MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	GT	3	6	6	11	0 %	50 %	50 %	0 %	224586488
2	NC_012131	TAG	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586488
3	NC_012131	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	224586488
4	NC_012131	AGA	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586488
5	NC_012131	TAT	2	6	212	217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586488
6	NC_012131	AC	3	6	265	270	50 %	0 %	0 %	50 %	224586488
7	NC_012131	GAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586489
8	NC_012131	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586489
9	NC_012131	AAT	2	6	539	544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586489
10	NC_012131	TATTTA	2	12	698	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
11	NC_012131	TAT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
12	NC_012131	TTCATT	2	12	815	826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224586490
13	NC_012131	AAT	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
14	NC_012131	CTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
15	NC_012131	ACA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586490
16	NC_012131	TCT	2	6	960	965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
17	NC_012131	TTG	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586490
18	NC_012131	TAA	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
19	NC_012131	AT	3	6	1194	1199	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
20	NC_012131	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
21	NC_012131	TAA	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
22	NC_012131	AGT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
23	NC_012131	T	6	6	1278	1283	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
24	NC_012131	TA	3	6	1313	1318	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
25	NC_012131	A	7	7	1325	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
26	NC_012131	TGC	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586490
27	NC_012131	ACT	2	6	1394	1399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
28	NC_012131	TTG	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586490
29	NC_012131	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
30	NC_012131	AAT	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
31	NC_012131	AAAT	2	8	1510	1517	75 %	25 %	0 %	0 %	224586490
32	NC_012131	TAT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
33	NC_012131	TATT	2	8	1635	1642	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
34	NC_012131	T	7	7	1697	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
35	NC_012131	TAT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
36	NC_012131	T	6	6	1767	1772	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
37	NC_012131	T	6	6	1814	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
38	NC_012131	A	7	7	1823	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
39	NC_012131	TAG	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
40	NC_012131	TTA	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
41	NC_012131	TTTC	2	8	1903	1910	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
42	NC_012131	GTA	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
43	NC_012131	T	6	6	1956	1961	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
44	NC_012131	TAA	2	6	1978	1983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
45	NC_012131	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
46	NC_012131	TCTTT	2	10	2047	2056	0 %	80 %	0 %	20 %	224586490
47	NC_012131	T	7	7	2054	2060	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
48	NC_012131	ATT	2	6	2156	2161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
49	NC_012131	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
50	NC_012131	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
51	NC_012131	TAA	2	6	2218	2223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
52	NC_012131	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
53	NC_012131	TGA	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
54	NC_012131	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
55	NC_012131	T	6	6	2277	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
56	NC_012131	T	7	7	2294	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
57	NC_012131	TA	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
58	NC_012131	TAT	3	9	2320	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
59	NC_012131	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
60	NC_012131	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586490
61	NC_012131	CTTT	2	8	2379	2386	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
62	NC_012131	CTT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
63	NC_012131	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
64	NC_012131	T	6	6	2462	2467	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
65	NC_012131	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
66	NC_012131	TTA	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
67	NC_012131	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
68	NC_012131	TAG	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
69	NC_012131	TAT	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
70	NC_012131	CTTT	2	8	3228	3235	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
71	NC_012131	TCA	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
72	NC_012131	TCT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
73	NC_012131	GCAA	2	8	3366	3373	50 %	0 %	25 %	25 %	224586490
74	NC_012131	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
75	NC_012131	ATTT	2	8	3454	3461	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
76	NC_012131	TTC	2	6	3491	3496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
77	NC_012131	AAG	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586490
78	NC_012131	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
79	NC_012131	ATT	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
80	NC_012131	ATT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
81	NC_012131	TTA	2	6	3774	3779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
82	NC_012131	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
83	NC_012131	CTT	2	6	3846	3851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
84	NC_012131	TA	3	6	3860	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
85	NC_012131	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
86	NC_012131	ATT	3	9	3893	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
87	NC_012131	TA	3	6	3979	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
88	NC_012131	AT	3	6	4011	4016	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
89	NC_012131	AATTT	2	10	4031	4040	40 %	60 %	0 %	0 %	224586491
90	NC_012131	T	7	7	4047	4053	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
91	NC_012131	ATT	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586491
92	NC_012131	CTA	2	6	4084	4089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586491
93	NC_012131	TAT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586491
94	NC_012131	T	8	8	4111	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
95	NC_012131	TAA	2	6	4125	4130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586491
96	NC_012131	T	7	7	4136	4142	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
97	NC_012131	T	6	6	4345	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	224586492
98	NC_012131	TAC	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
99	NC_012131	GCT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586492
100	NC_012131	CAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
101	NC_012131	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
102	NC_012131	T	6	6	4573	4578	0 %	100 %	0 %	0 %	224586492
103	NC_012131	ACTT	2	8	5310	5317	25 %	50 %	0 %	25 %	224586493
104	NC_012131	CTT	2	6	5322	5327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586493
105	NC_012131	AAT	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586493
106	NC_012131	CCT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586493
107	NC_012131	A	7	7	5495	5501	100 %	0 %	0 %	0 %	224586493
108	NC_012131	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	224586494
109	NC_012131	T	6	6	5553	5558	0 %	100 %	0 %	0 %	224586494
110	NC_012131	TATT	2	8	5594	5601	25 %	75 %	0 %	0 %	224586494
111	NC_012131	TCT	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586494
112	NC_012131	AAT	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586494
113	NC_012131	T	7	7	5647	5653	0 %	100 %	0 %	0 %	224586494
114	NC_012131	ACTTAA	2	12	5664	5675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224586494
115	NC_012131	A	6	6	5698	5703	100 %	0 %	0 %	0 %	224586494
116	NC_012131	T	7	7	5708	5714	0 %	100 %	0 %	0 %	224586494
117	NC_012131	T	6	6	5832	5837	0 %	100 %	0 %	0 %	224586495
118	NC_012131	CTT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586495
119	NC_012131	CAT	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586495
120	NC_012131	T	7	7	5892	5898	0 %	100 %	0 %	0 %	224586495
121	NC_012131	CAT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586495
122	NC_012131	TAG	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586495
123	NC_012131	T	8	8	6143	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	224586496
124	NC_012131	CTTTT	2	10	6158	6167	0 %	80 %	0 %	20 %	224586496
125	NC_012131	TCA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586496
126	NC_012131	TTC	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586496
127	NC_012131	GAA	2	6	6237	6242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586496
128	NC_012131	TTC	2	6	6278	6283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586496
129	NC_012131	T	7	7	6284	6290	0 %	100 %	0 %	0 %	224586496
130	NC_012131	TTG	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586496
131	NC_012131	TAC	2	6	6349	6354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586496
132	NC_012131	T	6	6	6626	6631	0 %	100 %	0 %	0 %	224586497
133	NC_012131	AGT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586497
134	NC_012131	AAAAT	2	10	6670	6679	80 %	20 %	0 %	0 %	224586497
135	NC_012131	A	6	6	6683	6688	100 %	0 %	0 %	0 %	224586497
136	NC_012131	A	6	6	6695	6700	100 %	0 %	0 %	0 %	224586497
137	NC_012131	TAAAAA	2	12	6707	6718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224586497
138	NC_012131	AAAC	2	8	6798	6805	75 %	0 %	0 %	25 %	224586497
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275	NC_012131	ATT	2	6	13387	13392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586510
276	NC_012131	T	6	6	13402	13407	0 %	100 %	0 %	0 %	224586510
277	NC_012131	CAATA	2	10	13465	13474	60 %	20 %	0 %	20 %	224586510
278	NC_012131	GCT	2	6	13512	13517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586510
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282	NC_012131	AAAGA	2	10	13691	13700	80 %	0 %	20 %	0 %	224586511
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286	NC_012131	TAC	2	6	13735	13740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586511
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386	NC_012131	A	6	6	18586	18591	100 %	0 %	0 %	0 %	224586518
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390	NC_012131	A	9	9	18707	18715	100 %	0 %	0 %	0 %	224586518
391	NC_012131	A	6	6	18764	18769	100 %	0 %	0 %	0 %	224586518
392	NC_012131	TAC	2	6	18770	18775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586518
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401	NC_012131	ATG	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586519
402	NC_012131	A	6	6	19086	19091	100 %	0 %	0 %	0 %	224586519
403	NC_012131	AGA	2	6	19169	19174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586519
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