MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 37566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_011835	GCTG	2	8	1212215	1212222	0 %	25 %	50 %	25 %	219683432
24002	NC_011835	GC	3	6	1212242	1212247	0 %	0 %	50 %	50 %	219683432
24003	NC_011835	ATG	2	6	1212262	1212267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683432
24004	NC_011835	CCG	2	6	1212341	1212346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683432
24005	NC_011835	TCA	2	6	1212473	1212478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683432
24006	NC_011835	ATGG	2	8	1212544	1212551	25 %	25 %	50 %	0 %	219683432
24007	NC_011835	CCG	2	6	1212734	1212739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683432
24008	NC_011835	TCG	2	6	1212752	1212757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24009	NC_011835	CAT	2	6	1212786	1212791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683432
24010	NC_011835	TCG	2	6	1212836	1212841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24011	NC_011835	CCA	2	6	1212883	1212888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683432
24012	NC_011835	ACG	2	6	1212913	1212918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24013	NC_011835	TGC	2	6	1212926	1212931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24014	NC_011835	CTG	2	6	1212940	1212945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24015	NC_011835	TCG	2	6	1212950	1212955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683432
24016	NC_011835	GGC	2	6	1212963	1212968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683432
24017	NC_011835	GC	3	6	1212984	1212989	0 %	0 %	50 %	50 %	219683432
24018	NC_011835	GCGAC	2	10	1212993	1213002	20 %	0 %	40 %	40 %	219683432
24019	NC_011835	GT	3	6	1214433	1214438	0 %	50 %	50 %	0 %	219683433
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24024	NC_011835	GC	3	6	1214843	1214848	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24025	NC_011835	G	6	6	1214913	1214918	0 %	0 %	100 %	0 %	219683433
24026	NC_011835	CGGC	2	8	1214963	1214970	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24027	NC_011835	G	6	6	1215145	1215150	0 %	0 %	100 %	0 %	219683433
24028	NC_011835	GCA	2	6	1215165	1215170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
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24031	NC_011835	GCC	2	6	1215304	1215309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683433
24032	NC_011835	GC	3	6	1215330	1215335	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24033	NC_011835	CGA	2	6	1215388	1215393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
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24035	NC_011835	CG	3	6	1215432	1215437	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24036	NC_011835	GCAC	2	8	1215475	1215482	25 %	0 %	25 %	50 %	219683433
24037	NC_011835	GACG	2	8	1215526	1215533	25 %	0 %	50 %	25 %	219683433
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24041	NC_011835	GA	3	6	1215659	1215664	50 %	0 %	50 %	0 %	219683433
24042	NC_011835	TG	3	6	1215686	1215691	0 %	50 %	50 %	0 %	219683433
24043	NC_011835	CGA	2	6	1215696	1215701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
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24046	NC_011835	G	6	6	1215814	1215819	0 %	0 %	100 %	0 %	219683433
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24052	NC_011835	CGC	2	6	1216018	1216023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683433
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24054	NC_011835	ACC	2	6	1216114	1216119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683433
24055	NC_011835	CGA	2	6	1216129	1216134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
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24057	NC_011835	TGC	2	6	1216227	1216232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683433
24058	NC_011835	CCGAGG	2	12	1216233	1216244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219683433
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24060	NC_011835	GGGT	2	8	1216302	1216309	0 %	25 %	75 %	0 %	219683433
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24088	NC_011835	GGCC	2	8	1217371	1217378	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24089	NC_011835	GAAC	2	8	1217401	1217408	50 %	0 %	25 %	25 %	219683433
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24102	NC_011835	GCGAT	2	10	1218054	1218063	20 %	20 %	40 %	20 %	219683433
24103	NC_011835	ACG	2	6	1218078	1218083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
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24105	NC_011835	CCGGAG	2	12	1218143	1218154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219683433
24106	NC_011835	GAC	2	6	1218163	1218168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
24107	NC_011835	CAT	2	6	1218186	1218191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683433
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24109	NC_011835	CGG	3	9	1218364	1218372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683433
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24115	NC_011835	CTG	2	6	1218620	1218625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683433
24116	NC_011835	GCCGGC	2	12	1218712	1218723	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24117	NC_011835	GC	3	6	1218760	1218765	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24118	NC_011835	ACG	2	6	1218781	1218786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683433
24119	NC_011835	TGG	2	6	1218798	1218803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683433
24120	NC_011835	TGC	2	6	1218804	1218809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683433
24121	NC_011835	GC	3	6	1218817	1218822	0 %	0 %	50 %	50 %	219683433
24122	NC_011835	GGTCG	2	10	1218843	1218852	0 %	20 %	60 %	20 %	219683433
24123	NC_011835	CGG	2	6	1218891	1218896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683433
24124	NC_011835	GGC	2	6	1218977	1218982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683433
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24127	NC_011835	TGA	2	6	1219238	1219243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683434
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24130	NC_011835	GGT	2	6	1219491	1219496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683434
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24132	NC_011835	ATC	2	6	1219564	1219569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683434
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24138	NC_011835	CAT	2	6	1219845	1219850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683434
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24142	NC_011835	GGTGC	2	10	1220110	1220119	0 %	20 %	60 %	20 %	219683434
24143	NC_011835	AC	3	6	1220132	1220137	50 %	0 %	0 %	50 %	219683434
24144	NC_011835	GTG	3	9	1220228	1220236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683434
24145	NC_011835	GCACC	2	10	1220250	1220259	20 %	0 %	20 %	60 %	219683434
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24147	NC_011835	TGTCT	2	10	1220303	1220312	0 %	60 %	20 %	20 %	219683434
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24152	NC_011835	TTC	2	6	1220717	1220722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683434
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24179	NC_011835	CAT	2	6	1221920	1221925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683436
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24219	NC_011835	GT	3	6	1223260	1223265	0 %	50 %	50 %	0 %	219683436
24220	NC_011835	TTC	2	6	1223386	1223391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683436
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24223	NC_011835	TG	3	6	1223491	1223496	0 %	50 %	50 %	0 %	219683436
24224	NC_011835	GTG	2	6	1223506	1223511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683436
24225	NC_011835	ATG	2	6	1223560	1223565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683436
24226	NC_011835	GTC	2	6	1223610	1223615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683436
24227	NC_011835	TCA	2	6	1223636	1223641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683436
24228	NC_011835	GCG	2	6	1223653	1223658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683436
24229	NC_011835	GCA	2	6	1223753	1223758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683436
24230	NC_011835	CGGT	2	8	1223759	1223766	0 %	25 %	50 %	25 %	219683436
24231	NC_011835	TTG	2	6	1223776	1223781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683436
24232	NC_011835	TCG	2	6	1223812	1223817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683436
24233	NC_011835	GCG	2	6	1223839	1223844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683436
24234	NC_011835	CGT	2	6	1223885	1223890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683436
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24236	NC_011835	GCGG	2	8	1224024	1224031	0 %	0 %	75 %	25 %	219683436
24237	NC_011835	GCA	2	6	1224053	1224058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683436
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24247	NC_011835	CG	3	6	1224633	1224638	0 %	0 %	50 %	50 %	219683437
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24262	NC_011835	CGA	2	6	1225162	1225167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683437
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24333	NC_011835	TGG	2	6	1228841	1228846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683441
24334	NC_011835	CAT	2	6	1228854	1228859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683441
24335	NC_011835	TCGAT	2	10	1228862	1228871	20 %	40 %	20 %	20 %	219683441
24336	NC_011835	TGCA	2	8	1228901	1228908	25 %	25 %	25 %	25 %	219683441
24337	NC_011835	CCGG	2	8	1228925	1228932	0 %	0 %	50 %	50 %	219683441
24338	NC_011835	ACG	2	6	1228984	1228989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683441
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24341	NC_011835	CGC	2	6	1229067	1229072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683441
24342	NC_011835	GAG	2	6	1229161	1229166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683441
24343	NC_011835	CAG	2	6	1229188	1229193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683441
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24345	NC_011835	GAC	2	6	1229251	1229256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683441
24346	NC_011835	CCG	2	6	1229264	1229269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683441
24347	NC_011835	CTGC	2	8	1229308	1229315	0 %	25 %	25 %	50 %	219683441
24348	NC_011835	GGTC	2	8	1229358	1229365	0 %	25 %	50 %	25 %	219683441
24349	NC_011835	GC	3	6	1229378	1229383	0 %	0 %	50 %	50 %	219683441
24350	NC_011835	CCG	2	6	1229465	1229470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683441
24351	NC_011835	GC	3	6	1229512	1229517	0 %	0 %	50 %	50 %	219683441
24352	NC_011835	TCGA	2	8	1229560	1229567	25 %	25 %	25 %	25 %	219683441
24353	NC_011835	CGA	2	6	1229577	1229582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683441
24354	NC_011835	GCGCAA	2	12	1229598	1229609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683441
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24356	NC_011835	CTG	2	6	1229671	1229676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683441
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24365	NC_011835	TC	3	6	1230138	1230143	0 %	50 %	0 %	50 %	219683441
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24374	NC_011835	CCA	2	6	1230679	1230684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683442
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24377	NC_011835	CGA	2	6	1230843	1230848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683443
24378	NC_011835	TGG	2	6	1230915	1230920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683443
24379	NC_011835	TGG	2	6	1230968	1230973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683443
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24420	NC_011835	CAT	2	6	1232905	1232910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683445
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24449	NC_011835	GCC	2	6	1233896	1233901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683445
24450	NC_011835	CGC	2	6	1233913	1233918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683445
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24452	NC_011835	TGA	2	6	1234036	1234041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683445
24453	NC_011835	GAC	2	6	1234095	1234100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683446
24454	NC_011835	GTG	2	6	1234153	1234158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683446
24455	NC_011835	TCA	2	6	1234178	1234183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683446
24456	NC_011835	TCG	3	9	1234187	1234195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683446
24457	NC_011835	CAT	2	6	1234299	1234304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683446
24458	NC_011835	TCA	2	6	1234319	1234324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683446
24459	NC_011835	CGC	2	6	1234332	1234337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683446
24460	NC_011835	CGG	2	6	1234385	1234390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683446
24461	NC_011835	CGG	4	12	1234617	1234628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683446
24462	NC_011835	ATC	2	6	1234696	1234701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683446
24463	NC_011835	GGT	2	6	1234719	1234724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683446
24464	NC_011835	CTG	2	6	1234756	1234761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683446
24465	NC_011835	CA	3	6	1234767	1234772	50 %	0 %	0 %	50 %	219683446
24466	NC_011835	AAC	2	6	1234774	1234779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683446
24467	NC_011835	GACC	2	8	1234890	1234897	25 %	0 %	25 %	50 %	219683447
24468	NC_011835	CGA	2	6	1234926	1234931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683447
24469	NC_011835	GCT	2	6	1234932	1234937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683447
24470	NC_011835	CGC	2	6	1234945	1234950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683447
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24473	NC_011835	CTG	2	6	1235221	1235226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683447
24474	NC_011835	GGC	2	6	1235229	1235234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683447
24475	NC_011835	CTGG	2	8	1235238	1235245	0 %	25 %	50 %	25 %	219683447
24476	NC_011835	GCCG	2	8	1235292	1235299	0 %	0 %	50 %	50 %	219683447
24477	NC_011835	GAT	2	6	1235361	1235366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683447
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24480	NC_011835	ATG	2	6	1235425	1235430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683447
24481	NC_011835	TG	3	6	1235437	1235442	0 %	50 %	50 %	0 %	219683447
24482	NC_011835	TGCA	2	8	1235459	1235466	25 %	25 %	25 %	25 %	219683447
24483	NC_011835	GGC	2	6	1235520	1235525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683447
24484	NC_011835	TCCA	2	8	1235573	1235580	25 %	25 %	0 %	50 %	219683447
24485	NC_011835	GGC	2	6	1235608	1235613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683447
24486	NC_011835	GTG	2	6	1235626	1235631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683447
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24488	NC_011835	GCC	2	6	1235731	1235736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683447
24489	NC_011835	TG	3	6	1235757	1235762	0 %	50 %	50 %	0 %	219683447
24490	NC_011835	GGA	2	6	1235871	1235876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683447
24491	NC_011835	TTG	2	6	1235905	1235910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683447
24492	NC_011835	TGA	2	6	1235979	1235984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683447
24493	NC_011835	CTGAG	2	10	1236043	1236052	20 %	20 %	40 %	20 %	219683447
24494	NC_011835	CGC	2	6	1236363	1236368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683448
24495	NC_011835	AAC	2	6	1236373	1236378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683448
24496	NC_011835	GGT	3	9	1236384	1236392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683448
24497	NC_011835	GCG	2	6	1236441	1236446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683448
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24499	NC_011835	CGA	2	6	1236501	1236506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683448
24500	NC_011835	AGCAC	2	10	1236551	1236560	40 %	0 %	20 %	40 %	219683448

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