562	NC_012225	ATA	2	6	181141	181146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619109
4563	NC_012225	AATG	2	8	181171	181178	50 %	25 %	25 %	0 %	225619109
4564	NC_012225	ATT	2	6	181196	181201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4565	NC_012225	ATTTA	2	10	181210	181219	40 %	60 %	0 %	0 %	225619109
4566	NC_012225	T	6	6	181220	181225	0 %	100 %	0 %	0 %	225619109
4567	NC_012225	ATT	2	6	181235	181240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4568	NC_012225	AAAG	2	8	181281	181288	75 %	0 %	25 %	0 %	225619109
4569	NC_012225	TTA	2	6	181289	181294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4570	NC_012225	TAATG	2	10	181330	181339	40 %	40 %	20 %	0 %	225619109
4571	NC_012225	TATAT	2	10	181340	181349	40 %	60 %	0 %	0 %	225619109
4572	NC_012225	A	8	8	181366	181373	100 %	0 %	0 %	0 %	225619109
4573	NC_012225	TTA	2	6	181376	181381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
4574	NC_012225	ATA	2	6	181413	181418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619110
4575	NC_012225	ATTTTT	2	12	181457	181468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225619110
4576	NC_012225	TAT	2	6	181493	181498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619110
4577	NC_012225	T	6	6	181547	181552	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
4578	NC_012225	CTT	2	6	181560	181565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
4579	NC_012225	TAT	2	6	181582	181587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619110
4580	NC_012225	TTC	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
4581	NC_012225	TA	3	6	181682	181687	50 %	50 %	0 %	0 %	225619110
4582	NC_012225	AT	3	6	181707	181712	50 %	50 %	0 %	0 %	225619110
4583	NC_012225	CTG	2	6	181729	181734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619110
4584	NC_012225	TCT	2	6	181737	181742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
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4586	NC_012225	T	7	7	181766	181772	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
4587	NC_012225	A	6	6	181802	181807	100 %	0 %	0 %	0 %	225619110
4588	NC_012225	TCT	2	6	181812	181817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
4589	NC_012225	AAT	2	6	181828	181833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619110
4590	NC_012225	TGC	2	6	181840	181845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619110
4591	NC_012225	T	6	6	181889	181894	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
4592	NC_012225	GAG	2	6	181945	181950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619110
4593	NC_012225	TGA	2	6	182222	182227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619111
4594	NC_012225	TTA	2	6	182267	182272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4595	NC_012225	TAT	2	6	182326	182331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4596	NC_012225	GGAA	2	8	182498	182505	50 %	0 %	50 %	0 %	225619111
4597	NC_012225	ATT	3	9	182511	182519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4598	NC_012225	ATTA	2	8	182541	182548	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
4599	NC_012225	TA	3	6	182547	182552	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
4600	NC_012225	TTTAGA	2	12	182558	182569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225619111
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4603	NC_012225	AT	4	8	182662	182669	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
4604	NC_012225	TTG	2	6	182685	182690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619111
4605	NC_012225	T	6	6	182718	182723	0 %	100 %	0 %	0 %	225619111
4606	NC_012225	TAA	2	6	182761	182766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619111
4607	NC_012225	TTA	2	6	182835	182840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4608	NC_012225	A	6	6	182846	182851	100 %	0 %	0 %	0 %	225619111
4609	NC_012225	TAA	2	6	182864	182869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619111
4610	NC_012225	TAT	2	6	182906	182911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4611	NC_012225	TTA	2	6	182914	182919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4612	NC_012225	TGGA	2	8	182957	182964	25 %	25 %	50 %	0 %	225619111
4613	NC_012225	GCT	2	6	182976	182981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619111
4614	NC_012225	ATT	2	6	182984	182989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4615	NC_012225	GAA	2	6	183003	183008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619111
4616	NC_012225	ATT	2	6	183011	183016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
4617	NC_012225	A	7	7	183032	183038	100 %	0 %	0 %	0 %	225619111
4618	NC_012225	TAAA	2	8	183052	183059	75 %	25 %	0 %	0 %	225619111
4619	NC_012225	TA	3	6	183060	183065	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
4620	NC_012225	AGA	2	6	183101	183106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619111
4621	NC_012225	TA	3	6	183122	183127	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
4622	NC_012225	GTGA	2	8	183384	183391	25 %	25 %	50 %	0 %	225619112
4623	NC_012225	TTA	2	6	183436	183441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619112
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4625	NC_012225	A	6	6	183525	183530	100 %	0 %	0 %	0 %	225619112
4626	NC_012225	A	6	6	183573	183578	100 %	0 %	0 %	0 %	225619112
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4995	NC_012225	AGC	2	6	196424	196429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619123
4996	NC_012225	ATGT	2	8	196617	196624	25 %	50 %	25 %	0 %	225619123
4997	NC_012225	ATT	2	6	196644	196649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619123
4998	NC_012225	TA	3	6	196707	196712	50 %	50 %	0 %	0 %	225619123
4999	NC_012225	GTA	2	6	196716	196721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619123
5000	NC_012225	ATA	2	6	196734	196739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619123

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