MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	T	6	6	26	31	0 %	100 %	0 %	0 %	224984010
2	NC_012166	AGA	2	6	32	37	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984010
3	NC_012166	GGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984010
4	NC_012166	AAT	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
5	NC_012166	ATA	2	6	704	709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
6	NC_012166	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
7	NC_012166	ATTTTG	2	12	783	794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984011
8	NC_012166	AAG	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984011
9	NC_012166	GGAT	2	8	850	857	25 %	25 %	50 %	0 %	224984011
10	NC_012166	AT	3	6	856	861	50 %	50 %	0 %	0 %	224984011
11	NC_012166	ATG	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
12	NC_012166	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	224984011
13	NC_012166	A	8	8	922	929	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
14	NC_012166	ATAG	2	8	965	972	50 %	25 %	25 %	0 %	224984011
15	NC_012166	ATG	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
16	NC_012166	TTGAT	2	10	1092	1101	20 %	60 %	20 %	0 %	224984011
17	NC_012166	AAT	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
18	NC_012166	CAAC	2	8	1969	1976	50 %	0 %	0 %	50 %	224984012
19	NC_012166	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984012
20	NC_012166	A	7	7	2135	2141	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
21	NC_012166	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	224984013
22	NC_012166	TA	3	6	2199	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	224984013
23	NC_012166	AAAC	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	224984013
24	NC_012166	A	9	9	2237	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
25	NC_012166	TCAA	2	8	2246	2253	50 %	25 %	0 %	25 %	224984013
26	NC_012166	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984013
27	NC_012166	GTTT	2	8	2333	2340	0 %	75 %	25 %	0 %	224984014
28	NC_012166	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984014
29	NC_012166	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984014
30	NC_012166	TCT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984014
31	NC_012166	TAA	2	6	2629	2634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
32	NC_012166	CAAA	2	8	2642	2649	75 %	0 %	0 %	25 %	224984015
33	NC_012166	CAA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
34	NC_012166	A	9	9	2711	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
35	NC_012166	TCAA	2	8	2786	2793	50 %	25 %	0 %	25 %	224984015
36	NC_012166	ACT	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
37	NC_012166	ATTA	2	8	2840	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
38	NC_012166	CTA	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
39	NC_012166	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
40	NC_012166	ACA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
41	NC_012166	TAA	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
42	NC_012166	AG	3	6	2942	2947	50 %	0 %	50 %	0 %	224984015
43	NC_012166	AGAA	2	8	2952	2959	75 %	0 %	25 %	0 %	224984015
44	NC_012166	AAAT	2	8	2991	2998	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
45	NC_012166	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
46	NC_012166	TAA	3	9	3037	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
47	NC_012166	ATA	2	6	3048	3053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
48	NC_012166	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
49	NC_012166	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
50	NC_012166	A	6	6	3074	3079	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
51	NC_012166	AAACTA	2	12	3095	3106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984015
52	NC_012166	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
53	NC_012166	CTTC	2	8	3147	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	224984015
54	NC_012166	AGA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
55	NC_012166	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
56	NC_012166	AAT	2	6	3245	3250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
57	NC_012166	A	6	6	3277	3282	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
58	NC_012166	AAAAAT	2	12	3301	3312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984015
59	NC_012166	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
60	NC_012166	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
61	NC_012166	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
62	NC_012166	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
63	NC_012166	A	6	6	3464	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
64	NC_012166	ACA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
65	NC_012166	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
66	NC_012166	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
67	NC_012166	TAAA	2	8	3585	3592	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
68	NC_012166	A	7	7	3594	3600	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
69	NC_012166	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
70	NC_012166	CAA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
71	NC_012166	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
72	NC_012166	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
73	NC_012166	TTAA	2	8	3689	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
74	NC_012166	A	9	9	3736	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
75	NC_012166	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
76	NC_012166	TCA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984016
77	NC_012166	A	6	6	3784	3789	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
78	NC_012166	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984016
79	NC_012166	AT	3	6	3811	3816	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
80	NC_012166	TA	3	6	3839	3844	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
81	NC_012166	A	8	8	3865	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
82	NC_012166	A	7	7	3908	3914	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
83	NC_012166	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984016
84	NC_012166	TATAT	2	10	4055	4064	40 %	60 %	0 %	0 %	224984016
85	NC_012166	A	6	6	4078	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
86	NC_012166	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
87	NC_012166	AGAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	25 %	0 %	224984016
88	NC_012166	ATAA	2	8	4138	4145	75 %	25 %	0 %	0 %	224984016
89	NC_012166	A	6	6	4144	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
90	NC_012166	ATGG	2	8	4245	4252	25 %	25 %	50 %	0 %	224984016
91	NC_012166	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
92	NC_012166	AGG	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984017
93	NC_012166	TGAT	2	8	4360	4367	25 %	50 %	25 %	0 %	224984017
94	NC_012166	ACC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984017
95	NC_012166	AGA	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
96	NC_012166	A	8	8	4437	4444	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
97	NC_012166	A	6	6	4467	4472	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
98	NC_012166	TTC	2	6	4481	4486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984017
99	NC_012166	AAT	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
100	NC_012166	AT	3	6	4530	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
101	NC_012166	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
102	NC_012166	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	224984017
103	NC_012166	ATA	3	9	4623	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
104	NC_012166	ATT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
105	NC_012166	ATA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
106	NC_012166	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
107	NC_012166	AAG	2	6	4754	4759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
108	NC_012166	ATTAAA	2	12	4760	4771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
109	NC_012166	A	8	8	4803	4810	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
110	NC_012166	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
111	NC_012166	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
112	NC_012166	GAT	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984017
113	NC_012166	T	6	6	4856	4861	0 %	100 %	0 %	0 %	224984017
114	NC_012166	TCAT	2	8	4867	4874	25 %	50 %	0 %	25 %	224984017
115	NC_012166	TAAA	2	8	4888	4895	75 %	25 %	0 %	0 %	224984017
116	NC_012166	A	6	6	4962	4967	100 %	0 %	0 %	0 %	224984017
117	NC_012166	TAA	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
118	NC_012166	AT	3	6	5037	5042	50 %	50 %	0 %	0 %	224984018
119	NC_012166	ATAAAA	2	12	5047	5058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984018
120	NC_012166	TAC	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984018
121	NC_012166	A	6	6	5076	5081	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
122	NC_012166	AAAG	2	8	5140	5147	75 %	0 %	25 %	0 %	224984018
123	NC_012166	ATA	2	6	5177	5182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984018
124	NC_012166	TAAAGA	2	12	5214	5225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984018
125	NC_012166	AGA	2	6	5328	5333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
126	NC_012166	AAAAGA	2	12	5343	5354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984018
127	NC_012166	AAG	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
128	NC_012166	A	6	6	5419	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	224984018
129	NC_012166	CATA	2	8	5477	5484	50 %	25 %	0 %	25 %	224984018
130	NC_012166	TAT	2	6	5485	5490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984018
131	NC_012166	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984018
132	NC_012166	TAAAGA	2	12	5535	5546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984018
133	NC_012166	ATA	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
134	NC_012166	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	224984019
135	NC_012166	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
136	NC_012166	AT	3	6	5849	5854	50 %	50 %	0 %	0 %	224984019
137	NC_012166	A	8	8	5864	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	224984019
138	NC_012166	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984019
139	NC_012166	ATA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984020
140	NC_012166	TTA	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984020
141	NC_012166	T	6	6	6940	6945	0 %	100 %	0 %	0 %	224984020
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270	NC_012166	A	9	9	13549	13557	100 %	0 %	0 %	0 %	224984034
271	NC_012166	TCAA	2	8	13624	13631	50 %	25 %	0 %	25 %	224984034
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411	NC_012166	A	6	6	18832	18837	100 %	0 %	0 %	0 %	224984041
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440	NC_012166	T	7	7	20430	20436	0 %	100 %	0 %	0 %	224984044
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