MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 37566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011835	GAGC	2	8	1260876	1260883	25 %	0 %	50 %	25 %	219683467
25002	NC_011835	AT	3	6	1260928	1260933	50 %	50 %	0 %	0 %	219683467
25003	NC_011835	CA	3	6	1261289	1261294	50 %	0 %	0 %	50 %	219683468
25004	NC_011835	GAC	2	6	1261381	1261386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25005	NC_011835	TGC	2	6	1261546	1261551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25006	NC_011835	GCC	2	6	1261604	1261609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683468
25007	NC_011835	CTG	2	6	1261637	1261642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25008	NC_011835	CAC	3	9	1261669	1261677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683468
25009	NC_011835	TCG	2	6	1261680	1261685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25010	NC_011835	GAG	2	6	1261709	1261714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683468
25011	NC_011835	ACA	2	6	1261725	1261730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683468
25012	NC_011835	ACA	2	6	1261836	1261841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683468
25013	NC_011835	CGCCA	2	10	1261846	1261855	20 %	0 %	20 %	60 %	219683468
25014	NC_011835	CAC	2	6	1261930	1261935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683468
25015	NC_011835	TCG	2	6	1261950	1261955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25016	NC_011835	CG	3	6	1262081	1262086	0 %	0 %	50 %	50 %	219683468
25017	NC_011835	CTG	2	6	1262090	1262095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25018	NC_011835	CTG	3	9	1262135	1262143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25019	NC_011835	AGTCG	2	10	1262230	1262239	20 %	20 %	40 %	20 %	219683468
25020	NC_011835	CATC	2	8	1262246	1262253	25 %	25 %	0 %	50 %	219683468
25021	NC_011835	GGC	2	6	1262336	1262341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683468
25022	NC_011835	GCT	2	6	1262386	1262391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25023	NC_011835	ACG	2	6	1262438	1262443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25024	NC_011835	GGA	2	6	1262470	1262475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683468
25025	NC_011835	CGA	2	6	1262527	1262532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25026	NC_011835	CAT	2	6	1262533	1262538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683468
25027	NC_011835	CGA	2	6	1262539	1262544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
25028	NC_011835	GC	3	6	1262569	1262574	0 %	0 %	50 %	50 %	219683468
25029	NC_011835	TGA	2	6	1262862	1262867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25030	NC_011835	CTC	2	6	1262890	1262895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683469
25031	NC_011835	GCACG	2	10	1262899	1262908	20 %	0 %	40 %	40 %	219683469
25032	NC_011835	ATG	2	6	1262925	1262930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25033	NC_011835	GTT	2	6	1262934	1262939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683469
25034	NC_011835	TAG	2	6	1262967	1262972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25035	NC_011835	ATC	2	6	1263020	1263025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
25036	NC_011835	TCA	2	6	1263057	1263062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
25037	NC_011835	TGGC	2	8	1263066	1263073	0 %	25 %	50 %	25 %	219683469
25038	NC_011835	GAT	2	6	1263304	1263309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25039	NC_011835	GCA	2	6	1263335	1263340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25040	NC_011835	CGA	2	6	1263382	1263387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25041	NC_011835	GAC	2	6	1263419	1263424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25042	NC_011835	GGT	2	6	1263448	1263453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683469
25043	NC_011835	GAT	2	6	1263454	1263459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25044	NC_011835	TGG	2	6	1263510	1263515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683469
25045	NC_011835	GGTGA	2	10	1263518	1263527	20 %	20 %	60 %	0 %	219683469
25046	NC_011835	CCG	2	6	1263529	1263534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683469
25047	NC_011835	TCC	2	6	1263552	1263557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683469
25048	NC_011835	CGT	2	6	1263564	1263569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25049	NC_011835	CGA	2	6	1263601	1263606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25050	NC_011835	CCGAT	2	10	1263651	1263660	20 %	20 %	20 %	40 %	219683469
25051	NC_011835	CAT	2	6	1263661	1263666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
25052	NC_011835	TAC	2	6	1263680	1263685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
25053	NC_011835	C	6	6	1263714	1263719	0 %	0 %	0 %	100 %	219683469
25054	NC_011835	CGT	2	6	1263766	1263771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25055	NC_011835	GAC	2	6	1263793	1263798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
25056	NC_011835	GAT	2	6	1263808	1263813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25057	NC_011835	CCG	2	6	1263867	1263872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683469
25058	NC_011835	ATG	2	6	1263932	1263937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25059	NC_011835	TGA	2	6	1264147	1264152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25060	NC_011835	CAA	2	6	1264213	1264218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683469
25061	NC_011835	GCAA	2	8	1264241	1264248	50 %	0 %	25 %	25 %	219683469
25062	NC_011835	GAT	2	6	1264253	1264258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
25063	NC_011835	GGA	2	6	1264294	1264299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683469
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25065	NC_011835	CTC	2	6	1264510	1264515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683470
25066	NC_011835	CTG	2	6	1264531	1264536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683470
25067	NC_011835	TTC	2	6	1264579	1264584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683470
25068	NC_011835	CAT	2	6	1264611	1264616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683470
25069	NC_011835	CTC	2	6	1264618	1264623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683470
25070	NC_011835	GCTG	2	8	1264664	1264671	0 %	25 %	50 %	25 %	219683470
25071	NC_011835	GGT	2	6	1264701	1264706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683470
25072	NC_011835	GTT	2	6	1264749	1264754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683470
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25075	NC_011835	GCC	2	6	1264819	1264824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683470
25076	NC_011835	GC	3	6	1264909	1264914	0 %	0 %	50 %	50 %	219683470
25077	NC_011835	CTG	2	6	1264943	1264948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683470
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25082	NC_011835	TGA	2	6	1265156	1265161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683470
25083	NC_011835	GTG	2	6	1265175	1265180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683470
25084	NC_011835	TCCGGA	2	12	1265523	1265534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219683471
25085	NC_011835	TGA	2	6	1265554	1265559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683471
25086	NC_011835	CCA	2	6	1265575	1265580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683471
25087	NC_011835	CGT	2	6	1265588	1265593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683471
25088	NC_011835	AGC	2	6	1265629	1265634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683471
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25090	NC_011835	CTG	2	6	1265685	1265690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683471
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25094	NC_011835	CGAA	2	8	1265815	1265822	50 %	0 %	25 %	25 %	219683471
25095	NC_011835	CAG	3	9	1265835	1265843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683471
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25098	NC_011835	GCC	2	6	1266009	1266014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683471
25099	NC_011835	CAT	2	6	1266053	1266058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683471
25100	NC_011835	CCG	2	6	1266133	1266138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683471
25101	NC_011835	CGG	2	6	1266208	1266213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683471
25102	NC_011835	CGG	2	6	1266218	1266223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683471
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25104	NC_011835	GCA	2	6	1266266	1266271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683471
25105	NC_011835	TGT	2	6	1266326	1266331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683472
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25107	NC_011835	GAA	3	9	1266351	1266359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683472
25108	NC_011835	GCT	2	6	1266423	1266428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25109	NC_011835	ACC	2	6	1266466	1266471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683472
25110	NC_011835	CGG	2	6	1266480	1266485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683472
25111	NC_011835	CGG	2	6	1266503	1266508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683472
25112	NC_011835	CGA	2	6	1266522	1266527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25113	NC_011835	TGG	2	6	1266546	1266551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683472
25114	NC_011835	CGA	2	6	1266665	1266670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25115	NC_011835	GCT	2	6	1266684	1266689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25116	NC_011835	TCG	2	6	1266799	1266804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25117	NC_011835	CGA	2	6	1266819	1266824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683472
25118	NC_011835	CGA	2	6	1266842	1266847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683472
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25122	NC_011835	CG	3	6	1267060	1267065	0 %	0 %	50 %	50 %	219683472
25123	NC_011835	GGT	2	6	1267105	1267110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683472
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25126	NC_011835	CGC	2	6	1267161	1267166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683472
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25133	NC_011835	GGC	2	6	1267378	1267383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683472
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25142	NC_011835	CGT	2	6	1267938	1267943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683472
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25144	NC_011835	CGC	2	6	1267971	1267976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683472
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25229	NC_011835	CAC	2	6	1271374	1271379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683474
25230	NC_011835	GCC	2	6	1271474	1271479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683474
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25233	NC_011835	TCG	2	6	1271595	1271600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683474
25234	NC_011835	CAT	2	6	1271616	1271621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683474
25235	NC_011835	GGC	2	6	1271626	1271631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683474
25236	NC_011835	GAT	4	12	1271653	1271664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683474
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25335	NC_011835	ACG	2	6	1276276	1276281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683478
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25340	NC_011835	GTC	2	6	1277208	1277213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683480
25341	NC_011835	GCT	2	6	1277214	1277219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683480
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25343	NC_011835	TG	3	6	1277254	1277259	0 %	50 %	50 %	0 %	219683480
25344	NC_011835	GAA	2	6	1277307	1277312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683480
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25457	NC_011835	CGA	2	6	1282698	1282703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683483
25458	NC_011835	GAC	2	6	1282756	1282761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683483
25459	NC_011835	CAA	2	6	1282791	1282796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683483
25460	NC_011835	CGT	2	6	1282819	1282824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683483
25461	NC_011835	GAG	3	9	1282834	1282842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683483
25462	NC_011835	CCA	3	9	1282872	1282880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683483
25463	NC_011835	ACC	2	6	1282963	1282968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683483
25464	NC_011835	GC	3	6	1282974	1282979	0 %	0 %	50 %	50 %	219683483
25465	NC_011835	CAA	3	9	1283028	1283036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683483
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25467	NC_011835	ATT	2	6	1283196	1283201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219683484
25468	NC_011835	CCG	2	6	1283240	1283245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683484
25469	NC_011835	GAA	2	6	1283410	1283415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683484
25470	NC_011835	GGCCAC	2	12	1283512	1283523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219683484
25471	NC_011835	TCG	2	6	1283583	1283588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683484
25472	NC_011835	CCGC	2	8	1283614	1283621	0 %	0 %	25 %	75 %	219683484
25473	NC_011835	CCA	2	6	1283631	1283636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683484
25474	NC_011835	CAT	2	6	1283689	1283694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683484
25475	NC_011835	CATG	2	8	1283718	1283725	25 %	25 %	25 %	25 %	219683484
25476	NC_011835	CGG	2	6	1283811	1283816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683484
25477	NC_011835	CAC	2	6	1283839	1283844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683484
25478	NC_011835	GACGT	2	10	1283846	1283855	20 %	20 %	40 %	20 %	219683484
25479	NC_011835	GATCGT	2	12	1283928	1283939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219683484
25480	NC_011835	CAG	2	6	1283950	1283955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683484
25481	NC_011835	GCC	2	6	1283974	1283979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683484
25482	NC_011835	TTGGT	2	10	1284194	1284203	0 %	60 %	40 %	0 %	219683485
25483	NC_011835	TTC	3	9	1284245	1284253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683485
25484	NC_011835	GTC	3	9	1284308	1284316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25485	NC_011835	AG	3	6	1284388	1284393	50 %	0 %	50 %	0 %	219683485
25486	NC_011835	CTC	2	6	1284403	1284408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683485
25487	NC_011835	CGT	2	6	1284412	1284417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25488	NC_011835	GCCC	2	8	1284478	1284485	0 %	0 %	25 %	75 %	219683485
25489	NC_011835	TGC	2	6	1284537	1284542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25490	NC_011835	GCA	2	6	1284572	1284577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25491	NC_011835	AGC	2	6	1284624	1284629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25492	NC_011835	CGG	2	6	1284645	1284650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683485
25493	NC_011835	ACG	2	6	1284651	1284656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25494	NC_011835	AGA	2	6	1284689	1284694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683485
25495	NC_011835	TCG	2	6	1284699	1284704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683485
25496	NC_011835	TGC	2	6	1284741	1284746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683485
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