MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AAT	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
2	NC_012129	TATTT	2	10	61	70	20 %	80 %	0 %	0 %	224586460
3	NC_012129	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
4	NC_012129	A	6	6	147	152	100 %	0 %	0 %	0 %	224586460
5	NC_012129	T	8	8	182	189	0 %	100 %	0 %	0 %	224586460
6	NC_012129	A	6	6	208	213	100 %	0 %	0 %	0 %	224586460
7	NC_012129	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	224586460
8	NC_012129	AAAC	2	8	268	275	75 %	0 %	0 %	25 %	224586460
9	NC_012129	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586460
10	NC_012129	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586460
11	NC_012129	ATT	3	9	392	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586461
12	NC_012129	A	7	7	425	431	100 %	0 %	0 %	0 %	224586461
13	NC_012129	AT	3	6	481	486	50 %	50 %	0 %	0 %	224586461
14	NC_012129	T	6	6	599	604	0 %	100 %	0 %	0 %	224586461
15	NC_012129	AAAT	2	8	624	631	75 %	25 %	0 %	0 %	224586461
16	NC_012129	CTG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586461
17	NC_012129	TAT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586461
18	NC_012129	T	7	7	721	727	0 %	100 %	0 %	0 %	224586461
19	NC_012129	ATT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
20	NC_012129	ATC	2	6	974	979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
21	NC_012129	ATC	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
22	NC_012129	AGAAT	2	10	1077	1086	60 %	20 %	20 %	0 %	224586462
23	NC_012129	TAA	2	6	1136	1141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
24	NC_012129	GTT	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586462
25	NC_012129	ATC	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586462
26	NC_012129	TGT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586462
27	NC_012129	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
28	NC_012129	AATA	2	8	1294	1301	75 %	25 %	0 %	0 %	224586462
29	NC_012129	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586462
30	NC_012129	TAT	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
31	NC_012129	ATT	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
32	NC_012129	AAC	2	6	1487	1492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586462
33	NC_012129	TAA	2	6	1498	1503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
34	NC_012129	TAT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
35	NC_012129	TC	3	6	1510	1515	0 %	50 %	0 %	50 %	224586462
36	NC_012129	T	6	6	1518	1523	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
37	NC_012129	CTAC	2	8	1551	1558	25 %	25 %	0 %	50 %	224586462
38	NC_012129	GAC	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586462
39	NC_012129	TAA	2	6	1655	1660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586462
40	NC_012129	ATT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
41	NC_012129	AATT	2	8	1690	1697	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
42	NC_012129	T	6	6	1732	1737	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
43	NC_012129	ACAA	2	8	1782	1789	75 %	0 %	0 %	25 %	224586462
44	NC_012129	ATT	2	6	1820	1825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
45	NC_012129	T	7	7	1855	1861	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
46	NC_012129	T	6	6	1881	1886	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
47	NC_012129	T	8	8	1897	1904	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
48	NC_012129	A	7	7	1912	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	224586462
49	NC_012129	A	6	6	1920	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	224586462
50	NC_012129	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
51	NC_012129	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
52	NC_012129	ATT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
53	NC_012129	ATTTTT	2	12	2070	2081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224586462
54	NC_012129	ATT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586462
55	NC_012129	TA	3	6	2125	2130	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
56	NC_012129	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	224586462
57	NC_012129	TAAT	2	8	2555	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	224586463
58	NC_012129	AAT	3	9	2560	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
59	NC_012129	A	8	8	2606	2613	100 %	0 %	0 %	0 %	224586463
60	NC_012129	AAT	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
61	NC_012129	CAA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
62	NC_012129	ATA	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
63	NC_012129	CAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586463
64	NC_012129	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586463
65	NC_012129	ACC	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586463
66	NC_012129	AT	3	6	2893	2898	50 %	50 %	0 %	0 %	224586463
67	NC_012129	TCC	2	6	2916	2921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586463
68	NC_012129	AAT	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
69	NC_012129	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
70	NC_012129	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586463
71	NC_012129	CAG	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586463
72	NC_012129	A	7	7	3308	3314	100 %	0 %	0 %	0 %	224586463
73	NC_012129	ATA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586463
74	NC_012129	CCG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586463
75	NC_012129	ACA	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
76	NC_012129	CTG	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586463
77	NC_012129	ACA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586463
78	NC_012129	TAAAA	2	10	3672	3681	80 %	20 %	0 %	0 %	224586463
79	NC_012129	ATTT	2	8	3740	3747	25 %	75 %	0 %	0 %	224586463
80	NC_012129	AGT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586463
81	NC_012129	TA	3	6	4039	4044	50 %	50 %	0 %	0 %	224586464
82	NC_012129	A	7	7	4050	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	224586464
83	NC_012129	AGA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586464
84	NC_012129	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586464
85	NC_012129	AC	3	6	4227	4232	50 %	0 %	0 %	50 %	224586464
86	NC_012129	ATA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586464
87	NC_012129	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586464
88	NC_012129	TTTTA	2	10	4283	4292	20 %	80 %	0 %	0 %	224586464
89	NC_012129	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586464
90	NC_012129	ATA	2	6	4368	4373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586464
91	NC_012129	A	7	7	4382	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	224586464
92	NC_012129	TAC	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586465
93	NC_012129	ATG	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586465
94	NC_012129	ACT	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586465
95	NC_012129	TGT	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586465
96	NC_012129	TAA	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586465
97	NC_012129	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	224586465
98	NC_012129	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586465
99	NC_012129	AAT	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586465
100	NC_012129	AATG	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	224586465
101	NC_012129	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586465
102	NC_012129	GAAA	2	8	4731	4738	75 %	0 %	25 %	0 %	224586466
103	NC_012129	ATT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
104	NC_012129	A	6	6	4796	4801	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
105	NC_012129	TAT	2	6	4914	4919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
106	NC_012129	TAGAC	2	10	5022	5031	40 %	20 %	20 %	20 %	224586466
107	NC_012129	AGA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
108	NC_012129	ATAA	2	8	5110	5117	75 %	25 %	0 %	0 %	224586466
109	NC_012129	AAT	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
110	NC_012129	A	6	6	5154	5159	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
111	NC_012129	CTTT	2	8	5213	5220	0 %	75 %	0 %	25 %	224586466
112	NC_012129	ACA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586466
113	NC_012129	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
114	NC_012129	TTA	2	6	5270	5275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586466
115	NC_012129	AGA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
116	NC_012129	GAAAA	2	10	5306	5315	80 %	0 %	20 %	0 %	224586466
117	NC_012129	CA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	0 %	50 %	224586466
118	NC_012129	AAG	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
119	NC_012129	A	7	7	5439	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
120	NC_012129	TAG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586466
121	NC_012129	AAT	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
122	NC_012129	TAC	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586466
123	NC_012129	AAT	2	6	5602	5607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
124	NC_012129	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
125	NC_012129	A	6	6	5641	5646	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
126	NC_012129	TTC	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586466
127	NC_012129	AAT	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
128	NC_012129	GAA	2	6	5761	5766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586466
129	NC_012129	AT	3	6	5767	5772	50 %	50 %	0 %	0 %	224586466
130	NC_012129	A	6	6	5780	5785	100 %	0 %	0 %	0 %	224586466
131	NC_012129	ATA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586466
132	NC_012129	ATAA	2	8	5819	5826	75 %	25 %	0 %	0 %	224586466
133	NC_012129	GTTT	2	8	5841	5848	0 %	75 %	25 %	0 %	224586467
134	NC_012129	ATA	3	9	5880	5888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586467
135	NC_012129	AT	3	6	5940	5945	50 %	50 %	0 %	0 %	224586467
136	NC_012129	TAG	3	9	5954	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586467
137	NC_012129	ATC	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586467
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139	NC_012129	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586467
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