MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 37566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_011835	CGG	2	6	1929945	1929950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684023
37502	NC_011835	GCG	2	6	1929981	1929986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684023
37503	NC_011835	CAC	2	6	1930045	1930050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684023
37504	NC_011835	GCG	2	6	1930145	1930150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684023
37505	NC_011835	CCT	2	6	1930155	1930160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684023
37506	NC_011835	GC	4	8	1930165	1930172	0 %	0 %	50 %	50 %	219684023
37507	NC_011835	CA	3	6	1930207	1930212	50 %	0 %	0 %	50 %	219684023
37508	NC_011835	GCA	2	6	1930272	1930277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684023
37509	NC_011835	GGC	2	6	1930279	1930284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684023
37510	NC_011835	TTGC	2	8	1930339	1930346	0 %	50 %	25 %	25 %	219684023
37511	NC_011835	CAC	2	6	1930372	1930377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684023
37512	NC_011835	GGC	2	6	1930378	1930383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684023
37513	NC_011835	CG	3	6	1930440	1930445	0 %	0 %	50 %	50 %	219684023
37514	NC_011835	TCG	2	6	1930541	1930546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684023
37515	NC_011835	TCA	2	6	1930548	1930553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684023
37516	NC_011835	GTC	2	6	1931022	1931027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37517	NC_011835	CTC	2	6	1931106	1931111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684024
37518	NC_011835	CACG	2	8	1931141	1931148	25 %	0 %	25 %	50 %	219684024
37519	NC_011835	GAT	2	6	1931157	1931162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684024
37520	NC_011835	CGCTTG	2	12	1931260	1931271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37521	NC_011835	CTG	2	6	1931319	1931324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37522	NC_011835	GCT	2	6	1931342	1931347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37523	NC_011835	ACC	2	6	1931359	1931364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684024
37524	NC_011835	GTC	3	9	1931400	1931408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37525	NC_011835	GGC	2	6	1931429	1931434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684024
37526	NC_011835	AGC	2	6	1931482	1931487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37527	NC_011835	CCT	2	6	1931516	1931521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684024
37528	NC_011835	GTC	2	6	1931544	1931549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684024
37529	NC_011835	CTT	2	6	1931687	1931692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684025
37530	NC_011835	TGA	2	6	1931770	1931775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684025
37531	NC_011835	CTC	4	12	1931777	1931788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684025
37532	NC_011835	CGGC	2	8	1931795	1931802	0 %	0 %	50 %	50 %	219684025
37533	NC_011835	CTTC	2	8	1931803	1931810	0 %	50 %	0 %	50 %	219684025
37534	NC_011835	CTT	2	6	1931816	1931821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684025
37535	NC_011835	CGG	2	6	1931857	1931862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684025
37536	NC_011835	GCA	2	6	1931908	1931913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684025
37537	NC_011835	TGT	2	6	1931923	1931928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219684025
37538	NC_011835	CAT	2	6	1932017	1932022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684025
37539	NC_011835	GCG	2	6	1932059	1932064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684025
37540	NC_011835	CAGG	2	8	1932089	1932096	25 %	0 %	50 %	25 %	219684025
37541	NC_011835	CGA	2	6	1932109	1932114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684025
37542	NC_011835	GTG	2	6	1932141	1932146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684025
37543	NC_011835	GGT	2	6	1932149	1932154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684025
37544	NC_011835	GGCA	2	8	1932318	1932325	25 %	0 %	50 %	25 %	219684025
37545	NC_011835	CCGG	2	8	1932330	1932337	0 %	0 %	50 %	50 %	219684025
37546	NC_011835	GTT	2	6	1932344	1932349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219684025
37547	NC_011835	TCA	2	6	1932364	1932369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684025
37548	NC_011835	CTTC	2	8	1932385	1932392	0 %	50 %	0 %	50 %	219684025
37549	NC_011835	TCA	2	6	1932433	1932438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684025
37550	NC_011835	GC	3	6	1932462	1932467	0 %	0 %	50 %	50 %	219684025
37551	NC_011835	GTA	2	6	1932485	1932490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684025
37552	NC_011835	CAC	2	6	1932512	1932517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684025
37553	NC_011835	GAT	2	6	1932530	1932535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684025
37554	NC_011835	AAG	2	6	1932671	1932676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684025
37555	NC_011835	AGG	2	6	1933077	1933082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684026
37556	NC_011835	GCC	2	6	1933088	1933093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684026
37557	NC_011835	CGCA	2	8	1933102	1933109	25 %	0 %	25 %	50 %	219684026
37558	NC_011835	GCTCAT	2	12	1933134	1933145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219684026
37559	NC_011835	ACC	2	6	1933190	1933195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684026
37560	NC_011835	CCAAAC	2	12	1933221	1933232	50 %	0 %	0 %	50 %	219684026
37561	NC_011835	CAC	2	6	1933273	1933278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684026
37562	NC_011835	GCA	2	6	1933284	1933289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684026
37563	NC_011835	CGG	2	6	1933313	1933318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684026
37564	NC_011835	CGG	2	6	1933412	1933417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684027
37565	NC_011835	GC	3	6	1933425	1933430	0 %	0 %	50 %	50 %	219684027
37566	NC_011835	CGG	3	9	1933478	1933486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684027

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.