MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 1325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	A	7	7	194	200	100 %	0 %	0 %	0 %	224984640
2	NC_012185	CCT	2	6	297	302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984640
3	NC_012185	TTGA	2	8	311	318	25 %	50 %	25 %	0 %	224984640
4	NC_012185	AACCCA	2	12	335	346	50 %	0 %	0 %	50 %	224984640
5	NC_012185	A	7	7	346	352	100 %	0 %	0 %	0 %	224984640
6	NC_012185	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984640
7	NC_012185	TAAA	2	8	393	400	75 %	25 %	0 %	0 %	224984640
8	NC_012185	ATTA	2	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	224984640
9	NC_012185	GAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
10	NC_012185	ACA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984640
11	NC_012185	AGA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
12	NC_012185	TGA	3	9	505	513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
13	NC_012185	TGC	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
14	NC_012185	AGT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
15	NC_012185	TTG	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984640
16	NC_012185	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224984640
17	NC_012185	TGA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
18	NC_012185	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
19	NC_012185	TGA	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
20	NC_012185	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
21	NC_012185	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
22	NC_012185	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984640
23	NC_012185	GCT	3	9	947	955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
24	NC_012185	GTG	3	9	969	977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
25	NC_012185	TGC	3	9	1096	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
26	NC_012185	GTG	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
27	NC_012185	TGC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
28	NC_012185	TTA	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984641
29	NC_012185	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	224984641
30	NC_012185	CTT	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984641
31	NC_012185	CAA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984641
32	NC_012185	A	6	6	4361	4366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984642
33	NC_012185	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984642
34	NC_012185	AAT	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
35	NC_012185	TTA	2	6	4395	4400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
36	NC_012185	ATT	2	6	4406	4411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
37	NC_012185	ATG	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984642
38	NC_012185	TTAT	2	8	4494	4501	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
39	NC_012185	TTTA	2	8	4526	4533	25 %	75 %	0 %	0 %	224984642
40	NC_012185	TAA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
41	NC_012185	A	7	7	4562	4568	100 %	0 %	0 %	0 %	224984642
42	NC_012185	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
43	NC_012185	A	7	7	4585	4591	100 %	0 %	0 %	0 %	224984642
44	NC_012185	TAT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
45	NC_012185	ATG	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984643
46	NC_012185	A	6	6	5049	5054	100 %	0 %	0 %	0 %	224984643
47	NC_012185	TATTT	2	10	5059	5068	20 %	80 %	0 %	0 %	224984643
48	NC_012185	TTC	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
49	NC_012185	TTG	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984643
50	NC_012185	ATT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984643
51	NC_012185	TTC	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
52	NC_012185	TG	3	6	5506	5511	0 %	50 %	50 %	0 %	224984644
53	NC_012185	T	6	6	5519	5524	0 %	100 %	0 %	0 %	224984644
54	NC_012185	CTA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984644
55	NC_012185	A	7	7	5563	5569	100 %	0 %	0 %	0 %	224984644
56	NC_012185	ACA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984644
57	NC_012185	TAA	2	6	5615	5620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984644
58	NC_012185	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984645
59	NC_012185	A	8	8	5931	5938	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
60	NC_012185	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
61	NC_012185	AAG	2	6	6040	6045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
62	NC_012185	AAG	3	9	6058	6066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
63	NC_012185	A	7	7	6075	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
64	NC_012185	A	6	6	6083	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
65	NC_012185	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
66	NC_012185	A	6	6	6150	6155	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
67	NC_012185	GAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
68	NC_012185	TGA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984645
69	NC_012185	ATGGA	2	10	6184	6193	40 %	20 %	40 %	0 %	224984645
70	NC_012185	A	6	6	6249	6254	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
71	NC_012185	AGA	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
72	NC_012185	A	6	6	6423	6428	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
73	NC_012185	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
74	NC_012185	AGA	2	6	6515	6520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
75	NC_012185	AAC	2	6	6526	6531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984645
76	NC_012185	TTA	2	6	6534	6539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
77	NC_012185	A	7	7	6623	6629	100 %	0 %	0 %	0 %	224984645
78	NC_012185	ATC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984645
79	NC_012185	ATT	2	6	7538	7543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
80	NC_012185	TTA	2	6	7573	7578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
81	NC_012185	CATC	2	8	7607	7614	25 %	25 %	0 %	50 %	224984646
82	NC_012185	TTTTG	2	10	7699	7708	0 %	80 %	20 %	0 %	224984646
83	NC_012185	T	7	7	7710	7716	0 %	100 %	0 %	0 %	224984646
84	NC_012185	GTTT	2	8	7725	7732	0 %	75 %	25 %	0 %	224984646
85	NC_012185	AT	3	6	7741	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
86	NC_012185	ATT	2	6	7767	7772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
87	NC_012185	TCT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984646
88	NC_012185	AAT	2	6	7792	7797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984646
89	NC_012185	TA	3	6	7824	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
90	NC_012185	A	6	6	7867	7872	100 %	0 %	0 %	0 %	224984646
91	NC_012185	TCC	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984646
92	NC_012185	T	6	6	7908	7913	0 %	100 %	0 %	0 %	224984646
93	NC_012185	AAT	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984646
94	NC_012185	TA	3	6	7955	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
95	NC_012185	ATT	2	6	7974	7979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
96	NC_012185	T	6	6	7978	7983	0 %	100 %	0 %	0 %	224984646
97	NC_012185	TAAT	2	8	7991	7998	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
98	NC_012185	TTC	2	6	8007	8012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984646
99	NC_012185	ATT	2	6	8055	8060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
100	NC_012185	TTA	2	6	8074	8079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984646
101	NC_012185	T	8	8	8095	8102	0 %	100 %	0 %	0 %	224984646
102	NC_012185	A	6	6	8180	8185	100 %	0 %	0 %	0 %	224984647
103	NC_012185	T	7	7	8196	8202	0 %	100 %	0 %	0 %	224984647
104	NC_012185	CAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984647
105	NC_012185	TTTA	2	8	8257	8264	25 %	75 %	0 %	0 %	224984647
106	NC_012185	TA	3	6	8281	8286	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
107	NC_012185	TACT	2	8	8307	8314	25 %	50 %	0 %	25 %	224984647
108	NC_012185	T	8	8	8342	8349	0 %	100 %	0 %	0 %	224984647
109	NC_012185	CTT	2	6	8388	8393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984647
110	NC_012185	ACT	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984647
111	NC_012185	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
112	NC_012185	TAT	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
113	NC_012185	AATTT	2	10	8550	8559	40 %	60 %	0 %	0 %	224984647
114	NC_012185	ATAG	2	8	8579	8586	50 %	25 %	25 %	0 %	224984647
115	NC_012185	ATA	3	9	8599	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984647
116	NC_012185	TCA	2	6	8621	8626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984647
117	NC_012185	TA	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
118	NC_012185	TAT	3	9	8655	8663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984647
119	NC_012185	TAA	2	6	8670	8675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984647
120	NC_012185	TTA	2	6	8892	8897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984648
121	NC_012185	T	8	8	8905	8912	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
122	NC_012185	T	6	6	8945	8950	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
123	NC_012185	TAT	2	6	9007	9012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984648
124	NC_012185	T	6	6	9032	9037	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
125	NC_012185	AAT	2	6	9048	9053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984648
126	NC_012185	A	6	6	9067	9072	100 %	0 %	0 %	0 %	224984648
127	NC_012185	T	6	6	9080	9085	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
128	NC_012185	TA	3	6	9098	9103	50 %	50 %	0 %	0 %	224984648
129	NC_012185	T	6	6	9165	9170	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
130	NC_012185	CTT	2	6	9214	9219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984648
131	NC_012185	CTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984648
132	NC_012185	TTGA	2	8	9254	9261	25 %	50 %	25 %	0 %	224984648
133	NC_012185	CATT	2	8	9285	9292	25 %	50 %	0 %	25 %	224984648
134	NC_012185	T	7	7	9295	9301	0 %	100 %	0 %	0 %	224984648
135	NC_012185	CAT	2	6	9326	9331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984648
136	NC_012185	TAA	2	6	9376	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984648
137	NC_012185	TTTTTG	2	12	9387	9398	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984648
138	NC_012185	TA	3	6	9459	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
139	NC_012185	AGA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984649
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